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ⅰ) 페놀계 화합물을 인지하는 dmpR의 52번째 아미노산이 돌연변이된 변형 dmpR 단백질을 코딩하는 변형 dmpR 유전자, 및 상기 변형 dmpR 유전자와 상호 작동가능하게 연결되어 상기 변형 dmpR 유전자의 발현을 조절하는 제1 프로모터를 포함하는 제1 유전자 컨스트럭트; 및ⅱ) 형광 단백질을 코딩하는 유전자 및 항생제 저항성 유전자로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 리포터 유전자, 및 상기 리포터 유전자와 상호 작동가능하게 연결되어, 페놀계 화합물을 인지한 변형 dmpR 단백질이 결합하면 상기 리포터 유전자의 발현을 유도하는 제2 프로모터를 포함하는 제2 유전자 컨스트럭트;를 포함하는 페놀계 화합물 감지용 재설계 유전자 회로
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청구항 1에 있어서,야생형 dmpR 단백질은 서열번호 1로 기재되는 아미노산 서열을 갖는 것인 페놀계 화합물 감지용 재설계 유전자 회로
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3
청구항 1에 있어서, 변형 dmpR 단백질은 야생형 dmpR 단백질의 52번째 메티오닌(M)이 이소루신(I) 또는 시스테인(C)으로 치환된 것인 페놀계 화합물 감지용 재설계 유전자 회로
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청구항 1에 있어서, 변형 dmpR 단백질은 추가적으로, 야생형 dmpR 단백질의 188번째 라이신(K)이 아르기닌(R)으로 치환되거나, 야생형 dmpR 단백질의 71번째 글루타민(Q)이 알라닌(A)으로 치환되거나, 또는 야생형 dmpR 단백질의 135번째 글루탐산(E)이 라이신(K)으로 치환된 것인 페놀계 화합물 감지용 재설계 유전자 회로
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청구항 1에 있어서, 상기 제1 프로모터 및 제2 프로모터는 슈도모나스(Pseudomonas)의 dmpR 또는 dmp 오페론의 프로모터, 일반 단백질 발현용 프로모터, trc 프로모터, T7 프로모터, lac 프로모터, ara 프로모터 및 σ54-의존성 프로모터(PECO)로 이루어진 군으로부터 선택되는 페놀계 화합물 감지용 재설계 유전자 회로
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6
청구항 1에 있어서, 상기 페놀계 화합물은 페놀(phenol), 2-클로로페놀(2-chloro phenol), 2-요오드페놀(2-iodophenol), o-크레졸(o-cresol), 2-에틸페놀(2-ethylphenol), m-크레졸(m-cresol), 2-니트로페놀(2-nitrophenol), 카테콜(catechol), 2-메톡시페놀(2-methoxyphenol), 2-아미노페놀(2-aminophenol), 2,3-디클로로페놀(2,3-dichlorophenol), 3-클로로페놀(3-chloro phenol), 2,3-디메틸페놀(2,3-dimethylphenol), 3-니트로페놀(3-nitrophenol), 4-클로로페놀(4-chloro phenol), p-크레졸(p-cresol), 2,5-디클로로페놀(2,5-dichlorophenol), 2,5-디메틸페놀(2,5-dimethylphenol) 및 살리신산(salicylic acid)로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상인 페놀계 화합물 감지용 재설계 유전자 회로
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청구항 1 내지 청구항 6 중 어느 한 항의 페놀계 화합물 감지용 재설계 유전자 회로를 포함하는 페놀계 화합물 감지용 형질전환체
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청구항 7에 있어서,상기 형질전환체 내에는 청구항 1의 ⅰ) 상기 제1 유전자 컨스트럭트가 클로닝된 벡터 및 ⅱ) 상기 제2 유전자 컨스트럭트가 클로닝된 벡터가 포함되어 있는 것인 페놀계 화합물 감지용 형질전환체
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청구항 7에 있어서,상기 형질전환체 내에는 청구항 1의 제1 유전자 컨스트럭트와 제2 유전자 컨스트럭트가 함께 클로닝된 벡터가 포함되어 있는 페놀계 화합물 감지용 형질전환체
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10
청구항 7의 페놀계 화합물 감지용 형질전환체를 2종 이상 포함하는 형질전환체의 집합체로서,상기 2종 이상의 형질전환체는 도입된 재설계 유전자 회로의 변형 dmpR 유전자가 코딩하는 변형 dmpR 단백질이 서로 다른 것이거나, 재설계 유전자 회로가 도입된 숙주세포가 서로 다른 것인, 형질전환체의 집합체
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11
청구항 7의 형질전환체 또는 청구항 10의 형질전환체의 집합체와, 페놀계 화합물 함유 가능성 있는 샘플을 접촉시키는 단계; 및페놀계 화합물을 감지하여 발현이 유도된 리포터 단백질의 활성을 분석하는 단계;를 포함하는 페놀계 화합물의 감지 또는 정량 분석 방법
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12
청구항 11에 있어서,상기 형질전환체의 집합체를 이용하는 경우,상기 분석된 리포터 단백질의 활성을, 기계학습 알고리즘으로 구축된 데이터베이스와 대비하는 단계;를 더 포함하는 것인, 페놀계 화합물의 감지 또는 정량 분석 방법
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13
청구항 7의 형질 전환체 또는 청구항 10의 형질전환체의 집합체와, 메타게놈 라이브러리 샘플을 접촉시키는 단계;상기 샘플 내에 존재하는 페놀계 화합물에 의해 발현이 유도된 리포터 단백질의 활성을 분석하여 샘플 내에 페놀계 화합물을 감지하는 단계; 및페놀계 화합물이 감지된 샘플에 함유된 균주를 페놀계 화합물 생산 균주로 선별하는 단계;를 포함하는 페놀계 화합물 생산 균주의 스크리닝 방법
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청구항 13에 있어서,상기 형질전환체의 집합체를 이용하는 경우,상기 분석된 리포터 단백질의 활성을, 기계학습 알고리즘으로 구축된 데이터베이스와 대비하는 단계;를 더 포함하는 것인, 페놀계 화합물 생산 균주의 스크리닝 방법
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ⅰ) 페놀계 화합물을 인지하는 dmpR의 52번째 아미노산이 돌연변이된 변형 dmpR 단백질을 코딩하는 변형 dmpR 유전자, 및 상기 변형 dmpR 유전자와 상호 작동가능하게 연결되어 상기 변형 dmpR 유전자의 발현을 조절하는 제1 프로모터를 포함하는 제1 유전자 컨스트럭트; 및ⅱ) 형광 단백질을 코딩하는 유전자 및 항생제 저항성 유전자로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 리포터 유전자, 및 상기 리포터 유전자와 상호 작동가능하게 연결되어, 페놀계 화합물을 인지한 변형 dmpR 단백질이 결합하면 상기 리포터 유전자의 발현을 유도하는 제2 프로모터를 포함하는 제2 유전자 컨스트럭트;를 포함하는 페놀계 화합물 유도성 발현 벡터
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