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메티실린 내성 또는 민감성 황색포도상구균 클론타입 판별용 바이오마커 조성물
- 기술번호 : KST2020009751
- 담당센터 : 부산기술혁신센터
- 전화번호 : 051-606-6561
| 요약 | 본 발명은 메티실린 내성 또는 민감성 황색포도상구균 클론타입 판별용 바이오마커 조성물 및 이의 용도에 관한 것으로, 보다 상세하게는 황색포도상구균 중 병원 매개 감염 유전형(ST5)과 지역 매개 감염 유전형(ST72)에 대해 각각 MSSA (Methicillin-sensitive SA) 및 MRSA (Methicillin-resistant SA) 총 4종에서 차별적으로 발현되는 바이오마커 조성물을 제공하며, 본 발명의 바이오마커 조성물은 상기 클론 타입에 따른 발현차이를 나타내는 유전자군의 조합을 통하여 메티실린 내성 또는 민감성 황색포도상구균의 감염 진단 및 클론 타입을 확인할 수 있어 임상적으로 간편하고 유효성 있는 판별방법 및 판별용 키트 제작에 사용될 수 있다. |
|---|---|
| Int. CL | G01N 33/569 (2017.01.01) G01N 33/68 (2006.01.01) |
| CPC | |
| 출원번호/일자 | 1020190175382 (2019.12.26) |
| 출원인 | 울산대학교 산학협력단, 재단법인 아산사회복지재단 |
| 등록번호/일자 | |
| 공개번호/일자 | 10-2020-0083297 (2020.07.08) 문서열기 |
| 공고번호/일자 | |
| 국제출원번호/일자 | |
| 국제공개번호/일자 | |
| 우선권정보 |
대한민국 | 1020180172718 | 2018.12.28
|
| 법적상태 | 등록 |
| 심사진행상태 | 수리 |
| 심판사항 | |
| 구분 | 신규 |
| 원출원번호/일자 | |
| 관련 출원번호 | |
| 심사청구여부/일자 | Y (2019.12.26) |
| 심사청구항수 | 11 |
출원인
| 번호 | 이름 | 국적 | 주소 |
|---|---|---|---|
| 1 | 울산대학교 산학협력단 | 대한민국 | 울산광역시 남구 |
| 2 | 재단법인 아산사회복지재단 | 대한민국 | 서울특별시 송파구 |
발명자
| 번호 | 이름 | 국적 | 주소 |
|---|---|---|---|
| 1 | 김경곤 | 서울특별시 송파구 | |
| 2 | 김양수 | 서울특별시 성동구 | |
| 3 | 염정훈 | 서울특별시 강동구 | |
| 4 | 유지영 | 경기도 안양시 동안구 | |
| 5 | 안희성 | 서울특별시 양천구 | |
| 6 | 오유미 | 서울특별시 강동구 | |
| 7 | 김은실 | 서울특별시 노원구 |
대리인
| 번호 | 이름 | 국적 | 주소 |
|---|---|---|---|
| 1 | 특허법인태백 | 대한민국 | 서울 금천구 가산디지털*로 *** 이노플렉스 *차 ***호 |
최종권리자
| 번호 | 이름 | 국적 | 주소 |
|---|---|---|---|
| 최종권리자 정보가 없습니다 | |||
| 번호 | 서류명 | 접수/발송일자 | 처리상태 | 접수/발송번호 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | [특허출원]특허출원서 [Patent Application] Patent Application |
2019.12.26 | 수리 (Accepted) | 1-1-2019-1342492-54 |
| 2 | [출원서 등 보정]보정서 [Amendment to Patent Application, etc.] Amendment |
2019.12.27 | 수리 (Accepted) | 1-1-2019-1348561-46 |
| 3 | 보정요구서 Request for Amendment |
2020.01.07 | 발송처리완료 (Completion of Transmission) | 1-5-2020-0003884-14 |
| 4 | [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서 [Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief) |
2020.02.07 | 수리 (Accepted) | 1-1-2020-0130622-22 |
| 5 | [출원서 등 보정]보정서 [Amendment to Patent Application, etc.] Amendment |
2020.02.25 | 수리 (Accepted) | 1-1-2020-0198722-61 |
| 6 | 출원인정보변경(경정)신고서 Notification of change of applicant's information |
2020.07.10 | 수리 (Accepted) | 4-1-2020-5154267-54 |
| 7 | 선행기술조사의뢰서 Request for Prior Art Search |
2020.07.14 | 수리 (Accepted) | 9-1-9999-9999999-89 |
| 8 | 출원인정보변경(경정)신고서 Notification of change of applicant's information |
2020.07.31 | 수리 (Accepted) | 4-1-2020-5172343-48 |
| 9 | 선행기술조사보고서 Report of Prior Art Search |
2020.09.10 | 발송처리완료 (Completion of Transmission) | 9-6-2020-0183514-45 |
| 번호 | 청구항 |
|---|---|
| 1 |
1 aacA (Aminoglycoside phosphotransferase APH(3'))(Accession: D3X7Z4), ermA (23S rRNA (Adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(B))(Accession: Q7DIC2), ant(9)(Streptomycin 3''-adenylyltransferase)(Accession: Q7DIC3), NCTC11940_00344 (Protein of uncharacterized function (DUF3644))(Accession: A0A2X3P763), CSC83_13340 (Capsular biosynthesis protein)(Accession: A0A2S6DTY7), ERS072840_00987 (Phage repressor protein)(Accession: A0A167QYC2), hmp (Flavohemoprotein)(Accession: A0A1D4MV18), SAP027A_009 (Antiseptic resistance protein)(Accession: D2J776), BN1321_390017 (Uncharacterized protein)(Accession: A0A0U1MRY5), CSC83_06955 (Phage major capsid protein)(Accession: A0A2S6DEN9), mecR1 (Methicillin resistance regulatory sensor-transducer MecR1)(Accession: A0A2Y2RBM2), cydA (Cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I)(Accession: A0A167UFF7), lytS (Autolysis histidine kinase LytS)(Accession: A0A131JSM9), SAMEA2445518_01017 (Hypothetical phage-related protein)(Accession: A0A0U1MY60), SAMEA1708674_03678 (Cell division inhibitor)(Accession: A0A2W2UEW9), capC (Tyrosine-protein phosphatase)(Accession: A0A0U1MX93), BTN44_14990 (Lipoprotein)(Accession: A0A0D3QB23), C0J46_00500 (Transcriptional regulator)(Accession: A0A2W3FHQ4), rbsK (Ribokinase)(Accession: A0A2Y2LM71), ERS140147_00739 (Membrane protein)(Accession: A0A077VLJ7), bglA (6-phospho-beta-glucosidase)(Accession: A0A0D6GG52), pyrR (Bifunctional protein PyrR)(Accession: W8U6N8), vraR (DNA-binding response regulator)(Accession: D9IFM7), yxeP_2 (Carboxypeptidase, M20(D) family)(Accession: A0A0U1MEH9), orfX (Ribosomal RNA large subunit methyltransferase H)(Accession: A0A068W8S1), aroA (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)(Accession: A0A133PU31), queF (NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase)(Accession: A0A077V3Q2), ydfH (Gluconate operon transcriptional repressor)(Accession: A0A1D4Q3C3), C7Q89_10110 (Abortive phage resistance protein)(Accession: B2Y834), rpsC (30S ribosomal protein S3)(Accession: A0A1Q8DBU3), traP (Signal transduction protein TRAP)(Accession: A0A0U1N0V2), BSZ10_08125 (Alkaline-shock protein)(Accession: A0A1Q8DDB2), SAP059A_003 (Antiadhesin Pls, binding to squamous nasal epithelial cells)(Accession: D2JDZ0), panB (3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase)(Accession: A0A0Z1DQN8), rpsO (30S ribosomal protein S15)(Accession: A0A077VJU6), SAMEA1708674_01891 (Enterotoxin)(Accession: A0A1D4MQV2), ndk (Nucleoside diphosphate kinase)(Accession: A0A0U1MN06), SAMEA1708674_00628 (Short-chain alcohol dehydrogenase)(Accession: A0A1D4IQF8), sbi (Immunoglobulin-binding protein sbi)(Accession: A0A0U1MSJ9), parB_2 (Chromosome partitioning protein ParB)(Accession: A0A0D3Q4U5), CSC83_07060 (Uncharacterized protein)(Accession: A0A2L2EVY2), ydaF_2 (Ribosomal-protein-L7p-serine acetyltransferase)(Accession: A0A1D4MIM0), BTN44_15570 (Putative transposase)(Accession: B6V383), BN1321_380004 (DUF961 domain-containing protein)(Accession: A0A0U1MRA0), C7Q89_00130 (Protein-disulfide isomerase)(Accession: A0A2W2RV36), truB_2 (Fibronectin-binding protein A)(Accession: A0A0U1MF71), ecsA_2 (Lantibiotic transport ATP-binding protein)(Accession: A0A0U1MEQ0), SAMEA1708674_03752 (Cell division protein (Putative))(Accession: A0A1D3YL80), clpB (Chaperone protein ClpB)(Accession: A0A2W3CJ21), argG (Argininosuccinate synthase)(Accession: A0A0D6WAS8), saeR (Response regulator SaeR)(Accession: A0A0U1MFP7), EP54_11640 (DegV domain-containing protein)(Accession: A0A0D6HNG8), RK64_10785 (DNA-binding response regulator)(Accession: A0A2Y9TRS2), HMPREF3211_00240 (GntR family transcriptional regulator)(Accession: A0A133QB66), BSZ10_11980 (Transposon DNA-invertase)(Accession: A0A1Q8DB86), OX=1280 (Uncharacterized protein)(Accession: A0A2S1FUN9), mprF (Phosphatidylglycerol lysyltransferase)(Accession: A0A077UML1) 및 mnhE (Na(+) H(+) antiporter subunit E)(Accession: A0A077VW30)으로 이루어진 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 유전자 또는 상기 유전자가 코딩하는 단백질을 포함하는 메티실린 내성 또는 민감성 황색포도상구균 클론타입 판별용 바이오마커 조성물 |
| 2 |
2 제1항에 있어서, 상기 클론타입은 ST5 메티실린 내성 황색포도상구균 (ST5 MRSA), ST72 메티실린 내성 황색포도상구균 (ST72 MRSA), ST5 메티실린 민감성 황색포도상구균 (ST5 MSSA) 및 ST72 메티실린 민감성 황색포도상구균 (ST72 MSSA)로 이루어진 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는 메티실린 내성 또는 민감성 황색포도상구균 클론타입 판별용 바이오마커 조성물 |
| 3 |
3 aacA (Aminoglycoside phosphotransferase APH(3'))(Accession: D3X7Z4), ermA (23S rRNA (Adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(B))(Accession: Q7DIC2), ant(9)(Streptomycin 3''-adenylyltransferase)(Accession: Q7DIC3), NCTC11940_00344 (Protein of uncharacterized function (DUF3644))(Accession: A0A2X3P763), CSC83_13340 (Capsular biosynthesis protein)(Accession: A0A2S6DTY7), ERS072840_00987 (Phage repressor protein)(Accession: A0A167QYC2), hmp (Flavohemoprotein)(Accession: A0A1D4MV18), SAP027A_009 (Antiseptic resistance protein)(Accession: D2J776), BN1321_390017 (Uncharacterized protein)(Accession: A0A0U1MRY5), CSC83_06955 (Phage major capsid protein)(Accession: A0A2S6DEN9), mecR1 (Methicillin resistance regulatory sensor-transducer MecR1)(Accession: A0A2Y2RBM2), cydA (Cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I)(Accession: A0A167UFF7), lytS (Autolysis histidine kinase LytS)(Accession: A0A131JSM9), SAMEA2445518_01017 (Hypothetical phage-related protein)(Accession: A0A0U1MY60), SAMEA1708674_03678 (Cell division inhibitor)(Accession: A0A2W2UEW9), capC (Tyrosine-protein phosphatase)(Accession: A0A0U1MX93), BTN44_14990 (Lipoprotein)(Accession: A0A0D3QB23), C0J46_00500 (Transcriptional regulator)(Accession: A0A2W3FHQ4), rbsK (Ribokinase)(Accession: A0A2Y2LM71), ERS140147_00739 (Membrane protein)(Accession: A0A077VLJ7), bglA (6-phospho-beta-glucosidase)(Accession: A0A0D6GG52), pyrR (Bifunctional protein PyrR)(Accession: W8U6N8), vraR (DNA-binding response regulator)(Accession: D9IFM7), yxeP_2 (Carboxypeptidase, M20(D) family)(Accession: A0A0U1MEH9), orfX (Ribosomal RNA large subunit methyltransferase H)(Accession: A0A068W8S1), aroA (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)(Accession: A0A133PU31), queF (NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase)(Accession: A0A077V3Q2), ydfH (Gluconate operon transcriptional repressor)(Accession: A0A1D4Q3C3), C7Q89_10110 (Abortive phage resistance protein)(Accession: B2Y834), rpsC (30S ribosomal protein S3)(Accession: A0A1Q8DBU3), traP (Signal transduction protein TRAP)(Accession: A0A0U1N0V2), BSZ10_08125 (Alkaline-shock protein)(Accession: A0A1Q8DDB2), SAP059A_003 (Antiadhesin Pls, binding to squamous nasal epithelial cells)(Accession: D2JDZ0), panB (3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase)(Accession: A0A0Z1DQN8), rpsO (30S ribosomal protein S15)(Accession: A0A077VJU6), SAMEA1708674_01891 (Enterotoxin)(Accession: A0A1D4MQV2), ndk (Nucleoside diphosphate kinase)(Accession: A0A0U1MN06), SAMEA1708674_00628 (Short-chain alcohol dehydrogenase)(Accession: A0A1D4IQF8), sbi (Immunoglobulin-binding protein sbi)(Accession: A0A0U1MSJ9), parB_2 (Chromosome partitioning protein ParB)(Accession: A0A0D3Q4U5), CSC83_07060 (Uncharacterized protein)(Accession: A0A2L2EVY2), ydaF_2 (Ribosomal-protein-L7p-serine acetyltransferase)(Accession: A0A1D4MIM0), BTN44_15570 (Putative transposase)(Accession: B6V383), BN1321_380004 (DUF961 domain-containing protein)(Accession: A0A0U1MRA0), C7Q89_00130 (Protein-disulfide isomerase)(Accession: A0A2W2RV36), truB_2 (Fibronectin-binding protein A)(Accession: A0A0U1MF71), ecsA_2 (Lantibiotic transport ATP-binding protein)(Accession: A0A0U1MEQ0), SAMEA1708674_03752 (Cell division protein (Putative))(Accession: A0A1D3YL80), clpB (Chaperone protein ClpB)(Accession: A0A2W3CJ21), argG (Argininosuccinate synthase)(Accession: A0A0D6WAS8), saeR (Response regulator SaeR)(Accession: A0A0U1MFP7), EP54_11640 (DegV domain-containing protein)(Accession: A0A0D6HNG8), RK64_10785 (DNA-binding response regulator)(Accession: A0A2Y9TRS2), HMPREF3211_00240 (GntR family transcriptional regulator)(Accession: A0A133QB66), BSZ10_11980 (Transposon DNA-invertase)(Accession: A0A1Q8DB86), OX=1280 (Uncharacterized protein)(Accession: A0A2S1FUN9), mprF (Phosphatidylglycerol lysyltransferase)(Accession: A0A077UML1) 및 mnhE (Na(+) H(+) antiporter subunit E)(Accession: A0A077VW30) 으로 이루어진 어느 하나 이상의 유전자에 특이적으로 결합하는 프로브, 상기 유전자를 증폭하기 위한 프라이머, 상기 유전자가 코딩하는 단백질에 특이적으로 결합하는 항체 또는 상기 단백질에 특이적인 결합 도메인을 갖는 펩티드를 포함하는 메티실린 내성 또는 민감성 황색포도상구균 클론타입 판별용 키트 |
| 4 |
4 제2항에 있어서, 상기 키트는 RT-PCR 키트, DNA 칩 키트 또는 단백질 칩 키트인 것을 특징으로 하는 메티실린 내성 또는 민감성 황색포도상구균 클론타입 판별용 키트 |
| 5 |
5 검체로부터 분리된 생물학적 시료로부터 aacA (Aminoglycoside phosphotransferase APH(3'))(Accession: D3X7Z4), ermA (23S rRNA (Adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(B))(Accession: Q7DIC2), ant(9)(Streptomycin 3''-adenylyltransferase)(Accession: Q7DIC3), NCTC11940_00344 (Protein of uncharacterized function (DUF3644))(Accession: A0A2X3P763), CSC83_13340 (Capsular biosynthesis protein)(Accession: A0A2S6DTY7), ERS072840_00987 (Phage repressor protein)(Accession: A0A167QYC2), hmp (Flavohemoprotein)(Accession: A0A1D4MV18), SAP027A_009 (Antiseptic resistance protein)(Accession: D2J776), BN1321_390017 (Uncharacterized protein)(Accession: A0A0U1MRY5), CSC83_06955 (Phage major capsid protein)(Accession: A0A2S6DEN9), mecR1 (Methicillin resistance regulatory sensor-transducer MecR1)(Accession: A0A2Y2RBM2), cydA (Cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I)(Accession: A0A167UFF7), lytS (Autolysis histidine kinase LytS)(Accession: A0A131JSM9), SAMEA2445518_01017 (Hypothetical phage-related protein)(Accession: A0A0U1MY60), SAMEA1708674_03678 (Cell division inhibitor)(Accession: A0A2W2UEW9), capC (Tyrosine-protein phosphatase)(Accession: A0A0U1MX93), BTN44_14990 (Lipoprotein)(Accession: A0A0D3QB23), C0J46_00500 (Transcriptional regulator)(Accession: A0A2W3FHQ4), rbsK (Ribokinase)(Accession: A0A2Y2LM71), ERS140147_00739 (Membrane protein)(Accession: A0A077VLJ7), bglA (6-phospho-beta-glucosidase)(Accession: A0A0D6GG52), pyrR (Bifunctional protein PyrR)(Accession: W8U6N8), vraR (DNA-binding response regulator)(Accession: D9IFM7), yxeP_2 (Carboxypeptidase, M20(D) family)(Accession: A0A0U1MEH9), orfX (Ribosomal RNA large subunit methyltransferase H)(Accession: A0A068W8S1), aroA (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)(Accession: A0A133PU31), queF (NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase)(Accession: A0A077V3Q2), ydfH (Gluconate operon transcriptional repressor)(Accession: A0A1D4Q3C3), C7Q89_10110 (Abortive phage resistance protein)(Accession: B2Y834), rpsC (30S ribosomal protein S3)(Accession: A0A1Q8DBU3), traP (Signal transduction protein TRAP)(Accession: A0A0U1N0V2), BSZ10_08125 (Alkaline-shock protein)(Accession: A0A1Q8DDB2), SAP059A_003 (Antiadhesin Pls, binding to squamous nasal epithelial cells)(Accession: D2JDZ0), panB (3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase)(Accession: A0A0Z1DQN8), rpsO (30S ribosomal protein S15)(Accession: A0A077VJU6), SAMEA1708674_01891 (Enterotoxin)(Accession: A0A1D4MQV2), ndk (Nucleoside diphosphate kinase)(Accession: A0A0U1MN06), SAMEA1708674_00628 (Short-chain alcohol dehydrogenase)(Accession: A0A1D4IQF8), sbi (Immunoglobulin-binding protein sbi)(Accession: A0A0U1MSJ9), parB_2 (Chromosome partitioning protein ParB)(Accession: A0A0D3Q4U5), CSC83_07060 (Uncharacterized protein)(Accession: A0A2L2EVY2), ydaF_2 (Ribosomal-protein-L7p-serine acetyltransferase)(Accession: A0A1D4MIM0), BTN44_15570 (Putative transposase)(Accession: B6V383), BN1321_380004 (DUF961 domain-containing protein)(Accession: A0A0U1MRA0), C7Q89_00130 (Protein-disulfide isomerase)(Accession: A0A2W2RV36), truB_2 (Fibronectin-binding protein A)(Accession: A0A0U1MF71), ecsA_2 (Lantibiotic transport ATP-binding protein)(Accession: A0A0U1MEQ0), SAMEA1708674_03752 (Cell division protein (Putative))(Accession: A0A1D3YL80), clpB (Chaperone protein ClpB)(Accession: A0A2W3CJ21), argG (Argininosuccinate synthase)(Accession: A0A0D6WAS8), saeR (Response regulator SaeR)(Accession: A0A0U1MFP7), EP54_11640 (DegV domain-containing protein)(Accession: A0A0D6HNG8), RK64_10785 (DNA-binding response regulator)(Accession: A0A2Y9TRS2), HMPREF3211_00240 (GntR family transcriptional regulator)(Accession: A0A133QB66), BSZ10_11980 (Transposon DNA-invertase)(Accession: A0A1Q8DB86), OX=1280 (Uncharacterized protein)(Accession: A0A2S1FUN9), mprF (Phosphatidylglycerol lysyltransferase)(Accession: A0A077UML1) 및 mnhE (Na(+) H(+) antiporter subunit E)(Accession: A0A077VW30)으로 이루어진 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 mRNA 발현 수준 또는 상기 유전자가 코딩하는 단백질의 발현 수준을 확인하는 단계; 및 상기 유전자의 mRNA 발현 수준 또는 상기 유전자가 코딩하는 단백질의 발현 수준을 대조군과 비교하는 단계를 포함하는 메티실린 내성 또는 민감성 황색포도상구균 클론타입 판별방법 |
| 6 |
6 제5항에 있어서, 상기 유전자의 mRNA 발현 수준 또는 상기 유전자가 코딩하는 단백질의 발현 수준을 대조군과 비교하는 단계는 검체로부터 분리된 생물학적 시료의 aacA (Aminoglycoside phosphotransferase APH(3'))(Accession: D3X7Z4), ermA (23S rRNA (Adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(B))(Accession: Q7DIC2), ant(9)(Streptomycin 3''-adenylyltransferase)(Accession: Q7DIC3), NCTC11940_00344 (Protein of uncharacterized function (DUF3644))(Accession: A0A2X3P763), CSC83_13340 (Capsular biosynthesis protein)(Accession: A0A2S6DTY7), ERS072840_00987 (Phage repressor protein)(Accession: A0A167QYC2), hmp (Flavohemoprotein)(Accession: A0A1D4MV18), SAP027A_009 (Antiseptic resistance protein)(Accession: D2J776), BN1321_390017 (Uncharacterized protein)(Accession: A0A0U1MRY5), CSC83_06955 (Phage major capsid protein)(Accession: A0A2S6DEN9), mecR1 (Methicillin resistance regulatory sensor-transducer MecR1)(Accession: A0A2Y2RBM2), cydA (Cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I)(Accession: A0A167UFF7), lytS (Autolysis histidine kinase LytS)(Accession: A0A131JSM9), SAMEA2445518_01017 (Hypothetical phage-related protein)(Accession: A0A0U1MY60), SAMEA1708674_03678 (Cell division inhibitor)(Accession: A0A2W2UEW9), capC (Tyrosine-protein phosphatase)(Accession: A0A0U1MX93), BTN44_14990 (Lipoprotein)(Accession: A0A0D3QB23), C0J46_00500 (Transcriptional regulator)(Accession: A0A2W3FHQ4), rbsK (Ribokinase)(Accession: A0A2Y2LM71) 및 ERS140147_00739 (Membrane protein)(Accession: A0A077VLJ7)으로 이루어진 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 mRNA 발현 수준 또는 상기 유전자가 코딩하는 단백질의 발현 수준이 대조군보다 증가되면 ST5 타입 메티실린 내성 황색포도상구균 (ST5 MRSA)으로 판단하는 것을 특징으로 하는 메티실린 내성 또는 민감성 황색포도상구균 클론타입 판별방법 |
| 7 |
7 제5항에 있어서, 상기 유전자의 mRNA 발현 수준 또는 상기 유전자가 코딩하는 단백질의 발현 수준을 대조군과 비교하는 단계는 검체로부터 분리된 생물학적 시료의 bglA (6-phospho-beta-glucosidase)(Accession: A0A0D6GG52), pyrR (Bifunctional protein PyrR)(Accession: W8U6N8), vraR (DNA-binding response regulator)(Accession: D9IFM7), yxeP_2 (Carboxypeptidase, M20(D) family)(Accession: A0A0U1MEH9), orfX (Ribosomal RNA large subunit methyltransferase H)(Accession: A0A068W8S1), aroA (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)(Accession: A0A133PU31), queF (NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase)(Accession: A0A077V3Q2), ydfH (Gluconate operon transcriptional repressor)(Accession: A0A1D4Q3C3), C7Q89_10110 (Abortive phage resistance protein)(Accession: B2Y834) 및 rpsC (30S ribosomal protein S3)(Accession: A0A1Q8DBU3)으로 이루어진 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 mRNA 발현 수준 또는 상기 유전자가 코딩하는 단백질의 발현 수준이 대조군보다 증가되면 ST72 타입 메티실린 내성 황색포도상구균 (ST5 MRSA)으로 판단하는 것을 특징으로 하는 메티실린 내성 또는 민감성 황색포도상구균 클론타입 판별방법 |
| 8 |
8 제5항에 있어서, 상기 유전자의 mRNA 발현 수준 또는 상기 유전자가 코딩하는 단백질의 발현 수준을 대조군과 비교하는 단계는 검체로부터 분리된 생물학적 시료의 traP (Signal transduction protein TRAP)(Accession: A0A0U1N0V2), BSZ10_08125 (Alkaline-shock protein)(Accession: A0A1Q8DDB2), SAP059A_003 (Antiadhesin Pls, binding to squamous nasal epithelial cells)(Accession: D2JDZ0), panB (3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase)(Accession: A0A0Z1DQN8), rpsO (30S ribosomal protein S15)(Accession: A0A077VJU6), SAMEA1708674_01891 (Enterotoxin)(Accession: A0A1D4MQV2), ndk (Nucleoside diphosphate kinase)(Accession: A0A0U1MN06), SAMEA1708674_00628 (Short-chain alcohol dehydrogenase)(Accession: A0A1D4IQF8), sbi (Immunoglobulin-binding protein sbi)(Accession: A0A0U1MSJ9), parB_2 (Chromosome partitioning protein ParB)(Accession: A0A0D3Q4U5), CSC83_07060 (Uncharacterized protein)(Accession: A0A2L2EVY2), ydaF_2 (Ribosomal-protein-L7p-serine acetyltransferase)(Accession: A0A1D4MIM0), BTN44_15570 (Putative transposase)(Accession: B6V383), BN1321_380004 (DUF961 domain-containing protein)(Accession: A0A0U1MRA0), C7Q89_00130 (Protein-disulfide isomerase)(Accession: A0A2W2RV36), truB_2 (Fibronectin-binding protein A)(Accession: A0A0U1MF71), ecsA_2 (Lantibiotic transport ATP-binding protein)(Accession: A0A0U1MEQ0) 및 SAMEA1708674_03752 (Cell division protein (Putative))(Accession: A0A1D3YL80)으로 이루어진 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 mRNA 발현 수준 또는 상기 유전자가 코딩하는 단백질의 발현 수준이 대조군보다 증가되면 ST5 타입 메티실린 민감성 황색포도상구균 (ST5 MSSA)으로 판단하는 것을 특징으로 하는 메티실린 내성 또는 민감성 황색포도상구균 클론타입 판별방법 |
| 9 |
9 제5항에 있어서, 상기 유전자의 mRNA 발현 수준 또는 상기 유전자가 코딩하는 단백질의 발현 수준을 대조군과 비교하는 단계는 검체로부터 분리된 생물학적 시료의 clpB (Chaperone protein ClpB)(Accession: A0A2W3CJ21), argG (Argininosuccinate synthase)(Accession: A0A0D6WAS8), saeR (Response regulator SaeR)(Accession: A0A0U1MFP7), EP54_11640 (DegV domain-containing protein)(Accession: A0A0D6HNG8), RK64_10785 (DNA-binding response regulator)(Accession: A0A2Y9TRS2), HMPREF3211_00240 (GntR family transcriptional regulator)(Accession: A0A133QB66), BSZ10_11980 (Transposon DNA-invertase)(Accession: A0A1Q8DB86), OX=1280 (Uncharacterized protein)(Accession: A0A2S1FUN9), mprF (Phosphatidylglycerol lysyltransferase)(Accession: A0A077UML1) 및 mnhE (Na(+) H(+) antiporter subunit E)(Accession: A0A077VW30)으로 이루어진 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 mRNA 발현 수준 또는 상기 유전자가 코딩하는 단백질의 발현 수준이 대조군보다 증가되면 ST72 타입 메티실린 민감성 황색포도상구균 (ST72 MSSA)으로 판단하는 것을 특징으로 하는 메티실린 내성 또는 민감성 황색포도상구균 클론타입 판별방법 |
| 10 |
10 제5항에 있어서, 상기 유전자의 mRNA 발현 수준을 확인하는 방법은 RT-PCR, 경쟁적 RT-PCR (Competitive RT-PCR), 실시간 RT-PCR (Real-time RT-PCR), RNase 보호 분석법 (RPA; RNase protection assay), 노던 블랏팅 (Northern blotting) 및 DNA 칩으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나를 이용하는 것을 특징으로 하는 메티실린 내성 또는 민감성 황색포도상구균 클론타입 판별방법 |
| 11 |
11 제5항에 있어서, 상기 단백질의 발현 수준을 확인하는 방법은 웨스턴 블랏, ELISA(enzyme linked immunosorbent asay), 방사선면역분석(Radioimmunoassay; RIA), 방사면역확산법(radioimmunodiffusion), 오우크테로니(Ouchterlony) 면역 확산법, 로케이트(rocket) 면역전기영동, 조직면역염색, 면역침전 분석법 (Immunoprecipitation assay), 보체고정분석법 (Complement Fixation Assay), FACS, 질량분석법(Mass spectrometry) 및 단백질 칩으로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나를 이용하는 것을 특징으로 하는 메티실린 내성 또는 민감성 황색포도상구균 클론타입 판별방법 |
| 지정국 정보가 없습니다 |
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| 패밀리정보가 없습니다 |
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| 순번 | 연구부처 | 주관기관 | 연구사업 | 연구과제 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 보건복지부 | 울산대학교 산학협력단 | 질환극복기술개발 | MRSA 감염에서 면역단백체학을 기반으로 발굴된 바이오마커의 임상적 활용 연구 |
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| 번호 | 서류명 | 접수/발송일자 | 처리상태 | 접수/발송번호 |
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| 1 | [특허출원]특허출원서 | 2019.12.26 | 수리 (Accepted) | 1-1-2019-1342492-54 |
| 2 | [출원서 등 보정]보정서 | 2019.12.27 | 수리 (Accepted) | 1-1-2019-1348561-46 |
| 3 | 보정요구서 | 2020.01.07 | 발송처리완료 (Completion of Transmission) | 1-5-2020-0003884-14 |
| 4 | [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서 | 2020.02.07 | 수리 (Accepted) | 1-1-2020-0130622-22 |
| 5 | [출원서 등 보정]보정서 | 2020.02.25 | 수리 (Accepted) | 1-1-2020-0198722-61 |
| 6 | 출원인정보변경(경정)신고서 | 2020.07.10 | 수리 (Accepted) | 4-1-2020-5154267-54 |
| 7 | 선행기술조사의뢰서 | 2020.07.14 | 수리 (Accepted) | 9-1-9999-9999999-89 |
| 8 | 출원인정보변경(경정)신고서 | 2020.07.31 | 수리 (Accepted) | 4-1-2020-5172343-48 |
| 9 | 선행기술조사보고서 | 2020.09.10 | 발송처리완료 (Completion of Transmission) | 9-6-2020-0183514-45 |
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