| 1 |
1
갑상선암의 진단 또는 갑상선암의 예후 판단에 필요한 정보를 제공하기 위하여, 분석 대상 시료로부터 얻은 지놈 DNA의 갑상선암 바이오마커 CpG 부위에 대해 메틸화 수준을 분석하는 방법으로서, 상기 갑상선암 바이오마커 CpG 부위는 (i) MICAL2(Microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 2); (ⅱ) LURAP1L-AS1(LURAP1L antisense RNA 1); (ⅲ) PKM2(Pyruvate kinase M2); (ⅳ) LTBP1(Latent-transforming growth factor beta-binding protein 1); (ⅴ) MMP7(Matrix metalloproteinase-7); (ⅵ) EIF4E(Eukaryotic translation initiation factor 4E); (ⅶ) DIAPH1(Protein diaphanous homolog 1); 및 (ⅷ) LOC100507487(long intergenic non-protein coding RNA 2615)으로 이루어지는 군에서 선택되는 유전자에 존재하는 것을 특징으로 하는 메틸화 수준을 분석하는 방법
|
| 2 |
2
제 1 항에 있어서, 상기 갑상선암 바이오마커 CpG 부위는 HumanEPIC BeadChip에서 Illumina ID로 표시되는, cg10705422, cg15441605, cg24327132, cg16336556, cg17707274, cg06034194, cg21341586, cg26849382 및 cg05763918로 이루어지는 군에서 선택되는 하나 이상의 CpC 부위인 것을 특징으로 하는 메틸화 수준을 분석하는 방법
|
| 3 |
3
제 1 항에 있어서, 상기 갑상선암 바이오마커 CpG 부위의 메틸화 수준이 ROC 곡선 분석에 의해 설정된 컷-오프 값보다 낮은 경우 갑상선암을 지시하거나 갑상선암의 재발율 증가, 림프절 전이 증가 및 높은 암병기 중 어느 하나를 지시하는 것을 특징으로 하는 메틸화 수준을 분석하는 방법
|
| 4 |
4
제 1 항에 있어서, 상기 갑상선암의 진단은 갑상선암의 병기 판단을 포함하고, 상기 갑상선암의 예후는 갑상선암의 재발율을 포함하는 것을 특징으로 하는 메틸화 수준을 분석하는 방법
|
| 5 |
5
제 1 항에 있어서, 상기 메틸화 수준의 분석은 분석 대상 시료로부터 얻은 지놈 DNA에 대해 바이설파이트(bisulfite)를 처리하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 메틸화 수준을 분석하는 방법
|
| 6 |
6
제 1 항에 있어서, 상기 메틸화 수준의 분석은 상기 갑상선암 바이오마커 CpG 부위를 포함하는 단편을 증폭하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 메틸화 수준을 분석하는 방법
|
| 7 |
7
제 1 항에 있어서, 상기 메틸화 수준의 분석은 파이로시퀀싱(pyrosequencing) 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 메틸화 수준을 분석하는 방법
|
| 8 |
8
(i) MICAL2(Microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 2); (ⅱ) LURAP1L-AS1(LURAP1L antisense RNA 1); (ⅲ) PKM2(Pyruvate kinase M2); (ⅳ) LTBP1(Latent-transforming growth factor beta-binding protein 1); (ⅴ) MMP7(Matrix metalloproteinase-7); (ⅵ) EIF4E(Eukaryotic translation initiation factor 4E); (ⅶ) DIAPH1(Protein diaphanous homolog 1); 및 (ⅷ) LOC100507487(long intergenic non-protein coding RNA 2615)으로 이루어지는 군에서 선택되는 유전자에 존재하는 갑상선암 바이오마커 CpG 부위의 메틸화 수준을 분석할 수 있는 물질을 포함하는 갑상선암의 진단용 또는 갑상선암의 예후 판단용 조성물
|
| 9 |
9
제 8 항에 있어서, 상기 갑상선암 바이오마커 CpG 부위는 HumanEPIC BeadChip에서 Illumina ID로 표시되는, cg10705422, cg15441605, cg24327132, cg16336556, cg17707274, cg06034194, cg21341586, cg26849382 및 cg05763918로 이루어지는 군에서 선택되는 하나 이상의 CpC 부위인 것을 특징으로 하는 갑상선암의 진단용 또는 갑상선암의 예후 판단용 조성물
|
| 10 |
10
제 8 항에 있어서, 갑상선암 바이오마커 CpG 부위의 메틸화 수준을 분석할 수 있는 물질은 상기 CpG 부위를 포함하는 단편을 증폭할 수 있는 프라이머쌍인 것을 특징으로 하는 갑상선암의 진단용 또는 갑상선암의 예후 판단용 조성물
|
| 11 |
11
제 10 항에 있어서, 상기 프라이머쌍에 의해 증폭된 증폭 산물을 시퀀싱하기 위한 시퀀싱 프라이머를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 갑상선암의 진단용 또는 갑상선암의 예후 판단용 조성물
|
