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선택적 스플라이싱 예측을 위한 분산 특징 표현에 기반한 딥러닝 모델

  • 기술번호 : KST2020017243
  • 담당센터 : 광주기술혁신센터
  • 전화번호 : 062-360-4654
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 RNA시퀀스 데이터를 정량화하고, RNA시퀀스 데이터를 단어로 생성하여 기 학습된 자연어처리모델을 통해 특징 표현으로 매핑하여 선택적 스플라이싱을 예측하는 분산 특징 표현에 기반한 딥러닝 모델에 관한 것이다. 본 발명은 컨볼루션 네트워크와 다충 퍼셉트론의 모델을 제안하며, 두 가지 자연어 처리 기술인 word2ver와 doc2ver의 학습을 통해 카세트 엑숀으로부터 분산된 특징 표현을 학습하는 모델을 제시함으로서 사전 정의된 특징 추출을 회피하여 기존의 방법들보다 높은 정밀도를 가질 수 있는 효과가 있다.
Int. CL G16B 25/10 (2019.01.01) G16B 20/20 (2019.01.01) G16B 30/00 (2019.01.01)
CPC G16B 25/10(2013.01) G16B 20/20(2013.01) G16B 30/00(2013.01)
출원번호/일자 1020190053524 (2019.05.08)
출원인 전북대학교산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2020-0129313 (2020.11.18) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2019.05.08)
심사청구항수 5

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 전북대학교산학협력단 대한민국 전라북도 전주시 덕진구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 정길도 대한민국 전라북도 전주시 덕진구
2 우부니 마네드 전라북도 전주시 덕진구
3 루아디 자카리 전라북도 전주시 덕진구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 홍성일 대한민국 대전광역시 서구 둔산중로 **, *층 ***호 국제특허법률사무소 태상 (둔산동, 인곡타워)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2019.05.08 수리 (Accepted) 1-1-2019-0467967-58
2 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.07.23 수리 (Accepted) 4-1-2019-5146986-17
3 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.07.23 수리 (Accepted) 4-1-2019-5146985-61
4 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.10.22 수리 (Accepted) 4-1-2019-5219602-91
5 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2020.07.06 수리 (Accepted) 4-1-2020-5149086-79
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번호 청구항
1 1
카세트 엑손으로 구성되는 데이터 세트로부터 RNA시퀀스 데이터를 정렬 및 스플라이싱 포함 비율(PSI)을 정량화하고, 상기 RNA시퀀스 데이터를 기 설정된 크기의 단어로 생성하는 데이터전처리부;기 학습된 자연어처리모델을 통해 상기 생성된 단어를 특징 표현으로 매핑하는 특징표현부; 및상기 특징 표현과 입력된 조직 유형으로부터 선택적 스플라이싱을 예측하는 딥러닝 기반의 스플라이싱예측부;을 포함하는 것을 특징으로 하는 선택적 스플라이싱 예측을 위한 분산 특징 표현에 기반한 딥러닝 모델
2 2
제1항에 있어서, 상기 데이터전처리부는엑숀사이에 구비된 인트론이 기 설정된 길이를 초과하면, 상기 각 인트론의 길이를 기 설정된 크기로 지정하여 카세트 엑숀으로 처리하는 것을 특징으로 하는 선택적 스플라이싱 예측을 위한 분산 특징 표현에 기반한 딥러닝 모델
3 3
제1항에 있어서,상기 자연어처리모델은 게놈의 유전자 특징이 분류된 코퍼스로부터 기 설정된 개수의 염색체로 분할하는 염색체분할부;상기 염색체에 대응되는 각각의 문장을 형성하며, 상기 문장을 기 설정된 크기의 또 다른 단어로 생성하는 단어생성부;복수의 단어 컨테스트를 기반으로 상기 각 문장내의 또 다른 단어를 벡터로 출력하는 제1자연어처리모델; 및 상기 각 문장 및 문서를 고정된 치수벡터로 출력하는 제2자연어처리모델;을 포함하는 것을 특징으로 하는 선택적 스플라이싱 예측을 위한 분산 특징 표현에 기반한 딥러닝 모델
4 4
제3항에 있어서, 상기 스플라이싱예측부는상기 제1자연어처리모델에서 매핑된 특징 벡터가 입력되는 입력레이어; 상기 특징 벡터에 32x32 컨볼루션을 적용하며, 크기 조정하여 특징을 표준화하기 위한 배치 정규화로 이루어지는 제1레이어;상기 제1레이어에서 출력된 값에 1x1 콘볼루션 적용하며, 2x2 맥스플링과 1x1, 3x3, 5x5 컨볼루션이 포함된 활성화 함수로 이루어지는 적어도 하나의 제2레이어;상기 특징 표현 및 상기 조직 유형에 따라 입력되는 상기 카세트 엑숀의 상기 스플라이싱 포함 비율(PSI)값을 예측하는 스플라이싱예측모델; 및 미리 지정된 클래스 레이블을 통해 상기 스플라이싱 포함 비율(PSI)값을 낮음, 중간 및 높음 중 어느 하나로 분류하여 출력하는 스플라이싱분류모델;로 구성되는 인셉션 컨볼루션 신경망모델을 포함하는 것을 특징으로 하는 선택적 스플라이싱 예측을 위한 분산 특징 표현에 기반한 딥러닝 모델
5 5
제3항에 있어서, 상기 스플라이싱예측부는상기 제2자연어처리모델에서 매핑된 또 다른 특징 벡터가 입력되되,피드포워드 심층 신경망으로 구성되고, 시그모이드 활성화함수를 통해 입력되는 상기 카세트 엑숀의 상기 스플라이싱 포함 비율(PSI)값을 예측하며, 소프트맥스 활성화 함수를 통해 상기 스플라이싱 포함 비율(PSI)값을 낮음, 중간 또는 높음 중 어느 하나로 분류하여 출력하는 다층 퍼셉트론모델을 포함하는 것을 특징으로 하는 선택적 스플라이싱 예측을 위한 분산 특징 표현에 기반한 딥러닝 모델
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 과학기술정보통신부 전북대학교 뇌과학원천기술개발(R&D) 인공지능을 이용한 자연지능 및 뇌질환 유발 유전자 규명