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서열번호 1 내지 6의 프라이머를 포함하는, 결핵균(Mycobacterium tuberculosis) 검출용 LAMP(Loop-mediated isothermal amplification) 프라이머 세트
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제1항에 있어서, 상기 서열번호 5의 프라이머는 15번째 염기인 티민(thymine)에 형광물질이 부착된 것을 특징으로 하는, 결핵균 검출용 LAMP 프라이머 세트
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제2항에 있어서, 상기 형광물질은 FAM(6-carboxyfluorescein), 텍사스 레드(texas red), 플루오레신(fluorescein), HEX(2',4',5',7'-tetrachloro-6-carboxy-4,7-dichlorofluorescein), 플루오레신 클로로트리아지닐(fluorescein chlorotriazinyl), 로다민 그린(rhodamine green), 로다민 레드(rhodamine red), 테트라메틸 로다민(tetramethyl rhodamine), FITC(fluorescein isothiocyanate), 오레곤 그린(oregon green), 알렉사 플루오로(alexa fluor), JOE(6-Carboxy-4',5'-Dichloro-2',7'-Dimethoxyfluorescein), ROX(6-Carboxyl-XRhodamine), TET(Tetrachloro-Fluorescein), TRITC(tertramethylrodamine isothiocyanate), TAMRA(6-carboxytetramethyl-rhodamine), NED(N-(1-Naphthyl) ethylenediamine), 시아닌(Cyanine) 계열 염료 및 씨아디카르보시아닌(thiadicarbocyanine)으로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상인 것을 특징으로 하는, 결핵균 검출용 LAMP 프라이머 세트
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4
서열번호 7 내지 12의 프라이머를 포함하는, 결핵균(Mycobacterium tuberculosis) 및 비결핵항산균(Nontuberculous mycobacteria) 검출용 LAMP(Loop-mediated isothermal amplification) 프라이머 세트
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5
제4항에 있어서,상기 서열번호 11의 프라이머는 18번째 염기인 티민(thymine)에 형광물질이 부착된 것을 특징으로 하는, 결핵균 및 비결핵항상균 검출용 LAMP 프라이머 세트
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6
제5항에 있어서,상기 형광물질은 FAM(6-carboxyfluorescein), 텍사스 레드(texas red), 플루오레신(fluorescein), HEX(2',4',5',7'-tetrachloro-6-carboxy-4,7-dichlorofluorescein), 플루오레신 클로로트리아지닐(fluorescein chlorotriazinyl), 로다민 그린(rhodamine green), 로다민 레드(rhodamine red), 테트라메틸 로다민(tetramethyl rhodamine), FITC(fluorescein isothiocyanate), 오레곤 그린(oregon green), 알렉사 플루오로(alexa fluor), JOE(6-Carboxy-4',5'-Dichloro-2',7'-Dimethoxyfluorescein), ROX(6-Carboxyl-XRhodamine), TET(Tetrachloro-Fluorescein), TRITC(tertramethylrodamine isothiocyanate), TAMRA(6-carboxytetramethyl-rhodamine), NED(N-(1-Naphthyl) ethylenediamine), 시아닌(Cyanine) 계열 염료 및 씨아디카르보시아닌(thiadicarbocyanine)으로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상인 것을 특징으로 하는, 결핵균 및 비결핵항상균 검출용 LAMP 프라이머 세트
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7
제1항의 프라이머 세트와 제4항의 프라이머 세트를 포함하는, 결핵균(Mycobacterium tuberculosis) 및 비결핵항산균(Nontuberculous mycobacteria) 감별 검출용 LAMP(Loop-mediated isothermal amplification) 프라이머 세트
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8
제7항에 있어서, 상기 프라이머 세트는 서열번호 13 내지 18의 프라이머를 추가로 포함하는 것을 특징으로 하는, 결핵균 및 비결핵항산균 감별 검출용 LAMP 프라이머 세트
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9
제8항에 있어서, 상기 서열번호 5, 11, 및 18의 프라이머는 형광물질이 부착된 것을 특징으로 하는, 결핵균 및 비결핵항산균 감별 검출용 LAMP 프라이머 세트
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10
제9항에 있어서, 상기 서열번호 5의 15번째 염기인 티민(thymine)에 형광물질이 부착되었고, 상기 서열번호 11의 18번째 염기인 티민에 형광물질이 부착되었고, 상기 서열번호 18의 18번째 염기인 티민에 형광물질이 부착된 것을 특징으로 하는, 결핵균 및 비결핵항상균 감별 검출용 LAMP 프라이머 세트
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11
제9항에 있어서,상기 형광물질은 FAM(6-carboxyfluorescein), 텍사스 레드(texas red), 플루오레신(fluorescein), HEX(2',4',5',7'-tetrachloro-6-carboxy-4,7-dichlorofluorescein), 플루오레신 클로로트리아지닐(fluorescein chlorotriazinyl), 로다민 그린(rhodamine green), 로다민 레드(rhodamine red), 테트라메틸 로다민(tetramethyl rhodamine), FITC(fluorescein isothiocyanate), 오레곤 그린(oregon green), 알렉사 플루오로(alexa fluor), JOE(6-Carboxy-4',5'-Dichloro-2',7'-Dimethoxyfluorescein), ROX(6-Carboxyl-XRhodamine), TET(Tetrachloro-Fluorescein), TRITC(tertramethylrodamine isothiocyanate), TAMRA(6-carboxytetramethyl-rhodamine), NED(N-(1-Naphthyl) ethylenediamine), 시아닌(Cyanine) 계열 염료 및 씨아디카르보시아닌(thiadicarbocyanine)으로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상인 것을 특징으로 하는, 결핵균 및 비결핵항산균 감별 검출용 LAMP 프라이머 세트
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12
제10항에 있어서, 상기 서열번호 5, 11, 및 18에 부착된 형광물질은 각각 상이한 파장을 발하는 형광물질인 것을 특징으로 하는, 결핵균 및 비결핵항상균 감별 검출용 LAMP 프라이머 세트
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13
제7항의 프라이머 세트 및 증폭 반응을 수행하기 위한 시약을 포함하는, 결핵균 및 비결핵항산균 감별 검출용 키트
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14
제13항에 있어서, 상기 증폭 반응을 수행하기 위한 시약은 DNA 중합효소, dNTPs 및 버퍼로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상을 포함하는 것을 특징으로 하는, 결핵균 및 비결핵항산균 감별 검출용 키트
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(1) 생물학적 시료의 게놈 DNA(gDNA)를 분리하는 단계; (2) 상기 분리된 gDNA를 주형으로 하고 제7항의 프라이머 세트를 이용하여 등온증폭반응을 수행하여 표적 서열을 증폭하는 단계; 및(3) 상기 증폭된 산물을 검출하는 단계;를 포함하는 결핵균 및 비결핵항산균 감별 검출 방법
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제15항에 있어서,상기 (1) 단계의 생물학적 시료는 객담(sputum), 기관지 흡인(bronchial aspiration) 및 기관지세척액(bronchial washing), 및 체액(body fluid)으로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상인 것을 특징으로 하는, 결핵균 및 비결핵항상균 감별 검출 방법
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