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중합효소연쇄반응 및 DNA 라이게이션 반응을 기반으로 한 표적 점 돌연변이의 검출 방법

  • 기술번호 : KST2021005631
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 중합효소연쇄반응(Polymerase Chain Reaction, PCR)과 DNA 라이게이션 반응을 기반으로 한 염기서열의 표적 점 돌연변이의 검출 방법에 관한 것이며, 구체적으로 표적 점 돌연변이가 존재할 경우, 표적 점 돌연변이와 템플레이트가 환형 템플레이트를 형성하여 증폭반응을 수행하되, 증폭반응 중 생성된 생성물이 추가적인 증폭반응을 유도하여 반응 속도 및 민감도 증가효과를 가지는 표적 점 돌연변이의 검출 방법 및 상기 방법 구현을 위한 중합효소연쇄반응(Polymerase Chain Reaction, PCR)용 조성물에 관한 것으로, 본 발명에 따른 표적 점 변이 분석 방법은 각 표적 점 변이의 종류에 따라 준비된 템플레이트를 이용하여 다중 표적을 한 번의 반응으로 동시에 분석할 수 있을 뿐만 아니라, 염기 단위의 변위를 높은 민감도로 분석할 수 있어, 점 변이의 분석에 유용하다. 또한, 생성물의 길이가 일정하여 절단효소가 추가적으로 필요하지 않으며, 센서 표면에서 분석을 할 때에 프로브 바코드와 결합하는 생성물의 길이가 너무 길 경우 분석이 정확히 되지 않으나, 발명의 생성물은 일정한 길이를 가지기 때문에 기존의 다양한 유전자 분석 시스템을 사용할 수 있어, 유전자 변이의 검출에 유용하다.
Int. CL C12Q 1/6862 (2018.01.01)
CPC C12Q 1/6862(2013.01) C12Q 2531/137(2013.01) C12Q 2563/185(2013.01)
출원번호/일자 1020190142823 (2019.11.08)
출원인 고려대학교 산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2021-0056124 (2021.05.18) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2019.11.08)
심사청구항수 15

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 고려대학교 산학협력단 대한민국 서울특별시 성북구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 신세현 서울특별시 서초구
2 박찬희 전라북도 부안군
3 이호윤 서울특별시 성북구
4 나원휘 서울특별시 광진구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 최훈식 대한민국 서울특별시 금천구 가산디지털*로 *** (가산동) ****호(강한국제특허법률사무소)

최종권리자

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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2019.11.08 수리 (Accepted) 1-1-2019-1149854-51
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2020.03.09 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2020.04.06 수리 (Accepted) 9-1-2020-0013660-44
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2020.08.29 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2020-0594398-95
5 [지정기간연장]기간 연장신청서·기간 단축신청서·기간 경과 구제신청서·절차 계속신청서
2020.10.29 수리 (Accepted) 1-1-2020-1152258-44
6 [지정기간연장]기간 연장신청서·기간 단축신청서·기간 경과 구제신청서·절차 계속신청서
2020.11.30 수리 (Accepted) 1-1-2020-1288867-39
7 [지정기간연장]기간 연장신청서·기간 단축신청서·기간 경과 구제신청서·절차 계속신청서
2020.12.29 수리 (Accepted) 1-1-2020-1424124-93
8 [대리인선임]대리인(대표자)에 관한 신고서
[Appointment of Agent] Report on Agent (Representative)
2021.01.07 불수리 (Non-acceptance) 1-1-2021-0018071-15
9 [대리인선임]대리인(대표자)에 관한 신고서
[Appointment of Agent] Report on Agent (Representative)
2021.01.13 불수리 (Non-acceptance) 1-1-2021-0044479-83
10 [반려요청]서류 반려요청서·반환신청서
2021.01.13 수리 (Accepted) 1-1-2021-0044441-59
11 [대리인선임]대리인(대표자)에 관한 신고서
[Appointment of Agent] Report on Agent (Representative)
2021.01.13 수리 (Accepted) 1-1-2021-0044460-16
12 서류반려이유통지서
Notice of Reason for Return of Document
2021.01.13 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2021-0007698-56
13 서류반려통지서
Notice for Return of Document
2021.01.18 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2021-0010891-33
14 [대리인해임]대리인(대표자)에 관한 신고서
[Dismissal of Sub-agent] Report on Agent (Representative)
2021.01.25 불수리 (Non-acceptance) 1-1-2021-0095063-88
15 서류반려이유통지서
Notice of Reason for Return of Document
2021.01.25 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2021-0014632-18
16 [반려요청]서류 반려요청서·반환신청서
2021.01.28 수리 (Accepted) 1-1-2021-0112670-26
17 서류반려통지서
Notice for Return of Document
2021.01.28 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2021-0017623-22
18 [지정기간연장]기간 연장신청서·기간 단축신청서·기간 경과 구제신청서·절차 계속신청서
2021.01.29 수리 (Accepted) 1-1-2021-0119951-69
19 [반려요청]서류 반려요청서·반환신청서
2021.02.01 수리 (Accepted) 1-1-2021-0127252-06
20 서류반려이유통지서
Notice of Reason for Return of Document
2021.02.01 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2021-0018770-04
21 [대리인해임]대리인(대표자)에 관한 신고서
[Dismissal of Sub-agent] Report on Agent (Representative)
2021.02.04 수리 (Accepted) 1-1-2021-0144349-79
22 서류반려통지서
Notice for Return of Document
2021.02.04 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2021-0021289-14
23 지정기간연장 관련 안내서
Notification for Extension of Designated Period
2021.02.05 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2021-0022020-29
24 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2021.03.02 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2021-0241844-66
25 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견서·답변서·소명서
2021.03.02 수리 (Accepted) 1-1-2021-0241845-12
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번호 청구항
1 1
(a) 점 변이(point mutation)를 갖는 표적 시료를 제공하는 단계;(b) i) 표적 점 변이와 상보적으로 결합하는 표적 점 변이 결합 영역; ii) 프라이머 결합 영역; 및 iii) 바코드 생성 영역; 을 포함하는 템플레이트를 제공하고, 라이게이션을 수행하여, 환형 템플레이트를 형성하는 단계;(c) 상기 템플레이트의 프라이머 결합 영역에 상보적인 프라이머를 제공하여 중합효소연쇄반응을 수행하되, 증폭산물이 상기 (b) 단계에서 제공되는 템플레이트를 라이게이션시켜 환형 템플레이트를 추가적으로 형성하며; 상기 (b) 단계에서 생성된 환형 템플레이트의 프라이머 결합 영역에 상보적인 프라이머를 지속적으로 제공하여 지속적으로 증폭산물을 생성하는 단계; 및(d) 상기 (c) 단계에서 생성된 증폭산물에 포함된 바코드 생성 영역을 검출하여 표적 점 변이의 존재 여부를 판별하는 단계를 포함하는 중합효소연쇄반응(Polymerase Chain Reaction, PCR)을 이용한 표적 점 변이 검출 방법
2 2
제1항에 있어서, 상기 템플레이트의 표적 점 변이 결합 영역은 템플레이트 양 말단에 존재하는 것을 특징으로 하는, 표적 점 변이 검출 방법
3 3
제1항에 있어서, 상기 바코드 서열은 표적 점 변이 별로 미리 정의된 임의의 염기서열이며, 표적 점 변이와 상보적으로 결합하지 않는 것을 특징으로 하는, 표적 점 변이 검출 방법
4 4
제1항에 있어서, 상기 (b) 단계에서 생성된 환형 템플레이트에 프라이머가 붙어 증폭산물을 추가적으로 생성하는 것을 특징으로 하는, 표적 점 변이 검출 방법
5 5
제1항에 있어서, 상기 (c) 단계에서 생성된 증폭산물이 새로운 템플레이트를 라이게이션시켜, 새로운 환형 템플레이트를 추가적으로 형성하는 것을 특징으로 하는, 표적 점 변이 검출 방법
6 6
제1항에 있어서, 상기 표적 점 변이는 하나 이상인 것을 특징으로 하는, 표적 점 변이 검출 방법
7 7
제6항에 있어서, 상기 하나 이상의 표적 점 변이 별로 서로 다른 염기서열을 가지는 템플레이트의 바코드 생성 영역이 증폭되어 생성된 바코드를 이용하여 검출하는 것을 특징으로 하는, 표적 점 변이 검출 방법
8 8
제1항에 있어서, 상기 템플레이트의 표적 점 변이 결합 영역은 표적 점 변이의 검출하고자 하는 지점이 라이게이션 반응에 의해 연결되도록 설계되는 것을 특징으로 하는, 표적 점 변이 검출 방법
9 9
제1항에 있어서, 상기 바코드에 상보적인 프로브를 포함하는 센서를 이용하여 상기 바코드를 검출하는 것을 특징으로 하는, 표적 점 변이 검출 방법
10 10
제9항에 있어서, 상기 센서는 SPR(surface plasmon resonance), FET(field effect transistor), 나노입자, 캔틸레버 및 MEMS(micro electro mechanical system)로 구성된 군에서 선택된 것을 이용하는 것을 특징으로 하는, 표적 점 변이 검출 방법
11 11
제9항에 있어서, 상기 바코드에 상보적인 프로브는 올리고뉴클레오티드, 잠금 핵산(LNA), 펩타이드 핵산(PNA), 트레오스 핵산(TNA), 글리콜 핵산(GNA), 브릿지 핵산(BNA) 및 이들의 혼합물로 구성된 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는, 표적 점 변이 검출 방법
12 12
제9항에 있어서, 상기 센서가 형광을 이용할 경우, 상기 바코드에 상보적인 프로브는 양 말단에 리포터(reporter) 및 소광자(quencher)를 포함하는 것을 특징으로 하는, 표적 점 변이 검출 방법
13 13
제12항에 있어서, 상기 리포터는 FAM, TET, JOE, YAKYE, HEX, CY3, ATTO550, TAM, ROX, TxRed, CY35, LC610, LC640, ATTO647N, CY5, 및 ATTO680 염료로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상의 형광 물질인 것을 특징으로 하는, 표적 점 변이 검출 방법
14 14
제12항에 있어서, 상기 소광자는 TAM, BHQ1, BHQ2, BHQ3, BHQ650, DAB, 및 Eclip으로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상인 것을 특징으로 하는, 표적 점 변이 검출 방법
15 15
제1항에 있어서, 상기 (b) 단계의 라이게이션은 열적 안정성이 있는 리가아제(ligase)를 사용하는 것을 특징으로 하는, 표적 점 변이 검출 방법
16 16
제15항에 있어서, 상기 리가아제는 Hifi Taq DNA 리가아제, Taq DNA 리가아제, 및 9°N™ DNA 리가아제로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상인 것을 특징으로 하는, 표적 점 변이 검출 방법
17 17
제1항에 있어서, 상기 (c) 단계의 중합효소연쇄반응에서 가닥 변위 활성(strand displacement activity)이 없는 중합효소를 사용하는 것을 특징으로 하는, 표적 점 변이 검출 방법
18 18
제17항에 있어서, 상기 중합효소는 Phusion? Hot Start Flex DNA 중합효소, Phusion? High-Fidelity DNA 중합효소 Q5? High-Fidelity DNA 중합효소 및 Q5? Hot Start High-Fidelity DNA 중합효소로 구성된 군으로부터 선택된 하나 이상인 것을 특징으로 하는, 표적 점 변이 검출 방법
19 19
(a) i) 표적 점 변이와 상보적으로 결합하는 표적 점 변이 결합 영역; ii) 프라이머 결합 영역; 및 iii) 바코드 생성 영역; 을 포함하는 템플레이트;(b) 상기 템플레이트의 프라이머 결합 영역에 결합하는 프라이머;(c) 중합효소(polymerase); 및(d) 리가아제(ligase);를 포함하는 표적 점 변이 검출을 위한 중합효소연쇄반응용 조성물
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 과학기술정보통신부 고려대학교 산학협럭단 선도연구센터지원사업 ERC 나노-생체유체 검사 연구단