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베일로넬라 디스파(Veillonella dispar) 종 균주, 라크노스피라(Lachnospira) 속 균주 및 도레아 포르미시게네란스(Dorea formicigenerans) 종 균주로 이루어지는 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 균주를 검출할 수 있는 제제를 포함하는, 장내 미생물을 이용한 신질환 위험도 예측 또는 진단용 조성물
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제 1 항에 있어서, 상기 베일로넬라 디스파(Veillonella dispar) 종 균주는 서열번호 1의 16S rRNA 염기서열을 포함하는 것이고, 상기 라크노스피라(Lachnospira) 속 균주는 서열번호 2의 16S rRNA 염기서열을 포함하는 것이며, 상기 도레아 포르미시게네란스(Dorea formicigenerans) 종 균주는 서열번호 3의 16S rRNA 염기서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 장내 미생물을 이용한 신질환 위험도 예측 또는 진단용 조성물
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제 1 항에 있어서, 상기 베일로넬라 디스파(Veillonella dispar) 종 균주, 라크노스피라(Lachnospira) 속 균주 및 도레아 포르미시게네란스(Dorea formicigenerans) 종 균주로 이루어지는 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 균주를 검출할 수 있는 제제에, 박테리오데스 (Bacteriodes) 속 균주, 비피도박테리움 아돌레스센티스(Bifidobacterium adolescentis) 종 균주 및 박테리오데스 유니포르미스(Bacteriodes uniformis) 종 균주로 이루어지는 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 균주를 검출할 수 있는 제제를 추가로 포함하는, 장내 미생물을 이용한 신질환 위험도 예측 또는 진단용 조성물
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제 3 항에 있어서, 상기 박테리오데스 (Bacteriodes) 속 균주는 서열번호 4의 16S rRNA 염기서열을 포함하는 것이고, 상기 비피도박테리움 아돌레스센티스(Bifidobacterium adolescentis) 종 균주는 서열번호 5 및 서열번호 6의 16S rRNA 염기서열 중에서 선택되는 어느 하나의 서열을 포함하는 것이며, 상기 박테리오데스 유니포르미스(Bacteriodes uniformis) 종 균주는 서열번호 7 내지 서열번호 11의 16S rRNA 염기서열 중에서 선택되는 어느 하나의 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 장내 미생물을 이용한 신질환 위험도 예측 또는 진단용 조성물
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제 3 항에 있어서, 로제부리아(Roseburia) 속 균주, 오스실로스피라(Oscillospira) 속 균주 및 라크노스피라새(Lachnospiraceae) 과 균주로 이루어지는 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 균주를 검출할 수 있는 제제를 추가로 포함하는, 장내 미생물을 이용한 신질환 위험도 예측 또는 진단용 조성물
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제 5 항에 있어서, 상기 로제부리아(Roseburia) 속 균주는 서열번호 12의 16S rRNA 염기서열을 포함하는 것이고, 상기 오스실로스피라(Oscillospira) 속 균주는 서열번호 13의 16S rRNA 염기서열을 포함하는 것이며, 상기 라크노스피라새(Lachnospiraceae) 과 균주는 서열번호 14의 16S rRNA 염기서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 장내 미생물을 이용한 신질환 위험도 예측 또는 진단용 조성물
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제 1 항 내지 제 6 항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 균주를 검출할 수 있는 제제는 상기 균주에 특이적인 프라이머, 프로브, 안티센스 올리고뉴클레오티드, 압타머 또는 항체인 것을 특징으로 하는 장내 미생물을 이용한 신질환 위험도 예측 또는 진단용 조성물
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제 7 항에 있어서, 상기 프라이머는 균주의 16S rRNA를 증폭할 수 있는 프라이머인 것을 특징으로 하는 장내 미생물을 이용한 신질환 위험도 예측 또는 진단용 조성물
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9
청구항 제 1 항 내지 제 6 항 중 어느 한 항의 조성물을 포함하는 신질환 위험도 예측 또는 진단용 키트
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피시험자의 장관 유래 시료에서 얻어진 미생물의 게놈 DNA로부터 베일로넬라 디스파(Veillonella dispar) 종 균주, 라크노스피라(Lachnospira) 속 균주 및 도레아 포르미시게네란스(Dorea formicigenerans) 종 균주로 이루어지는 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 균주를 검출하는 단계; 및피시험자의 장관 유래 시료에서 얻어진 미생물의 게놈 DNA에서 베일로넬라 디스파(Veillonella dispar) 종 균주, 라크노스피라(Lachnospira) 속 균주 및 도레아 포르미시게네란스(Dorea formicigenerans) 종 균주로 이루어지는 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 균주의 증감을 정상군과 비교하여, 상기 미생물의 게놈 DNA에서 베일로넬라 디스파(Veillonella dispar) 종 균주가 증가되어 있는 경우, 또는 라크노스피라(Lachnospira) 속 균주가 감소되어 있는 경우, 또는 도레아 포르미시게네란스(Dorea formicigenerans) 종 균주가 증가되어 있는 경우에 상기 피시험자를 신질환 또는 신질환 위험군으로 진단하는 단계;를 포함하는 장내 미생물을 이용한 신질환 위험도 예측 또는 진단을 위한 정보제공방법
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제 10항에 있어서, 상기 피시험자의 장관 유래 시료에서 얻어진 미생물의 게놈 DNA로부터 박테리오데스 (Bacteriodes) 속 균주, 비피도박테리움 아돌레스센티스(Bifidobacterium adolescentis) 종 균주 및 박테리오데스 유니포르미스(Bacteriodes uniformis) 종 균주로 이루어지는 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 균주를 추가로 검출하는 단계; 및 피시험자의 장관 유래 시료에서 얻어진 미생물의 게놈 DNA에서 박테리오데스 (Bacteriodes) 속 균주, 비피도박테리움 아돌레스센티스(Bifidobacterium adolescentis) 종 균주 및 박테리오데스 유니포르미스(Bacteriodes uniformis) 종 균주로 이루어지는 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 균주의 증감을 정상군과 비교하여, 박테리오데스 (Bacteriodes) 속 균주가 감소되어 있는 경우, 또는 비피도박테리움 아돌레스센티스(Bifidobacterium adolescentis) 종 균주가 감소되어 있는 경우, 또는 박테리오데스 유니포르미스(Bacteriodes uniformis) 종 균주가 감소되어 있는 경우에 상기 피시험자를 신질환 또는 신질환 위험군으로 진단하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 장내 미생물을 이용한 신질환 위험도 예측 또는 진단을 위한 정보제공방법
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제 11 항에 있어서, 상기 피시험자의 장관 유래 시료에서 얻어진 미생물의 게놈 DNA로부터 로제부리아(Roseburia) 속 균주, 오스실로스피라(Oscillospira) 속 균주 및 라크노스피라새(Lachnospiraceae) 과 균주로 이루어지는 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 균주를 추가로 검출하는 단계; 및 피시험자의 장관 유래 시료에서 얻어진 미생물의 게놈 DNA에서 로제부리아(Roseburia) 속 균주, 오스실로스피라(Oscillospira) 속 균주 및 라크노스피라새(Lachnospiraceae) 과 균주로 이루어지는 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 균주의 증감을 정상군과 비교하여, 상기 미생물의 게놈 DNA에서 로제부리아(Roseburia) 속 균주가 증가되어 있는 경우, 또는 오스실로스피라(Oscillospira) 속 균주가 증가되어 있는 경우, 또는 라크노스피라새(Lachnospiraceae) 과 균주가 감소되어 있는 경우에 상기 피시험자를 신질환 또는 신질환 위험군으로 진단하는 단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 장내 미생물을 이용한 신질환 위험도 예측 또는 진단을 위한 정보제공방법
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피시험자의 장관 유래 시료에서 얻어진 미생물의 게놈 DNA로부터 베일로넬라 디스파(Veillonella dispar) 종 균주, 라크노스피라(Lachnospira) 속 균주, 도레아 포르미시게네란스(Dorea formicigenerans) 종 균주, 박테리오데스 (Bacteriodes) 속 균주, 비피도박테리움 아돌레스센티스(Bifidobacterium adolescentis) 종 균주 및 박테리오데스 유니포르미스(Bacteriodes uniformis) 종 균주, 로제부리아(Roseburia) 속 균주, 오스실로스피라(Oscillospira) 속 균주 및 라크노스피라새(Lachnospiraceae) 과 균주 중에서 선택되는 2 이상의 균주의 상대량을 검출하는 단계; 및 상기 검출하는 단계에서 얻어진 결과를, 상기 2 이상의 균주의 상대량을 변수로 하는 신질환군을 예측하는 다변량 선형 모델에 의해 상기 피시험자의 신질환 위험도 예측값을 산출하는 단계;를 포함하는 장내 미생물을 이용한 신질환 위험도 예측 또는 진단을 위한 정보제공방법
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피시험자의 장관 유래 시료에서 얻어진 미생물의 게놈 DNA로부터 베일로넬라 디스파(Veillonella dispar) 종 균주, 라크노스피라(Lachnospira) 속 균주, 도레아 포르미시게네란스(Dorea formicigenerans) 종 균주, 박테리오데스 (Bacteriodes) 속 균주, 비피도박테리움 아돌레스센티스(Bifidobacterium adolescentis) 종 균주 및 박테리오데스 유니포르미스(Bacteriodes uniformis) 종 균주, 로제부리아(Roseburia) 속 균주, 오스실로스피라(Oscillospira) 속 균주 및 라크노스피라새(Lachnospiraceae) 과 균주를 검출하는 단계; 및피시험자의 장관 유래 시료에서 얻어진 미생물의 게놈 DNA에서 베일로넬라 디스파(Veillonella dispar) 종 균주, 도레아 포르미시게네란스(Dorea formicigenerans) 종 균주, 로제부리아(Roseburia) 속 균주 및 오스실로스피라(Oscillospira) 속 균주가 증가되어 있는 경우, 또는 라크노스피라(Lachnospira) 속 균주, 박테리오데스 (Bacteriodes) 속 균주, 비피도박테리움 아돌레스센티스(Bifidobacterium adolescentis) 종 균주, 박테리오데스 유니포르미스(Bacteriodes uniformis) 종 균주 및 라크노스피라새(Lachnospiraceae) 과 균주가 감소되어 있는 경우에 상기 피시험자를 신질환 또는 신질환 위험군으로 진단하는 단계;를 포함하는 장내 미생물을 이용한 신질환 위험도 예측 또는 진단을 위한 정보제공방법
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신질환 예방 또는 치료제 후보 물질을 인간이 아닌 동물에 투여하는 단계;상기 후보 물질 처리 전 및 처리 후 장관 유래 시료에서 얻어진 미생물의 게놈 DNA로부터 베일로넬라 디스파(Veillonella dispar) 종 균주, 라크노스피라(Lachnospira) 속 균주 및 도레아 포르미시게네란스(Dorea formicigenerans) 종 균주로 이루어지는 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 균주를 검출하는 단계; 및상기 후보 물질 처리 전 및 처리 후 미생물의 게놈 DNA에서 베일로넬라 디스파(Veillonella dispar) 종 균주, 라크노스피라(Lachnospira) 속 균주 및 도레아 포르미시게네란스(Dorea formicigenerans) 종 균주로 이루어지는 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 균주의 증감을 비교하여, 베일로넬라 디스파(Veillonella dispar) 종 균주가 감소되어 있는 경우, 또는 라크노스피라(Lachnospira) 속 균주가 증가되어 있는 경우, 또는 도레아 포르미시게네란스(Dorea formicigenerans) 종 균주가 감소되어 있는 경우에 상기 후보 물질을 신질환 예방 또는 치료제로 판단하는 단계;를 포함하는 장내 미생물을 이용한 신질환 예방 또는 치료제 스크리닝 방법
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제 15항에 있어서, 상기 후보 물질 처리 전 및 처리 후 장관 유래 시료에서 얻어진 미생물의 게놈 DNA로부터 박테리오데스 (Bacteriodes) 속 균주, 비피도박테리움 아돌레스센티스(Bifidobacterium adolescentis) 종 균주 및 박테리오데스 유니포르미스(Bacteriodes uniformis) 종 균주로 이루어지는 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 균주를 추가로 검출하는 단계; 및 상기 후보 물질 처리 전 및 처리 후 미생물의 게놈 DNA에서 박테리오데스 (Bacteriodes) 속 균주, 비피도박테리움 아돌레스센티스(Bifidobacterium adolescentis) 종 균주 및 박테리오데스 유니포르미스(Bacteriodes uniformis) 종 균주로 이루어지는 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 균주의 증감을 비교하여, 박테리오데스 (Bacteriodes) 속 균주가 증가되어 있는 경우, 또는 비피도박테리움 아돌레스센티스(Bifidobacterium adolescentis) 종 균주가 증가되어 있는 경우, 또는 박테리오데스 유니포르미스(Bacteriodes uniformis) 종 균주가 증가되어 있는 경우에 상기 후보 물질을 신질환 예방 또는 치료제로 판단하는 단계;를 포함하는 장내 미생물을 이용한 신질환 예방 또는 치료제 스크리닝 방법
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제 16 항에 있어서, 상기 후보 물질 처리 전 및 처리 후 장관 유래 시료에서 얻어진 미생물의 게놈 DNA로부터 로제부리아(Roseburia) 속 균주, 오스실로스피라(Oscillospira) 속 균주 및 라크노스피라새(Lachnospiraceae) 과 균주로 이루어지는 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 균주를 추가로 검출하는 단계; 및 상기 후보 물질 처리 전 및 처리 후 미생물의 게놈 DNA에서 로제부리아(Roseburia) 속 균주, 오스실로스피라(Oscillospira) 속 균주 및 라크노스피라새(Lachnospiraceae) 과 균주로 이루어지는 군에서 선택되는 어느 하나 이상의 균주의 증감을 비교하여, 로제부리아(Roseburia) 속 균주가 감소되어 있는 경우, 또는 오스실로스피라(Oscillospira) 속 균주가 감소되어 있는 경우, 또는 라크노스피라새(Lachnospiraceae) 과 균주가 증가되어 있는 경우에 상기 후보 물질을 신질환 예방 또는 치료제로 판단하는 단계;를 포함하는 장내 미생물을 이용한 신질환 예방 또는 치료제 스크리닝 방법
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