요약 |
본 발명은 토마토 흰가루병 저항성 품종 판별용 SNP 마커 세트 및 이의 용도에 관한 것으로서, 본 발명에서는 토마토에서 최초로 전장유전체연관분석 (Genome wide association study, GWAS)을 통해 흰가루병 저항성 신규 양적형질유전자좌 (Quantitative Trait Loci, QTL)의 발굴과 이와 연관된 분자표지를 개발하고자 진행되었다. 병리검정을 통해 확인한 토마토 유전자원 289 계통의 표현형과 Axiom Tomato SNP chip array로부터 얻은 단일염기변이(Single nucleotide polymorphism, SNP) 21,899좌를 기반으로 TASSEL, GAPIT 소프트웨어에서 각각 GWAS를 수행하였다. 그 결과 염색체 2, 4, 6, 7, 11, 12에서 총 7개의 주요 QTL 영역이 탐색 되었으며, 해당 영역으로부터 총 8개의 유의한 SNP 마커를 선발하였다. 이들 SNP 마커 세트는 흰가루 내병성 토마토 신품종 육성을 위한 마커이용선발(Marker-assisted selection) 뿐만 아니라 향후 저항성 유전자의 분자적 기초를 이해하는데 유용한 정보를 제공할 것이다.
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