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오이 품종 판별용 SNP 마커 세트 및 이의 용도

  • 기술번호 : KST2022000230
  • 담당센터 : 부산기술혁신센터
  • 전화번호 : 051-606-6561
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 오이 품종 판별용 SNP 마커 세트 및 이의 용도에 관한 것으로서, 오이의 품종 판별을 위한 Fluidigm 분석에 최적화된 96/24개의 핵심 마커 두 세트를 개발하였다. Hierarchical clustering 분석을 통해 96개의 핵심 SNP 세트가 88개의 품종을 품종군에 따라 명확하게 구별할 수 있음을 확인하였다. 24개 핵심 SNP 세트의 경우 품종간 분해능이 다소 낮아졌지만 90% 이상의 품종들을 식별할 수 있었다. 또한, 본 발명에서는 UPOV 형질 37개를 87개 품종에 대해 조사하였으며, Mantel test를 통해 SNP에 기반한 유전적 변이와 형질변이 간에 높은 수준의 상관관계가 존재함을 확인하였다. 따라서, 최종 개발된 96/24개의 핵심 SNP 세트들은 오이 상용품종 및 유전자원의 DNA 프로필 생성을 통한 신품종 등록 및 품종판별에 매우 유용할 것이다.
Int. CL C12Q 1/6895 (2018.01.01)
CPC C12Q 1/6895(2013.01) C12Q 2600/156(2013.01) C12Q 2600/13(2013.01)
출원번호/일자 1020200126541 (2020.09.29)
출원인 부산대학교 산학협력단, 대한민국(국립종자원장)
등록번호/일자 10-2315086-0000 (2021.10.14)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20211021) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 국내출원/신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2020.09.29)
심사청구항수 11

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 부산대학교 산학협력단 대한민국 부산광역시 금정구
2 대한민국(국립종자원장) 대한민국 경상북도 김천시

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 박영훈 경상남도 밀양시 미리벌중앙로*길 *
2 박기림 부산광역시 서구
3 정진기 경상북도 김천시 혁신*로 *
4 심은조 경상북도 김천시 혁신*로

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인태백 대한민국 서울 금천구 가산디지털*로 *** 이노플렉스 *차 ***호

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 부산대학교 산학협력단 부산광역시 금정구
2 대한민국(국립종자원장) 경상북도 김천시
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2020.09.29 수리 (Accepted) 1-1-2020-1036823-43
2 등록결정서
Decision to grant
2021.08.26 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2021-0677205-17
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번호 청구항
1 1
서열번호 1 내지 서열번호 24의 26번째 뉴클레오티드로 이루어진 단일염기다형성(SNP) 마커를 포함하는 10-50개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드를 포함하는 오이 품종 판별용 SNP 마커 세트 조성물
2 2
제1항에 있어서, 상기 SNP 마커 세트 조성물은 서열번호 25 내지 서열번호 240의 26번째 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상의 단일염기다형성(SNP) 마커를 포함하는 10-50개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드를 추가적으로 포함하는 것을 특징으로 하는 오이 품종 판별용 SNP 마커 세트 조성물
3 3
제2항에 있어서, 상기 SNP 마커 세트 조성물은 서열번호 1 내지 서열번호 96의 26번째 뉴클레오티드로 이루어진 단일염기다형성(SNP) 마커를 포함하는 10-50개의 연속적인 DNA 서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드 또는 그의 상보적 폴리뉴클레오티드를 포함하는 것을 특징으로 하는 오이 품종 판별용 SNP 마커 세트 조성물
4 4
제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 오이 품종은 한국 가시, 한국 낙합, 한국 백다다기, 동남아시아 슬라이스, 유럽 슬라이스, 일본 가시, 중국 가시, 중국 백다다기 및 피클로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상인 것을 특징으로 하는 오이 품종 판별용 SNP 마커 세트 조성물
5 5
제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 따른 SNP 마커 세트를 증폭하기 위한 프라이머 세트를 함유하는 오이 품종 판별용 조성물
6 6
제5항에 있어서, 상기 프라이머 세트는 서열번호 241 내지 서열번호 244로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 245 내지 서열번호 248로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 249 내지 서열번호 252로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 253 내지 서열번호 256으로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 257 내지 서열번호 260으로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 261 내지 서열번호 264로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 265 내지 서열번호 268로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 269 내지 서열번호 272로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 273 내지 서열번호 276으로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 277 내지 서열번호 280으로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 281 내지 서열번호 284로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 285 내지 서열번호 288로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 289 내지 서열번호 292로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 293 내지 서열번호 296으로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 297 내지 서열번호 300으로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 301 내지 서열번호 304로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 305 내지 서열번호 308로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 309 내지 서열번호 312로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 313 내지 서열번호 316으로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 317 내지 서열번호 320으로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 321 내지 서열번호 324로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 325 내지 서열번호 328로 표시되는 프라이머 세트, 서열번호 329 내지 서열번호 332로 표시되는 프라이머 세트 및 서열번호 333 내지 서열번호 336으로 표시되는 프라이머 세트로 이루어진 오이 품종 판별용 조성물
7 7
제5항에 있어서, 상기 프라이머 세트는 Fluidigm SNP 분석용 프라이머 세트인 것을 특징으로 하는 오이 품종 판별용 조성물
8 8
제5항의 조성물을 포함하는 오이 품종 판별용 키트
9 9
(1) 오이에서 DNA를 분리하는 단계; (2) 상기 분리된 DNA를 주형으로 하여, 제1항 내지 제3항 중 어느 한 항에 따른 SNP 마커 세트를 증폭시키는 단계; 및 (3) 상기 증폭된 SNP 마커 세트의 유전자형을 확인하는 단계를 포함하는 오이 품종 판별방법
10 10
제9항에 있어서, 상기 SNP 마커 세트의 유전자형을 확인하는 단계는 Fluidigm SNP 분석을 수행하는 것을 특징으로 하는 오이 품종 판별방법
11 11
제9항에 있어서, 상기 오이 품종은 한국 가시, 한국 낙합, 한국 백다다기, 동남아시아 슬라이스, 유럽 슬라이스, 일본 가시, 중국 가시, 중국 백다다기 및 피클로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나 이상인 것을 특징으로 하는 오이 품종 판별방법
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 농림축산식품부 부산대학교 산학협력단 농생명산업기술개발(R&D) SNP 분자바코드를 이용한 오이 품종에 대한 DNA Profile Database 구축
2 농림축산식품부 국립종자원 농생명산업기술개발(R&D) 종자산업 육성을 위한 차세대 품종식별 기술 개발 및 사업화