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시퀀싱 데이터를 이용한 미소부수체 불안정성 검출 방법 및 분석 장치

  • 기술번호 : KST2022002062
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 시퀀싱 데이터를 이용한 미소부수체 불안정성 검출 방법은 분석장치가 샘플의 염기서열을 미소부수체(microsatellite) 마커들로 구성된 패널에 매핑한 데이터를 획득하는 단계, 상기 분석장치가 상기 마커들 각각에 매핑된 리드의 길이를 결정하는 단계, 상기 분석장치가 상기 마커들 각각에 대한 리드의 길이를 참조 게놈을 기준으로 정규화하는 단계, 상기 분석장치가 상기 마커들 각각에 정규화된 리드의 길이에 대한 비대칭도(skewness)를 연산하는 단계 및 상기 분석장치가 상기 비대칭도가 제1 임계값 이상 또는 제2 임계값 미만인 경우 상기 샘플의 미소부수체 불안정(microsatellite instability)이 높다고 판단하는 단계를 포함한다.
Int. CL C12Q 1/6886 (2018.01.01) C12Q 1/6869 (2018.01.01) G16B 20/20 (2019.01.01)
CPC
출원번호/일자 1020210052845 (2021.04.23)
출원인 서울대학교병원, 주식회사 셀레믹스
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2022-0021397 (2022.02.22) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보 대한민국  |   1020200102037   |   2020.08.13
법적상태 공개
심사진행상태 수리
심판사항
구분 국내출원/신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2021.04.23)
심사청구항수 12

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 서울대학교병원 대한민국 서울특별시 종로구
2 주식회사 셀레믹스 대한민국 서울특별시 금천구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 강경훈 서울특별시 서초구
2 조남윤 경기도 의정부시 누원로 **,
3 배정모 서울특별시 서초구
4 이윤범 서울특별시 금천구
5 한효준 서울특별시 양천구
6 정재환 서울특별시 양천구
7 장훈 서울특별시 동작구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 이성하 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로**길 ** A&C빌딩 *층(STN국제특허법률사무소)
2 곽현규 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로**길 ** A&C빌딩 *층(STN국제특허법률사무소)

최종권리자

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번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2021.04.23 수리 (Accepted) 1-1-2021-0476371-16
2 보정요구서
Request for Amendment
2021.05.03 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2021-0070844-93
3 [출원서 등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment
2021.05.21 수리 (Accepted) 1-1-2021-0584847-03
4 수수료 사후 감면 신청서
Request for Follow-up Reduction of Official Fee
2021.05.24 수리 (Accepted) 1-1-2021-0591333-12
5 수수료 사후 감면안내서
Notification of Follow-up Reduction of Official Fee
2021.05.25 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2021-0082648-76
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번호 청구항
1 1
분석장치가 샘플의 염기서열의 리드들을 미소부수체(microsatellite) 마커들로 구성된 패널에 매핑한 데이터를 획득하는 단계;상기 분석장치가 상기 데이터에서 분석 대상인 타깃 마커들 각각에 매핑된 리드들의 길이를 추출하는 단계;상기 분석장치가 상기 타깃 마커들 각각에 대한 리드들의 길이를 참조 게놈을 기준으로 정규화하는 단계;상기 분석장치가 상기 타깃 마커들 각각에 대하여 정규화된 리드들의 길이에 대한 비대칭도(skewness)를 연산하는 단계; 및상기 분석장치가 상기 타깃 마커들 각각에 대하여 상기 비대칭도를 기준으로 해당 마커가 나타내는 미소부수체가 불안정한지 판단하고, 상기 타깃 마커들 중 불안정한 마커들의 개수가 임계값 초과하는 경우, 상기 샘플의 미소부수체 불안정(microsatellite instability)이 높다라고 판단하는 단계를 포함하는 시퀀싱 데이터를 이용한 미소부수체 불안정성 검출 방법
2 2
제1항에 있어서,상기 분석 장치는 상기 타깃 마커에 대한 상기 비대칭도가 제1 임계값 이상 또는 제2 임계값 미만인 상기 타깃 마커가 나타내는 미소부수체가 불안정하다라고 판단하는 시퀀싱 데이터를 이용한 미소부수체 불안정성 검출 방법
3 3
제1항에 있어서,상기 비대칭도는 PSC(Pearson's skewness coefficient) 계수로 결정되는 시퀀싱 데이터를 이용한 미소부수체 불안정성 검출 방법
4 4
제1항에 있어서,상기 비대칭도는 PSC(Pearson's skewness coefficient) 계수로 결정되는 경우, 상기 제1 임계값은 1이고, 상기 제2 임계값은 -1인 시퀀싱 데이터를 이용한 미소부수체 불안정성 검출 방법
5 5
제1항에 있어서,상기 분석장치는 상기 매핑한 데이터의 상기 마커들 중 시퀀스 커버리지(sequence coverage)가 기준값 미만인 마커들을 배제하여 상기 타깃 마커들을 필터링하는 단계를 더 포함하는 시퀀싱 데이터를 이용한 미소부수체 불안정성 검출 방법
6 6
제1항에 있어서,상기 참조 게놈은 인간의 표준 게놈이고, 상기 정규화 단계에서 상기 분석장치는 상기 마커들 각각에서 리드의 길이가 상기 참조 게놈에서의 길이와 동일한 경우 0으로 리드의 길이를 조정하는 방식으로 정규화를 수행하는 시퀀싱 데이터를 이용한 미소부수체 불안정성 검출 방법
7 7
샘플의 염기서열의 리드들을 미소부수체(microsatellite) 마커들로 구성된 패널에 매핑한 데이터를 입력받은 입력장치;마커에 매핑된 리드의 길이를 추출하고, 추출한 리드의 길이에 대한 비대칭도(skewness)를 연산하는 명령어(instruction)를 저장하는 저장장치; 및상기 명령어를 사용하여 상기 입력장치에 입력되는 데이터에서 분석 대상인 타깃 마커들 각각에 대한 리드들의 길이를 추출하고, 상기 타깃 마커들 각각에 대한 리드들의 길이를 참조 게놈을 기준으로 정규화하고, 상기 타깃 마커들 각각에 대하여 정규화된 리드들의 길이에 대한 비대칭도를 연산하고, 상기 타깃 마커들 각각에 대하여 상기 비대칭도를 기준으로 해당 마커가 나타내는 미소부수체가 불안정한지 판단하는 연산장치를 포함하는 미소부수체 불안정성 검출하는 분석장치
8 8
제7항에 있어서,상기 연산 장치는 상기 타깃 마커에 대한 상기 비대칭도가 제1 임계값 이상 또는 제2 임계값 미만인 상기 타깃 마커가 나타내는 미소부수체가 불안정하다라고 판단하고, 상기 타깃 마커들 중 불안정한 마커들의 개수가 임계값 초과하는 경우, 상기 샘플의 미소부수체 불안정(microsatellite instability)이 높다라고 판단하는 미소부수체 불안정성 검출하는 분석장치
9 9
제7항에 있어서,상기 비대칭도는 PSC(Pearson's skewness coefficient) 계수로 결정되는 미소부수체 불안정성 검출하는 분석장치
10 10
제7항에 있어서,상기 비대칭도는 PSC(Pearson's skewness coefficient) 계수로 결정되는 경우, 상기 제1 임계값은 1이고, 상기 제2 임계값은 -1인 미소부수체 불안정성 검출하는 분석장치
11 11
제7항에 있어서,상기 연산장치는 상기 매핑한 데이터의 상기 마커들 중 시퀀스 커버리지(sequence coverage)가 기준값 미만인 마커들을 배제하여 상기 타깃 마커들을 필터링하는 미소부수체 불안정성 검출하는 분석장치
12 12
제7항에 있어서,상기 참조 게놈은 인간의 표준 게놈이고, 상기 정규화 단계에서 상기 연산장치는 상기 마커들 각각에서 리드의 길이가 상기 참조 게놈에서의 길이와 동일한 경우 0으로 리드의 길이를 조정하는 방식으로 정규화를 수행하는 미소부수체 불안정성 검출하는 분석장치
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1 보건복지부 서울대학교병원 연구중심병원육성(R&D) FIRST-암패널 고도화, 상용화 및 임상시험