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오염 지수를 이용한 양성 대조군 주형 오염에 의한 위양성 평가 시스템

  • 기술번호 : KST2022002926
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 실시간 핵산증폭반응을 이용하는 분자진단시 양성 대조군(Positive Control, PC) 주형(Template)에 의해 검체나 시약이 오염된 경우 발생하는 위양성 반응을 효과적으로 평가하는 방법에 관한 것으로서, 양성 대조군 주형에 포함된 타겟 검출을 위한 유전자 서열의 내부에 오염 확인을 위한 유전자 서열이 삽입되어 있는 것을 특징으로 한다. 검체를 이용한 분자진단에서 사용되는 프라이머와 프로브 구성시 양성 대조군 주형에 의한 오염확인을 위한 별도의 프라이머와 형광 채널을 사용하지 않고 내부 대조군(Internal Control, IC)의 검출에 사용되는 형광체와 동일한 형광체(Fluorophore) 또는 유사한 파장대의 형광체를 사용하는 것을 특징으로 한다. 따라서, 다종의 타겟을 동일한 반응 튜브에서 동시 다중 반응시 분자진단 장비에서 사용가능한 형광채널을 모두 타겟 검출에 이용할 수 있는 장점을 가진다. 뿐만 아니라, 양성 대조군 주형의 오염 지수(Contamination Index, CIPCT) 계산을 통하여 오염 정도를 보다 정량적으로 평가가 가능하다.
Int. CL G16B 20/30 (2019.01.01) G16B 20/20 (2019.01.01) G16B 30/10 (2019.01.01) G16B 35/10 (2019.01.01)
CPC G16B 20/30(2013.01) G16B 20/20(2013.01) G16B 30/10(2013.01) G16B 35/10(2013.01)
출원번호/일자 1020200117219 (2020.09.11)
출원인 (주) 하임바이오텍, 한국전자통신연구원
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2022-0034618 (2022.03.18) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 공개
심사진행상태 수리
심판사항
구분 국내출원/신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2021.08.13)
심사청구항수 10

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 (주) 하임바이오텍 대한민국 경기도 성남시 분당구
2 한국전자통신연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 정은수 서울특별시 영등포구
2 이혜민 서울특별시 광진구
3 안재현 경기도 광주시 송정로 **

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인이룸리온 대한민국 서울특별시 서초구 사평대로 ***, *층 (반포동)

최종권리자

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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2020.09.11 수리 (Accepted) 1-1-2020-0968701-18
2 [출원서 등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment
2020.09.14 수리 (Accepted) 1-1-2020-0969542-12
3 [심사청구]심사청구서·우선심사신청서
2021.08.13 수리 (Accepted) 1-1-2021-0936861-44
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번호 청구항
1 1
형광 프로브를 사용하는 실시간 핵산 증폭 반응에 의한 위양성 판별 방법에 있어서,a) 타겟 유전자 서열 및 오염 판단 유전자 서열을 포함하는 양성 대조군유전자가 포함된 양성 대조군을 준비하는 단계;b) 검체로부터 유전자를 수득하여 검사 대상군을 준비한 후 상기 검사 대상군에 내부 대조군 유전자를 첨가하는 단계; 및c) 상기 양성 대조군 및 검사 대상군에 타겟 유전자, 오염 판단 유전자 및 내부 대조 유전자와 각각 결합 가능한 프로브를 첨가하고, 실시간 핵산 증폭반응(PCR) 진행하는 단계를 포함하고,상기 오염 판단 유전자 및 내부 대조 유전자 각각과 결합 가능한 프로브의 가수분해에 따라 동일한 파장에서 발광하는 것을 특징으로 하는, 실시간 핵산 증폭 반응에 의한 위양성 판별 방법
2 2
제1 항에 있어서, d) 상기 c) 단계의 핵산 증폭반응 결과 내부 대조군 유전자와 결합하는 프로브에 결합된 형광체의 파장에서 발광하는 경우 실시간 핵산 증폭 반응이 정상적으로 진행되었음을 확인하는 단계를 더 포함하는, 실시간 핵산 증폭 반응에 의한 위양성 판별 방법
3 3
제2 항에 있어서,e) 상기 d) 단계의 내부 대조군 유전자와 결합 가능한 프로브가 발광하는 파장에서, 추가적인 형광 세기가 확인되는 경우 양성 대조군에 의해 검사 대상군이 오염되었음을 판별하는 단계를 포함하는, 실시간 핵산 증폭 반응에 의한 위양성 판별 방법
4 4
제1 항에 있어서,상기 오염 판단 유전자 서열은 15bp 내지 40bp의 길이를 갖는 DNA 또는 RNA 서열인, 실시간 핵산 증폭 반응에 의한 위양성 판별 방법
5 5
제 1 항에 있어서,상기 프로브는 핵산 올리고머가 형광체(fluorophore) 및 소광체(quencher)와 결합된 것인, 실시간 핵산 증폭 반응에 의한 위양성 판별 방법
6 6
제 5 항에 있어서, 상기 프로브는 상기 타겟 유전자 서열의 증폭을 위한 정방향 또는 역방향 프라이머에 의해 가수분해되어 형광이 나타나는 태그맨(TaqMan) 프로브, 태그맨 MGB 프로브, 상보적인 서열과 결합된 상태에서 RNase H에 의해 절단된 후 프라이머에 의해 가수분해되어 형광을 발생시키는 사이클링 프로브(Cycling Probe), 상보적인 서열과 결합된 상태에서 형광을 발하는 분자 비콘(Molecular Beacon), 스콜피온 프로브(Scorpion probe), 및 프렛(FRET) 원리를 이용하는 핵산 올리고머를 포함하는 프로브로 이루어진 군에서 선택된 적어도 어느 하나의 프로브인, 실시간 핵산 증폭 반응에 의한 위양성 판별 방법
7 7
제 1 항에 있어서, 내부 대조군 유전자와 상보적인 프로브에 결합하는 형광체는 오염 판단 유전자 서열과 상보적인 프로브에 결합하는 형광체와 동일하거나, 발광 시 동일한 파장대를 갖는 형광체인, 실시간 핵산 증폭 반응에 의한 위양성 판별 방법
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제 6 항에 있어서,RT-qPCR 또는 qPCR반응을 통한 진단 검사에서 내부 대조군 주형의 검출은 내부 대조군의 형광 값이 최초로 증가하는 시점 (Ct 값)이 5 이상, 35이하의 값을 가지며, 이후 10 사이클 이내에, 형광 값(FI, Fluorescence Intensity 또는 RFU, Relative Fluorescence Units)이 일정한 값에 도달하여 유지되도록 내부 대조군 검출을 위한 프로브의 양을 조절하는 실시간 핵산 증폭 반응에 의한 위양성 판별 방법
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제 8 항에 있어서,내부 대조군 검출에 사용된 형광 값(FI, Fluorescence Intensity 또는 RFU, Relative Fluorescence Units)이 일정하게 유지되다가 다시 증가하는 현상에 의해 양성 대조군에 의한 오염 여부를 판단하는, 실시간 핵산 증폭 반응에 의한 위양성 판별 방법
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제9 항에 있어서,상기 내부 대조군의 형광 값이 다시 증가하는 시점 (Ct 값) 의해 오염 정도를 반정량적으로 평가하고, 상기 양성 대조군 주형에 의한 오염이 결과에 미친 정도는 하기 수학식 1에 의해 산출되고, 정량적인 평가가 가능한 실시간 핵산 증폭 반응에 의한 위양성 판별 방법:003c#수학식 1003e#
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 중소벤처기업부 한국전자통신연구원 공공연구기관 연구인력 파견 사업 miRNA 다중진단 기술기반 진단 시스템 개발