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간암의 예후 예측을 위한 정보 제공 방법

  • 기술번호 : KST2022010950
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 게놈 DNA의 메틸화 수준을 분석 및 정규화하는 방법, 이를 이용한 간암의 예후 예측을 위한 정보 제공 방법에 관한 것으로 상기 정규화 방법을 이용하면 간암 조직에서 분리한 게놈 DNA에서 메틸화 마커의 메틸화 수준을 확인할 수 있고, 특정 컷오프 값을 초과하면 간암 환자의 예후가 불량할 것으로 판단할 수 있다.
Int. CL C12Q 1/6886 (2018.01.01)
CPC
출원번호/일자 1020210161420 (2021.11.22)
출원인 연세대학교 산학협력단, 세종대학교산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2022-0069869 (2022.05.27) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보 대한민국  |   1020200156644   |   2020.11.20
법적상태 공개
심사진행상태 수리
심판사항
구분 국내출원/신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2021.11.22)
심사청구항수 9

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 연세대학교 산학협력단 대한민국 서울특별시 서대문구
2 세종대학교산학협력단 대한민국 서울특별시 광진구 능동로 *** (군

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 김영준 서울특별시 강남구
2 하정실 서울특별시 강남구
3 김시초 서울특별시 도봉구
4 이진영 경기도 안산시 단원구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인다나 대한민국 서울특별시 강남구 역삼로 *길 **, 신관 *층~*층, **층(역삼동, 광성빌딩)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2021.11.22 수리 (Accepted) 1-1-2021-1344538-61
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번호 청구항
1 1
하기 단계를 포함하는 간암 환자의 예후 예측을 위한 정보 제공 방법:a) 간암 환자로부터 분리된 생물학적 시료에서 게놈 DNA를 분리하는 단계;b) 분리된 게놈 DNA에서 서열번호 1 내지 5로 이루어진 군에서 선택되는 서열의 CpG 부위의 메틸화 수준을 측정하는 단계; 및c) 측정된 메틸화 수준을 하기 표의 컷오프 값과 비교하는 단계
2 2
제1항에 있어서, 상기 방법은 a) 단계 이후 분리된 게놈 DNA에 아황산 (bisulfite)을 처리하는 단계를 추가로 포함하는, 간암 환자의 예후 예측을 위한 정보 제공 방법
3 3
제1항에 있어서, 상기 방법은 c) 단계 이후 3개 이상의 CpG 부위에서 메틸화 수준이 컷오프를 넘으면 암이 1년 이내에 재발할 가능성이 낮은 것으로 판단하고, 3개 이상의 CpG 부위에서 메틸화 수준이 컷오프를 넘지 못하면 암이 1년 이내에 재발할 가능성이 높은 것으로 판단하는 단계를 추가로 포함하는, 간암 환자의 예후 예측을 위한 정보 제공 방법
4 4
제1항에 있어서, 상기 b)의 CpG 부위의 메틸화 수준을 측정하는 단계는 하기 단계를 포함하는, 간암 환자의 예후 예측을 위한 정보 제공 방법:b-1) 아황산 처리된 게놈 DNA를 주형으로 서열번호 1 내지 5로 이루어진 군에서 선택되는 서열의 CpG 부위에 대한 프라미어로 MS-HRM (methylation-sensitive high resolution melting) 분석을 수행하는 단계;b-2) 하기 식 1 및 2에 따라 MS-HRM 분석 데이터를 정규화하는 단계; 및[식 1]TL: 녹는점의 아래 구간에서 MS-HRM 형광 변화율이 일정한 온도;TR: 녹는점의 위 구간에서 MS-HRM 형광 변화율이 일정한 온도;dF/dT: 각 온도(T) 지점에서의 형광 변화율;a: 지수함수 배경 노이즈의 파라미터;C: 지수함수 배경 노이즈 값;F(T): 해당 온도 지점에서의 총 형광값;e: 자연상수; 및 M(T): 해당 온도 지점에서의 잔여 dsDNA에 기인한 총 형광값[식 2]Mmax: [TL, TR] 구간 내 M(T)의 최대값Mmin: [TL, TR] 구간 내 M(T)의 최소값M1(T): 해당 온도 지점에서 변성(denature)되지 않은 잔여 dsDNA의 비율b-3) 하기 식 3에 따라 CpG 부위의 메틸화 수준을 확인하는 단계
5 5
제4항에 있어서, 상기 프라미어는 서열번호 6 내지 15로 이루어진 군에서 선택되는, 간암 환자의 예후 예측을 위한 정보 제공 방법
6 6
제1항에 있어서, 상기 b)의 CpG 부위의 메틸화 수준을 측정하는 단계는 PCR, 메틸화 특이 PCR(methylation specific PCR), 실시간 메틸화 특이 PCR(real time methylation specific PCR), MethyLight PCR, MehtyLight digital PCR, EpiTYPER, 메틸화 DNA 특이적 결합 단백질을 이용한 PCR, 정량 PCR, DNA 칩, 분자 비콘(molecular beacon), 차세대 염기서열분석 패널(NGS panel), 파이로시퀀싱 및 바이설파이트 시퀀싱으로 이루어진 군에서 선택되는 방법으로 수행되는, 간암 환자의 예후 예측을 위한 정보 제공 방법
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제1항에 있어서, 상기 생물학적 시료는 간암 환자로부터 분리된 조직, 세포, 혈액, 혈장, 체액, 대변 및 소변으로 이루어진 군에서 선택되는, 간암 환자의 예후 예측을 위한 정보 제공 방법
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제7항에 있어서, 상기 조직은 간암 조직인, 간암 환자의 예후 예측을 위한 정보 제공 방법
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서열번호 6 내지 15로 이루어진 군에서 선택되는 프라미어를 포함하는, 간암 환자의 예후 예측을 위한 정보 제공 키트
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 과학기술정보통신부 연세대학교 산학협력단 포스트게놈 다부처유전체 사업 [통합이지바로][총괄/1세부]세포 특이적 후성유전체마커 발굴 및 검증(3/3단계, 1/3차년도) (총괄:국제 협력 기반 암 특이적 후성유전체 마커 개발)