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DENND2A, PRDM8 및 ZBTB22를 암호화하는 유전자의 돌연변이를 검출할 수 있는 제제를 포함하는, 전립선암의 치료 효과 예측 또는 예후 진단용 조성물
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제 1항에 있어서,상기 진단용 조성물은 ACSS2, ACTN1, ALG13, ANTXR2, AQP12A, BCAT1, C2orf42, CCDC102A, CCDC102B, CCNB1IP1, CCND3, CD34, CDC16, CDH2, CNN1, COL28A1, CORO1A, CRIP1, CSN2, CYLC2, CYP4B1, DCAF13, EDF1, EPAS1, FCHO2, FGD2, FLVCR2, FOXR2, CMTR2, GSTA3, HIST1H3B, HNRNPUL2, HOXB8, IL7R, KLHL20, KPNA4, KRTAP4-4, LPL, LRRC28, MAP7, MCCC1, MED25, METRNL, MS4A14, NCOA3, NFATC2, NPHP1, NPIPA1, NPPA, NPR1, OR4D2, OR51G1, PLEKHS1, PNPLA2, PTX3, RAC2, RAD21, RPL3L, SAV1, SHC2, SLC30A9, SLC36A3, SOX1, SRP68, STK36, TEX26, TFG, TMEM178A, TTC39B, TUBG1, ZDHHC24 및 ZFAND1로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 하나를 암호화하는 유전자의 돌연변이를 검출할 수 있는 제제를 더 포함하는 것인, 전립선암 환자의 치료 효과 예측 또는 예후 진단용 조성물
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제 1항에 있어서,상기 DENND2A를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 23의 아미노산 서열에서, A276V 및 K540T로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 하나의 미스센스 돌연변이고;상기 PRDM8을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 56의 아미노산 서열에서, A172V 및 Q212H로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 하나의 미스센스 돌연변이고;상기 ZBTB22를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 73의 아미노산 서열에서, R565C인 미스센스 돌연변이거나, R148*인 넌센스 돌연변이; 인 전립선암의 치료 효과 예측 또는 예후 진단용 조성물
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제 2항에 있어서,상기 ACSS2를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 1의 아미노산 서열에서, Q433H인 미스센스 돌연변이고;상기 ACTN1를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 2의 아미노산 서열에서, V829Gfs*28인 프레임 시프트 결실(frame shift delete, FS del) 돌연변이고;상기 ALG13을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 3의 아미노산 서열에서, K263Rfs*7인 프레임 시프트 결실(frame shift delete, FS del) 돌연변이고;상기 ANTXR2를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 4의 아미노산 서열에서, Y257*인 넌센스 돌연변이고;상기 AQP12A를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 5의 아미노산 서열에서, V73F인 미스센스 돌연변이고;상기 BCAT1를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 6의 아미노산 서열에서, T59M인 미스센스 돌연변이고;상기 C2orf42를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 7의 아미노산 서열에서, V90M인 미스센스 돌연변이고;상기 CCDC102A를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 8의 아미노산 서열에서, K464R인 미스센스 돌연변이고;상기 CCDC102B를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 9의 아미노산 서열에서, T445A인 미스센스 돌연변이고;상기 CCNB1IP1을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 10의 아미노산 서열에서, Y109C인 미스센스 돌연변이고;상기 CCND3를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 11의 아미노산 서열에서, R135L인 미스센스 돌연변이고;상기 CD34를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 12의 아미노산 서열에서, R314H인 미스센스 돌연변이고;상기 CDC16를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 13의 아미노산 서열에서, D442G인 미스센스 돌연변이고;상기 CDH2를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 14의 아미노산 서열에서, P297H 및 R430W로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 하나의 미스센스 돌연변이고;상기 CNN1을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 15의 아미노산 서열에서, A202V인 미스센스 돌연변이고;상기 COL28A1을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 16의 아미노산 서열에서, G424R인 미스센스 돌연변이고;상기 CORO1A를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 17의 아미노산 서열에서, R206H인 미스센스 돌연변이고;상기 CRIP1을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 18의 아미노산 서열에서, G42Afs*?인 프레임 시프트 결실(frame shift delete, FS del) 돌연변이고;상기 CSN2를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 19의 아미노산 서열에서, Q215*인 넌센스 돌연변이고;상기 CYLC2를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 20의 아미노산 서열에서, P74Q인 미스센스 돌연변이고;상기 CYP4B1을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 21의 아미노산 서열에서, R274Q인 미스센스 돌연변이고;상기 DCAF13을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 22의 아미노산 서열에서, I373T인 미스센스 돌연변이고;상기 EDF1을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 24의 아미노산 서열에서, P17T인 미스센스 돌연변이고;상기 EPAS1을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 25의 아미노산 서열에서, A578Pfs*118인 프레임 시프트 결실(frame shift delete, FS del) 돌연변이고;상기 FCHO2를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 26의 아미노산 서열에서, G420Efs*24인 프레임 시프트 결실(frame shift delete, FS del) 돌연변이고;상기 FGD2를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 27의 아미노산 서열에서, L595R인 미스센스 돌연변이고;상기 FLVCR2를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 28의 아미노산 서열에서, L298V인 미스센스 돌연변이고;상기 FOXR2를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 29의 아미노산 서열에서, A47V인 미스센스 돌연변이고;상기 CMTR2을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 30의 아미노산 서열에서, L533V인 미스센스 돌연변이고;상기 GSTA3를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 31의 아미노산 서열에서, T186S인 미스센스 돌연변이고;상기 HIST1H3B를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 32의 아미노산 서열에서, C97Y인 미스센스 돌연변이고;상기 HNRNPUL2를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 33의 아미노산 서열에서, Q652_N653delinsH인 인-프레임 결실 (in-frame delete, IF del) 돌연변이고;상기 HOXB8을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 34의 아미노산 서열에서, V6I인 미스센스 돌연변이고;상기 IL7R을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 35의 아미노산 서열에서, Q171K인 미스센스 돌연변이고;상기 KLHL20을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 36의 아미노산 서열에서, R247S인 미스센스 돌연변이고;상기 KPNA4를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 37의 아미노산 서열에서, I240V인 미스센스 돌연변이고;상기 KRTAP4-4를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 38의 아미노산 서열에서, R37H인 미스센스 돌연변이고;상기 LPL을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 39의 아미노산 서열에서, N152K인 미스센스 돌연변이고;상기 LRRC28을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 40의 아미노산 서열에서, S249L인 미스센스 돌연변이고;상기 MAP7을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 41의 아미노산 서열에서, A292V인 미스센스 돌연변이고;상기 MCCC1을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 42의 아미노산 서열에서, Y453*인 넌센스 돌연변이고;상기 MED25를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 43의 아미노산 서열에서, R132C인 미스센스 돌연변이고;상기 METRNL을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 44의 아미노산 서열에서, G78V인 미스센스 돌연변이고;상기 MS4A14를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 45의 아미노산 서열에서, Q333K인 미스센스 돌연변이고;상기 NCOA3을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 46의 아미노산 서열에서, S867G인 미스센스 돌연변이고;상기 NFATC2를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 47의 아미노산 서열에서, V238M 및 T893A로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 하나의 미스센스 돌연변이고;상기 NPHP1을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 48의 아미노산 서열에서, E110G 및 R585Q로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 하나의 미스센스 돌연변이거나, K241*인 넌센스 돌연변이고;상기 NPIPA1을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 49의 아미노산 서열에서, I347T인 미스센스 돌연변이고;상기 NPPA를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 50의 아미노산 서열에서, G71E인 미스센스 돌연변이고;상기 NPR1을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 51의 아미노산 서열에서, R525W인 미스센스 돌연변이고;상기 OR4D2를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 52의 아미노산 서열에서, S254R인 미스센스 돌연변이고;상기 OR51G1을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 53의 아미노산 서열에서, V151L인 미스센스 돌연변이고;상기 PLEKHS1를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 54의 아미노산 서열에서, P327H인 미스센스 돌연변이고;상기 PNPLA2를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 55의 아미노산 서열에서, F35Sfs*57인 프레임 시프트 결실(frame shift delete, FS del) 돌연변이고;상기 PTX3을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 57의 아미노산 서열에서, X44_splice인 스플라이스 사이트 (splice region) 돌연변이고;상기 RAC2를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 58의 아미노산 서열에서, R187H인 미스센스 돌연변이고;상기 RAD21을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 59의 아미노산 서열에서, I311K인 미스센스 돌연변이고;상기 RPL3L을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 60의 아미노산 서열에서, R249H인 미스센스 돌연변이고;상기 SAV1을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 61의 아미노산 서열에서, P35L인 미스센스 돌연변이고;상기 SHC2를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 62의 아미노산 서열에서, R194Q인 미스센스 돌연변이고;상기 SLC30A9를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 63의 아미노산 서열에서, R151Efs*19인 프레임 시프트 결실(frame shift delete, FS del) 돌연변이고;상기 SLC36A3을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 64의 아미노산 서열에서, V170M인 미스센스 돌연변이고;상기 SOX1을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 65의 아미노산 서열에서, G381_V382dup인 인-프레임 삽입 (in-frame insert, IF ins) 돌연변이고;상기 SRP68을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 66의 아미노산 서열에서, G15del인 인-프레임 결실 (in-frame delete, IF del) 돌연변이고;상기 STK36을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 67의 아미노산 서열에서, S41L, T222A 및 R120H로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 하나의 미스센스 돌연변이고;상기 TEX26을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 68의 아미노산 서열에서, R149*인 넌센스 돌연변이고;상기 TFG를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 69의 아미노산 서열에서, S100T인 미스센스 돌연변이고;상기 TMEM178A를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 70의 아미노산 서열에서, L10F인 미스센스 돌연변이고;상기 TTC39B를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 71의 아미노산 서열에서, I534M인 미스센스 돌연변이고;상기 TUBG1를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 72의 아미노산 서열에서, R244C인 미스센스 돌연변이고;상기 ZDHHC24를 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 74의 아미노산 서열에서, H217Mfs*82인 프레임 시프트 결실(frame shift delete, FS del) 돌연변이고;상기 ZFAND1을 암호화하는 유전자의 돌연변이는 서열번호 75의 아미노산 서열에서, R130*인 넌센스 돌연변이; 인 전립선암의 치료 효과 예측 또는 예후 진단용 조성물
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5
제 1항 또는 제 2항에 있어서,상기 제제는 상기 유전자의 돌연변이에 대한 프라이머 세트 또는 프로브 또는 상기 유전자의 돌연변이가 발현하는 단백질에 대한 항체를 포함하는 것인, 전립선암의 치료 효과 예측 또는 예후 진단용 조성물
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제 1항 또는 제 2항의 조성물을 포함하는, 전립선암의 치료 효과 예측 또는 예후 진단용 키트
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전립선암 환자의 샘플로부터 시료 DNA를 준비하는 단계;상기 시료 DNA를 청구항 6의 키트를 이용하여 증폭하는 단계; 및상기 증폭 결과로부터 생존 특이적 마커의 유무를 확인하는 단계; 를 포함하는, 전립선암 환자의 예후 진단을 위해 필요한 정보를 제공하는 방법
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제 7항에 있어서,상기 방법은 전립선암 환자의 총 생존율 또는 무병 생존율을 예측하는 방법
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제 7항에 있어서,DENND2A, PRDM8 및 ZBTB22를 암호화하는 유전자에서 돌연변이가 확인되고, 전립선암 환자인 경우, 상기 전립선암 환자의 생존율이 상기 유전자에서 돌연변이가 확인되지 않은 사람의 생존율보다 낮거나, 상기 전립선암 환자의 전립선암의 재발율이 상기 유전자에서 돌연변이가 확인되지 않은 사람의 전립선암의 재발율보다 높은 것으로 판단하는 단계; 를 더 포함하는 방법
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제 9항에 있어서, ACSS2, ACTN1, ALG13, ANTXR2, AQP12A, BCAT1, C2orf42, CCDC102A, CCDC102B, CCNB1IP1, CCND3, CD34, CDC16, CDH2, CNN1, COL28A1, CORO1A, CRIP1, CSN2, CYLC2, CYP4B1, DCAF13, EDF1, EPAS1, FCHO2, FGD2, FLVCR2, FOXR2, CMTR2, GSTA3, HIST1H3B, HNRNPUL2, HOXB8, IL7R, KLHL20, KPNA4, KRTAP4-4, LPL, LRRC28, MAP7, MCCC1, MED25, METRNL, MS4A14, NCOA3, NFATC2, NPHP1, NPIPA1, NPPA, NPR1, OR4D2, OR51G1, PLEKHS1, PNPLA2, PTX3, RAC2, RAD21, RPL3L, SAV1, SHC2, SLC30A9, SLC36A3, SOX1, SRP68, STK36, TEX26, TFG, TMEM178A, TTC39B, TUBG1, ZDHHC24 및 ZFAND1로 이루어진 군으로부터 선택되는 적어도 하나를 암호화하는 유전자에서 돌연변이가 확인될 경우, 전립선암 환자의 생존율이 상기 유전자에서 돌연변이가 확인되지 않은 사람의 생존율보다 낮거나, 상기 전립선암 환자의 전립선암의 재발율이 상기 유전자에서 돌연변이가 확인되지 않은 사람의 전립선암의 재발율보다 높은 것으로 판단하는 단계; 를 더 포함하는 방법
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