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폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법

  • 기술번호 : KST2022016277
  • 담당센터 : 서울서부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-6124-6930
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 명세서에서는 개체로부터 분리된 생물학적 시료에 대한, ITGAE, ID2, IFNG, CD7, CXCR6, PRF1, GZMA, GZMB, GNLY, GZMK, GZMH, GZMM, HAVCR2 및 LAG3 중 적어도 하나의 마커 유전자에 대한 mRNA 또는 이의 단백질의 수준을 측정하는 단계, 및 측정된 마커 유전자에 대한 mRNA 또는 이의 단백질의 수준을 기초로 개체에 대한 면역 항암 요법의 치료 반응을 결정하는 단계를 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법을 제공한다.
Int. CL G01N 33/574 (2006.01.01) C12Q 1/6886 (2018.01.01)
CPC G01N 33/57423(2013.01) G01N 33/57484(2013.01) C12Q 1/6886(2013.01) G01N 2800/52(2013.01) C12Q 2600/158(2013.01) C12Q 2600/106(2013.01)
출원번호/일자 1020210015712 (2021.02.03)
출원인 연세대학교 산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2022-0112121 (2022.08.10) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 공개
심사진행상태 수리
심판사항
구분 국내출원/신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2021.02.03)
심사청구항수 26

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 연세대학교 산학협력단 대한민국 서울특별시 서대문구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 김혜련 서울특별시 서대문구
2 하상준 서울특별시 서대문구
3 이인석 서울특별시 중구
4 조재원 서울특별시 강남구
5 김가민 서울특별시 서대문구
6 박세연 서울특별시 용산구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인인벤싱크 대한민국 서울특별시 강남구 언주로 ***, *층, *층 (역삼동, 아레나빌딩)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
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번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2021.02.03 수리 (Accepted) 1-1-2021-0142639-68
2 심사처리보류(연기)보고서
Report of Deferment (Postponement) of Processing of Examination
2022.02.23 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-6-2022-0035123-94
3 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2022.03.15 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 심사처리보류(연기)보고서
Report of Deferment (Postponement) of Processing of Examination
2022.04.13 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-6-2022-0064573-95
5 출원심사처리보류통지서
Notice of Deferment of Processing of Application Examination
2022.04.18 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2022-0285970-12
6 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2022.06.09 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-6-2022-0101803-15
7 심사처리보류(연기)보고서
Report of Deferment (Postponement) of Processing of Examination
2022.06.13 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-6-2022-0100547-42
8 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2022.06.14 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2022-0436117-91
9 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견서·답변서·소명서
2022.08.12 수리 (Accepted) 1-1-2022-0848170-51
10 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2022.08.12 접수중 (On receiving) 1-1-2022-0848169-15
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번호 청구항
1 1
개체로부터 분리된 생물학적 시료에 대한, ITGAE, ID2, IFNG, CD7, CXCR6, PRF1, GZMA, GZMB, GNLY, GZMK, GZMH, GZMM, HAVCR2 및 LAG3 중 적어도 하나의 마커 유전자에 대한 mRNA 또는 이의 단백질의 수준을 측정하는 단계, 및측정된 상기 마커 유전자에 대한 mRNA 또는 이의 단백질의 수준을 기초로 상기 개체에 대한 면역 항암 요법의 치료 반응을 결정하는 단계를 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응을 예측하는 방법
2 2
제 1항에 있어서,상기 측정하는 단계는,정상 대조군의 시료에 대한 ITGAE, ID2, IFNG, CD7, CXCR6, PRF1, GZMA, GZMB, GNLY, GZMK, GZMH, GZMM, HAVCR2 및 LAG3 중 적어도 하나의 마커 유전자에 대한 mRNA 또는 이의 단백질의 수준을 측정하는 단계를 포함하고,상기 결정하는 단계는,상개 개체에 대한 상기 마커 유전자에 대한 mRNA 또는 이의 단백질의 수준이 상기 정상 대조군의 수준보다 낮은 경우, 상기 개체를 면역 항암 요법에 대한 치료 반응성이 음성인 것으로 결정하는 단계를 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
3 3
제 1항 또는 제 2항에 있어서,상기 적어도 하나의 유전자 마커는 ITGAE 및/또는 GZMA인, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
4 4
개체로부터 분리된 생물학적 시료에 대한, GZMB+CD103+CD8+T세포의 수준을 측정하는 단계, 및 측정된 상기 GZMB+CD103+CD8+T세포의 수준을 기초로 상기 개체에 대한 면역 항암 요법의 치료 반응을 결정하는 단계를 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
5 5
제 4항에 있어서,상기 GZMB+CD103+CD8+T세포는,ID2, IFNG, CD7, TNFRSF4, CCR7, IL7R, CXCR4, CXCR6, PRF1, GZMA, GNLY, GZMK, GZMH, GZMM, PDCD1, CTAL4, TIGIT, HAVCR2, LAG3, ICOS, TOX 및 TCF7 중 적어도 하나의 마커 유전자에 대한 mRNA 또는 이의 단백질을 발현하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
6 6
제 5항에 있어서,상기 GNLY의 log FC(fold change)는,1
7 7
제 4항에 있어서,상기 GZMB의 log FC(fold change)는,1
8 8
제 4항에 있어서,상기 GZMB+CD103+CD8+T세포에 대한 예측력은, AUC 0
9 9
제 4항에 있어서,상기 측정하는 단계는,정상 대조군의 시료에 대한 GZMB+CD103+CD8+T세포를 측정하는 단계를 포함하고,상기 면역 항암 요법의 치료 반응을 결정하는 단계는,측정된 개체에 대한 상기 GZMB+CD103+CD8+T세포의 수준이 상기 정상 대조군 시료에 대한 GZMB+ITGAE(CD103)+CD8+T세포의 수준보다 감소된 수준을 나타내는 경우,상기 개체가 면역 항암 요법에 대한 반응성이 음성인 것으로 결정하는 단계를 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
10 10
제 4항에 있어서,상기 측정하는 단계는,CXCR5+CD20+B세포 또는 CXCL13+CD4+T세포(regulatory T cells, Tregs)를 측정하는 단계를 더 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
11 11
제 10항에 있어서,상기 측정하는 단계는,정상 대조군의 시료에 대한 CXCL13+CD4+T세포를 측정하는 단계를 더 포함하고,상기 결정하는 단계는,측정된 개체에 대한 상기 CXCL13+CD4+T세포의 수준이 상기 정상 대조군에 대한 CXCL13+CD4+T세포의 수준보다 감소된 수준을 나타내는 경우, 상기 개체가 면역 항암 요법에 대한 반응성이 음성인 것으로 결정하는 단계를 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
12 12
제 10항에 있어서,상기 CXCL13+CD4+T세포는,CD2, CD6, CD82
13 13
제 10항에 있어서,상기 CXCL13+CD4+T세포는,PDCD1, MAF 및 SH2D1A 중 적어도 하나의 마커 유전자에 대한 mRNA 또는 이의 단백질을 더 발현하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
14 14
제 10항에 있어서,상기 측정하는 단계는,정상 대조군의 시료에 대한 CXCR5+CD20+B세포의 수준을 측정하는 단계를 더 포함하고,상기 결정하는 단계는,측정된 개체에 대한 상기 CXCR5+CD20+B세포의 수준이 상기 정상 대조군 시료에 대한 CXCR5+CD20+B 세포의 수준보다 감소된 수준을 나타내는 경우, 상기 개체가 면역 항암 요법에 대한 치료 반응이 음성인 것으로 결정하는 단계를 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
15 15
제 10항에 있어서,상기 CXCR5+CD20+B세포는,HLA-DPB1, HLA-DRB5, HLA-DQA2 및 HLA-C 중 적어도 하나의 항원 표시 인자 (antigen presentation molecule)을 발현하고,TAP1 마커 유전자에 대한 mRNA 또는 이의 단백질을 발현하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
16 16
제 15항에 있어서,상기 항원은,정상 대조군에 대한 CXCR5+CD20+B세포의 항원 표지 인자 발현 수준보다 감소된 수준을 나타내는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
17 17
제 4항에 있어서,상기 측정하는 단계는,상기 GZMB+CD103+CD8+T세포 수를 측정하는 단계를 더 포함하고,상기 결정하는 단계는,측정된 상기 GZMB+CD103+CD8+T세포 수가 1 cells/mm2 이하이거나,전체 CD103+CD8+T세포에 대한 상기 GZMB+CD103+CD8+T세포 수의 비율이 30 % 미만인 경우,상기 개체가 면역 항암 요법에 대한 치료 반응이 음성인 것으로 결정하는 단계를 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
18 18
제 4항에 있어서,상기 측정하는 단계는,상기 GZMB+CD103+CD8+T세포의 GZMB+CD103+CD8+T세포로의 전환 확률(transition probability)을 측정하는 단계를 더 포함하고,상기 결정하는 단계는,전체 CD8+T세포로의 전환 확률에 대한 상기GZMB+CD103+CD8+T세포로의 전환 확률이 41%이하인 경우, 상기 개체가 면역 항암 요법에 대한 치료 반응이 음성인 것으로 결정하는 단계를 더 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
19 19
제 4항에 있어서,상기 측정하는 단계는,상기 개체 및 정상 대조군의 시료에 대한 3 차 림프절 구조 (tertiary lymphoid structures, TLS)의 면적를 측정하는 단계를 더 포함하고,상기 결정하는 단계는,측정된 개체에 대한 상기 TLS의 면적이, 상기 정상 대조군 시료에 대한 TLS 면적의 수준보다 70 %이상 감소된 수준을 나타내거나,상기 개체에 대한 TLS의 면적이 5 mm2 미만인 경우,상기 개체가 면역 항암 요법에 대한 치료 반응이 음성인 것으로 결정하는 단계를 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
20 20
제 4항에 있어서,상기 개체는, 폐암 의심 개체이고,상기 생물학적 시료는,조직, 말초 혈액, 혈청 및 혈장으로 이루어진 그룹에서 선택된 적어도 하나를 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
21 21
제 4항에 있어서,상기 면역 항암 요법은,항 PD-1 치료인, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
22 22
제 4항에 있어서,상기 GZMB+CD103+CD8+T세포의 수준은,웨스턴 블롯(western blot), 엘라이자(enzyme linked immunosorbent assay, ELISA), 방사선면역분석(Radioimmunoassay), 방사 면역 확산법(radioimmunodiffusion), 오우크테로니(ouchterlony) 면역 확산법, 로켓 면역전기영동, 면역조직화학법(immunohistochemistry, IHC), 면역침전 분석법(Immunoprecipitation Assay), 보체 고정 분석법(Complement Fixation Assay), 유세포분석(Fluorescence Activated Cell Sorter, FACS) 및 단백질 칩(protein chip) 중 적어도 하나의 방법으로 측정되는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
23 23
개체로부터 분리된 생물학적 시료에 대한, GZMB+CD103+CD8+T세포의 수준을 측정하도록 구성된 제제를 포함하는, 폐암 개체의 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측용 키트
24 24
제 23항에 있어서,상기 개체는, 폐암 의심 개체이고,상기 생물학적 시료는,조직, 말초 혈액, 혈청 및 혈장으로 이루어진 그룹에서 선택된 적어도 하나를 포함하는, 폐암 개체의 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측용 키트
25 25
제 23항에 있어서,상기 제제는, 상기 GZMB+CD103+CD8+T세포의 ID2, IFNG, CD7, TNFRSF4, CCR7, IL7R, CXCR4, CXCR6, PRF1, GZMA, GNLY, GZMK, GZMH, GZMM, PDCD1, CTAL4, TIGIT, HAVCR2, LAG3, ICOS, TOX 및 TCF7 중 적어도 하나의 마커 유전자에 대한 mRNA 또는 이의 단백질을 측정하도록 구성된 제제를 더 포함하는, 폐암 개체의 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측용 키트
26 26
제 23항에 있어서,상기 제제는, CXCR5+CD20+B세포 또는 CXCL13+CD4+T세포의 수준을 측정하도록 구성된 제제를 더 포함하는, 폐암 개체의 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측용 키트
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
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7 과학기술정보통신부 연세대학교 산학협력단 바이오.의료기술개발(R&D) 단일세포 다중오믹스 기술을 활용한 면역리액톰 유도기전 규명
8 과학기술정보통신부 연세대학교 산학협력단 집단연구지원 비임파성 장기 면역 연구센터