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개체로부터 분리된 생물학적 시료에 대한, ITGAE, ID2, IFNG, CD7, CXCR6, PRF1, GZMA, GZMB, GNLY, GZMK, GZMH, GZMM, HAVCR2 및 LAG3 중 적어도 하나의 마커 유전자에 대한 mRNA 또는 이의 단백질의 수준을 측정하는 단계, 및측정된 상기 마커 유전자에 대한 mRNA 또는 이의 단백질의 수준을 기초로 상기 개체에 대한 면역 항암 요법의 치료 반응을 결정하는 단계를 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응을 예측하는 방법
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제 1항에 있어서,상기 측정하는 단계는,정상 대조군의 시료에 대한 ITGAE, ID2, IFNG, CD7, CXCR6, PRF1, GZMA, GZMB, GNLY, GZMK, GZMH, GZMM, HAVCR2 및 LAG3 중 적어도 하나의 마커 유전자에 대한 mRNA 또는 이의 단백질의 수준을 측정하는 단계를 포함하고,상기 결정하는 단계는,상개 개체에 대한 상기 마커 유전자에 대한 mRNA 또는 이의 단백질의 수준이 상기 정상 대조군의 수준보다 낮은 경우, 상기 개체를 면역 항암 요법에 대한 치료 반응성이 음성인 것으로 결정하는 단계를 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
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제 1항 또는 제 2항에 있어서,상기 적어도 하나의 유전자 마커는 ITGAE 및/또는 GZMA인, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
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개체로부터 분리된 생물학적 시료에 대한, GZMB+CD103+CD8+T세포의 수준을 측정하는 단계, 및 측정된 상기 GZMB+CD103+CD8+T세포의 수준을 기초로 상기 개체에 대한 면역 항암 요법의 치료 반응을 결정하는 단계를 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
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제 4항에 있어서,상기 GZMB+CD103+CD8+T세포는,ID2, IFNG, CD7, TNFRSF4, CCR7, IL7R, CXCR4, CXCR6, PRF1, GZMA, GNLY, GZMK, GZMH, GZMM, PDCD1, CTAL4, TIGIT, HAVCR2, LAG3, ICOS, TOX 및 TCF7 중 적어도 하나의 마커 유전자에 대한 mRNA 또는 이의 단백질을 발현하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
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제 5항에 있어서,상기 GNLY의 log FC(fold change)는,1
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제 4항에 있어서,상기 GZMB의 log FC(fold change)는,1
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8
제 4항에 있어서,상기 GZMB+CD103+CD8+T세포에 대한 예측력은, AUC 0
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제 4항에 있어서,상기 측정하는 단계는,정상 대조군의 시료에 대한 GZMB+CD103+CD8+T세포를 측정하는 단계를 포함하고,상기 면역 항암 요법의 치료 반응을 결정하는 단계는,측정된 개체에 대한 상기 GZMB+CD103+CD8+T세포의 수준이 상기 정상 대조군 시료에 대한 GZMB+ITGAE(CD103)+CD8+T세포의 수준보다 감소된 수준을 나타내는 경우,상기 개체가 면역 항암 요법에 대한 반응성이 음성인 것으로 결정하는 단계를 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
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제 4항에 있어서,상기 측정하는 단계는,CXCR5+CD20+B세포 또는 CXCL13+CD4+T세포(regulatory T cells, Tregs)를 측정하는 단계를 더 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
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제 10항에 있어서,상기 측정하는 단계는,정상 대조군의 시료에 대한 CXCL13+CD4+T세포를 측정하는 단계를 더 포함하고,상기 결정하는 단계는,측정된 개체에 대한 상기 CXCL13+CD4+T세포의 수준이 상기 정상 대조군에 대한 CXCL13+CD4+T세포의 수준보다 감소된 수준을 나타내는 경우, 상기 개체가 면역 항암 요법에 대한 반응성이 음성인 것으로 결정하는 단계를 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
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제 10항에 있어서,상기 CXCL13+CD4+T세포는,CD2, CD6, CD82
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제 10항에 있어서,상기 CXCL13+CD4+T세포는,PDCD1, MAF 및 SH2D1A 중 적어도 하나의 마커 유전자에 대한 mRNA 또는 이의 단백질을 더 발현하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
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제 10항에 있어서,상기 측정하는 단계는,정상 대조군의 시료에 대한 CXCR5+CD20+B세포의 수준을 측정하는 단계를 더 포함하고,상기 결정하는 단계는,측정된 개체에 대한 상기 CXCR5+CD20+B세포의 수준이 상기 정상 대조군 시료에 대한 CXCR5+CD20+B 세포의 수준보다 감소된 수준을 나타내는 경우, 상기 개체가 면역 항암 요법에 대한 치료 반응이 음성인 것으로 결정하는 단계를 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
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제 10항에 있어서,상기 CXCR5+CD20+B세포는,HLA-DPB1, HLA-DRB5, HLA-DQA2 및 HLA-C 중 적어도 하나의 항원 표시 인자 (antigen presentation molecule)을 발현하고,TAP1 마커 유전자에 대한 mRNA 또는 이의 단백질을 발현하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
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제 15항에 있어서,상기 항원은,정상 대조군에 대한 CXCR5+CD20+B세포의 항원 표지 인자 발현 수준보다 감소된 수준을 나타내는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
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제 4항에 있어서,상기 측정하는 단계는,상기 GZMB+CD103+CD8+T세포 수를 측정하는 단계를 더 포함하고,상기 결정하는 단계는,측정된 상기 GZMB+CD103+CD8+T세포 수가 1 cells/mm2 이하이거나,전체 CD103+CD8+T세포에 대한 상기 GZMB+CD103+CD8+T세포 수의 비율이 30 % 미만인 경우,상기 개체가 면역 항암 요법에 대한 치료 반응이 음성인 것으로 결정하는 단계를 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
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제 4항에 있어서,상기 측정하는 단계는,상기 GZMB+CD103+CD8+T세포의 GZMB+CD103+CD8+T세포로의 전환 확률(transition probability)을 측정하는 단계를 더 포함하고,상기 결정하는 단계는,전체 CD8+T세포로의 전환 확률에 대한 상기GZMB+CD103+CD8+T세포로의 전환 확률이 41%이하인 경우, 상기 개체가 면역 항암 요법에 대한 치료 반응이 음성인 것으로 결정하는 단계를 더 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
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제 4항에 있어서,상기 측정하는 단계는,상기 개체 및 정상 대조군의 시료에 대한 3 차 림프절 구조 (tertiary lymphoid structures, TLS)의 면적를 측정하는 단계를 더 포함하고,상기 결정하는 단계는,측정된 개체에 대한 상기 TLS의 면적이, 상기 정상 대조군 시료에 대한 TLS 면적의 수준보다 70 %이상 감소된 수준을 나타내거나,상기 개체에 대한 TLS의 면적이 5 mm2 미만인 경우,상기 개체가 면역 항암 요법에 대한 치료 반응이 음성인 것으로 결정하는 단계를 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
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제 4항에 있어서,상기 개체는, 폐암 의심 개체이고,상기 생물학적 시료는,조직, 말초 혈액, 혈청 및 혈장으로 이루어진 그룹에서 선택된 적어도 하나를 포함하는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
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제 4항에 있어서,상기 면역 항암 요법은,항 PD-1 치료인, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
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제 4항에 있어서,상기 GZMB+CD103+CD8+T세포의 수준은,웨스턴 블롯(western blot), 엘라이자(enzyme linked immunosorbent assay, ELISA), 방사선면역분석(Radioimmunoassay), 방사 면역 확산법(radioimmunodiffusion), 오우크테로니(ouchterlony) 면역 확산법, 로켓 면역전기영동, 면역조직화학법(immunohistochemistry, IHC), 면역침전 분석법(Immunoprecipitation Assay), 보체 고정 분석법(Complement Fixation Assay), 유세포분석(Fluorescence Activated Cell Sorter, FACS) 및 단백질 칩(protein chip) 중 적어도 하나의 방법으로 측정되는, 폐암에서 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측 방법
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개체로부터 분리된 생물학적 시료에 대한, GZMB+CD103+CD8+T세포의 수준을 측정하도록 구성된 제제를 포함하는, 폐암 개체의 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측용 키트
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제 23항에 있어서,상기 개체는, 폐암 의심 개체이고,상기 생물학적 시료는,조직, 말초 혈액, 혈청 및 혈장으로 이루어진 그룹에서 선택된 적어도 하나를 포함하는, 폐암 개체의 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측용 키트
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제 23항에 있어서,상기 제제는, 상기 GZMB+CD103+CD8+T세포의 ID2, IFNG, CD7, TNFRSF4, CCR7, IL7R, CXCR4, CXCR6, PRF1, GZMA, GNLY, GZMK, GZMH, GZMM, PDCD1, CTAL4, TIGIT, HAVCR2, LAG3, ICOS, TOX 및 TCF7 중 적어도 하나의 마커 유전자에 대한 mRNA 또는 이의 단백질을 측정하도록 구성된 제제를 더 포함하는, 폐암 개체의 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측용 키트
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제 23항에 있어서,상기 제제는, CXCR5+CD20+B세포 또는 CXCL13+CD4+T세포의 수준을 측정하도록 구성된 제제를 더 포함하는, 폐암 개체의 면역 항암 요법에 대한 치료 반응 예측용 키트
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