| 1 |
1
유전자 발현량 예측 방법에 있어서,뉴럴 네트워크를 학습시키기 위한 학습 샘플로부터 제1 SNP 데이터를 추출하는 단계;상기 제1 SNP 데이터를 입력 데이터로 하고 상기 제1 SNP 데이터에 대응되는 제1 유전자의 발현량을 목표 데이터로 하여 상기 뉴럴 네트워크를 학습시키는 단계;유전자 발현량을 예측하기 위한 테스트 샘플로부터 제2 SNP 데이터를 추출하는 단계; 및상기 제2 SNP 데이터를 입력 데이터로 하여 상기 학습된 뉴럴 네트워크로부터 상기 제2 SNP 데이터에 대응되는 제2 유전자의 발현량을 획득하는 단계를 포함하는, 방법
|
| 2 |
2
제 1항에 있어서,상기 제1 SNP 데이터를 추출하는 단계는,상기 학습 샘플로부터 SNP 염기 및 상기 SNP 염기 주변의 염기들을 포함하는 상기 제1 SNP 데이터를 추출하는 단계를 포함하고,상기 뉴럴 네트워크를 학습시키는 단계는,상기 SNP 염기 및 상기 주변 염기들 각각에 웨이트를 적용하는 단계를 포함하는, 방법
|
| 3 |
3
제 2항에 있어서,상기 웨이트를 적용하는 단계는,상기 SNP 염기가 상기 제1 유전자의 발현량에 미치는 영향에 기초하여 상기 SNP 염기에 웨이트를 적용하는 단계;상기 주변 염기들 각각이 상기 제1 유전자의 발현량에 미치는 영향에 기초하여 상기 주변 염기들 각각에 웨이트를 적용하는 단계; 및상기 주변 염기들 각각이 상기 SNP 염기에 미치는 영향에 기초하여 상기 주변 염기들 각각에 웨이트를 적용하는 단계를 포함하는, 방법
|
| 4 |
4
제 1항에 있어서,상기 제1 SNP 데이터를 추출하는 단계는,상기 제1 SNP 데이터를 연속되는 복수의 청크들로 구분하는 단계를 포함하고,상기 뉴럴 네트워크를 학습시키는 단계는,상기 복수의 청크들 간의 상호 작용을 고려한 연산을 수행하도록 상기 뉴럴 네트워크를 학습시키는 단계를 포함하는, 방법
|
| 5 |
5
제 4항에 있어서,상기 제1 SNP 데이터를 연속되는 복수의 청크들로 구분하는 단계는,상기 제1 유전자에 포함되는 염기쌍의 개수에 비례하도록 상기 청크들의 개수를 결정하는 단계를 포함하는, 방법
|
| 6 |
6
제 1항에 있어서,상기 제1 SNP 데이터를 추출하는 단계는,상기 제1 SNP 데이터에 포함된 SNP 영역에 표현된 SNP 염기가 상기 SNP 영역에 표현될 수 있는 염기들 중 몇 번째로 흔하게 표현되는 염기인지에 따라 0, 1 또는 2로 레이블링하는 단계를 포함하고,상기 뉴럴 네트워크를 학습시키는 단계는,상기 SNP 염기에 레이블링된 번호에 기초하여 연산을 수행하도록 상기 뉴럴 네트워크를 학습시키는 단계를 포함하는, 방법
|
| 7 |
7
제 1항에 있어서,상기 제1 SNP 데이터를 추출하는 단계는,상기 제1 SNP 데이터에 대해 One-Hot 인코딩을 수행하는 단계를 포함하고,상기 뉴럴 네트워크를 학습시키는 단계는,상기 One-Hot 인코딩된 제1 SNP 데이터를 입력 데이터로 하여 상기 뉴럴 네트워크를 학습시키는 단계를 포함하는, 방법
|
| 8 |
8
제 1항에 있어서,상기 뉴럴 네트워크를 학습시키는 단계는,상기 제1 SNP 데이터의 서로 구분되는 영역들 각각에 개별적인 커넬을 적용하고, 스트라이드 없이 연산을 수행하도록 상기 뉴럴 네트워크를 학습시키는 단계를 포함하는, 방법
|
| 9 |
9
제 1항에 있어서,상기 뉴럴 네트워크는 FCN이며, 상기 제2 유전자는 CCNA2 유전자인, 방법
|
| 10 |
10
제 1항에 있어서,상기 뉴럴 네트워크는 CNN이며, 상기 제2 유전자는 SERINC5 유전자인, 방법
|
| 11 |
11
유전자 발현량 예측 장치에 있어서,적어도 하나의 프로그램이 저장된 메모리; 및상기 적어도 하나의 프로그램을 실행함으로써 유전자 발현량을 예측하는 프로세서를 포함하고,상기 프로세서는,뉴럴 네트워크를 학습시키기 위한 학습 샘플로부터 제1 SNP 데이터를 추출하고, 상기 제1 SNP 데이터를 입력 데이터로 하고 상기 제1 SNP 데이터에 대응되는 제1 유전자의 발현량을 목표 데이터로 하여 상기 뉴럴 네트워크를 학습시키고, 유전자 발현량을 예측하기 위한 테스트 샘플로부터 제2 SNP 데이터를 추출하고, 상기 제2 SNP 데이터를 입력 데이터로 하여 상기 학습된 뉴럴 네트워크로부터 상기 제2 SNP 데이터에 대응되는 제2 유전자의 발현량을 획득하는, 장치
|
| 12 |
12
제 1항의 방법을 컴퓨터에서 실행하기 위한 프로그램을 기록한 컴퓨터로 읽을 수 있는 기록매체
|
