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세포 내 반응 시뮬레이션 장치 및 방법

  • 기술번호 : KST2023000855
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 세포의 라이프사이클에 대한 세포 내의 다양한 반응에 대해 시뮬레이션을 하기 위함이다. 이를 위해 본 발명은 세포모델을 생성하기 위한 세포와 관련된 정보를 포함하는 데이터베이스; 상기 데이터베이스로부터 상기 세포와 관련된 정보를 입력 받아 세포모델을 생성하는 모델생성모듈; 상기 데이터베이스로부터 상기 세포와 관련된 정보를 입력 받아 단백질 정량화를 위한 수치모델을 구성하는 발현체모듈;및상기 형성된 세포모델 내의 세포반응을 적어도 하나 이상의 컴퓨터에 할당하여 시뮬레이션 하는 시뮬레이션모듈을 포함한다.
Int. CL G16B 5/00 (2019.01.01) G16B 50/00 (2019.01.01)
CPC G16B 5/00(2013.01) G16B 5/00(2013.01)
출원번호/일자 1020150129167 (2015.09.11)
출원인 한국과학기술정보연구원
등록번호/일자 10-1610785-0000 (2016.04.04)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20160408) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 국내출원/신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2015.09.11)
심사청구항수 16

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술정보연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 유석종 대한민국 충청북도 청주시 흥덕구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 지관영 대한민국 서울 서초구 서초대로**길 ** (서초동) Block**빌딩 **층 ****호(인텝특허법률사무소)
2 김용인 대한민국 서울특별시 송파구 올림픽로 ** (잠실현대빌딩 *층)(특허법인(유한)케이비케이)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 주식회사 에스티원 부산광역시 기장군
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2015.09.11 수리 (Accepted) 1-1-2015-0887011-27
2 [우선심사신청]심사청구(우선심사신청)서
[Request for Preferential Examination] Request for Examination (Request for Preferential Examination)
2015.09.16 수리 (Accepted) 1-1-2015-0900652-24
3 [우선심사신청]선행기술조사의뢰서
[Request for Preferential Examination] Request for Prior Art Search
2015.09.21 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 [우선심사신청]선행기술조사보고서
[Request for Preferential Examination] Report of Prior Art Search
2015.09.22 수리 (Accepted) 9-1-2015-0061474-55
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2015.11.23 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2015-0810216-44
6 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2016.01.21 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2016-0071487-19
7 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2016.01.21 수리 (Accepted) 1-1-2016-0071490-46
8 등록결정서
Decision to grant
2016.03.25 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2016-0224523-56
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
세포모델을 생성하기 위한 세포와 관련된 정보를 포함하는 데이터베이스;상기 데이터베이스로부터 상기 세포와 관련된 정보를 입력받아 세포모델을 생성하는 모델생성모듈;상기 데이터베이스로부터 상기 세포와 관련된 정보를 입력받아 단백질 정량화를 위한 수치모델을 구성하는 발현체모듈;및 상기 형성된 세포모델 내의 세포반응을 적어도 하나 이상의 컴퓨터에 할당하여 시뮬레이션하는 시뮬레이션모듈을 포함하고,상기 수치모델은 개별 단백질들의 발현정보를 시계열로 정량화하는 것을 특징으로 하고,상기 발현체모듈은 상기 개별 단백질들의 발현정보에 기초하여 시계열로 개별 단백질의 발현량을 측정하고 상기 측정된 발현량을 기초로 시계열로 필요한 개별 단백질 생성량을 계산하여 상기 계산된 생성량을 기초로 생성된 개별 단백질을 실시간으로 상기 시뮬레이션 모듈에 입력하는 것을 특징으로 하고, 및상기 생성된 개별 단백질은 protase에 의해 단백질이 소멸하는 반응조건을 포함하는 것을 특징으로 하는 세포 내 반응 시뮬레이션 장치
2 2
제 1항에 있어서, 상기 세포 내 반응 시뮬레이션 장치는 상기 시뮬레이션을 수행하는 적어도 하나 이상의 컴퓨터가 분석한 시뮬레이션 결과정보를 저장하는 분석결과저장모듈; 및 상기 분석결과저장모듈로부터 상기 시뮬레이션 결과정보를 로딩하여 3차원 세포공간에 표시하는 가시화모듈;을 더 포함하는 세포 내 반응 시뮬레이션 장치
3 3
제 1항에 있어서, 상기 데이터베이스는, 생명체를 이루고 있는 구성물질에 관한 정보를 포함하는 오믹스 데이터베이스; 생명체의 세포 구조에 대한 정보를 포함하는 세포골격 데이터베이스; 및 세포 내의 반응에 관한 반응식 정보를 포함하는 세포반응 데이터베이스;를 포함하는 것을 특징으로 하는 세포 내 반응 시뮬레이션 장치
4 4
제 1항에 있어서, 상기 수치모델은 마이크로어레이나 RNA-seq실험을 통해 얻어지는 개별 단백질들을 시간에 따라 정량화하는 것을 특징으로 하는 세포 내 반응 시뮬레이션 장치
5 5
제 1항에 있어서, 상기 시뮬레이션모듈은 세포 내 공간을 큐브모양의 3차원 격자공간들로 분리한 후 상기 격자공간들을 상기 적어도 하나 이상의 컴퓨터에 개별적으로 할당하여 분석하는 것을 특징으로 하는 세포 내 반응 시뮬레이션 장치
6 6
제 1항에 있어서, 상기 시뮬레이션 모듈은 실제 세포 내에서의 반응과 유사하게 구현하기 위해 상기 발현체모듈로부터 생성되는 단백질들의 정보에 기반하여 지속적으로 세포 공간 내에 상기 단백질들을 생성하고 소멸시키면서 시뮬레이션하는 것을 특징으로 하는 세포 내 반응 시뮬레이션 장치
7 7
세포모델을 생성하기 위한 세포와 관련된 정보를 데이터베이스로부터 입력받는 단계;상기 데이터베이스로부터 상기 세포와 관련된 정보를 입력받아 세포모델을 생성하는 단계;상기 데이터베이스로부터 상기 세포와 관련된 정보를 입력받아 단백질 정량화를 위한 수치모델을 구성하는 단계,상기 수치모델은 개별 단백질들의 발현정보를 시계열로 정량화하는 것을 특징으로 하고;상기 개별 단백질들의 발현정보에 기초하여 시계열로 개별 단백질의 발현량을 측정하고 상기 측정된 발현량을 기초로 시계열로 필요한 개별 단백질 생성량을 계산하여 상기 계산된 생성량을 기초로 생성된 개별 단백질을 실시간으로 상기 생성된 세포모델에 입력하는 단계,상기 생성된 개별 단백질은 protase에 의해 단백질이 소멸하는 반응조건을 포함하는 것을 특징으로 하고;및 상기 형성된 세포모델 내의 세포반응을 적어도 하나 이상의 컴퓨터에 할당하여 시뮬레이션하는 단계;를 포함하는 세포 내 반응 시뮬레이션 방법
8 8
제 7항에 있어서, 상기 세포 내 반응 시뮬레이션 방법은 상기 시뮬레이션을 수행하는 적어도 하나 이상의 컴퓨터가 분석한 시뮬레이션 결과정보를 저장하는 단계; 및 상기 저장하는 단계로부터 상기 시뮬레이션 결과정보를 로딩하여 3차원 세포공간에 표시하는 단계;를 더 포함하는 세포 내 반응 시뮬레이션 방법
9 9
제 7항에 있어서, 상기 데이터베이스는, 생명체를 이루고 있는 구성물질에 관한 정보를 포함하는 오믹스 데이터베이스; 생명체의 세포 구조에 대한 정보를 포함하는 세포골격 데이터베이스; 및 세포 내의 반응에 관한 반응식 정보를 포함하는 세포반응 데이터베이스;를 포함하는 것을 특징으로 하는 세포 내 반응 시뮬레이션 방법
10 10
제 7항에 있어서, 상기 수치모델은 마이크로어레이나 RNA-seq실험을 통해 얻어지는 개별 단백질들을 시간에 따라 정량화하는 것을 특징으로 하는 세포 내 반응 시뮬레이션 방법
11 11
제 7항에 있어서, 상기 시뮬레이션하는 단계는 세포 내 공간을 큐브모양의 3차원 격자공간들로 분리한 후 상기 격자공간들을 상기 적어도 하나 이상의 컴퓨터에 개별적으로 할당하여 분석하는 것을 특징으로 하는 세포 내 반응 시뮬레이션 방법
12 12
제 7항에 있어서, 상기 시뮬레이션하는 단계는 실제 세포 내에서의 반응과 유사하게 구현하기 위해 상기 발현체모듈로부터 생성되는 단백질들의 정보에 기반하여 지속적으로 세포 공간 내에 상기 단백질들을 생성하고 소멸시키면서 시뮬레이션하는 것을 특징으로 하는 세포 내 반응 시뮬레이션 방법
13 13
세포모델을 생성하기 위한 세포와 관련된 정보를 데이터베이스로부터 입력받고, 상기 데이터베이스로부터 상기 세포와 관련된 정보를 입력받아 세포모델을 생성하고, 상기 데이터베이스로부터 상기 세포와 관련된 정보를 입력받아 단백질 정량화를 위한 수치모델을 구성하고, 상기 수치모델은 개별 단백질들의 발현정보를 시계열로 정량화하는 것을 특징으로 하고, 상기 개별 단백질들의 발현정보에 기초하여 시계열로 개별 단백질의 발현량을 측정하고 상기 측정된 발현량을 기초로 시계열로 필요한 개별 단백질 생성량을 계산하여 상기 계산된 생성량을 기초로 생성된 개별 단백질을 실시간으로 상기 생성된 세포모델에 입력하는 것을 특징으로 하고, 상기 생성된 개별 단백질은 protase에 의해 단백질이 소멸하는 반응조건을 포함하는 것을 특징으로 하고, 상기 형성된 세포모델 내의 세포반응을 적어도 하나 이상의 컴퓨터에 할당하여 시뮬레이션하는 것을 특징으로 하는 세포 내 반응 시뮬레이션 프로그램을 저장하는 저장매체
14 14
제 13항에 있어서, 상기 수치모델은 마이크로어레이나 RNA-seq실험을 통해 얻어지는 개별 단백질들을 시간에 따라 정량화하는 것을 특징으로 하는 세포 내 반응 시뮬레이션 프로그램을 저장하는 저장매체
15 15
제 13항에 있어서, 상기 시뮬레이션모듈은 세포 내 공간을 큐브모양의 3차원 격자공간들로 분리한 후 상기 격자공간들을 상기 적어도 하나 이상의 컴퓨터에 개별적으로 할당하여 분석하는 것을 특징으로 하는 세포 내 반응 시뮬레이션 프로그램을 저장하는 저장매체
16 16
제 13항에 있어서, 상기 시뮬레이션 모듈은 실제 세포 내에서의 반응과 유사하게 구현하기 위해 상기 발현체모듈로부터 생성되는 단백질들의 정보에 기반하여 지속적으로 세포 공간 내에 상기 단백질들을 생성하고 소멸시키면서 시뮬레이션하는 것을 특징으로 하는 세포 내 반응 시뮬레이션 프로그램을 저장하는 저장매체
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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 JP06284988 JP 일본 FAMILY
2 JP29054499 JP 일본 FAMILY
3 US10490298 US 미국 FAMILY
4 US20170076021 US 미국 FAMILY

DOCDB 패밀리 정보

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순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 JP2017054499 JP 일본 DOCDBFAMILY
2 JP6284988 JP 일본 DOCDBFAMILY
3 US10490298 US 미국 DOCDBFAMILY
4 US2017076021 US 미국 DOCDBFAMILY
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