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구강 미생물군총의 변화에 기초하여 구강암의 림프절 전이를 예측하는 방법 및 구강암의 림프절 전이 예방 또는 치료용 물질을 스크리닝하는 방법

  • 기술번호 : KST2023003730
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 구강암 환자의 구강 미생물군의 계통별 풍부도 및 메타게놈의 기능적 유전자 활성을 기초로 림프절 전이 가능성을 예측하는 방법 및 림프절 전이 예방 또는 치료용 물질을 스크리닝하는 방법이 개시된다.
Int. CL C12Q 1/6886 (2018.01.01) C12Q 1/689 (2018.01.01)
CPC C12Q 1/6886(2013.01) C12Q 1/689(2013.01) C12Q 2600/156(2013.01) C12Q 2600/136(2013.01)
출원번호/일자 1020220010952 (2022.01.25)
출원인 경희대학교 산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2023-0114590 (2023.08.01) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 공개
심사진행상태 수리
심판사항
구분 국내출원/신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2022.01.25)
심사청구항수 8

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 경희대학교 산학협력단 대한민국 경기도 용인시 기흥구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 이영찬 서울특별시 강남구
2 배진우 서울특별시 동대문구
3 은영규 서울특별시 동대문구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인 천지 대한민국 서울특별시 강남구 논현로**길 **, *층(역삼동, 신한빌딩)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2022.01.25 수리 (Accepted) 1-1-2022-0095929-46
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번호 청구항
1 1
구강암 환자의 타액 시료로부터 구강 미생물군의 16S rRNA 앰플리콘의 서열정보를 얻는 단계; 상기 16S rRNA 앰플리콘의 서열정보로부터 앰플리콘 시퀀스 변이(ASV)에 기초한 특징 데이터를 얻는 단계; 상기 특징 데이터로부터 구강 미생물군의 계통별 풍부도 데이터를 얻는 단계; 상기 계통별 풍부도 데이터에서 프레보텔라(Prevotella), 스토마토바쿨룸(Stomatobaculum), 비피도박테리움(Bifidobacterium), 및 푸소박테리움(Fusobacterium)의 풍부도를 비전이 구강암 환자군의 기준값과 비교하는 단계를 포함하는, 구강암 환자의 림프절 전이를 예측하기 위한 정보를 제공하는 방법
2 2
제1항에 있어서, 상기 프레보텔라(Prevotella) 스토마토바쿨룸(Stomatobaculum), 및 비피도박테리움(Bifidobacterium)의 풍부도가 비전이 구강암 환자군의 기준값보다 높고, 푸소박테리움(Fusobacterium)의 상대적 풍부도가 비전이 구강암 환자군의 기준값보다 낮으면 림프절 전이 가능성이 높을 것으로 예측하는 것인, 구강암 환자의 림프절 전이를 예측하기 위한 정보를 제공하는 방법
3 3
구강암 환자의 타액 시료로부터 구강 미생물군의 16S rRNA 앰플리콘의 서열정보를 얻는 단계; 상기 16S rRNA 앰플리콘의 서열정보로부터 앰플리콘 시퀀스 변이(ASV)에 기초한 특징 데이터를 얻는 단계; 상기 특징 데이터로부터 구강 미생물군의 메타게놈 데이터를 얻는 단계; 상기 메타게놈 데이터로부터 기능적 유전자(ortholog) 활성 데이터를 얻는 단계; 상기 기능적 유전자 활성 데이터에서 signal peptidase II 기능의 활성을 비전이 구강암 환자군의 기준값과 비교하는 단계를 더 포함하는, 구강암 환자의 림프절 전이를 예측하기 위한 정보를 제공하는 방법
4 4
제3항에 있어서, 상기 signal peptidase II 기능의 활성이 기준값보다 낮으면 림프절 전이 가능성이 높을 것으로 예측하는, 구강암 환자의 림프절 전이를 예측하기 위한 정보를 제공하는 방법
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제1항 또는 제3항에 있어서,상기 구강암 환자는 한국인인, 구강암 환자의 림프절 전이를 예측하기 위한 정보를 제공하는 방법
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구강암 환자의 타액으로부터 얻은 구강 미생물군의 16S rRNA 앰플리콘의 서열정보를 입력받는 입력부; 상기 서열정보를 앰플리콘 시퀀스 변이(ASV)에 기초한 특징 데이터로 변환하는 제1변환부; 상기 특징 데이터로부터 구강 미생물군의 계통별 풍부도, 기능적 유전자 활성, 또는 이들의 조합으로 변환하는 제2변환부; 및 상기 구강 미생물군의 계통별 풍부도, 기능적 유전자 활성, 또는 이들의 조합으로부터 구강암 환자의 림프절 전이 가능성을 진단하는 진단부;를 포함하고,상기 진단부는 림프절 전이 여부가 알려진 구강암 환자의 구강 미생물군의 계통별 풍부도 및 기능적 유전자 활성으로 기계학습된 분류기로 전이 가능성을 진단하는 것인, 구강암 환자의 림프절 전이를 예측하기 위한 장치
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림프절 전이 구강암 환자로부터 분리한 타액 시료에 후보물질을 처리하는 단계; 후보물질이 처리된 타액 시료로부터 구강 미생물군의 16S rRNA 앰플리콘의 서열정보를 얻는 단계; 상기 16S rRNA 앰플리콘의 서열정보로부터 앰플리콘 시퀀스 변이(ASV)에 기초한 특징 데이터를 얻는 단계; 상기 특징 데이터로부터 구강 미생물군의 계통별 풍부도 데이터를 얻는 단계;상기 계통별 풍부도 데이터에서 프레보텔라(Prevotella), 스토마토바쿨룸(Stomatobaculum), 비피도박테리움(Bifidobacterium), 및 푸소박테리움(Fusobacterium)의 풍부도를 림프절 전이된 구강암 환자군의 기준값과 비교하는 단계를 포함하고, 상기 프레보텔라(Prevotella), 스토마토바쿨룸(Stomatobaculum), 및 비피도박테리움(Bifidobacterium)의 풍부도가 림프절 전이된 구강암 환자군의 기준값보다 낮고, 상기 푸소박테리움(Fusobacterium)의 풍부도가 림프절 전이된 구강암 환자군의 기준값보다 높으면 상기 후보물질을 구강암의 림프절 전이 예방 또는 치료용 물질로 결정하는, 구강암의 림프절 전이 예방 또는 치료용 물질 스크리닝 방법
8 8
구강암 환자로부터 분리한 타액 시료에 후보물질을 처리하는 단계; 후보물질이 처리된 타액 시료로부터 구강 미생물군의 16S rRNA 앰플리콘의 서열정보를 얻는 단계; 상기 16S rRNA 앰플리콘의 서열정보로부터 앰플리콘 시퀀스 변이(ASV)에 기초한 특징 데이터를 얻는 단계; 상기 특징 데이터로부터 구강 미생물군의 메타게놈 데이터를 얻는 단계; 상기 메타게놈 데이터로부터 기능적 유전자 활성 데이터를 얻는 단계; 및상기 기능적 유전자 활성 데이터 중에서 signal peptidase II 기능의 활성을 림프절 전이된 구강암 환자군의 기준값과 비교하는 단계를 더 포함하고, 상기 signal peptidase II 기능의 활성이 기준값보다 높으면 상기 후보물질을 구강암의 예방 또는 치료용 물질로 결정하는, 구강암의 림프절 전이 예방 또는 치료용 물질 스크리닝 방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 과학기술정보통신부 경희대학교 산학협력단 (혁신법) 기본연구 두경부암 조기 진단과 전이 예측을 위하여 머신러닝을 이용한 타액 내 종양유래 엑소좀의 마이크로 RNA 바이오마커의 발굴 및 검증