1 |
1
CRKL, RAF1, MOS, FGR, NTRK2, ERBB2, NTRK1, FGFR2, ALK, FGFR1, SRC, BLK, MST1R, AXL, ARAF, FES, FRK, HCK, ITK, BTK, YES1, MAP2K1, PRKCQ, LRGUK, ALPK2, MAPK1, AURKA, PIK3CG, TRIB3, CDK6, ZAK, PCTK3, PDGFRA, PDGFRB, NTRK3, SYK, CSF1R, BMX, GK2, PRKCZ, CCL4, LIMK2, STK32B, PTK6, RET, CSNK2B, CSK, CDK2, LYN, TYK2, NEK8, CSNK1A1L, FYN, CIB4, NME7, PRKCH, TYRO3, GUK1, PRKCE, PRKCB1, EPHB6, PFKFB1, MAPK8, PKDCC, NEK7, IRAK2, PIK3C3, LATS2, LRRK2, TPK1, COASY, RIPK5, RPS6KA1 및 EPHA6로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 유전자 또는 상기 유전자에 의해 인코딩되는 단백질을 포함하는, EGFR 표적치료제 내성 예측 또는 진단용 바이오마커
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2 |
2
제 1항에 있어서, 상기 EGFR 표적치료제는 엘로티닙(erlotinib), 게피티닙(gefitinib), 아파티닙(Afatinib), 다코미티닙(Dacomitinib), 오시머티닙(Osimertinib), 레이저티닙(lazertinib), 펠리티닙(Pelitinib), 네라티닙(Neratinib), 이코티닙(Icotinib), 브리가티닙(brigatinib), 라파티닙(lapatinib), 카네르티닙(canertinib), 반데타닙(vandetanib), PKI-166 및 AEE788으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상인 것을 특징으로 하는, EGFR 표적치료제 내성 예측 또는 진단용 바이오마커
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3 |
3
제 2항에 있어서, 상기 EGFR 표적치료제는 엘로티닙 및 오시머티닙으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상인 것을 특징으로 하는, EGFR 표적치료제 내성 예측 또는 진단용 바이오마커
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4 |
4
제 3항에 있어서, 상기 엘로티닙 내성 예측 또는 진단용 바이오마커는 CRKL, RAF1, MOS, FGR, NTRK2, ERBB2, NTRK1, FGFR2, ALK, FGFR1, SRC, BLK, MST1R, AXL, ARAF, FES, FRK, HCK, ITK, BTK, YES1, MAP2K1, PRKCQ, LRGUK, ALPK2, MAPK1, AURKA, PIK3CG, TRIB3, CDK6, ZAK, PCTK3, PDGFRA, PDGFRB, NTRK3, SYK, CSF1R, BMX, GK2, PRKCZ, CCL4, LIMK2, STK32B, PTK6, RET, CSNK2B 및 CSK로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 유전자 또는 상기 유전자에 의해 인코딩되는 단백질을 포함하는 것을 특징으로 하는, EGFR 표적치료제 내성 예측 또는 진단용 바이오마커
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5 |
5
제 3항에 있어서, 상기 오시머티닙 내성 예측 또는 진단용 바이오마커는 CRKL, RAF1, MOS, FGR, FGFR2, ALK, SRC, BLK, AXL, ARAF, FES, FRK, HCK, ITK, YES1, MAP2K1, PRKCQ, ALPK2, PIK3CG, CDK6, PDGFRA, SYK, CSF1R, GK2, PRKCZ, CDK2, LYN, TYK2, NEK8, CSNK1A1L, FYN, CIB4, NME7, PRKCH, TYRO3, GUK1, PRKCE, PRKCB1, EPHB6, PFKFB1, MAPK8, PKDCC, NEK7, IRAK2, PIK3C3, LATS2, LRRK2, TPK1, COASY, RIPK5, RPS6KA1 및 EPHA6으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 유전자 또는 상기 유전자에 의해 인코딩되는 단백질을 포함하는 것을 특징으로 하는, EGFR 표적치료제 내성 예측 또는 진단용 바이오마커
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6
제 3항에 있어서, 상기 엘로티닙 및 오시머티닙 동시 내성 예측 또는 진단용 바이오마커는 CRKL, RAF1, MOS, FGR, FGFR2, ALK, SRC, BLK, AXL, ARAF, FES, FRK, HCK, ITK, YES1, MAP2K1, ALPK2, PRKCQ, PIK3CG, CDK6, PDGFRA, SYK, CSF1R 및 GK2로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 유전자 또는 상기 유전자에 의해 인코딩되는 단백질을 포함하는 것을 특징으로 하는, EGFR 표적치료제 내성 예측 또는 진단용 바이오마커
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7
제 3항에 있어서, EGFR T790M 돌연변이를 가지지 않는 EGFR에 엘로티닙 및 오시머티닙 동시 내성 예측 또는 진단용 바이오마커는 CRKL, RAF1, FGR, FGFR2, ALK, AXL, ARAF, FES, FRK, HCK, ITK, YES1, ALPK2, PIK3CG, PDGFRA, SYK, CSF1R 및 GK2로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 유전자 또는 상기 유전자에 의해 인코딩되는 단백질을 포함하는 것을 특징으로 하는, EGFR 표적치료제 내성 예측 또는 진단용 바이오마커
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8
CRKL, RAF1, MOS, FGR, NTRK2, ERBB2, NTRK1, FGFR2, ALK, FGFR1, SRC, BLK, MST1R, AXL, ARAF, FES, FRK, HCK, ITK, BTK, YES1, MAP2K1, PRKCQ, LRGUK, ALPK2, MAPK1, AURKA, PIK3CG, TRIB3, CDK6, ZAK, PCTK3, PDGFRA, PDGFRB, NTRK3, SYK, CSF1R, BMX, GK2, PRKCZ, CCL4, LIMK2, STK32B, PTK6, RET, CSNK2B, CSK, CDK2, LYN, TYK2, NEK8, CSNK1A1L, FYN, CIB4, NME7, PRKCH, TYRO3, GUK1, PRKCE, PRKCB1, EPHB6, PFKFB1, MAPK8, PKDCC, NEK7, IRAK2, PIK3C3, LATS2, LRRK2, TPK1, COASY, RIPK5, RPS6KA1 및 EPHA6로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 유전자 또는 상기 유전자에 의해 인코딩되는 단백질 발현 또는 활성 수준을 측정하는 제제를 포함하는, EGFR 표적치료제 내성 예측 또는 진단용 조성물
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제 8항에 있어서, 상기 유전자 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 유전자의 mRNA에 특이적으로 결합하는 안티센스 올리고뉴클레오티드, 프라이머 쌍 및 프로브 중 1종 이상인 것을 특징으로 하는, EGFR 표적치료제 내성 예측 또는 진단용 조성물
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10
제 8항에 있어서, 상기 단백질 발현 또는 활성 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 펩타이드 및 뉴클레오티드 중 1종 이상인 것을 특징으로 하는, EGFR 표적치료제 내성 예측 또는 진단용 조성물
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암 환자로부터 분리된 시료에서 CRKL, RAF1, MOS, FGR, NTRK2, ERBB2, NTRK1, FGFR2, ALK, FGFR1, SRC, BLK, MST1R, AXL, ARAF, FES, FRK, HCK, ITK, BTK, YES1, MAP2K1, PRKCQ, LRGUK, ALPK2, MAPK1, AURKA, PIK3CG, TRIB3, CDK6, ZAK, PCTK3, PDGFRA, PDGFRB, NTRK3, SYK, CSF1R, BMX, GK2, PRKCZ, CCL4, LIMK2, STK32B, PTK6, RET, CSNK2B, CSK, CDK2, LYN, TYK2, NEK8, CSNK1A1L, FYN, CIB4, NME7, PRKCH, TYRO3, GUK1, PRKCE, PRKCB1, EPHB6, PFKFB1, MAPK8, PKDCC, NEK7, IRAK2, PIK3C3, LATS2, LRRK2, TPK1, COASY, RIPK5, RPS6KA1 및 EPHA6로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 유전자 또는 상기 유전자에 의해 인코딩되는 단백질 발현 또는 활성 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 암에서의 EGFR 표적치료제 내성을 예측 또는 진단하기 위한 정보를 제공하는 방법
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제 11항에 있어서, 상기 암은 유방암, 대장암, 두경부암, 비소세포폐암, 췌장암, 편평상피암 및 갑상선암 중 1종 이상인 것을 특징으로 하는, 암에서의 EGFR 표적치료제 내성을 예측 또는 진단하기 위한 정보를 제공하는 방법
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제 11항에 있어서, 상기 시료는 조직, 세포, 혈액, 혈청, 혈장, 타액 및 뇨 중 1종 이상인 것을 특징으로 하는, 암에서의 EGFR 표적치료제 내성을 예측 또는 진단하기 위한 정보를 제공하는 방법
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제 11항에 있어서, 상기 EGFR 표적치료제는 엘로티닙, 게피티닙, 아파티닙, 다코미티닙, 오시머티닙, 레이저티닙, 펠리티닙, 네라티닙, 이코티닙, 브리가티닙, 라파티닙, 카네르티닙, 반데타닙, PKI-166 및 AEE788으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상인 것을 특징으로 하는, 암에서의 EGFR 표적치료제 내성을 예측 또는 진단하기 위한 정보를 제공하는 방법
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제 14항에 있어서, 상기 EGFR 표적치료제는 엘로티닙 및 오시머티닙으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상인 것을 특징으로 하는, 암에서의 EGFR 표적치료제 내성을 예측 또는 진단하기 위한 정보를 제공하는 방법
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제 15항에 있어서, 상기 CRKL, RAF1, MOS, FGR, NTRK2, ERBB2, NTRK1, FGFR2, ALK, FGFR1, SRC, BLK, MST1R, AXL, ARAF, FES, FRK, HCK, ITK, BTK, YES1, MAP2K1, PRKCQ, LRGUK, ALPK2, MAPK1, AURKA, PIK3CG, TRIB3, CDK6, ZAK, PCTK3, PDGFRA, PDGFRB, NTRK3, SYK, CSF1R, BMX, GK2, PRKCZ, CCL4, LIMK2, STK32B, PTK6, RET, CSNK2B 및 CSK으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 유전자 또는 상기 유전자에 의해 인코딩되는 단백질 발현 또는 활성 수준 측정 결과, 정상 대조군 시료에 비해 증가하는 경우 상기 암 환자는 엘로티닙 내성이 있는 것으로 판단하는 것을 특징으로 하는, 암에서의 EGFR 표적치료제 내성을 예측 또는 진단하기 위한 정보를 제공하는 방법
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제 15항에 있어서, 상기 CRKL, RAF1, MOS, FGR, FGFR2, ALK, SRC, BLK, AXL, ARAF, FES, FRK, HCK, ITK, YES1, MAP2K1, ALPK2, PRKCQ, PIK3CG, CDK6, PDGFRA, SYK, CSF1R, GK2, PRKCZ, CDK2, LYN, TYK2, NEK8, CSNK1A1L, FYN, CIB4, NME7, PRKCH, TYRO3, GUK1, PRKCE, PRKCB1, EPHB6, PFKFB1, MAPK8, PKDCC, NEK7, IRAK2, PIK3C3, LATS2, LRRK2, TPK1, COASY, RIPK5, RPS6KA1 및 EPHA6으로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 유전자 또는 상기 유전자에 의해 인코딩되는 단백질 발현 또는 활성 수준 측정 결과, 정상 대조군 시료에 비해 증가하는 경우 상기 암 환자는 오시머티닙 내성이 있는 것으로 판단하는 것을 특징으로 하는, 암에서의 EGFR 표적치료제 내성을 예측 또는 진단하기 위한 정보를 제공하는 방법
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제 15항에 있어서, 상기 CRKL, RAF1, MOS, FGR, FGFR2, ALK, SRC, BLK, AXL, ARAF, FES, FRK, HCK, ITK, YES1, MAP2K1, ALPK2, PRKCQ, PIK3CG, CDK6, PDGFRA, SYK, CSF1R 및 GK2로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 유전자 또는 상기 유전자에 의해 인코딩되는 단백질 발현 또는 활성 수준 측정 결과, 정상 대조군 시료에 비해 증가하는 경우 상기 암 환자는 엘로티닙 및 오시머티닙 모두에 내성이 있는 것으로 판단하는 것을 특징으로 하는, 암에서의 EGFR 표적치료제 내성을 예측 또는 진단하기 위한 정보를 제공하는 방법
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1) EGFR 표적치료제 민감성을 나타내는 암 세포에 CRKL, RAF1, MOS, FGR, NTRK2, ERBB2, NTRK1, FGFR2, ALK, FGFR1, SRC, BLK, MST1R, AXL, ARAF, FES, FRK, HCK, ITK, BTK, YES1, MAP2K1, PRKCQ, LRGUK, ALPK2, MAPK1, AURKA, PIK3CG, TRIB3, CDK6, ZAK, PCTK3, PDGFRA, PDGFRB, NTRK3, SYK, CSF1R, BMX, GK2, PRKCZ, CCL4, LIMK2, STK32B, PTK6, RET, CSNK2B, CSK, CDK2, LYN, TYK2, NEK8, CSNK1A1L, FYN, CIB4, NME7, PRKCH, TYRO3, GUK1, PRKCE, PRKCB1, EPHB6, PFKFB1, MAPK8, PKDCC, NEK7, IRAK2, PIK3C3, LATS2, LRRK2, TPK1, COASY, RIPK5, RPS6KA1 및 EPHA6로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 유전자를 과발현하는 단계; 및2) 상기 단계 1)의 세포에 EGFR 표적치료제를 처리하는 단계를 포함하는, EGFR 표적치료제 내성 세포 모델의 제조 방법
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1) EGFR 표적치료제 민감성을 나타내는 암 세포에 CRKL, RAF1, MOS, FGR, NTRK2, ERBB2, NTRK1, FGFR2, ALK, FGFR1, SRC, BLK, MST1R, AXL, ARAF, FES, FRK, HCK, ITK, BTK, YES1, MAP2K1, PRKCQ, LRGUK, ALPK2, MAPK1, AURKA, PIK3CG, TRIB3, CDK6, ZAK, PCTK3, PDGFRA, PDGFRB, NTRK3, SYK, CSF1R, BMX, GK2, PRKCZ, CCL4, LIMK2, STK32B, PTK6, RET, CSNK2B, CSK, CDK2, LYN, TYK2, NEK8, CSNK1A1L, FYN, CIB4, NME7, PRKCH, TYRO3, GUK1, PRKCE, PRKCB1, EPHB6, PFKFB1, MAPK8, PKDCC, NEK7, IRAK2, PIK3C3, LATS2, LRRK2, TPK1, COASY, RIPK5, RPS6KA1 및 EPHA6로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 유전자를 과발현하는 단계; 및2) 상기 단계 1)의 세포에 EGFR 표적치료제 및 피검 물질을 처리하고 약물 반응성을 측정하는 단계를 포함하는, EGFR 표적치료제 내성 억제제의 스크리닝 방법
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제 20항에 있어서, 상기 단계 2)의 피검 물질은 올리고뉴클레오티드, 펩티드, 단백질, 비펩티드성 화합물, 활성 화합물, 발효 생산물, 대사산물, 효소, 항체 및 생활성 분자로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상인 것을 특징으로 하는, EGFR 표적치료제 내성 억제제의 스크리닝 방법
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22
1) EGFR 표적치료제 민감성을 나타내는 암 세포에 CRKL, RAF1, MOS, FGR, NTRK2, ERBB2, NTRK1, FGFR2, ALK, FGFR1, SRC, BLK, MST1R, AXL, ARAF, FES, FRK, HCK, ITK, BTK, YES1, MAP2K1, PRKCQ, LRGUK, ALPK2, MAPK1, AURKA, PIK3CG, TRIB3, CDK6, ZAK, PCTK3, PDGFRA, PDGFRB, NTRK3, SYK, CSF1R, BMX, GK2, PRKCZ, CCL4, LIMK2, STK32B, PTK6, RET, CSNK2B, CSK, CDK2, LYN, TYK2, NEK8, CSNK1A1L, FYN, CIB4, NME7, PRKCH, TYRO3, GUK1, PRKCE, PRKCB1, EPHB6, PFKFB1, MAPK8, PKDCC, NEK7, IRAK2, PIK3C3, LATS2, LRRK2, TPK1, COASY, RIPK5, RPS6KA1 및 EPHA6로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상의 유전자를 과발현하는 단계; 및2) 단계 1)의 세포에 피검 물질을 처리하고 약물 반응성을 측정하는 단계를 포함하는, EGFR 표적치료제 내성 암 치료제의 스크리닝 방법
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제 22항에 있어서, 상기 단계 2)의 피검 물질은 올리고뉴클레오티드, 펩티드, 단백질, 비펩티드성 화합물, 활성 화합물, 발효 생산물, 대사산물, 효소, 항체 및 생활성 분자로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상인 것을 특징으로 하는, EGFR 표적치료제 내성 암 치료제의 스크리닝 방법
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