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단백질 표면에서의 물 분자 위치를 예측하는 장치에 있어서,물 분자 위치 예측 프로그램을 저장한 메모리; 및상기 물 분자 위치 예측 프로그램을 실행하는 프로세서를 포함하되,상기 물 분자 위치 예측 프로그램은, 단백질의 구조 정보를 수신함에 따라 상기 단백질의 구조 정보를 3D-CNN(convolutional neural network) 기반 물 분자 예측 모델에 입력하고, 상기 물 분자 예측 모델이 출력한 단백질 표면에서 물 분자가 존재할 확률에 대한 정보를 기초로 물 분자를 배치하되,상기 3D-CNN 기반 물 분자 예측 모델은 복수의 단백질의 3차원 구조 정보와 해당 단백질에 위치한 물 분자의 3차원 구조 정보를 학습 데이터로 하고, 상기 단백질의 구조 정보의 입력시에 물 분자의 위치 정보를 예측하도록 학습된 것인, 물 분자 위치 예측 장치
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제 1 항에 있어서,상기 학습 데이터는 각 단백질의 3차원 구조 정보, 각 단백질에 위치한 물 분자의 3차원 구조 정보, 단백질을 구성하는 원자의 위치 정보 및 각 단백질에 위치한 물 분자를 구성하는 원자의 위치 정보가 반영된 3차원 복셀 영상을 포함하는 것인, 물 분자 위치 예측 장치
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제 1 항에 있어서,상기 물 분자 예측 모델은,입력 데이터가 입력되는 기본 컨볼루션 계층;상기 기본 컨볼루션 계층의 출력을 수신하고, 원자의 반지름을 크게 설정한 성긴 상태의 제 1 물 점수 지도를 출력하도록 학습되는 제 1 컨볼루션 계층; 및상기 제 1 컨볼루션 계층의 잔차 블록의 출력을 수신하고, 원자의 반지름을 정상적으로 유지한 정밀 상태의 제 2 물 점수 지도를 출력하도록 학습되는 제 2 컨볼루션 계층을 포함하는 것인, 물 분자 위치 예측 장치
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제 3 항에 있어서,상기 물 분자 위치 예측 프로그램은, 상기 제 2 물 점수 지도에서 물이 존재할 확률이 가장 높은 것으로 추정된 지점부터 물 분자를 배치하되, 물이 존재할 확률이 임계값 이상인 경우에 한해 물 분자를 위치시키는 것인, 물 분자 위치 예측 장치
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물 분자 위치 예측 장치를 이용하여 단백질 표면에서의 물 분자 위치를 예측하는 방법에 있어서,(a) 단백질의 구조 정보를 수신하는 단계;(b) 상기 단백질의 구조 정보를 3D-CNN 기반 물 분자 예측 모델에 입력하는 단계;(c) 상기 물 분자 예측 모델이 단백질 표면에서 물 분자가 존재할 확률에 대한 정보를 출력하는 단계; 및(d) 상기 물 분자가 존재할 확률에 대한 정보를 기초로 물 분자를 배치하는 단계를 포함하되,상기 3D-CNN 기반 물 분자 예측 모델은 복수의 단백질의 3차원 구조 정보와 해당 단백질에 위치한 물 분자의 3차원 구조 정보를 학습 데이터로 하고, 상기 단백질의 구조 정보의 입력시에 물 분자의 위치 정보를 예측하도록 학습된 것인, 물 분자 위치 예측 방법
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제 5 항에 있어서,상기 학습 데이터는 각 단백질의 3차원 구조 정보, 각 단백질에 위치한 물 분자의 3차원 구조 정보, 단백질을 구성하는 원자의 위치 정보 및 각 단백질에 위치한 물 분자를 구성하는 원자의 위치 정보가 반영된 3차원 복셀 영상을 포함하는 것인, 물 분자 위치 예측 방법
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제 5 항에 있어서,상기 물 분자 예측 모델은,입력 데이터가 입력되는 기본 컨볼루션 계층;상기 기본 컨볼루션 계층의 출력을 수신하고, 원자의 반지름을 크게 설정한 성긴 상태의 제 1 물 점수 지도를 출력하도록 학습되는 제 1 컨볼루션 계층; 및상기 제 1 컨볼루션 계층의 잔차 블록의 출력을 수신하고, 원자의 반지름을 정상적으로 유지한 정밀 상태의 제 2 물 점수 지도를 출력하도록 학습되는 제 2 컨볼루션 계층을 포함하는 것인, 물 분자 위치 예측 방법
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제 5 항에 있어서,상기 (d) 단계는, 상기 제 2 물 점수 지도에서 물이 존재할 확률이 가장 높은 것으로 추정된 지점부터 물 분자를 배치하되, 물이 존재할 확률이 임계값 이상인 경우에 한해 물 분자를 위치시키는 것인, 물 분자 위치 예측 방법
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제 5 항 내지 제 8 항 중 어느 한 항에 따른 물 분자 위치 예측 방법을 수행하기 위한 컴퓨터 프로그램이 기록된 비일시적 컴퓨터 판독가능 기록매체
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