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암 특이 표적 및 CSP(Cancer cell surface protein) 패널 획득 방법에 있어서,환자 별 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보 및 환자 별 예후 정보를 수집하는 단계;상기 환자 별 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보 및 상기 환자 별 예후 정보에 기초하여 예후 연관 가중치를 산출하는 단계;상기 예후 연관 가중치를 타겟 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보에 적용하는 단계;상기 예후 연관 가중치가 적용된 타겟 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보를 시각화하는 단계; 및상기 시각화된 타겟 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보에 기초하여 예후 연관 암 특이 표적 및 CSP 패널을 획득하는 단계를 포함하는 암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 방법
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제1항에 있어서,상기 예후 연관 가중치는,제1 예후 연관 가중치 및 제2 예후 연관 가중치를 포함하고,상기 산출하는 단계는,회귀 모델을 이용하여, 상기 제1 예후 연관 가중치와 상기 환자 별 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보의 벡터곱 또는 합성곱과 상기 제2 예후 연관 가중치의 합이 상기 환자 별 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보가 되도록 하는 상기 예후 연관 가중치를 산출하는 단계를 포함하는,암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 방법
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제1항에 있어서,상기 환자 별 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보는,정상 조직의 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현량과 환자의 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현량을 비교한 fc(fold change), 정상 조직과 환자의 조직을 비교한 logCPM 및 상기 환자의 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현량과 내생 제어 물질을 비교하여 표준화한 정량 값 중 적어도 하나를 포함하는,암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 방법
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제1항에 있어서,상기 환자 별 예후 정보는,전체 생존율, 무진행 생존율, 진단일, 수술일, 재발일, 암 진행 진단일, 정보 취득 일시, 정보 분석 일시, 정보 취득 또는 분석 시점에서의 환자 생존 여부 및 치료 정보 중 적어도 하나를 포함하는,암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 방법
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제1항에 있어서,상기 시각화하는 단계는,상기 예후 연관 가중치가 적용된 상기 타겟 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보에 대한 주성분 분석(Principal component analysis; PCA)에 기초하여 상기 타겟 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보를 시각화하는 단계를 포함하는,암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 방법
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제1항에 있어서,상기 획득하는 단계는,상기 시각화된 타겟 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보에 기초하여 나쁜 예후와 연관된 암 특이 표적 및 CSP 패널과 좋은 예후와 연관된 암 특이 표적 및 CSP 패널을 분배하는 단계를 포함하는,암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 방법
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7
제6항에 있어서,상기 시각화된 타겟 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보에서,x축은 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현량을 나타내고, y축은 예후 정보를 나타내는,암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 방법
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제6항에 있어서,상기 분배하는 단계는,컬러링을 수행하는 것에 의해 이미지로 시각화된 상기 타겟 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보에 대해 군집화 또는 세분화를 수행하는 단계를 포함하는,암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 방법
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제1항의 방법을 실행하기 위한 인스트럭션들을 저장하는 컴퓨터 판독 가능한 저장매체
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암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 장치에 있어서,메모리 및 프로세서를 포함하고,상기 메모리는 상기 프로세서에 의해 실행 가능한 인스트럭션들을 저장하고,상기 인스트럭션들이 상기 프로세서에 의해 실행될 때, 상기 프로세서는 상기 암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 장치가,환자 별 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보 및 환자 별 예후 정보를 수집하고,상기 환자 별 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보 및 상기 환자 별 예후 정보에 기초하여 예후 연관 가중치를 산출하고,상기 예후 연관 가중치를 타겟 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보에 적용하고,상기 예후 연관 가중치가 적용된 타겟 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보를 시각화하고,상기 시각화된 타겟 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보에 기초하여 예후 연관 암 특이 표적 및 CSP 패널을 획득하도록 상기 암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 장치를 제어하는,암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 장치
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제10항에 있어서,상기 예후 연관 가중치는,제1 예후 연관 가중치 및 제2 예후 연관 가중치를 포함하고,상기 프로세서는 상기 암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 장치가,회귀 모델을 이용하여, 상기 제1 예후 연관 가중치와 상기 환자 별 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보의 벡터곱 또는 합성곱과 상기 제2 예후 연관 가중치의 합이 상기 환자 별 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보가 되도록 하는 상기 예후 연관 가중치를 산출하도록 상기 암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 장치를 제어하는,암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 장치
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제10항에 있어서,상기 환자 별 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보는,정상 조직의 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현량과 환자의 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현량을 비교한 fc(fold change), 정상 조직과 환자의 조직을 비교한 logCPM 및 상기 환자의 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현량과 내생 제어 물질을 비교하여 표준화한 정량 값 중 적어도 하나를 포함하는,암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 장치
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제10항에 있어서,상기 환자 별 예후 정보는,전체 생존율, 무진행 생존율, 진단일, 수술일, 재발일, 암 진행 진단일, 정보 취득 일시, 정보 분석 일시, 정보 취득 또는 분석 시점에서의 환자 생존 여부 및 치료 정보 중 적어도 하나를 포함하는,암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 장치
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제10항에 있어서,상기 프로세서는 상기 암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 장치가,상기 예후 연관 가중치가 적용된 상기 타겟 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보에 대한 주성분 분석(Principal component analysis; PCA)에 기초하여 상기 타겟 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보를 시각화하도록 상기 암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 장치를 제어하는,암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 장치
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제10항에 있어서,상기 프로세서는 상기 암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 장치가,상기 시각화된 타겟 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보에 기초하여 나쁜 예후와 연관된 암 특이 표적 및 CSP 패널과 좋은 예후와 연관된 암 특이 표적 및 CSP 패널을 분배하도록 상기 암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 장치를 제어하는,암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 장치
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제15항에 있어서,상기 시각화된 타겟 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보에서,x축은 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현량을 나타내고, y축은 예후 정보를 나타내는,암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 장치
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제15항에 있어서,상기 프로세서는 상기 암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 장치가,컬러링을 수행하는 것에 의해 이미지로 시각화된 상기 타겟 CSP를 포함한 암 특이 유전자 발현 정보에 대해 군집화 또는 세분화를 수행하도록 상기 암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 장치를 제어하는,암 특이 표적 및 CSP 패널 획득 장치
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