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인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 장치 및 방법(DEVICE AND METHOD FOR ANALYZING GENE EXPRESSING RESPONSE DATA OF MODEL EXPERIMENT FOR ACTUAL HUMAN RESPONSE)

  • 기술번호 : KST2016016089
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명의 일 실시예에 따른 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 장치는 동물의 유전자 발현에 관한 사용자 실험 데이터를 입력받고, 상기 입력된 사용자 실험 데이터와 가장 높은 상관 관계를 가지는 동물 실험 데이터, 및 상기 동물 실험 데이터와 매칭된 인간의 반응에 관한 인간 실험 데이터를 질병 데이터베이스로부터 검색하는 프로필 검색부; 상기 동물 실험 데이터 및 상기 인간 실험 데이터 각각에 대한 폴드 체인지(fold change) 및 클래스 내(within-class) 표준편차에 기초하여 해당 유전자에 대한 가상 분산을 계산하는 가상 분산 계산부; 및 상기 가상 분산에 기초하여 상기 유전자에 대한 중요도를 통계적으로 계산하는 유전자 중요도 계산부를 포함한다.
Int. CL G06F 19/24 (2011.01) G06F 19/20 (2011.01)
CPC G16B 25/00(2013.01) G16B 25/00(2013.01)
출원번호/일자 1020150027484 (2015.02.26)
출원인 고려대학교 산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2016-0104439 (2016.09.05) 문서열기
공고번호/일자 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2015.02.26)
심사청구항수 20

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 고려대학교 산학협력단 대한민국 서울특별시 성북구

발명자

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1 석준희 대한민국 서울특별시 강북구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 홍성욱 대한민국 서울특별시 강남구 역삼로 ***(역삼동) 동아빌딩 *층(주식회사에스와이피)
2 심경식 대한민국 서울시 강남구 역삼로 *** 동아빌딩 *층(에스와이피특허법률사무소)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 고려대학교 산학협력단 서울특별시 성북구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2015.02.26 수리 (Accepted) 1-1-2015-0193377-88
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2015.07.31 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2016.08.12 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-6-2016-0106731-80
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2016.08.31 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2016-0628244-87
5 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2016.10.04 수리 (Accepted) 1-1-2016-0960178-13
6 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2016.10.04 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2016-0960179-69
7 등록결정서
Decision to grant
2017.02.10 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2017-0103175-45
8 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.10.10 수리 (Accepted) 4-1-2019-5210941-09
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
동물의 유전자 발현에 관한 사용자 실험 데이터를 입력받고, 상기 입력된 사용자 실험 데이터와 가장 높은 상관 관계를 가지는 동물 실험 데이터, 및 상기 동물 실험 데이터와 매칭된 인간의 반응에 관한 인간 실험 데이터를 질병 데이터베이스로부터 검색하는 프로필 검색부;상기 동물 실험 데이터 및 상기 인간 실험 데이터 각각에 대한 폴드 체인지(fold change) 및 클래스 내(within-class) 표준편차에 기초하여 해당 유전자에 대한 가상 분산을 계산하는 가상 분산 계산부; 및상기 가상 분산에 기초하여 상기 유전자에 대한 중요도를 통계적으로 계산하는 유전자 중요도 계산부를 포함하며,상기 클래스 내 표준편차는상기 동물 실험 데이터 내 실험군 샘플들의 표준편차와, 상기 동물 실험 데이터 내 대조군 샘플들의 표준편차를 합하여 평균한 값인 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 장치
2 2
제1항에 있어서,복수의 유전자 각각에 대한 동물 실험 데이터 및 인간 실험 데이터를 매칭하여 저장하는 상기 질병 데이터베이스를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 장치
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제2항에 있어서,상기 동물 실험 데이터 및 상기 인간 실험 데이터 각각은복수의 대조군 샘플 및 복수의 실험군 샘플을 포함하고,상기 질병 데이터베이스는상기 복수의 유전자 각각에 대한 발현 정도를 나타내는, 복수의 유전자 발현 데이터를 행으로 하고, 상기 복수의 대조군 샘플 및 실험군 샘플 각각에 대한 프로파일을 열로 하는 매트릭스 형태로 상기 동물 실험 데이터 및 상기 인간 실험 데이터를 가공하여 저장하는 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 장치
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제1항에 있어서,상기 프로필 검색부는상기 질병 데이터베이스 내 동물 실험 데이터에 속하는 유전자들 중에서 상기 사용자 실험 데이터의 유전자와 공통으로 속해있는 공통 유전자를 추출하고, 상기 추출된 공통 유전자에 대하여 상기 동물 실험 데이터 및 상기 사용자 실험 데이터 각각의 폴드 체인지를 계산하여, 상기 사용자 실험 데이터와 가장 높은 상관 관계를 가지는 동물 실험 데이터를 상기 질병 데이터베이스로부터 검색하는 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 장치
5 5
제4항에 있어서,상기 프로필 검색부는상기 사용자 실험 데이터의 폴드 체인지와 상기 동물 실험 데이터의 폴드 체인지 간의 상관 계수를 계산하고, 상기 상관 계수의 계산 결과에 기초하여 상기 사용자 실험 데이터와 가장 높은 상관 관계를 가지는 동물 실험 데이터를 검색하는 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 장치
6 6
제1항에 있어서,상기 가상 분산 계산부는상기 사용자 실험 데이터와 가장 높은 상관 관계를 가지는 동물 실험 데이터의 i번째 유전자(여기서, i는 1이상의 자연수)의 폴드 체인지(fmi) 및 클래스 내 표준편차(smi)를 계산하고, 상기 동물 실험 데이터의 i번째 유전자에 대응되는 인간 실험 데이터의 i번째 유전자의 폴드 체인지(fti) 및 클래스 내 표준편차(sti)를 계산하며, 상기 폴드 체인지(fmi) 및 클래스 내 표준편차(smi)와 상기 폴드 체인지(fti) 및 클래스 내 표준편차(sti)를 이용하여 상기 i번째 유전자에 대한 가상 분산을 계산하는 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 장치
7 7
제6항에 있어서,상기 가상 분산 계산부는상기 폴드 체인지(fmi)의 로그 값과 상기 폴드 체인지(fti)의 로그 값을 곱한 결과가 0보다 큰 제1 조건을 만족하는 i번째 유전자에 대하여, 하기 수학식 3을 이용하여 상기 가상 분산(αi)을 계산하는 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 장치
8 8
제7항에 있어서,상기 가상 분산 계산부는상기 제1 조건을 만족하지 않는 k번째 유전자(여기서, k는 1이상의 자연수)에 대하여 상기 가상 분산(αk)을 계산하는 경우,상기 제1 조건을 만족하는 i번째 유전자에 대하여, 하기 수학식 4를 이용하여 제1 중간 값(di)을 산출하고,상기 제1 중간 값(di), 상기 클래스 내 표준편차(smi), 및 상기 클래스 내 표준편차(sti)를 이용한 하기 수학식 5의 선형 회기 분석을 통해 상기 i번째 유전자의 가상 분산을 근사 계산하며,상기 동물 실험 데이터의 k번째 유전자의 폴드 체인지(fmk)의 로그 값, 및 상기 인간 실험 데이터의 k번째 유전자의 폴드 체인지(ftk)의 로그 값을 곱한 결과가 0보다 큰 제2 조건을 만족하지 않는 상기 k번째 유전자에 대하여, 하기 수학식 6을 이용하여 제2 중간 값(dk)을 계산하고,상기 제2 조건을 만족하지 않는 상기 k번째 유전자에 대하여, 상기 제2 중간 값(dk), 클래스 내 표준편차(smk), 및 클래스 내 표준편차(stk)를 이용한 하기 수학식 7을 통해 상기 가상 분산(αk)을 근사 계산하는 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 장치
9 9
제1항에 있어서,상기 유전자 중요도 계산부는상기 가상 분산을 이용한 하기 수학식 8에 기초하여 통계량(ti)을 계산하고, 상기 계산된 통계량(ti)에 기초하여 상기 유전자에 대한 중요도(pi)를 계산하는 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 장치
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제9항에 있어서,상기 중요도는0 ~ 1 범위 내의 값으로 계산되며,상기 유전자 중요도 계산부는상기 중요도의 값이 0에 가까울수록 상기 동물의 유전자가 상기 인간의 유전자와 가장 유사한 반응을 보이는 것으로 판단하는 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 장치
11 11
제1항에 있어서,상기 폴드 체인지는상기 동물 실험 데이터 내 실험군 샘플들의 평균값을 상기 동물 실험 데이터 내 대조군 샘플들의 평균값으로 나누어 계산한 결과인 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 장치
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삭제
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동물의 유전자 발현에 관한 사용자 실험 데이터를 입력받는 단계;상기 입력된 사용자 실험 데이터와 가장 높은 상관 관계를 가지는 동물 실험 데이터, 및 상기 동물 실험 데이터와 매칭된 인간의 반응에 관한 인간 실험 데이터를 질병 데이터베이스로부터 검색하는 단계;상기 동물 실험 데이터 및 상기 인간 실험 데이터 각각에 대한 폴드 체인지 및 클래스 내 표준편차에 기초하여 해당 유전자에 대한 가상 분산을 계산하는 단계; 및상기 가상 분산에 기초하여 상기 유전자에 대한 중요도를 통계적으로 계산하는 단계를 포함하며,상기 클래스 내 표준편차는상기 동물 실험 데이터 내 실험군 샘플들의 표준편차와, 상기 동물 실험 데이터 내 대조군 샘플들의 표준편차를 합하여 평균한 값인 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 방법
14 14
제13항에 있어서,복수의 유전자 각각에 대한 동물 실험 데이터 및 인간 실험 데이터를 매칭하여 상기 질병 데이터베이스에 저장하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 방법
15 15
제13항에 있어서,상기 질병 데이터베이스로부터 검색하는 단계는상기 질병 데이터베이스 내 동물 실험 데이터에 속하는 유전자들 중에서 상기 사용자 실험 데이터의 유전자와 공통으로 속해있는 공통 유전자를 추출하는 단계; 및상기 추출된 공통 유전자에 대하여 상기 동물 실험 데이터 및 상기 사용자 실험 데이터 각각의 폴드 체인지를 계산하여, 상기 사용자 실험 데이터와 가장 높은 상관 관계를 가지는 동물 실험 데이터를 상기 질병 데이터베이스로부터 검색하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 방법
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제15항에 있어서,상기 질병 데이터베이스를 검색하는 단계는상기 사용자 실험 데이터의 폴드 체인지와 상기 동물 실험 데이터의 폴드 체인지 간의 상관 계수를 계산하는 단계; 및상기 상관 계수의 계산 결과에 기초하여 상기 사용자 실험 데이터와 가장 높은 상관 관계를 가지는 동물 실험 데이터를 검색하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 방법
17 17
제13항에 있어서,상기 가상 분산을 계산하는 단계는상기 사용자 실험 데이터와 가장 높은 상관 관계를 가지는 동물 실험 데이터의 i번째 유전자(여기서, i는 1이상의 자연수)의 폴드 체인지(fmi) 및 클래스 내 표준편차(smi)를 계산하는 단계;상기 동물 실험 데이터의 i번째 유전자에 대응되는 인간 실험 데이터의 i번째 유전자의 폴드 체인지(fti) 및 클래스 내 표준편차(sti)를 계산하는 단계; 및상기 폴드 체인지(fmi) 및 클래스 내 표준편차(smi)와 상기 폴드 체인지(fti) 및 클래스 내 표준편차(sti)를 이용하여 상기 i번째 유전자에 대한 가상 분산을 계산하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 방법
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제17항에 있어서,상기 i번째 유전자에 대한 가상 분산을 계산하는 단계는상기 폴드 체인지(fmi)의 로그 값과 상기 폴드 체인지(fti)의 로그 값을 곱한 결과가 0보다 큰 제1 조건을 만족하는 i번째 유전자에 대하여, 하기 수학식 3을 이용하여 상기 가상 분산(αi)을 계산하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 방법
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제18항에 있어서,상기 제1 조건을 만족하지 않는 k번째 유전자(여기서, k는 1이상의 자연수)에 대하여 상기 가상 분산(αk)을 계산하는 경우,상기 가상 분산을 계산하는 단계는상기 제1 조건을 만족하는 i번째 유전자에 대하여, 하기 수학식 4를 이용하여 제1 중간 값(di)을 산출하는 단계;상기 제1 중간 값(di), 상기 클래스 내 표준편차(smi), 및 상기 클래스 내 표준편차(sti)를 이용한 하기 수학식 5의 선형 회기 분석을 통해 상기 i번째 유전자의 가상 분산을 근사 계산하는 단계;상기 동물 실험 데이터의 k번째 유전자의 폴드 체인지(fmk)의 로그 값, 및 상기 인간 실험 데이터의 k번째 유전자의 폴드 체인지(ftk)의 로그 값을 곱한 결과가 0보다 큰 제2 조건을 만족하지 않는 상기 k번째 유전자에 대하여, 하기 수학식 6을 이용하여 제2 중간 값(dk)을 계산하는 단계; 및상기 제2 조건을 만족하지 않는 상기 k번째 유전자에 대하여, 상기 제2 중간 값(dk), 클래스 내 표준편차(smk), 및 클래스 내 표준편차(stk)를 이용한 하기 수학식 7을 통해 상기 가상 분산(αk)을 근사 계산하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 방법
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제13항에 있어서,상기 유전자에 대한 중요도를 통계적으로 계산하는 단계는상기 가상 분산을 이용한 하기 수학식 8에 기초하여 통계량(ti)을 계산하는 단계; 및상기 계산된 통계량(ti)에 기초하여 상기 유전자에 대한 중요도(pi)를 계산하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 방법
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제20항에 있어서,상기 중요도는0 ~ 1 범위 내의 값으로 계산되며,상기 유전자에 대한 중요도를 통계적으로 계산하는 단계는상기 중요도의 값이 0에 가까울수록 상기 동물의 유전자가 상기 인간의 유전자와 가장 유사한 반응을 보이는 것으로 판단하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 인간의 실제 반응을 고려한 동물 모델의 유전자 발현 반응 데이터 분석 방법
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1 교육부 고려대학교 산학협력단 한국형 SGER 인간 면역 질환에 대한 모델 실험의 계산적 해석