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상호 작용 유전자 쌍의 차등적 발현 패턴을 이용한 ＨＩＶ ＴＹＰＥ １ 감염 단계를 구별하기 위한 방법

  • 기술번호 : KST2014047850
  • 담당센터 : 경기기술혁신센터
  • 전화번호 : 031-8006-1570
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 하나의 샘플 내의 개별적인 상호 작용이 있는 유전자 (또는 단백질) 쌍의 합동-발현 스코어(co-expressed score)에 기반을 두고 차등 합동-발현 유전자 쌍(differentially co-expressed interacting gene pairs, DEPs)을 이용함으로써, HIV-1 감염의 단계-특이적인 유전자 특징을 구별하며 그로 인해 HIV TYPE 1 감염 단계를 보다 명확하게 구별할 수 있는 방법에 관한 것이다.
Int. CL C12Q 1/68 (2006.01) G06F 19/20 (2011.01)
CPC G16B 25/00(2013.01) G16B 25/00(2013.01)
출원번호/일자 1020100120895 (2010.11.30)
출원인 아주대학교산학협력단
등록번호/일자 10-1198468-0000 (2012.10.31)
공개번호/일자 10-2012-0059230 (2012.06.08) 문서열기
공고번호/일자 (20121106) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2010.11.30)
심사청구항수 4

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 아주대학교산학협력단 대한민국 경기도 수원시 영통구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 이기영 대한민국 경상북도 경산시 경산로**길 *
2 윤덕용 대한민국 경기도 수원시 팔달구
3 김효실 대한민국 경기도 수원시 장안구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 손민 대한민국 서울특별시 송파구 법원로 ***, *층(문정동)(특허법인한얼)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 아주대학교산학협력단 경기도 수원시 영통구
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2010.11.30 수리 (Accepted) 1-1-2010-0789663-15
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2012.01.17 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2012.02.17 수리 (Accepted) 9-1-2012-0010649-50
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2012.05.24 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2012-0303030-97
5 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2012.07.23 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2012-0588407-10
6 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2012.07.23 수리 (Accepted) 1-1-2012-0588406-64
7 등록결정서
Decision to grant		 2012.10.05 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2012-0595220-80
8 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2014.01.02 수리 (Accepted) 4-1-2014-5000672-13
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
(a) 유전자 발현 데이터를 입력 받는 단계;(b) 입력받은 상기 유전자 발현 데이터를 마이크로 어레이 분석을 위하여 매핑 및 표준화하는 단계; (c) 측정 대상 샘플 내의 합동-발현 스코어(ρ)를 산출하는 단계; (d) 상기 합동-발현 스코어(ρ)를 이용하여 차등적 합동-발현 유전자 쌍(DEPs)를 선택하는 단계; 및(e) 상기 선택된 합동-발현 유전자 쌍(DEPs)을 이용하여 상기 측정 대상 샘플의 HIV TYPE 1 감염 단계를 구별하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 HIV TYPE 1 감염 단계를 구별하기 위한 정보 제공 방법에 있어서,상기 합동-발현 스코어(ρ)를 산출하는 단계는, (i) 2개의 유전자 각각에 대하여 유전자의 변화하는 로그-비(γ)를 계산하는 단계; 및 (ii) 계산된 로그-비(γ)를 이용하여 2개의 유전자 사이의 합동-발현 스코어(ρ)를 산출하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는, HIV TYPE 1 감염 단계를 구별하기 위한 정보 제공 방법
2 2
삭제
3 3
제1항에 있어서, 상기 (i) 단계는 수학식 1에 의해 산출되며, 그리고 상기 (ii) 단계는 수학식 2에 의해 산출되는 것을 특징으로 하는, HIV TYPE 1 감염 단계를 구별하기 위한 정보 제공 방법
4 4
제3항에 있어서, 상기 (d) 단계는, 합동-발현 스코어(ρ)의 중간값의 차들의 기하학적인 평균 및 분산분석(ANOVA)을 통하여 유의수준값(p-value)을 산출하는 단계; 및컷오프값(-log10(유의수준값) × 기하학적인 평균)이 특정한 값 이상인 합동-발현 유전자 쌍(DEPs)를 선택하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는, HIV TYPE 1 감염 단계를 구별하기 위한 정보 제공 방법
5 5
삭제
6 6
제1항에 있어서, 상기 (e) 단계는, HIV-관련 서브-네트워크를 추출 단계; 및 HIV 단계 의존 네트워크 모듈 추출 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는, HIV TYPE 1 감염 단계를 구별하기 위한 정보 제공 방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
순번, 연구부처, 주관기관, 연구사업, 연구과제의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 국가R&D 연구정보 정보 표입니다.
순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 교육과학기술부 아주대학교 산합혁력단 기초연구사업→일반연구자지원사업→기본연구 유형1 → 기초, 비실용화 생체지표 발굴을 위한 네트워크 기반 대용량 생물학 데이터 처리 기법 연구
2 교육과학기술부 서울대학교 산학협력단 기초연구사업 → 선도연구센터육성사업(학제간융합분야)→시스템 바이오정보의학 연구센터 Phenomic Self : 생체기능 보존과 향상을 위한 다중 모달리티 분석기술 및 처치기술 개발 연구