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당단백질의 당쇄화를 이용한 암 진단방법

  • 기술번호 : KST2014050096
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 암 발생과 관계있는 당단백질의 당쇄화(glycosylation)에 대한 정보를 내포하는 펩타이드들을 이용하여 암을 진단하는 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 암 발생과 관계있는 당단백질로부터 효소를 이용하는 가수분해 과정을 통하여 펩타이드들을 얻고, 이들 펩타이드들 중에서 단백질 당쇄화의 영향을 받아 가수분해과정에서 특이적인 양적 변화를 보여주는 당쇄화 관련 특이 펩타이드들을 정량적으로 검출함으로써, 암 발생에 따른 특이적인 정량적 변화를 보이는 당쇄화 관련 특이 펩타이드들을 선별하고, 상기 선별된 당쇄화 관련 특이 펩타이드들을 마커로 이용하여 암을 진단하는 방법에 관한 것이다. 당쇄화(glycosylation), 가수분해, 정량적 변화, 암, 진단, 마커, 키트.
Int. CL G01N 33/68 (2006.01) G06F 19/28 (2011.01) C12N 9/50 (2006.01) G01N 33/574 (2006.01)
CPC G01N 33/6893(2013.01) G01N 33/6893(2013.01) G01N 33/6893(2013.01) G01N 33/6893(2013.01) G01N 33/6893(2013.01) G01N 33/6893(2013.01) G01N 33/6893(2013.01) G01N 33/6893(2013.01)
출원번호/일자 1020090039602 (2009.05.07)
출원인 한국기초과학지원연구원
등록번호/일자 10-1077275-0000 (2011.10.20)
공개번호/일자 10-2010-0120788 (2010.11.17) 문서열기
공고번호/일자 (20111027) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2009.05.07)
심사청구항수 18

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국기초과학지원연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 유종신 대한민국 서울특별시 강남구
2 안영희 대한민국 충청북도 청주시 상당구
3 이주연 대한민국 대전광역시 서구
4 김진영 대한민국 경기도 용인시 기흥구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 이원희 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로 ***, 성지하이츠빌딩*차 ***호 (역삼동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국기초과학지원연구원 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2009.05.07 수리 (Accepted) 1-1-2009-0273417-74
2 [출원서등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment		 2010.02.25 수리 (Accepted) 1-1-2010-0125599-06
3 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2010.04.09 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2010.05.19 수리 (Accepted) 9-1-2010-0031912-21
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2011.02.07 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2011-0067071-43
6 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2011.04.07 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2011-0254466-69
7 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2011.04.07 수리 (Accepted) 1-1-2011-0254468-50
8 [출원서등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment		 2011.09.27 수리 (Accepted) 1-1-2011-0752397-54
9 등록결정서
Decision to grant		 2011.10.19 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2011-0602213-91
10 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2011.10.21 수리 (Accepted) 4-1-2011-5212108-42
11 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2012.08.31 수리 (Accepted) 4-1-2012-5184293-13
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2012.08.31 수리 (Accepted) 4-1-2012-5184331-50
13 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2013.04.15 수리 (Accepted) 4-1-2013-5058386-17
14 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2013.04.15 수리 (Accepted) 4-1-2013-5058545-81
15 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2020.06.22 수리 (Accepted) 4-1-2020-5135881-88
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
1) 암환자의 시료로부터 총단백질을 분리하는 단계; 2) 상기 단계 1)에서 분리된 총단백질을 대량 단백질 제거용 컬럼을 이용하여 정제하는 단계; 3) 상기 단계 2)에서 정제된 단백질에 가수분해효소를 처리하여 가수분해된 펩타이드 조각 혼합물을 제조하는 단계; 4) 상기 단계 3)에서 가수분해된 펩타이드 조각 혼합물을 질량 분석하는 단계; 5) 상기 단계 4)에서 질량 분석된 펩타이드 조각 혼합물 내에서, 단백질 당쇄화 변화로 인해 유발된 가수분해 반응의 차이를 정량적으로 분석하는 단계; 및 6) 상기 단계 5)에서 분석된 가수분해 반응의 결과로부터 대조군에 비해 가수분해된 펩타이드의 양이 유의적으로 변화된 당단백질 유래 펩타이드를 탐색하는 단계를 포함하는, 암 진단용 마커 스크리닝 방법
2 2
제 1항에 있어서, 상기 암은 간암, 위암, 대장암, 폐암, 자궁암, 유방암, 전립선암, 갑상선암 및 췌장암으로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 방법
3 3
제 1항에 있어서, 상기 단계 1)의 시료는 세포, 혈액, 혈청, 혈장, 타액, 소변, 뇌척수액, 난포액, 모유, 수정체액 및 췌액으로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나인 것을 특징으로 하는 방법
4 4
제 1항에 있어서, 상기 단계 3)의 정제된 단백질은 가수분해 전에 디티오트레이톨(dithiothreitol; DTT) 및 아이오도아세트아마이드(iodoacetamide; IAA)로 전처리되는 것을 특징으로 하는 방법
5 5
제 1항에 있어서, 상기 단계 3) 가수분해효소는 아르기닌 C(Arg-C), 아스파르트산 N(Asp-N), 글루탐산 C(Glu-C), 라이신 C(Lys-C), 키모트립신(chymotrypsin) 및 트립신(trypsin)으로 구성되는 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 방법
6 6
제 1항에 있어서, 상기 단계 4)의 질량 분석은 액체크로마토그래피-질량 분석(lquid chromatography-Mass Spectrometry, LC-MS)을 이용하여 분석하는 것을 특징으로 하는 방법
7 7
제 1항에 있어서, 상기 단계 6)의 당단백질 유래 펩타이드는 아미노산 서열의 N-말단 또는 C-말단 중 어느 하나의 말단 가수분해자리로부터 8개의 아미노산 자리 이내에 당쇄 결합 부위를 갖는 것을 특징으로 하는 방법
8 8
제 1항에 있어서, 상기 단계 6)의 당단백질 유래 펩타이드는 서열번호 1의 아미노산 서열을 갖는 아프민 프리커서(Afamin precursor), 서열번호 2의 아미노산 서열을 갖는 알파 1 애시드 글리코프로테인 1 프리커서(Alpha 1 acid glycoprotein 1 precursor), 서열번호 3의 아미노산 서열을 갖는 키니노겐 1 프리커서의 HMW 아형(Isoform HMW of Kininogen 1 precursor), 및 서열번호 4의 아미노산 서열을 갖는 비트로넥틴 프리커서(Vitronectin precursor)로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 방법
9 9
간암의 진단에 필요한 정보를 제공하기 위하여, 1) 피검체의 시료로부터 총단백질을 분리하는 단계; 2) 상기 단계 1)에서 분리된 총단백질을 대량 단백질 제거용 컬럼을 이용하여 정제하는 단계; 3) 상기 단계 2)에서 정제된 단백질에 가수분해효소를 처리하여 가수분해된 펩타이드 조각 혼합물을 제조하는 단계; 4) 상기 단계 3)에서 가수분해된 펩타이드 조각 혼합물 내에서, 서열번호 4의 아미노산 서열을 갖는 비트로넥틴 프리커서(Vitronectin presursor) 유래 펩타이드의 질량을 분석하는 단계; 5) 상기 단계 4)에서 질량 분석된 펩타이드를 이용하여 당쇄화 변화로 인해 유발된 가수분해 반응의 차이를 분석하는 단계; 및, 6) 상기 단계 5)에서 분석된 가수분해 반응의 결과로부터, 정상 대조군에 비해 가수분해된 펩타이드의 양이 유의적으로 변화된 것으로 확인되는 경우, 상기 피검체가 암에 걸릴 위험이 높거나 암에 걸린 개체로 판단하는 단계를 포함하는, 당단백질 유래 펩타이드에서 당쇄화 변화로 인해 유발된 가수분해 반응의 차이를 분석하는 방법
10 10
제 9항에 있어서, 상기 단계 1)의 시료는 세포, 혈액, 혈청, 혈장, 타액, 소변, 뇌척수액, 난포액, 모유, 수정체액 및 췌액으로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나인 것을 특징으로 하는 방법
11 11
제 9항에 있어서, 상기 단계 3) 가수분해효소는 아르기닌 C(Arg-C), 아스파르트산 N(Asp-N), 글루탐산 C(Glu-C), 라이신 C(Lys-C), 키모트립신(chymotrypsin) 및 트립신(trypsin)으로 구성되는 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 방법
12 12
삭제
13 13
제 9항에 있어서, 상기 단계 4)에서 추가적으로 서열번호 1의 아미노산 서열을 갖는 아프민 프리커서(Afamin precursor), 서열번호 2의 아미노산 서열을 갖는 알파 1 애시드 글리코프로테인 1 프리커서(Alpha 1 acid glycoprotein 1 precursor) 및 서열번호 3의 아미노산 서열을 갖는 키니노겐 1 프리커서의 HMW 아형(Isoform HMW of Kininogen 1 precursor) 유래의 펩타이드로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 펩타이드의 질량을 분석하여 이용하는 것을 특징으로 하는 방법
14 14
서열번호 4의 아미노산 서열을 갖는 비트로넥틴 프리커서(Vitronectin precursor)로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나의 펩타이드에 특이적으로 결합하는 항체를 포함하는 간암 진단용 키트
15 15
삭제
16 16
서열번호 4의 아미노산 서열을 갖는 비트로넥틴 프리커서(Vitronectin precursor)에 특이적으로 결합하는 생물분자가 고형기질에 집적된 간암 진단용 바이오칩
17 17
제 16항에 있어서, 상기 생물분자는 항체 또는 앱타머인 것을 특징으로 하는 바이오칩
18 18
제 16항에 있어서, 상기 고형기질은 플라스틱, 유리, 금속 및 실리콘으로 구성된 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 바이오칩
19 19
삭제
20 20
제 14항에 있어서, 상기 키트는 서열번호 1의 아미노산 서열을 갖는 아프민 프리커서(Afamin precursor), 서열번호 2의 아미노산 서열을 갖는 알파 1 애시드 글리코프로테인 1 프리커서(Alpha 1 acid glycoprotein 1 precursor) 및 서열번호 3의 아미노산 서열을 갖는 키니노겐 1 프리커서의 HMW 아형(Isoform HMW of Kininogen 1 precursor)으로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 펩타이드에 특이적으로 결합하는 항체를 추가적으로 포함하는 것을 특징으로 하는 키트
21 21
제 16항에 있어서, 상기 바이오칩는 서열번호 1의 아미노산 서열을 갖는 아프민 프리커서(Afamin precursor), 서열번호 2의 아미노산 서열을 갖는 알파 1 애시드 글리코프로테인 1 프리커서(Alpha 1 acid glycoprotein 1 precursor) 및 서열번호 3의 아미노산 서열을 갖는 키니노겐 1 프리커서의 HMW 아형(Isoform HMW of Kininogen 1 precursor)으로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 펩타이드에 특이적으로 결합하는 생물분자가 추가적으로 집적된 것을 특징으로 하는 바이오칩
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1 CN102422161 CN 중국 FAMILY
2 US20120107858 US 미국 FAMILY
3 WO2010128742 WO 세계지적재산권기구(WIPO) FAMILY

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1 CN102422161 CN 중국 DOCDBFAMILY
2 US2012107858 US 미국 DOCDBFAMILY
3 WO2010128742 WO 세계지적재산권기구(WIPO) DOCDBFAMILY
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 기초기술연구회,보건복지가족부 한국기초과학지원연구원, 연세대학교 산학협력단 국가적대형연구시설운영사업,보건의료연구개발사업 다목적 첨단 질량분석장치 운영, 질병유전단백체연구지원센터