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Ｎ―연결형 당펩티드의 동정 및 정량을 위한 생물정보처리 분석 방법

  • 기술번호 : KST2014061511
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 고분해능 질량분석기로부터 얻은 질량 스펙트럼의 결과를 이용하여 일반 펩티드에 비해 상대적으로 낮은 감도 또는 낮은 농도로 존재하는 당펩티드를 효율적이고 정확히 동정 및 정량화하여, 질병 표지자(Biomarker)인 당펩티드를 발견하여 효과적으로 암을 예측 및 진단할 수 있는 기술에 유용하게 사용될 수 있다.
Int. CL G01N 33/68 (2006.01) C12Q 1/34 (2006.01) G06F 17/10 (2006.01) G01N 30/72 (2006.01)
CPC
출원번호/일자 1020120108011 (2012.09.27)
출원인 한국기초과학지원연구원
등록번호/일자 10-1341591-0000 (2013.12.09)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20131216) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2012.09.27)
심사청구항수 16

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국기초과학지원연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 박건욱 대한민국 충북 청원군
2 유종신 대한민국 서울 강남구
3 김진영 대한민국 충북 청원군
4 이주연 대한민국 대전 서구
5 이현경 대한민국 대전 서구
6 안현주 대한민국 대전광역시 유성구
7 김재한 대한민국 대전광역시 유성구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 이원희 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로 ***, 성지하이츠빌딩*차 ***호 (역삼동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국기초과학지원연구원 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2012.09.27 수리 (Accepted) 1-1-2012-0789813-47
2 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2013.04.15 수리 (Accepted) 4-1-2013-5058386-17
3 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2013.04.15 수리 (Accepted) 4-1-2013-5058545-81
4 [출원서등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment		 2013.05.03 수리 (Accepted) 1-1-2013-0392269-43
5 등록결정서
Decision to grant		 2013.09.30 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2013-0676233-30
6 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2020.06.22 수리 (Accepted) 4-1-2020-5135881-88
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
1) 시료 내 당단백질을 가수분해 효소로 처리하여 획득한 폴리펩티드를 질량분석기로 분석하여 질량 스펙트럼을 얻는 단계;2) 상기 단계 1)에서 얻은 질량분석기 결과에서 MS1 및 탄뎀 스펙트럼으로 변환하는 단계;3) 상기 단계 2)에서 변환된 MS/MS 스펙트럼에서 피크 분자량이 129
2 2
제 1항에 있어서, 상기 단계 1)의 가수분해 효소는 트립신(Trypsin), 아르기닌 C(Arg-C), 아스파르트산 N(Asp-N), 글루탐산 C(Glu-C), 라이신 C(Lys-C), 키모트립신(Chymotrypsin), 프로테인나아제 K(Proteinase k) 및 프로나아제(Pronase)으로 구성되는 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 혈액 시료로부터 N-연결형 당펩티드를 동정 및 정량을 위한 생물정보처리 분석 방법
3 3
제 1항에 있어서, 상기 단계 2)의 질량분석기는 LTQ-FT, Orbitrap, Triple-Tof, Q-Tof, Tof-Tof 및 Q Exactive로 구성되는 군으로부터 얻어진 것을 특징으로 하는 혈액 시료로부터 N-연결형 당펩티드를 동정 및 정량을 위한 생물정보처리 분석 방법
4 4
제 3항에 있어서, 상기 질량 분석기는 질량 분해능 10,000 이상 및 질량 정확도 50 ppm 이하의 고분해능 질량분석기인 것을 특징으로 하는 혈액 시료로부터 N-연결형 당펩티드를 동정 및 정량을 위한 생물정보처리 분석 방법
5 5
제 1항에 있어서, 상기 단계 3)에서 탄뎀 스펙트럼은 CID 또는 HCD 스펙트럼이고, M-스코어의 계산은 하기 [수학식 1]에 의해 수행되는 것을 특징으로 하는 혈액 시료로부터 N-연결형 당펩티드를 동정 및 정량을 위한 생물정보처리 분석 방법:[수학식 1] (N: 확인 할 수 있는 당피크 수;n: 확인 한 당피크 수;Ii: 반복분석에서 i번째 강도; 및C: 상수 값)
6 6
제 1항에 있어서, 상기 단계 5)에서 S-스코어의 계산은 하기 [수학식 2]에 의해 수행되는 것을 특징으로 하는 혈액 시료로부터 N-연결형 당펩티드를 동정 및 정량을 위한 생물정보처리 분석 방법:[수학식 2](X1: 이론적인 동위원소 피크들 중 n 번째의 피크의 질량;Y1: 실험적인 동위원소 피크들 중 n 번째의 피크의 질량;X2: 이론적인 동위원소 피크들 중 n 번째의 피크의 상대적인 강도;Y2: 실험적인 동위원소 피크들 중 n 번째의 피크의 상대적인 강도;C1: 상수 값; 및C2: 상수 값)
7 7
제 1항에 있어서, 상기 단계 5)에서 당단백질로부터 당펩티드들의 이론적인 동위원소 분포를 이용하여 데이터베이스를 구축한 다음, N-연결형 당펩티드의 동정 및 정량 분석에 이용하는 것을 특징으로 하는 혈액 시료로부터 N-연결형 당펩티드를 동정 및 정량을 위한 생물정보처리 분석 방법
8 8
제 6항에 있어서, 상기 S-스코어를 계산할 때 동위원소의 질량 분포는 유클리드 거리 및 강도 분포를 피어슨 상관 분석을 이용하여 유사도를 측정하는 것을 특징으로 하는 혈액 시료로부터 N-연결형 당펩티드를 동정 및 정량을 위한 생물정보처리 분석 방법
9 9
제 1항에 있어서, 상기 단계 6)에서 탄뎀 스펙트럼은 CID 또는 HCD 스펙트럼이고, Y-스코어의 계산은 하기 [수학식 3]에 의해 수행되는 것을 특징으로 하는 혈액 시료로부터 N-연결형 당펩티드를 동정 및 정량을 위한 생물정보처리 분석 방법:[수학식 3](N: 확인 할 수 있는 당펩티드의 단편화 수;n: 확인 한 당펩티드의 단편화 수; 및Ii: 반복분석에서 I번째의 강도)
10 10
제 1항에 있어서, 상기 단계 6)에서 탄뎀 스펙트럼은 HCD 스펙트럼에서 Y'-스코어의 계산은 하기 [수학식 4]에 의해 수행되는 것을 특징으로 하는 혈액 시료로부터 N-연결형 당펩티드를 동정 및 정량을 위한 생물정보처리 분석 방법:[수학식 4]
11 11
제 1항에 있어서, 상기 단계 7)의 당펩티드의 정량 분석은 MS1의 스펙트라에서 S-스코어를 이용하는 것을 특징으로 하는 혈액 시료로부터 N-연결형 당펩티드를 동정 및 정량을 위한 생물정보처리 분석 방법
12 12
제 1항에 있어서, 상기 단계 7)의 당펩티드의 정량 분석은 MS1의 스펙트라에서 선택된 당펩티드의 강도를 나타내는 동위원소 피크 중에 이론적으로 가장 강도가 강한 것부터 3개의 피크의 강도를 합쳐서 나타내는 것을 특징으로 하는 혈액 시료로부터 N-연결형 당펩티드를 동정 및 정량을 위한 생물정보처리 분석 방법
13 13
제 1항에 있어서, 상기 시료는 혈청, 혈장, 혈액, 소변, 뇌척수액, 양수, 활액 (synovial fluid), 또는 세척액(lavage fluid)인 것을 특징으로 하는 혈액 시료로부터 N-연결형 당펩티드를 동정 및 정량을 위한 생물정보처리 분석 방법
14 14
1) 시료 내 당단백질을 트립신(Trypsin)으로 처리하여 획득한 폴리펩티드를 Orbitrap으로 분석하여 질량 스펙트럼을 얻는 단계;2) 상기 단계 1)에서 얻은 질량분석기 RAW 파일을 RawExtractor v1
15 15
1) 시료 내 당단백질을 트립신(Trypsin)으로 처리하여 획득한 폴리펩티드를 LTQ-FT로 분석하여 질량 스펙트럼을 얻는 단계;2) 상기 단계 1)에서 얻은 질량분석기 RAW 파일을 RawExtractor v1
16 16
1) 시료 내 당단백질을 트립신(Trypsin)으로 처리하여 획득한 폴리펩티드를 Triple-Tof로 분석하여 질량 스펙트럼을 얻는 단계;2) 상기 단계 1)에서 얻은 질량분석기 WIFF 파일을 AB Science MS Data Convert v1
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1 CN103890578 CN 중국 FAMILY
2 EP02738554 EP 유럽특허청(EPO) FAMILY
3 EP02738554 EP 유럽특허청(EPO) FAMILY
4 JP05855264 JP 일본 FAMILY
5 JP26529750 JP 일본 FAMILY
6 US09436797 US 미국 FAMILY
7 US20150186595 US 미국 FAMILY
8 WO2014051220 WO 세계지적재산권기구(WIPO) FAMILY

DOCDB 패밀리 정보

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1 CN103890578 CN 중국 DOCDBFAMILY
2 CN103890578 CN 중국 DOCDBFAMILY
3 EP2738554 EP 유럽특허청(EPO) DOCDBFAMILY
4 EP2738554 EP 유럽특허청(EPO) DOCDBFAMILY
5 EP2738554 EP 유럽특허청(EPO) DOCDBFAMILY
6 JP2014529750 JP 일본 DOCDBFAMILY
7 JP5855264 JP 일본 DOCDBFAMILY
8 US2015186595 US 미국 DOCDBFAMILY
9 US9436797 US 미국 DOCDBFAMILY
10 WO2014051220 WO 세계지적재산권기구(WIPO) DOCDBFAMILY
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1 교육과학기술부 한국기초과학지원연구원 신기술유합형 성장동력 사업 질량분석기반 신기술 융합형 진단기술 개발
2 교육과학기술부 한국기초과학지원연구원 특화전문대학원 연계학연협력 지원사업 분석과학기술 전문대학원 연계학연협력 지원사업