맞춤기술찾기

이전대상기술

전자의무기록과 약물/질환 네트워크 정보 기반의 신약 재창출 후보 예측 방법

  • 기술번호 : KST2015012425
  • 담당센터 : 경기기술혁신센터
  • 전화번호 : 031-8006-1570
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 전자의무기록과 약물/질환 네트워크 정보 기반의 신약 재창출 후보 예측 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 컴퓨터로 판독 가능한 기록 매체를 포함하는 신약 재창출 후보 예측 시스템을 이용하여 전자의무기록과 약물/질환 네트워크 정보 기반의 신약 재창출 후보를 예측하는 방법에 있어서, a) 상기 신약 재창출 예측 시스템이 약물 적응증 정보에 기초하여 약물-질병의 이분 네트워크를 구성하는 단계와; b) 상기 신약 재창출 예측 시스템이 임상정보(EMR 또는 clinical physiomic)와 유전체 정보(genomic signatures)에 기초하여 약물 및 질환의 검체 정보를 추출하는 단계; c) 상기 신약 재창출 예측 시스템이 약물-약물/질병-질병 유사도 매트릭스를 임상정보에 따라 구성하는 단계; d) 상기 신약 재창출 예측 시스템이 유사도 매트릭스에 따라 임상 정보 기반의 약물-질환 엣지(edge) 점수(P_c)를 계산하는 단계; e) 상기 신약 재창출 예측 시스템이 임상정보(EMR 또는 clinical physiomic)와 유전체 정보(genomic signatures)에 기초하여 약물 및 질환의 유전자 연관 정보를 추출하는 단계; f) 상기 신약 재창출 예측 시스템이 약물-약물/질병-질병 유사도 매트릭스를 유전체 정보에 따라 구성하는 단계; g) 상기 신약 재창출 예측 시스템이 유사도 매트릭스에 따라 유전체 정보 기반의 약물-질환 엣지(edge) 점수(P_g)를 계산하는 단계; h) 상기 신약 재창출 예측 시스템이 상기 P_c와 P_g를 사용하여 엣지(edge)의 최종 예측 점수 f(e_ij)를 계산하는 단계; 및 i) 상기 신약 재창출 예측 시스템이 상기 f(e_ij)를 기준값(cut-off)에 따라 참/거짓(True/False) 라벨값을 결정하는 단계를 포함한다.이에 따라, 본 발명은 대규모 EMR 데이터에 포함된 환자의 검체 수치(laboratory test value)와 공개되어 있는 약물 및 질환 관련 다양한 유전체 정보를 활용하여 시판 약물의 적응증 정보를 약물-질환의 이분 네트워크 또는 그래프(bipartite network/graph)로 구성하고, 다양한 임상 및 오믹스 유전체 정보를 활용하여 질환-질환 및 약물-약물의 유사도 측정을 통하여 약물의 신규 적응증을 예측할 수 있는 매우 유용한 발명인 것이다.
Int. CL G06F 19/00 (2011.01)
CPC G16H 10/00(2013.01) G16H 10/00(2013.01) G16H 10/00(2013.01)
출원번호/일자 1020130077255 (2013.07.02)
출원인 아주대학교산학협력단
등록번호/일자 10-1450784-0000 (2014.10.07)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20141023) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2013.07.02)
심사청구항수 10

출원인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 출원인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 아주대학교산학협력단 대한민국 경기도 수원시 영통구

발명자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 발명자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 이기영 대한민국 경기도 수원시 영통구
2 백효정 대한민국 대전시 서구

대리인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 대리인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 김순웅 대한민국 서울시 구로구 디지털로**길 **, ***호 (구로동,에이스테크노타워*차)(정진국제특허법률사무소)

최종권리자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 최종권리자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 아주대학교산학협력단 경기도 수원시 영통구
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2013.07.02 수리 (Accepted) 1-1-2013-0595374-90
2 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2014.01.02 수리 (Accepted) 4-1-2014-5000672-13
3 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2014.07.31 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2014-0523964-88
4 [출원서등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment
2014.09.01 수리 (Accepted) 1-1-2014-0834525-17
5 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2014.09.25 수리 (Accepted) 1-1-2014-0911813-02
6 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2014.09.25 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2014-0911821-67
7 등록결정서
Decision to grant
2014.09.30 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2014-0673255-54
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
컴퓨터로 판독 가능한 기록 매체를 포함하는 신약 재창출 후보 예측 시스템을 이용하여 전자의무기록과 약물/질환 네트워크 정보 기반의 신약 재창출 후보를 예측하는 방법에 있어서,a) 상기 신약 재창출 예측 시스템이 약물 적응증 정보에 기초하여 약물-질병의 이분 네트워크를 구성하는 단계와;b) 상기 신약 재창출 예측 시스템이 임상정보(EMR 또는 clinical physiomic)와 유전체 정보(genomic signatures)에 기초하여 약물 및 질환의 검체 정보를 추출하는 단계;c) 상기 신약 재창출 예측 시스템이 약물-약물/질병-질병 유사도 매트릭스를 임상정보에 따라 구성하는 단계;d) 상기 신약 재창출 예측 시스템이 유사도 매트릭스에 따라 임상 정보 기반의 약물-질환 엣지(edge) 점수(P_c)를 계산하는 단계;e) 상기 신약 재창출 예측 시스템이 임상정보(EMR 또는 clinical physiomic)와 유전체 정보(genomic signatures)에 기초하여 약물 및 질환의 유전자 연관 정보를 추출하는 단계;f) 상기 신약 재창출 예측 시스템이 약물-약물/질병-질병 유사도 매트릭스를 유전체 정보에 따라 구성하는 단계;g) 상기 신약 재창출 예측 시스템이 유사도 매트릭스에 따라 유전체 정보 기반의 약물-질환 엣지(edge) 점수(P_g)를 계산하는 단계;h) 상기 신약 재창출 예측 시스템이 상기 P_c와 P_g를 사용하여 엣지(edge)의 최종 예측 점수 f(e_ij)를 계산하는 단계; 및i) 상기 신약 재창출 예측 시스템이 상기 f(e_ij)를 기준값(cut-off)에 따라 참/거짓(True/False) 라벨값을 결정하는 단계를 포함하는 전자의무기록과 약물/질환 네트워크 정보 기반의 신약 재창출 후보 예측 방법
2 2
제 1 항에 있어서,상기 a) 단계는 종래에 알려진 질병-치료약물의 연관관계를 이분 네트워크로 모델링하는 것으로, 질병-약물의 이분 네트워크는 N_s, N_t 와 e_ij의 집합 E={e11,
3 3
제 1 항 또는 제 2 항에 있어서,상기 b) 단계에서 임상정보 기반의 약물 및 질병연관 검체 정보를 추출하는 과정의 상기 임상정보는 전자의무기록(EMR: Electronic Medical Record)으로 환자의 진단 질병 및 투약 정보, 그리고 입원 기간중 검체정보를 포함하며, 상기 전자의무기록(EMR) 요소는 환자 아이디, 입퇴원 아이디, 입퇴원 정보, 진단 질병정보, 처방 정보, 검체 실시 정보(laboratory test order), 검체 결과 정보(laboratory test results)를 포함하는 것을 특징으로 하는 전자의무기록과 약물/질환 네트워크 정보 기반의 신약 재창출 후보 예측 방법
4 4
제 3 항에 있어서,상기 b) 단계에서 약물 연관 검체 정보는, 각 약물의 투여에 따른 검체 결과 값의 변화로서, 검체실험(laboratory test)의 종류(type of laboratory test)에 따라 아래 수학식 1과 같이 정의되는 것을 특징으로 하는 전자의무기록과 약물/질환 네트워크 정보 기반의 신약 재창출 후보 예측 방법
5 5
제 4 항에 있어서,상기 b) 단계에서 질병 연관 검체 정보는 아래 수학식 2와 같이 정의되는 것을 특징으로 하는 전자의무기록과 약물/질환 네트워크 정보 기반의 신약 재창출 후보 예측 방법
6 6
제 5 항에 있어서,상기 c) 단계는 임상정보 기반의 약물-약물 및 질병-질병 유사도 매트릭스를 구성하는 것으로, 상기 b) 단계에서 계산된 질병연관 검체 실험 결과 정보(Rkp,x)와 약물 연관 검체 실험 결과 정보(Fkd,p)를 k-번째 검체 실험 종류에 따라 계산하고, d-번째 약물 투여로 인한 검체 결과의 변화량(Fkd,p)과 d+1 번째 약물의 값의 분포 유사도 평가를 통해 아래 수학식 3과 같은 유사도 매트릭스를 구성하며, 동일한 방식으로 질병-질병의 유사도 매트릭스를 각 질병별 Rkp,x 값에 대한 wilcoxon rank sum test 결과(p-value)로 유사도를 측정하되, 상기 매트릭스는 각 k-번째 검체 실험 종류에 따라 생성되며, k-번째 검체 실험 종류에 따라 다양한 p-value 분포를 보이므로 c1) 유사도 매트릭스의 p-value 값을 0~1사이의 값을 가지는 정규화 된 랭킹수치(normalized rank value)로 변환 한 후, c2) k-번째 검체 실험 종류의 랭킹 수치 중 최상위 랭킹 값을 사용하여 통합하는 것을 특징으로 하는 전자의무기록과 약물/질환 네트워크 정보 기반의 신약 재창출 후보 예측 방법
7 7
제 6 항에 있어서,상기 d) 단계는 유사도 매트릭스에 따라 임상 정보 기반의 약물-질환 엣지(edge) 점수(P_c)를 계산하는 것으로, 상기 c) 단계의 과정에 따라 생선된 약물-약물 및 질병-질병 유사도 매트릭스와 상기 a) 단계의 과정에서 모델링된 약물-질병 이분네트워크 정보를 통해 계산하며, 아래 수학식 4와 같이 정의되는 것을 특징으로 하는 전자의무기록과 약물/질환 네트워크 정보 기반의 신약 재창출 후보 예측 방법
8 8
제 7 항에 있어서,상기 g) 단계는 유사도 매트릭스에 따라 유전체 정보 기반의 약물-질환 엣지(edge) 점수(P_g)를 계산하는 것으로, 상기 f) 단계의 과정에 따라 생성 된 약물-약물 및 질병-질병 유사도 매트릭스와 상기 a) 단계의 과정에서 모델링된 약물-질병 이분네트워크 정보를 통해 계산되며, 아래 수학식 7과 같이 정의되는 것을 특징으로 하는 전자의무기록과 약물/질환 네트워크 정보 기반의 신약 재창출 후보 예측 방법
9 9
제 8 항에 있어서,상기 h) 단계는 임상 및 유전체 정보 기반 약물-질병 엣지 접수 계산하여 통합하는 것으로 상기 d) 단계와 상기 g) 단계에서 계산 된, P_c 와 P_g 값을 통합하여 최종 엣지 점수 f(e_ij)를 계산하며, 아래 수학식 8과 같이 정의되는 것을 특징으로 하는 전자의무기록과 약물/질환 네트워크 정보 기반의 신약 재창출 후보 예측 방법
10 10
제 9 항에 있어서,상기 i) 단계는 기준 값(θ)에 따른 약물-질병 엣지 라벨의 참/거짓 결정하는 것으로 상기 h) 단계에서 계산된 f(e_ij)는 연속 값을 가지므로, 기준 값(θ)에 따라 f(e_ij)의 라벨의 참-거짓(True/False)을 결정하며, 아래 수학식 9와 같이 정의되는 것을 특징으로 하는 전자의무기록과 약물/질환 네트워크 정보 기반의 신약 재창출 후보 예측 방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
순번, 연구부처, 주관기관, 연구사업, 연구과제의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 국가R&D 연구정보 정보 표입니다.
순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 교육과학기술부 아주대학교 산학협력단 일반연구자지원사업 생체지표 발굴을 위한 네트워크 기반 대용량 생물학 데이터 처리 기법 연구
2 교육과학기술부 아주대학교 산학협력단 일반연구자지원사업 (세부사업명: 여성과학자) 대용량 다차원 데이터 기반의 질명 연관 유전형 동정 기법연구