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단백질의 기능을 예측하는 시스템 및 방법

  • 기술번호 : KST2015098256
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 잘 알려진 데이터베이스에 있는 기능이 밝혀지지 않은 DNA 서열, 아미노산 서열, 또는 상기 데이터베이스에는 없고 실험자가 가지고 있는 새로운 서열의 상동성(homology) 및 도메인(domain) 검색을 통해 단백질의 기능을 예측하는 시스템 및 방법에 관한 것이다. 종래에는 단백질의 기능을 에측하는 방법에 있어, 아미노산 서열만이 입력 가능한가하면, DNA 또는 RNA 서열을 입력했을 때 6가지 가능한 아미노산 서열 중 한 가지 선택된 서열에 대한 도메인 검색 정보만을 볼 수 있다. 또한 검색 옵션에 다양한 도메인 또는 모티프 데이터베이스의 선택이 불가능하고 단지 한 개의 데이터베이스만을 검색해주고 있다. 본 발명은 유전자의 서열만을 가지고 기능을 예측하므로 더 많은 도메인 검색 데이터를 확보할 수 있으며 실험적으로 도메인을 밝히는 방법보다 상당한 시간과 비용을 절약할 수 있다.
Int. CL C12Q 1/68 (2011.01) G06F 19/18 (2011.01)
CPC G06F 19/18(2013.01) G06F 19/18(2013.01)
출원번호/일자 1020020082216 (2002.12.21)
출원인 한국전자통신연구원
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2004-0055521 (2004.06.26) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 거절
심사진행상태 수리
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2002.12.21)
심사청구항수 6

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국전자통신연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 허미영 대한민국 대전광역시동구
2 김홍기 대한민국 대전광역시서구
3 김기홍 대한민국 대전광역시유성구
4 정혁 대한민국 대전광역시유성구
5 김현빈 대한민국 대전광역시유성구
6 최진성 대한민국 대전광역시유성구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 장성구 대한민국 서울특별시 서초구 마방로 ** (양재동, 동원F&B빌딩)(제일특허법인(유))
2 김원준 대한민국 서울특별시 서초구 마방로 ** (양재동, 동원F&B빌딩)(제일특허법인(유))

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 특허출원서
Patent Application		 2002.12.21 수리 (Accepted) 1-1-2002-0423718-89
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2004.10.11 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2004.11.19 수리 (Accepted) 9-1-2004-0069271-90
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2004.12.20 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2004-0538345-31
5 거절결정서
Decision to Refuse a Patent		 2005.02.25 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2005-0086029-28
6 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2009.08.04 수리 (Accepted) 4-1-2009-5150899-36
7 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2015.02.02 수리 (Accepted) 4-1-2015-0006137-44
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1

상동성, 도메인 및 단백질의 구조 검색을 통해 단백질의 기능을 예측하는 시스템에 있어서,

DNA나 RNA 시료를 받아 시퀀싱하는 DNA 시퀀서;

단백질 시료를 받아 시퀀싱하는 아미노산 시퀀서;

상기 DNA 시퀀서 및 상기 아미노산 시퀀서로부터 시퀀싱 데이터를 각각 받아 분석하여 DNA, RNA, 및 아미노산 서열 데이터를 획득하는 시퀀싱 데이터 분석부; 및

상기 시퀀싱 데이터 분석부로부터 제공되는 DNA, RNA, 및 아미노산 서열 데이터에 대응하는 다수개의 가능한 아미노산 서열을 추출하여 도메인 검색과 목표 아미노산 서열에 대한 상동성을 검색하고 이 검색 결과를 바탕으로 상동성 모델링을 거쳐 이를 보완하여 이 구조를 가지고 단백질 구조를 검색해서 상기 검색 결과와 상동성 및 도메인 검색 결과로부터 얻어진 정보를 종합하여 유전자 또는 단백질 서열로부터 기능을 예측하는 바이오인포매틱스부를 포함하는 단백질의 기능을 예측하는 시스템

2 2

제 1 항에 있어서, 상기 다수개는 6개인 것을 특징으로 하는 단백질의 기능을 예측하는 시스템

3 3

상동성, 도메인 및 단백질의 구조 검색을 통해 단백질의 기능을 예측하는 시스템에서 단백질의 기능을 예측하는 방법에 있어서,

DNA, RNA, 및 단백질 시료가 시퀀싱된 데이터를 분석하여 DNA, RNA, 및 아미노산 서열 데이터를 획득하는 제 1 단계;

상기 DNA, RNA 서열에 대해서는 아미노산 서열로 번역하는 제 2 단계;

상기 아미노산 서열 데이터에 대해서 다수개의 가능한 아미노산 서열을 추출하는 제 3 단계;

상기 추출된 아미노산 서열에 대한 도메인 검색 및 목표 아미노산 서열에 대한 상동성을 검색하는 제 4 단계;

상기 상동성 검색 결과를 바탕으로 상동성 모델링을 거쳐 이를 보완해서 이 구조를 가지고 단백질 구조를 검색하는 제 5 단계; 및

상기 제 5 단계의 검색 결과와 상기 상동성 및 도메인 검색 결과로부터 얻어진 정보를 종합하여 유전자 또는 단백질 서열로부터 기능을 예측하는 제 6 단계를 포함하는 단백질의 기능을 예측하는 방법

4 4

제 3 항에 있어서, 상기 다수개는 6개인 것을 특징으로 하는 단백질의 기능을 예측하는 방법

5 5

제 3 항에 있어서, 상기 제 2 단계는 상기 DNA, RNA 서열에 대해서 유전코드를 사용하여 아미노산 서열로 번역하는 것을 특징으로 하는 단백질의 기능을 예측하는 방법

6 6

제 5 항에 있어서, 상기 유전코드로 유니버셜 유전 코드 및 미토콘드리아 RAN 유전코드 중 하나 이상을 선택하여 사용하는 것을 특징으로 하는 단백질의 기능을 예측하는 방법

지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.