| 1 |
1
복수의 기준 활성부위에 대한 정보를 저장하는 활성부위 데이터베이스;입력된 입력 활성부위와 상기 저장된 기준 활성부위에 대해, 상호 간에 겹쳐진 잔기의 개수에 따라 3차원 구조상의 유사도를 산출하는 비교부; 및상기 유사도에 따라 상기 입력활성부위에 대한 기준 활성부위를 검색하는 검색부를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 활성부위 검색 장치
|
| 2 |
2
제1항에 있어서, 상기 비교부는,상기 입력 활성부위에 포함된 잔기와 상기 기준 활성부위에 포함된 잔기가 적어도 하나 이상 겹쳐지도록 상기 입력 활성부위 및 상기 기준 활성부위를 위치정합하는 위치정합부; 및상기 위치정합된 상태에서, 상기 입력 활성부위 및 상기 기준 활성부위 간에 겹쳐지는 잔기의 갯수를 기초로 상기 유사도를 산출하는 유사도 산출부를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 활성부위 검색 장치
|
| 3 |
3
제2항에 있어서,상기 활성부위 데이터베이스는,단백질의 명칭, 상기 단백질에 포함된 기준 활성부위의 명칭, 상기 기준 활성부위에 포함된 잔기의 명칭, 상기 잔기의 N, Cα, C의 좌표데이터 및 상기 잔기의 정규직교벡터를 저장하고,상기 위치정합부는,상기 입력 활성부위에 포함된 잔기의 N, Cα 및 C의 좌표를 기초로, 각각의 잔기에 대한 정규직교벡터를 산출하는 벡터산출부; 및상기 산출된 정규직교벡터 및 상기 저장된 정규직교벡터를 이용하여, 상기 입력 활성부위에 포함된 좌표 및 상기 기준 활성부위에 포함된 좌표를 회전변환 및 이동변환하는 변환부를 포함하고,상기 유사도 산출부는,상기 입력 활성부위에 포함된 잔기의 상기 변환된 좌표와 상기 기준 활성부위에 포함된 잔기의 상기 변환된 좌표가 일치하면, 상기 잔기가 겹쳐지는 것으로 판단하는 것을 특징으로 하는 단백질 활성부위 검색 장치
|
| 4 |
4
제1항에 있어서, 활성부위에 대한 정보를 포함하는 PDB(Protein Data Bank) 파일을 입력받고, 상기 입력된 PDB 파일로부터 활성부위를 추출하는 활성부위 추출부;상기 추출된 활성부위를 디스플레이하는 디스플레이부; 및상기 디스플레이된 활성부위 중 사용자에 의해 선택된 활성부위를 상기 입력 활성부위로서 상기 비교부로 제공하는 활성부위선택부를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 활성부위 검색 장치
|
| 5 |
5
제1항에 있어서, 활성부위에 대한 정보를 포함하는 PDB(Protein Data Bank) 파일을 입력받고, 상기 입력된 PDB 파일에 포함된 원자 또는 잔기를 디스플레이하는 디스플레이부; 및상기 디스플레이된 원자 또는 잔기 중에서, 사용자가 선택한 원자 또는 잔기가 속하는 활성부위를 상기 입력 활성부위로서 상기 비교부로 제공하는 활성부위선택부를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 활성부위 검색 장치
|
| 6 |
6
제1항에 있어서, 상기 검색부는,복수 개의 상기 산출된 유사도를 순위화하는 것을 특징으로 하는 단백질 활성부위 검색 장치
|
| 7 |
7
복수의 기준 활성부위에 대한 정보를 저장하는 단계;입력된 입력 활성부위와 상기 저장된 기준 활성부위에 대해, 상호 간에 겹쳐진 잔기의 개수에 따라 3차원 구조상의 유사도를 산출하는 비교 단계; 및상기 유사도에 따라 상기 입력 활성부위에 대한 기준 활성부위를 검색하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 활성부위 검색 방법
|
| 8 |
8
제7항에 있어서, 상기 비교 단계는,상기 입력 활성부위에 포함된 잔기와 상기 기준 활성부위에 포함된 잔기가 적어도 하나 이상 겹쳐지도록 상기 입력 활성부위 및 상기 기준 활성부위를 위치정합하는 단계; 및상기 위치정합된 상태에서, 상기 입력 활성부위 및 상기 기준 활성부위 간에 겹쳐지는 잔기의 갯수를 기초로 상기 유사도를 산출하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 활성부위 검색 방법
|
| 9 |
9
제8항에 있어서,상기 저장하는 단계는,단백질의 명칭, 상기 단백질에 포함된 기준 활성부위의 명칭, 상기 기준 활성부위에 포함된 잔기의 명칭, 상기 잔기의 N, Cα, C의 좌표데이터 및 상기 잔기의 정규직교벡터를 저장하는 단계를 포함하고,상기 위치정합하는 단계는,상기 입력 활성부위에 포함된 잔기의 N, Cα 및 C의 좌표를 기초로, 각각의 잔기에 대한 정규직교벡터를 산출하는 단계; 및상기 산출된 정규직교벡터 및 상기 저장된 정규직교벡터를 이용하여, 상기 입력 활성부위에 포함된 좌표 및 상기 기준 활성부위에 포함된 좌표를 회전변환 및 이동변환하는 단계를 포함하고,상기 유사도를 산출하는 단계는,상기 입력 활성부위에 포함된 잔기의 상기 변환된 좌표와 상기 기준 활성부위에 포함된 잔기의 상기 변환된 좌표가 일치하면, 상기 잔기가 겹쳐지는 것으로 판단하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 활성부위 검색 방법
|
| 10 |
10
제7항에 있어서, 활성부위에 대한 정보를 포함하는 PDB(Protein Data Bank) 파일을 입력받고, 상기 입력된 PDB 파일로부터 활성부위를 추출하는 단계;상기 추출된 활성부위를 디스플레이하는 단계; 및상기 디스플레이된 활성부위 중 사용자에 의해 선택된 활성부위를 상기 입력 활성부위로 결정하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 활성부위 검색 방법
|
| 11 |
11
제7항에 있어서, 활성부위에 대한 정보를 포함하는 PDB(Protein Data Bank) 파일을 입력받고, 상기 입력된 PDB 파일에 포함된 원자 또는 잔기를 디스플레이하는 단계; 및상기 디스플레이된 원자 또는 잔기 중에서, 사용자가 선택한 원자 또는 잔기가 속하는 활성부위를 상기 입력 활성부위로 결정하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 활성부위 검색 방법
|
| 12 |
12
제7항에 있어서, 상기 검색하는 단계는복수 개의 상기 산출된 유사도를 순위화하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 단백질 활성부위 검색 방법
|
