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다음의 표 1의 x-선 회절 패턴 데이터 또는 발명의 상세한 설명에 기재된 표 2에 기재된 2389개의 원자 좌표로 표시되는 3차원 결정 구조를 갖는, FabK-FMN(falvin mononucleotide) 복합체 결정:
[표 1]
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발명의 상세한 설명에 기재된 표 2에 기재된 2389개의 원자 좌표로 표시되는 3차원 결정 구조를 갖는 FabK-FMN(falvin mononucleotide) 복합체와 후보 화합물을 반응시키는 단계; 및
상기 후보 화합물 중에서 상기 복합체와 상호작용하는 화합물을 선발하여 FabK 단백질의 활성을 저해하는 화합물을 결정하는 단계
를 포함하는, FabK 단백질 활성 저해제 개발 방법
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제8항에 있어서, 상기 상호작용 여부는 후보 화합물과, 상기 표 2의 원자번호 1015부터 1103까지의 부위; 상기 표 2의 원자번호 141부터 206까지의 부위; 상기 표 2의 원자번호 1380부터 2137까지의 부위에 위치하는 1개 이상의 아미노산; 198부터 205까지의 아미노산 서열을 포함하는 hinge 부위; 208번 위치 티로신 (Y208); 209번 위치 라이신 (K209); 211번 위치 라이신 (K211); 214번 위치 라이신 (K214); 229번 위치 히스티딘 (H229); 261 위치 류신 (L261); 276번 위치 메티오닌 (M276); 208번부터 215번까지의 8개 아미노산으로 구성된 헬릭스; 및 278번부터 283번까지의 6개의 아미노산으로 구성된 헬릭스로 이루어진 군 중에서 선택된 하나 이상의 부위와의 상호작용을 측정하여 결정되는 것인, 방법
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발명의 상세한 설명의 표 2에 기재된 2389개의 원자 좌표로 표시되는 3차원 결정 구조를 갖는 FabK-FMN(falvin mononucleotide) 복합체와 결합 가능한 화합물을 설계하는 단계를 포함하는, FabK 단백질 활성 저해제 개발 방법
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제10항에 있어서, 상기 화합물은 상기 표 2의 원자번호 1015부터 1103까지의 부위; 상기 표 2의 원자번호 141부터 206까지의 부위; 상기 표 2의 원자번호 1380부터 2137까지의 부위에 위치하는 1개 이상의 아미노산; 198부터 205까지의 아미노산 서열을 포함하는 hinge 부위; 208번 위치 티로신 (Y208); 209번 위치 라이신 (K209); 211번 위치 라이신 (K211); 214번 위치 라이신 (K214); 229번 위치 히스티딘 (H229); 261 위치 류신 (L261); 276번 위치 메티오닌 (M276); 208번부터 215번까지의 8개 아미노산으로 구성된 헬릭스; 및 278번부터 283번까지의 6개의 아미노산으로 구성된 헬릭스로 이루어진 군 중에서 선택된 하나 이상에 결합 가능하도록 설계된 것인, 방법
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FabK-FMN 복합체의 3차원 결정 구조 정보와 후보 화합물의 3차원 결정 구조 정보를 매칭시키는 가상 스크리닝법을 사용하여, FabK-FMN 복합체와 결합 가능한 화합물을 선별하는 단계를 포함하고,
상기 FabK- FMN 복합체의 3차원 결정 구조 정보는 발명의 상세한 설명의 표 2에 기재된 2389개의 좌표; 상기 표 2의 원자번호 1015부터 1103까지의 부위; 상기 표 2의 원자번호 141부터 206까지의 부위; 상기 표 2의 원자번호 1380부터 2137까지의 부위에 위치하는 1개 이상의 아미노산; 198부터 205까지의 아미노산 서열을 포함하는 hinge 부위; 208번 위치 티로신 (Y208); 209번 위치 라이신 (K209); 211번 위치 라이신 (K211); 214번 위치 라이신 (K214); 229번 위치 히스티딘 (H229); 261 위치 류신 (L261); 276번 위치 메티오닌 (M276); 208번부터 215번까지의 8개 아미노산으로 구성된 헬릭스; 및 278번부터 283번까지의 6개의 아미노산으로 구성된 헬릭스로 이루어진 군 중에서 선택된 하나에 해당하는 것인,
FabK 단백질 활성 저해제 개발 방법
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제9항, 제11항, 및 제12항 중 어느 한 항에 있어서, 상기 표 2의 원자번호 1380부터 2137까지의 부위에 위치하는 1개 이상의 아미노산은 Gly193, Thr194, Lue261, Met276, Gln279, 및 Ser280로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상인, 방법
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