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1) 표적 단백질에 결합하며 5'-말단이 연장된 DNA 앱타머(aptamer) 및 상기 앱타머의 말단 부분 및 연장된 부분에 상보적인 G-DNA(Guard-DNA)를 결합시켜 이중가닥 DNA를 형성하는 단계;
2) 단계 1)의 G-DNA에 상보적이며 형광물질(fluorophore)과 형광소멸물질(quencher)이 결합된 단일가닥 RNA에 표적 단백질이 포함된 시료를 처리하는 단계;
3) RNase H를 처리하는 단계; 및
4) 단계 2)의 시료 내의 형광의 세기를 측정하는 단계를 포함하는 앱타머를 이용한 표적 단백질 검출 방법
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제 1항에 있어서, 단계 2)의 단일가닥 RNA는 G-DNA의 사슬 길이보다 길지 않은 것을 특징으로 하는 앱타머를 이용한 표적 단백질 검출 방법
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제 1항에 있어서, 단계 2)의 단일가닥 RNA는 5'-말단에는 형광물질, 3'-말단에는 형광소멸물질로 표지된 단일가닥 RNA(F-RNA-Q)인 것을 특징으로 하는 앱타머를 이용한 표적 단백질 검출 방법
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제 5항에 있어서, 형광물질은 플루오레세인(fluorescein), 테트라메틸로다민(tetramethylrhodamine), Cy5, Cy3 및 텍사스 레드(Texas Red)로 이루어진 군으로부터 선택되어지는 것을 특징으로 하는 앱타머를 이용한 표적 단백질 검출 방법
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제 5항에 있어서, 형광소멸물질은 댑실(dabsyl), 댑실(dabcyl) 및 블랙 형광소멸물질(black quencher)로 이루어진 군으로부터 선택되어지는 것을 특징으로 하는 앱타머를 이용한 표적 단백질 검출 방법
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제 5항에 있어서, 형광소멸물질은 FRET(fluorescence resonance energy transfer) 작용을 하는 형광물질인 것을 특징으로 하는 앱타머를 이용한 표적 단백질 검출 방법
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제 1항에 있어서, 단계 2)의 표적 단백질이 포함된 시료는 항체, 리간드, 천연화합물, 추출물, 합성 펩타이드, 신약 후보물질 또는 단백질 중 선택된 어느 하나인 것을 특징으로 하는 앱타머를 이용한 표적 단백질 검출 방법
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제 1항에 있어서, 단계 4)의 형광의 세기는 트라이애드 멀티모드 디텍터(TRIAD Multimode Detector), 왈락/빅터 형광(Wallac/Victor Fluorescence) 또는 퍼킨-엘머 LB50B 형광분광광도계(Perkin-Elmer LB50B luminescence spectrometer)를 이용하여 측정되어지는 것을 특징으로 하는 앱타머를 이용한 표적 단백질 검출 방법
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a) 표적 단백질에 결합하며 5'-말단이 연장된 DNA 앱타머(aptamer) 및 상기 앱타머의 말단 부분 및 연장된 부분에 상보적인 G-DNA로 구성된 이중가닥 DNA;
b) 형광물질과 형광소멸물질(quencher)이 결합되며 상기 G-DNA에 상보적인 단일가닥 RNA; 및
c) RNase H를 포함하는 표적 단백질 검출키트
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제 11항에 있어서, a)의 표적 단백질은 항체, 리간드, 천연화합물, 추출물, 합성 펩타이드, 신약 후보물질 또는 단백질 등에 포함되어 있는 것임을 특징으로 하는 표적 단백질 검출키트
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제 11항에 있어서, b)의 단일가닥 RNA는 a)의 G-DNA와 상보적인 것을 특징으로 하는 표적 단백질 검출키트
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제 11항에 있어서, b)의 단일가닥 RNA는 a)의 G-DNA의 사슬 길이보다 길지 않은 것을 특징으로 하는 표적 단백질 검출키트
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제 11항에 있어서, b)의 형광물질은 단일가닥 RNA의 5'-말단에 표지된 것을 특징으로 하는 표적 단백질 검출키트
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제 17항에 있어서, 형광물질은 플루오레세인(fluorescein), 테트라메틸로다민(tetramethylrhodamine), Cy5, Cy3 및 텍사스 레드(Texas Red)로 이루어진 군으로부터 선택되어지는 것을 특징으로 하는 표적 단백질 검출키트
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제 11항에 있어서, b)의 형광소멸물질은 단일가닥 RNA의 3'-말단에 표지된 것을 특징으로 하는 표적 단백질 검출키트
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제 19항에 있어서, 형광소멸물질은 댑실(dabsyl), 댑실(dabcyl) 및 블랙 형광소멸물질(black quencher)로 이루어진 군으로부터 선택되어지는 것을 특징으로 하는 표적 단백질 검출키트
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제 19항에 있어서, 형광소멸물질은 FRET(fluorescence resonance energy transfer) 작용을 하는 형광물질인 것을 특징으로 하는 표적 단백질 검출키트
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