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합성 수율 증대 및 합성 오류 최소화를 위한 Ｙ형 핵산 나노구조체의 ５＇ 말단 응축성 염기서열을 설계하는 방법

  • 기술번호 : KST2015144065
  • 담당센터 : 경기기술혁신센터
  • 전화번호 : 031-8006-1570
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 5' 말단에 응축성 염기서열(cohesive end)을 포함하는 핵산 나노구조체의 5' 말단 응축성 염기서열을 설계하는 방법 등에 관한 것으로서, 더욱 구체적으로는 GC 농도가 50% 이상인 응축성 염기서열 후보군을 선정하는 단계, 상기 선정한 응축성 염기서열 후보군에서 깁스자유에너지 값을 계산하여 후보군을 재선정하는 단계 및 상기 재선정한 후보군에서 3개 이상의 염기를 가지는 염기서열 중 연속되는 3개의 염기서열이 동일하지 않은 후보군을 최종 선정하는 단계를 포함하는 핵산 나노구조체의 5' 말단 응축성 염기서열을 설계하는 방법 등에 관한 것이다.본 발명은 저가의 고순도 고수율 단일 나뭇가지형 핵산 구조체를 제작하기 위한 최적화 조건을 제시함으로써, 기존 반응물의 HPLC 등의 방법으로 추가 정제하는 단계를 생략하여 가격을 감소시키고, 최종 합성 생산물의 합성 수율을 극대화시켰을 뿐 아니라, 나뭇가지형 핵산 구조체 이외에도 X, T형 등의 다른 핵산 나노구조체를 이용하여 합성 가능한 다른 모양의 핵산 구조체 대상에도 적용 가능한 특징이 있다.
Int. CL C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) C12N 15/11 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01)
CPC
출원번호/일자 1020140038585 (2014.04.01)
출원인 성균관대학교산학협력단
등록번호/일자 10-1465394-0000 (2014.11.19)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20141125) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2014.04.01)
심사청구항수 11

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 성균관대학교산학협력단 대한민국 경기도 수원시 장안구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 엄숭호 대한민국 서울특별시 용산구
2 송인현 대한민국 경기도 수원시 영통구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인이룸 대한민국 서울시 서초구 사평대로 ***, *층(반포동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 성균관대학교산학협력단 경기도 수원시 장안구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2014.04.01 수리 (Accepted) 1-1-2014-0312687-06
2 [우선심사신청]심사청구(우선심사신청)서
[Request for Preferential Examination] Request for Examination (Request for Preferential Examination)		 2014.04.30 수리 (Accepted) 1-1-2014-0418415-57
3 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2014.05.26 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2014-0359873-73
4 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2014.07.14 수리 (Accepted) 1-1-2014-0658222-15
5 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2014.07.14 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2014-0658221-69
6 등록결정서
Decision to grant		 2014.09.03 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2014-0608198-36
7 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2017.02.23 수리 (Accepted) 4-1-2017-5028829-43
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번호 청구항
1 1
하기 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는, 핵산 나노구조체의 5' 말단 응축성 염기서열(cohesive end) 설계방법:a) G(구아닌) 및 C(시토신) 농도가 50 내지 60% 인 응축성 염기서열 후보군을 선정하는 단계;b) 상기 선정한 응축성 염기서열 후보군의 깁스에너지 값(Gibb's free energy)을 계산하고, 실험적으로 접합이 잘되는 특정 깁스자유에너지 값을 가지는 후보를 도출한 뒤, 상기 값의 ±0
2 2
삭제
3 3
제1항에 있어서,상기 설계방법은 5' 말단에 응축성 염기서열을 포함하는 Y형 핵산 나노구조체를 나뭇가지형 핵산 나노구조체로 합성하는 수율을 증가시키기 위한 것임을 특징으로 하는, 설계방법
4 4
제3항에 있어서,상기 설계방법은 나뭇가지형 핵산 나노구조체 합성시 불일치 결찰(mismatch ligation) 생성물이 생성될 가능성을 감소시키기 위한 것임을 특징으로 하는, 설계방법
5 5
제1항의 설계방법에 의해 최종 선정된 5' 말단에 응축성 염기서열을 포함하는 핵산 나노구조체를 이용하여 나뭇가지형 핵산 나노구조체를 합성하는 방법
6 6
제5항에 있어서,상기 합성은 접합 효소(ligation enzyme) 및 염을 포함하는 접합 버퍼(ligation buffer)에서 수행되는 것을 특징으로 하는, 방법
7 7
제6항에 있어서,상기 합성은 4 ℃, 25 ℃ 또는 37 ℃에서 수행되는 것을 특징으로 하는, 방법
8 8
제6항에 있어서,상기 접합효소는 T4 접합효소, Thermus Thermophilus 접합효소, Mammalian DNA 접합효소Ⅰ, Mammalian DNA 접합효소 Ⅱ 및 vaccinia virus DNA 접합효소로 이루어진 군으로부터 선택되는 것을 특징으로 하는, 방법
9 9
제6항에 있어서,상기 접합 버퍼는 150 내지 200 mM 농도의 염 조건인 것을 특징으로 하는, 방법
10 10
제6항에 있어서,상기 합성은 저염 농도의 접합 버퍼를 이용하여 30 내지 37 ℃에서 수행되는 것을 특징으로 하는, 방법
11 11
제10항에 있어서,상기 저염 농도는 1 내지 50 mM 농도의 염 조건인 것을 특징으로 하는, 방법
12 12
제5항의 방법에 의해 합성된, 합성 수율이 증가하고 불일치 결찰(mismatch ligation) 생성물의 생성 가능성이 감소된 나뭇가지형 핵산 나노구조체
13 13
삭제
14 14
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1 US10065983 US 미국 FAMILY
2 US20150274768 US 미국 FAMILY

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1 US10065983 US 미국 DOCDBFAMILY
2 US2015274768 US 미국 DOCDBFAMILY
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순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
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2 미래창조과학부 성균관대학교 산학협력단 일반연구자지원사업(신진연구:유형I) 1/3 생체모사 기능성 합성 나노공학을 이용한 특정 암질환 맞춤형 신형 T 면역세포(제약세포: T-pharmacyte)개발 연구