맞춤기술찾기

홈으로 가기
맞춤기술찾기
이전대상기술
프린트하기

이전대상기술

알엔에이(ＲＮＡ) 슈도노트(Ｐｓｅｕｄｏｋｎｏｔ) 구조의시각화 방법

  • 기술번호 : KST2015157771
  • 담당센터 : 인천기술혁신센터
  • 전화번호 : 032-420-3580
상담신청 PDF 받기
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 H 타입을 포함하는 모든 타입의 RNA 슈도노트 구조를 선분 교차없이 평면적으로 명료하게 시각화하여 구조 파악을 용이하게 하는 RNA 슈도노트 구조의 시각화 방법에 관한 것이다. 본 발명은 서열의 구조가 괄호로 표시되는 구조데이타로부터 각 구조요소, 괄호 쌍으로 묶여지는 단일 스템-루프, 다른 단일 스템-루프를 포함하는 복합 스템-루프, 다수의 스템부와 스템 사이에 구비되는 루프의 염기열 또는 스템-루프를 포함하는 내부구조요소로 구분되는 고슈도노트를 식별하고, 다른 구조요소를 포함하지 않는 최소 구조요소, 즉, 단일 스템-루프로부터 시각화를 수행한 후, 해당 단일 스템-루프 및 구조요소를 슈도노트에 소정 규칙에 따라서 삽입시킴으로서, 선분교차 없이 명확하게 RNA 슈도노트를 시각화하는 것이다. 바이오인포메틱스, RNA, pseudoknot, simple stem-loop, complex stem-loop,
Int. CL C12Q 1/68 (2006.01)
CPC
출원번호/일자 1020030033804 (2003.05.27)
출원인 인하대학교 산학협력단
등록번호/일자 10-0618667-0000 (2006.08.24)
공개번호/일자 10-2004-0102430 (2004.12.08) 문서열기
공고번호/일자 (20060905) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2003.05.27)
심사청구항수 10

출원인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 출원인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 인하대학교 산학협력단 대한민국 인천광역시 미추홀구

발명자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 발명자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 한경숙 대한민국 인천광역시연수구
2 변양아 대한민국 인천광역시남구

대리인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 대리인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 이원희 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로 ***, 성지하이츠빌딩*차 ***호 (역삼동)

최종권리자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 최종권리자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 인하대학교 산학협력단 대한민국 인천광역시 남구
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 특허출원서
Patent Application		 2003.05.27 수리 (Accepted) 1-1-2003-0189235-49
2 출원인 변경 신고서
Applicant change Notification		 2004.03.29 수리 (Accepted) 1-1-2004-0128714-89
3 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search		 2005.01.12 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
4 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search		 2005.02.17 수리 (Accepted) 9-1-2005-0009606-31
5 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2005.05.30 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2005-0246947-25
6 지정기간연장신청서
Request for Extension of Designated Period		 2005.07.29 수리 (Accepted) 1-1-2005-0419319-39
7 지정기간연장신청서
Request for Extension of Designated Period		 2005.08.30 수리 (Accepted) 1-1-2005-0483551-50
8 지정기간연장신청서
Request for Extension of Designated Period		 2005.09.30 수리 (Accepted) 1-1-2005-0555983-82
9 지정기간연장신청서
Request for Extension of Designated Period		 2005.10.31 수리 (Accepted) 1-1-2005-0624815-27
10 지정기간연장신청서
Request for Extension of Designated Period		 2005.11.30 수리 (Accepted) 1-1-2005-0700746-36
11 지정기간연장신청서
Request for Extension of Designated Period		 2005.12.30 수리 (Accepted) 1-1-2005-0784805-89
12 지정기간연장신청서
Request for Extension of Designated Period		 2006.01.26 수리 (Accepted) 1-1-2006-0062879-46
13 지정기간연장신청서
Request for Extension of Designated Period		 2006.02.28 수리 (Accepted) 1-1-2006-0148787-38
14 지정기간연장신청서
Request for Extension of Designated Period		 2006.03.27 수리 (Accepted) 1-1-2006-0215609-81
15 명세서등보정서
Amendment to Description, etc.		 2006.04.26 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2006-0291783-77
16 의견서
Written Opinion		 2006.04.26 수리 (Accepted) 1-1-2006-0291801-12
17 등록결정서
Decision to grant		 2006.08.23 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2006-0484493-59
18 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2008.03.07 수리 (Accepted) 4-1-2008-0003929-31
19 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2008.06.12 수리 (Accepted) 4-1-2008-5093865-89
20 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2009.11.17 수리 (Accepted) 4-1-2009-5220324-82
21 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2015.07.22 수리 (Accepted) 4-1-2015-5098802-16
22 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2016.09.05 수리 (Accepted) 4-1-2016-5127132-49
23 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2018.03.02 수리 (Accepted) 4-1-2018-5036549-31
24 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2018.12.27 수리 (Accepted) 4-1-2018-5266647-91
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
염기의 서열구조가 괄호로 표시되는 구조 데이타를 컴퓨터의 입력장치를 통하여 입력받는 입력 단계;상기 입력된 구조 데이타로부터 괄호쌍으로 둘러싸여져 이루어지는 스템-루프들과 슈도노트들을 식별하는 식별 단계;상기 식별된 슈도노트에 포함되어 있는 스템-루프의 위치 및 모양을 계산하는 제1계산 단계;상기 계산된 스템-루프를 포함하는 슈도노트의 위치 및 모양을 계산하는 제2계산 단계;상기 계산된 슈도노트 외부에 위치한 스템-루프의 위치 및 모양을 계산하는 제3계산 단계; 및상기 시각화된 스템-루프를 슈도노트에 삽입하거나 연결하여 RNA 슈도노트 구조도를 완성하여 컴퓨터의 출력장치를 통해 출력하는 단계로 이루어지는 RNA 슈도노트 구조의 시각화 방법
2 2
제 1항에 있어서, 상기 식별 단계는루프에 다른 스템-루프를 포함하고 있지 않은 단일 루프-스템과,루프에 하나 이상의 다른 스템-루프를 포함하는 복합 스템-루프와,슈도노트를 구분하는 것을 특징으로 하는 RNA 슈도노트 구조의 시각화 방법
3 3
제 2항에 있어서, 상기 제1계산 단계는스템-루프의 염기 쌍들을 수직축(y축)상에 동일한 y좌표를 갖도록 누적하는 단계;루프 중심 C, 루프 반경 R, 루프의 염기간 각도 α를 다음과 같이 계산하는 단계:[상기에서, n은 '루프의 염기수 + 2'이고, L은 스템의 염기 쌍 및 인접 염기 간의 거리이고, 벡터 Pm은 스템의 마지막 염기쌍(p1,p2)의 중심점 위치벡터 이며{x1,x2,y1,y2는 스템의 마지막 염기쌍(p1,p2의 좌표}, d는 상기 점 Pm에서 루프 중심 C까지의 거리 이고, 벡터 N은 상기 점 Pm에서 루프 중심 C로 향하는 단위벡터이다]; 및, 상기 계산된 루프 중심 C로부터 반경 R의 원내에 2α각도로 배치하는 단계로 이루어지는 것을 특징으로 하는 RNA 슈도노트 구조의 시각화 방법
4 4
제 3항에 있어서, 상기 제1계산 단계에서 계산된 스템-루프가 다른 복합 스템-루프에 포함하는 경우에는,복합 스템-루프에 연결되기 전의 단일 스템-루프의 첫번째 염기와 마지막 염기의 위치 sStart, sEnd와, 복합 스템-루프에 연결된 후의 단일 스템-루프의 첫 번째 염기 및 마지막 염기의 위치 pStart, pEnd로부터 각각 벡터 s, p를 다음과 같이 구하는 단계;상기 구해진 벡터 s와 벡터 p로부터 각도 b를 에 의하여 구하는 단계;다른 복합 스템-루프에 포함될 스템-루프를 상기 계산된 각도 b로 회전시키는 단계;상기 회전된 스템-루프를 평행이동하여 해당 복합 스템-루프에 삽입시키는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 RNA 슈도노트 구조의 시각화 방법
5 5
제 1항에 있어서, 상기 제2계산 단계는상기 식별단계에서 식별된 슈도노트를 스템부와 스템부 사이에 위치하는 내부구조요소들로 구분하는 단계;상기 구분된 부분중 스템부는 염기쌍이 동일한 y좌표를 갖도록 수직으로 배치하는 단계;상기 내부 구조요소의 위치 및 모양을 계산하여 시각화하는 단계;상기 시각화된 내부 구조요소를 지정된 상기 스템부의 내부 또는 스템부들 사이에 삽입하는 단계로 이루어지는 것을 특징으로 하는 RNA 슈도노트 구조의 시각화 방법
6 6
제 5항에 있어서, 상기 슈도노트의 구분 단계는 슈도노트를5'-end에 첫번째 염기가 연결되는 제1스템과,상기 제1스템의 마지막 염기에 자신의 첫번째 염기가 연결되는 제2스템과,상기 제2스템의 마지막 염기 쌍에 자신의 첫번째 염기가 연결되고 자신의 마지막 염기는 3'-end에 연결되는 제3스템과,상기 제1,2,3 스템 사이에 위치하는 쌍을 갖지 않는 염기들 또는 스템루프로 이루어진 제1~제5 내부구조요소중 일부 또는 전부로 구분하는 것을 특징으로 하는 RNA 슈도노트 구조의 시각화 방법
7 7
제 6항에 있어서,상기 제1내부구조요소는 슈도노트의 제1스템의 시작부와 제2스템의 시작부 사이의 구조요소,제2내부구조요소는 슈도노트의 제2스템의 시작부와 제1스템의 종료부 사이의 구조요소,제3내부구조요소는 슈도노트의 제2스템의 종료부와 제3스템의 시작부 사이의 구조요소,제4내부구조요소는 슈도노트의 제1스템의 종료부와 제3스템의 시작부 사이의 구조요소,제5내부구조요소는 슈도노트의 제2스템의 종료부와 제3스템의 종료부 사이의 구조요소로 정의되는 것을 특징으로 하는 RNA 슈도노트 구조의 시각화 방법
8 8
제 5항에 있어서, 상기 삽입 단계는제1스템의 시작부, 제1내부구조요소, 제3스템의 시작부 부분에 위치되는 스템-루프는 반시계방향으로 90°회전시킨 후 삽입시키고,제2스템의 시작부, 제2내부구조요소 부분의 스템-루프는 수평적으로 뒤집고나서, 반시계방향으로 90°회전시킨 후 슈도노트에 삽입시키고,제1스템의 종료부, 제5내부구조요소, 제3스템의 종료부 부분의 스템-루프들은 시계방향으로 90°회전시킨 후, 슈도노트에 삽입시키고,제3내부구조요소, 제4내부구조요소, 제2스템의 종료부 부분의 스템-루프들은 수평적으로 뒤집고, 시계방향으로 90°회전시킨 후 슈도노트에 삽입시키는 것을 특징으로 하는 RNA 슈도노트 구조의 시각화 방법
9 9
제 5항에 있어서, 상기 삽입 단계 후, 상기 삽입이 이루어진 스템부의 시작부 또는 종료부의 한 쌍으로된 두 염기들이 같은 y 좌표를 갖도록 염기 위치를 조정하는 단계를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 RNA 슈도노트 구조의 시각화 방법
10 10
제 1항 내지 제 9항의 어느 한 항에 기재된 RNA 슈도노트 구조의 시각화 방법을 수행하는 프로그램을 기록한 컴퓨터 판독 가능한 기록매체
11 10
제 1항 내지 제 9항의 어느 한 항에 기재된 RNA 슈도노트 구조의 시각화 방법을 수행하는 프로그램을 기록한 컴퓨터 판독 가능한 기록매체
지정국 정보가 없습니다
순번, 패밀리번호, 국가코드, 국가명, 종류의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 패밀리정보 - 패밀리정보 표입니다.
순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 EP01482439 EP 유럽특허청(EPO) FAMILY
2 EP01482439 EP 유럽특허청(EPO) FAMILY
3 US07974786 US 미국 FAMILY
4 US20050042640 US 미국 FAMILY

DOCDB 패밀리 정보

순번, 패밀리번호, 국가코드, 국가명, 종류의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 패밀리정보 - DOCDB 패밀리 정보 표입니다.
순번 패밀리번호 국가코드 국가명 종류
1 EP1482439 EP 유럽특허청(EPO) DOCDBFAMILY
2 EP1482439 EP 유럽특허청(EPO) DOCDBFAMILY
3 US2005042640 US 미국 DOCDBFAMILY
4 US7974786 US 미국 DOCDBFAMILY
국가 R&D 정보가 없습니다.