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혈액으로부터 직접 폐암 진단 및 폐암의 서브타입 진단이 가능한 마커를 선별하는 시스템 생물학적 방법 및 이로부터 선별된 혈액으로부터 직접 폐암 진단 및 폐암 서브타입 진단이 가능한 마커

  • 기술번호 : KST2015169355
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 혈액으로부터 직접 폐암 및 폐암의 서브타입 진단이 가능한 마커를 선별하는 시스템 생물학적 방법 및 이에 의하여 선별된 혈액으로부터 직접 폐암 진단 및 폐암 서브타입의 진단이 가능한 마커에 관한 것이다.
Int. CL C12Q 1/68 (2018.01.01) G16C 10/00 (2019.01.01)
CPC C12Q 1/6886(2013.01) C12Q 1/6886(2013.01) C12Q 1/6886(2013.01) C12Q 1/6886(2013.01)
출원번호/일자 1020100008095 (2010.01.28)
출원인 (주) 더바이오, 포항공과대학교 산학협력단
등록번호/일자 10-1378919-0000 (2014.03.27)
공개번호/일자 10-2011-0088264 (2011.08.03) 문서열기
공고번호/일자 (20140414) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2012.01.30)
심사청구항수 8

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 (주) 더바이오 대한민국 대구광역시 동구
2 포항공과대학교 산학협력단 대한민국 경상북도 포항시 남구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 김현기 대한민국 대구광역시 수성구
2 노상철 대한민국 경상북도 포항시 남구
3 황대희 대한민국 경상북도 포항시 남구
4 박건욱 대한민국 대구광역시 수성구
5 이영미 대한민국 경상북도 포항시 북구
6 윤소정 대한민국 경상북도 포항시 남구
7 유성용 대한민국 경상북도 포항시 남구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 김태선 대한민국 서울(해산으로 인한 퇴사 후 사무소변경 미신고)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 (주) 더바이오 대구광역시 동구
2 포항공과대학교 산학협력단 경상북도 포항시 남구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2010.01.28 수리 (Accepted) 1-1-2010-0061620-99
2 보정요구서
Request for Amendment
2010.02.08 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2010-0012145-68
3 [출원서등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment
2010.03.08 수리 (Accepted) 1-1-2010-0145665-80
4 [심사청구]심사청구(우선심사신청)서
[Request for Examination] Request for Examination (Request for Preferential Examination)
2012.01.30 수리 (Accepted) 1-1-2012-0073791-82
5 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2012.07.05 수리 (Accepted) 4-1-2012-5143792-89
6 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2013.06.13 수리 (Accepted) 4-1-2013-0025573-58
7 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2013.07.25 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2013-0514684-53
8 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2013.07.31 수리 (Accepted) 1-1-2013-0696286-61
9 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2013.07.31 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2013-0696302-15
10 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2013.08.07 수리 (Accepted) 4-1-2013-0036096-38
11 등록결정서
Decision to grant
2013.12.23 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2013-0891227-09
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2014.02.25 수리 (Accepted) 4-1-2014-5024386-11
13 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.07.31 수리 (Accepted) 4-1-2019-0041472-38
14 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.11.20 수리 (Accepted) 4-1-2019-5243581-27
15 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.11.22 수리 (Accepted) 4-1-2019-5245997-53
16 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.11.25 수리 (Accepted) 4-1-2019-5247115-68
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
비-소세포성 폐암(non-small cell lung cancer (NSCLC)) 중 주요 서브타입인 선암(adenocarcinoma, ACC)과 편평상피세포암(squamous cell carcinoma, SCC)의 전사체 데이터를 문헌으로부터 확보하는 제 1 단계;상기 제 1 단계에서 얻어진 전사체 데이터를 분석하여 i)비-소세포성 폐암의 서브타입인 ADC 와 SCC 에서 발현양의 차이가 있으며, 또한 ii) 비-소세포성 폐암과 정상 폐 세포에서도 발현양의 차이가 있는 유전자를 선별하는 제 2 단계;상기 제 2 단계에서 얻어진 마커 유전자 후보군 중에서 폐에서 특이적으로 발현하는 유전자를 선별하는 제 3 단계;상기 제 3 단계에서 얻어진 폐 특이적 ACC/SCC 서브 타입의 진단이 가능한 마커 유전자 중에서 혈액으로 분비가능성이 있는 단백질을 선별하는 제 4 단계;상기 제 4 단계에서는 얻어진 단백질을 이용하여 네트워크 모델을 구축하고, 분석하여 혈액으로부터 직접 폐암 진단 및 폐암의 서브타입의 진단이 가능한 마커 후보를 선별하는 제 5 단계: 및 상기 제 5 단계에서 얻어진 후보 물질을 ELISA 시스템으로 검증하는 제 6 단계로 구성되는 것을 특징으로 하는 혈액으로부터 직접 폐암 진단 및 폐암의 서브타입의 진단이 가능한 마커를 선별하는 시스템생물학적 방법
2 2
제 1항에 있어서,상기 제 2 단계에서는 상기 제 1 단계에서 얻어진 데이터에 대해 T-검정 (Student's t-test), median test, 또는 윌콕슨 순위 검정 (Wilcoxon rank sum test)을 적용하고, 적용한 결과를 (p-value) 메타분석법(Stouffer's method)를 이용하여 통합 p-value 를 계산하는 통합 통계 검정 (integrative statistical testing)을 적용하여, i) ADC 와 SCC 에서 발현양의 차이가 있으며, ii) 비-소세포성 폐암(NSCLC)와 정상 폐 세포에서도 발현양의 차이가 있는 유전자 선별하는 것을 특징으로 하는 혈액으로부터 직접 폐암 진단 및 폐암의 서브타입의 진단이 가능한 마커를 선별하는 시스템생물학적 방법
3 3
제 1 항에 있어서, 상기 제 3 단계에서는 폐암 서브타입을 진단하는 마커 유전자 후보군 중에서 폐에서 특이적으로 발현하는 유전자를 선별하기 위해 Novartis gene expression atlas 의 정보를 이용하여 다른 조직 대비 폐 조직에서 발현양이 높은 폐 특이적 유전자를 선별하는 것을 특징으로 하는 혈액으로부터 직접 폐암 진단 및 폐암의 서브타입의 진단이 가능한 마커를 선별하는 시스템생물학적 방법
4 4
제 1 항에 있어서, 상기 제 4 단계에서는 폐암 특이적 ACC/SCC 서브타입의 진단이 가능한 마커 유전자 중에서 혈액으로 분비가능성이 있는 단백질을 선별하기 위해 유전자 온톨로지에 관한 정보(Gene Ontology Cellular Component; GOCC) 및 peptide atlas (혈액에서 측정된 단백질을 모아둔 DB) 를 이용하여 extracellular space 로 secretion 되거나 혈액에서 측정된 유전자를 선별하는 것을 특징으로 하는 혈액으로부터 직접 폐암 진단 및 폐암의 서브 타입의 진단이 가능한 마커를 선별하는 시스템생물학적 방법
5 5
제 1 항에 있어서, 상기 제 5 단계에서는 상기 제 4 단계에서 선별된 폐암 특이적 혈액 마커 후보 단백질을 이용하여 네트워크 모델을 구축하고, 상기 네트워크 모델의 네트워크 기능 모듈에 대해서 발현양이 많고, 항체가 존재하며, 혈액에서 모니터링 가능한 단백질을 고신뢰성 폐암 관련 혈액 마커로서 선별하는 것을 특징으로 하는 혈액으로부터 직접 폐암 진단 및 폐암의 서브 타입의 진단이 가능한 마커를 선별하는 시스템생물학적 방법
6 6
제 1 항 내지 제 5 항 중 어느 하나의 방법으로 선별된 마커를 포함하는 마커 조성물로서, SFN(ENTREZ ID 2810), MUC1(ENTREZ ID 4582), JUP(ENTREZ ID 3728), IGFBP3(ENTREZ ID 3486), SLC9A3R1(ENTREZ ID 9368), MST1R(ENTREZ ID 4486), MDK(ENTREZ ID 4192), ACTL6A(ENTREZ ID 86), EPHB3(ENTREZ ID 2049), SLC2A1(ENTREZ ID 6513), CASK(ENTREZ ID 8573), SERPINB5(ENTREZ ID 5268), PERP(ENTREZ ID 64065), MMP9(ENTREZ ID 4318), LAD1(ENTREZ ID 3898), GOLM1(ENTREZ ID 51280), CEACAM1(ENTREZ ID 634), AGR2(ENTREZ ID 10551), DSC2(ENTREZ ID 1824), DSG2(ENTREZ ID 1829), SERPINE2(ENTREZ ID 5270), CLDN4(ENTREZ ID 1364), CLDN3(ENTREZ ID 2810), CEACAM5(ENTREZ ID 1048), CEACAM5(ENTREZ ID 1048), WFDC2(ENTREZ ID 10406), CFB(ENTREZ ID 629), CP(ENTREZ ID 1356), SLC7A5(ENTREZ ID 8140), DPP4(ENTREZ ID 1803), CEACAM6(ENTREZ ID 4680), RAMP1(ENTREZ ID 10267), MMP12(ENTREZ ID 4321), SORD(ENTREZ ID 6652), SPINK1(ENTREZ ID 6690), ST14(ENTREZ ID 6768), KCNK5(ENTREZ ID 8645), ABCC3(ENTREZ ID 8714), GGH(ENTREZ ID 8836), GDF15(ENTREZ ID 9518), GPR87(ENTREZ ID 53836), FERMT1(ENTREZ ID 55612), SLC38A1(ENTREZ ID 81539) 으로 이루어진 그룹에서 선택되는 하나 이상의 마커로 구성되는 것인 혈액으로부터 직접 폐암 진단 및 폐암의 서브 타입의 진단이 가능한 마커 조성물
7 7
제 1 항 내지 제 5 항 중 어느 하나의 방법으로 선별된 마커를 포함하는 마커 조성물로서, MUC1(ENTREZ ID 4582), IGFBP3(ENTREZ ID 3486), MDK(ENTREZ ID 4192), SERPINE2(ENTREZ ID 5270), DPP4(ENTREZ ID 1803), SORD(ENTREZ ID 6652), 및 GDF15(ENTREZ ID 9518)으로 이루어진 그룹에서 선택되는 하나 이상의 마커로 구성되는 것인 혈액으로부터 직접 폐암 진단 및 폐암의 서브 타입의 진단이 가능한 마커 조성물
8 8
제 1 항 내지 제 5 항 중 어느 하나의 방법으로 선별된 마커를 포함하는 마커 조성물로서, MDK(ENTREZ ID 4192), DPP4(ENTREZ ID 1803) 로 구성되는 것인 혈액으로부터 직접 폐암 진단 및 폐암의 서브 타입의 진단이 가능한 마커 조성물
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1 WO2011093675 WO 세계지적재산권기구(WIPO) FAMILY
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1 WO2011093675 WO 세계지적재산권기구(WIPO) DOCDBFAMILY
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