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다음의 단계를 포함하는 타겟에 결합하는 바이포달 펩타이드 바인더(bipodal peptide binder)의 제조방법: (a) (i) 가닥간(interstrand) 비공유결합이 형성되는 패러럴(parallel), 안티패러럴(antiparallel) 또는 패러럴(parallel)과 안티패러럴(antiparallel) 아미노산 가닥들을 포함하는 구조 안정화 부위(structure stabilizing region); (ⅱ) 상기 구조 안정화 부위의 양 말단에 결합되어 있고 무작위적으로 선택된 각각 n 및 m개의 아미노산을 포함하는 타겟 결합 부위 I(target binding region I) 및 타겟 결합 부위 Ⅱ(target binding region Ⅱ)를 포함하는 바이포달 펩타이드 바인더의 라이브러리를 제공하는 단계; (b) 상기 라이브러리와 타겟을 접촉시키는 단계; 그리고, (c) 상기 타겟과 결합된 바이포달 펩타이드 바인더를 선택하는 단계
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제 1 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위에 형성되는 가닥간 비공유결합은 수소결합, 정전기적 상호작용, 소수성상호작용, 반데르 발스 상호작용, 파이-파이 상호작용, 양이온-파이 상호작용 또는 이들의 조합인 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위의 아미노산 가닥들은 링커로 연결된 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위는 β-헤어핀, 링커로 연결된 β-쉬트, 루이신 지퍼, 링커로 연결된 루이신 지퍼, 루이신 리치 모티프 또는 링커로 연결된 루이신 리치 모티프인 것을 특징으로 하는 방법
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제 4 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위는 β-헤어핀인 것을 특징으로 하는 방법
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제 5 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 서열목록 제1서열 내지 제19서열로 구성된 군으로부터 선택되는 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 방법
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제 6 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 서열목록 제2서열, 제14서열 또는 제18서열로부터 선택되는 아미노산 서열을 포함하는 것을 특징으로 하는 방법
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제 5 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 다음 일반식 I로 표시되는 것을 특징으로 하는 방법: 일반식 I X1-Trp(X2)X3-X4-X5(X''2)X6-X7X1은 Ser 또는 Gly-Glu이고, X2 및 X''2는 서로 독립적으로 Thr, His, Val, Ile, Phe 또는 Tyr이며, X3는 Trp 또는 Tyr이고, X4는 타입 I, 타입 I'', 타입 Ⅱ, 타입 Ⅱ'' 또는 타입 Ⅲ 또는 타입 Ⅲ'' 턴 서열이고, X5는 Trp 또는 Phe이며, X6는 Trp 또는 Val이고, X7는 Lys 또는 Thr-Glu이다
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제 5 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 다음 일반식 Ⅱ로 표시되는 것을 특징으로 하는 방법: 일반식 ⅡX1-Trp-X2-Tyr-X3-Phe-Thr-Val-X4X1은 Arg, Gly-Glu 또는 Lys-Lys이고, X2는 Gln 또는 Thr이며, X3는 타입 I, 타입 I'', 타입 Ⅱ, 타입 Ⅱ'' 또는 타입 Ⅲ 또는 타입 Ⅲ'' 턴 서열이고, X4는 Gln, Thr-Glu 또는 Gln-Glu이다
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제 5 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 다음 일반식 Ⅲ으로 표시되는 것을 특징으로 하는 방법: 일반식 ⅢX1-X2-X3-Trp-X4-X5-Thr-X6-X7X1은 Lys 또는 Lys-Lys이고, X2는 Trp 또는 Tyr이고, X3는 Val 또는 Thr이며, X4는 타입 I, 타입 I'', 타입 Ⅱ, 타입 Ⅱ'' 또는 타입 Ⅲ 또는 타입 Ⅲ'' 턴 서열이고, X5는 Trp 또는 Ala이며, X6는 Trp 또는 Val이고, X7은 Glu 또는 Gln-Glu이다
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제 5 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 다음 일반식 Ⅳ로 표시되는 것을 특징으로 하는 방법: 일반식 ⅣX1-X2-X3-Trp-X4X1은 Lys-Thr 또는 Gly이고, X2는 Trp 또는 Tyr이고, X3는 타입 I, 타입 I'', 타입 Ⅱ, 타입 Ⅱ'' 또는 타입 Ⅲ 또는 타입 Ⅲ'' 턴 서열이고, X4는 Thr-Glu 또는 Gly이다
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제 8 항에 있어서, 상기 β-헤어핀은 상기 일반식 I에서 X1은 Ser 또는 Gly-Glu이고, X2 및 X''2는 서로 독립적으로 Thr, His 또는 Val이며, X3는 Trp 또는 Tyr이고, X4는 타입 I, 타입 I'', 타입 Ⅱ 또는 타입 Ⅱ'' 서열이고, X5는 Trp 또는 Phe이며, X6는 Trp 또는 Val이고, X7는 Lys 또는 Thr-Glu이다
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제 1 항에 있어서, 상기 타겟 결합 부위 I의 아미노산 개수 n은 2-20인 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 타겟 결합 부위 Ⅱ의 아미노산 개수 m은 2-20인 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 라이브러리는 플라스미드, 박테리오파아지, 파아지미드로, 이스트 또는 박테리아로부터 제작된 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 타겟 결합 부위 I 및 타겟 결합 부위 Ⅱ는 타겟에 공동으로 작용하여 결합하는 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 구조 안정화 부위, 타겟 결합 부위 I 또는 타겟 결합 부위 Ⅱ에 추가적으로 기능성 분자가 결합되어 있는 것을 특징으로 하는 방법
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제 17 항에 있어서, 상기 기능성 분자는 검출가능한 신호를 발생시키는 레이블, 화학약물, 바이오약물, 세포막투과 펩타이드(CPP) 또는 나노입자인 것을 특징으로 하는 방법
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제 1 항에 있어서, 상기 타겟은 생화학물질, 펩타이드, 폴리펩타이드, 핵산, 탄수화물, 지질, 세포, 조직, 화합물, 금속 또는 비금속 물질인 것을 특징으로 하는 방법
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