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아미노산 서열 확인 방법 및 장치

  • 기술번호 : KST2015199484
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 아미노산 서열 확인 방법 및 장치가 개시된다. 단백질의 아미노산 결합들에 각각의 인덱스를 부여하는 단계, 아미노산 결합을 확인하는 탠덤 질량 분석 데이터의 피크 개수를 카운트하여 카운트 값을 산출하는 단계, 산출된 카운트 값을 기초로 각각의 아미노산 결합에 대한 존재를 확인하는 정확도 점수를 산출하는 단계 및 산출된 정확도 점수를 기초로 기 설정된 정확도 점수 미만의 아미노산 결합 부위를 분류하는 단계를 포함한다.
Int. CL G01N 33/68 (2006.01) G06F 19/22 (2011.01)
CPC G01N 33/6848(2013.01) G01N 33/6848(2013.01) G01N 33/6848(2013.01)
출원번호/일자 1020140043414 (2014.04.11)
출원인 한국기초과학지원연구원
등록번호/일자 10-1596391-0000 (2016.02.16)
공개번호/일자 10-2015-0118226 (2015.10.22) 문서열기
공고번호/일자 (20160223) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2014.04.11)
심사청구항수 8

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국기초과학지원연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 백선종 대한민국 충청북도 청원군
2 박재은 대한민국 서울특별시 광진구
3 이상범 대한민국 대전광역시 서구
4 김현식 대한민국 대전광역시 유성구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 이원희 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로 ***, 성지하이츠빌딩*차 ***호 (역삼동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국기초과학지원연구원 대한민국 대전광역시 유성구
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2014.04.11 수리 (Accepted) 1-1-2014-0347002-61
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2014.12.05 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2015.01.09 수리 (Accepted) 9-1-2015-0006365-53
4 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2015.07.13 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2015-0465980-04
5 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2015.09.11 수리 (Accepted) 1-1-2015-0886380-81
6 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2015.11.06 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2015-1084805-28
7 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2015.11.06 수리 (Accepted) 1-1-2015-1084800-01
8 등록결정서
Decision to grant
2016.01.28 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2016-0074634-96
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2020.06.22 수리 (Accepted) 4-1-2020-5135881-88
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
단백질의 아미노산 결합들에 각각의 인덱스(index)를 부여하는 단계;상기 아미노산 결합을 확인하는 피크의 개수를 카운트(count)하여 카운트 값을 산출하는 단계;상기 산출된 카운트 값을 기초로 상기 아미노산 결합에 대한 존재를 확인하는 정확도 점수를 산출하는 단계; 및상기 산출된 정확도 점수를 기초로 기 설정된 정확도 점수 미만의 아미노산 결합 부위를 분류하는 단계;를 포함하고,상기 카운트하여 산출하는 단계는 상기 단백질의 탠덤 질량 분석 데이터를 이용하고, 상기 탠덤 질량 분석 데이터에 포함된 피크에 해당하는 인덱스 별로 수학식 1을 이용하여 특정 아미노산 결합의 확인도(Ci,j)를 산출하는 것을 특징으로 하는 아미노산 서열 확인 방법:[수학식 1]여기서, Ci,j는 아미노산 결합 인덱스 i의 확인에 활용되는 현재 피크의 확인도(기여도)를 의미하고, Imax는 피크 강도의 전체 중 가장 큰 피크 강도를 의미하며, Imin는 피크 강도의 전체 중 가장 작은 피크 강도를 의미한다
2 2
삭제
3 3
제 1항에 있어서,상기 탠덤 질량 분석 데이터는,하나의 피크(peak)에 아미노산 결합이 1개 또는 2개의 정보를 포함하는 탠덤 질량 스펙트럼(Tandem Mass Spectrum)을 포함하는 것을 특징으로 하는 아미노산 서열 확인 방법
4 4
삭제
5 5
제 1항에 있어서,상기 카운트 값을 산출하는 단계는,상기 산출된 아미노산 결합의 확인도를 상기 인덱스 별로 합하여 카운트를 산출하는 것을 특징으로 하는 아미노산 서열 확인 방법
6 6
제 1항에 있어서,상기 정확도 점수를 산출하는 단계는,수학식 2를 이용하여 상기 카운트의 정수부에 대한 정확도 점수 및 상기 카운트의 소수부에 대한 정확도 점수를 각각 산출한 후, 합을 하는 것을 특징으로 하는 아미노산 서열 확인 방법:[수학식 2]여기서, F는 카운트의 정확도 점수를 의미하고, Fn는 카운트의 정수부에 대한 정확도 점수를 의미하며, Fs는 카운트의 소수부에 대한 정확도 점수를 의미한다
7 7
제 6항에 있어서,상기 정확도 점수를 산출하는 단계는,상기 카운트의 정수부의 정확도 점수를 수학식 3을 이용하여 산출하는 것을 특징으로 하는 아미노산 서열 확인 방법:[수학식 3]여기서, n은 카운트의 정수부를 의미하고, β는 2 내지 5의 임의의 수를 의미하며, e는 자연수(e=2
8 8
제 6항에 있어서,상기 정확도 점수를 산출하는 단계는,상기 카운트의 소수부의 정확도 점수를 수학식 4를 이용하여 산출하는 것을 특징으로 하는 아미노산 서열 확인 방법:[수학식 4]여기서, s는 카운트의 소수부를 의미한다
9 9
제 1항에 기재된 방법을 컴퓨터에서 실행시키기 위한 프로그램을 기록한 컴퓨터로 읽을 수 있는 기록매체
10 10
단백질의 아미노산 배열을 수신받는 입력부;상기 수신된 아미노산 배열에 대한 결합들에 각각의 인덱스(index)를 부여하고, 상기 아미노산 결합을 확인하는 탠덤 질량분석 데이터의 피크 개수를 카운트(count)하여 카운트 값을 산출하며, 상기 산출된 카운트 값을 기초로 상기 아미노산 결합에 대한 존재를 확인하는 정확도 점수를 산출하고, 상기 산출된 정확도 점수를 기초로 기 설정된 정확도 점수 미만의 아미노산 결합 부위를 분류하는 제어부;를 포함하고,상기 카운트하여 산출하는 방법은, 상기 단백질의 탠덤 질량 분석 데이터를 이용하고, 상기 탠덤 질량 분석 데이터에 포함된 피크에 해당하는 인덱스 별로 수학식 1을 이용하여 특정 아미노산 결합의 확인도(Ci,j)를 산출하는 것을 특징으로 하는 아미노산 서열 확인 방법:[수학식 1]여기서, Ci,j는 아미노산 결합 인덱스 i의 확인에 활용되는 현재 피크의 확인도(기여도)를 의미하고, Imax는 피크 강도의 전체 중 가장 큰 피크 강도를 의미하며, Imin는 피크 강도의 전체 중 가장 작은 피크 강도를 의미한다
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1 산업통상자원부 한남대학교 산업융합원천기술개발사업 항체의약품 물리적 화학적 특성분석시스템