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단백질의 리간드 결합부위 예측 방법(Protein Ligand Binding Site Prediction Method)

  • 기술번호 : KST2016012754
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 단백질의 리간드 결합부위를 예측하는 방법에 관한 것으로, 단백질 내 빈 공간들을 단백질의 잔기 원자들의 위치를 출발점으로 하여 단백질 표면과 같은 높이까지만 채우도록 모조원자들의 위치를 계산하고; 생성된 모조 원자들의 밀도를 바탕으로 하는 군집화를 통해 리간드 결합부위로 가능한 모조원자들의 클러스터를 도출하고; 모조원자 클러스터를 구성하는 모조 원자의 상호 작용하는 단백질 잔기들의 특성값과 모조원자를 둘러싸는 단백질 원자 개수의 통계값을 조합한 함수로 총점을 계산하고; 계산된 총점으로 순위를 매겨 단백질의 리간드 결합부위를 예측하는 일련의 방법으로 구성되며, 기존의 단백질 리간드 결합 부위 예측 방법들에 비해 보다 정확하게 예측 할 수 있다.
Int. CL G06F 19/18 (2011.01) G06F 19/24 (2011.01)
CPC G16B 20/00(2013.01)G16B 20/00(2013.01)G16B 20/00(2013.01)
출원번호/일자 1020140187713 (2014.12.24)
출원인 서울대학교산학협력단
등록번호/일자 10-1657821-0000 (2016.09.08)
공개번호/일자 10-2016-0078537 (2016.07.05) 문서열기
공고번호/일자 (20160920) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2014.12.24)
심사청구항수 4

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 서울대학교산학협력단 대한민국 서울특별시 관악구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 신환철 대한민국 서울특별시 서초구
2 전재경 대한민국 서울특별시 관악구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 강문호 대한민국 서울특별시 서초구 사평대로 ** (반포동) 우주빌딩 *층(다민특허법률사무소)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 서울대학교산학협력단 대한민국 서울특별시 관악구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2014.12.24 수리 (Accepted) 1-1-2014-1253796-80
2 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2015.03.17 수리 (Accepted) 4-1-2015-5033829-92
3 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2015.05.13 수리 (Accepted) 4-1-2015-5062924-01
4 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2015.05.27 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
5 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2015.07.13 수리 (Accepted) 9-1-2015-0047890-17
6 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2016.04.26 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2016-0306033-97
7 [대리인선임]대리인(대표자)에 관한 신고서
[Appointment of Agent] Report on Agent (Representative)
2016.05.19 수리 (Accepted) 1-1-2016-0480899-98
8 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2016.06.24 수리 (Accepted) 1-1-2016-0612155-56
9 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2016.07.22 수리 (Accepted) 1-1-2016-0713610-10
10 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2016.07.22 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2016-0713635-51
11 등록결정서
Decision to grant
2016.08.31 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2016-0630524-69
12 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.05.13 수리 (Accepted) 4-1-2019-5093546-10
13 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.05.23 수리 (Accepted) 4-1-2019-5101798-31
14 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.08.02 수리 (Accepted) 4-1-2019-5154561-59
15 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2020.11.25 수리 (Accepted) 4-1-2020-5265458-48
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
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(A) CPU에 의해 단백질 구조로부터 도출된 모조원자를 둘러싸는 단백질 원자 개수를 계산하여 단백질 표면의 같은 높이를 가지는 모조 원자들을 산출하는 단계; (B) CPU에 의해 상기 산출된 모조원자들을 군집화하여 모조원자 클러스터를 생성하는 단계; (C) CPU에 의해 모조원자 클러스터와 상호작용하는 잔기들의 특성값과 각각의 모조원자를 둘러싸는 단백질 원자들의 수의 표준편차와 평균값의 조합으로 모조원자 클러스터의 총점을 계산하여 순위를 매기는 단계를 포함하는 단백질 리간드 결합부위 예측 방법
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제1항에 있어서, 상기 (A) 단계는,단백질의 원자의 3차원 좌표로부터 계산된 모조 원자의 중심 좌표로부터 반경 14Å내에 존재하는 단백질 원자 개수와 7Å내에 존재하는 단백질 표면 원자 개수를 1:3 의 비율로 더한 값과 단백질 표면과 같은 높이를 가지는 지표값의 비교를 통해 단백질 표면과 같은 높이를 가지는 모조 원자를 생성하여 단백질 리간드 결합부위를 예측하는 방법
3 3
제2항에 있어서, 상기 (B) 단계는,생성된 모조원자들 간의 거리가 1
4 4
제3항에 있어서, 상기 (C) 단계는, 생성된 모조원자의 클러스터와 상호작용하는 단백질의 잔기의 특성값과 클러스터를 이루는 모조원자의 좌표로부터 반경 14Å내에 존재하는 단백질 원자 개수들의 표준편차와 평균값에 가중치를 주어 총점을 구하고 이를 순위를 매겨 단백질 리간드 결합부위를 예측하는 방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.