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ｎｃＲＮＡ 서열의 컴퓨터적 동정 방법

  • 기술번호 : KST2015158890
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 진화 알고리즘의 하나인 유전자 프로그래밍 기법을 이용하는 ncRNA (비코딩 RNA), 특히 miRNA 의 컴퓨터적 동정 방법에 관한 것으로, 더욱 구체적으로 본 발명에 따른 ncRNA, 특히 miRNA 의 컴퓨터적 동정 방법은 ncRNA, 특히 miRNA 인 것으로 공지된 포지티브 데이터 세트 및 ncRNA, 특히 miRNA 가 아닌 것으로 공지된 네거티브 데이터 세트로 이루어진 데이터 세트로부터 폴스 네거티브(false-negative) 결과를 생성하지 않는 함수 트리와 이로부터 전환된 RNA 공통구조문법을 유전자 프로그래밍(genetic programming)으로 진화적으로 학습시켜 생성된 최적의 함수 트리 또는 RNA 공통구조문법(RCSG)에, 공지되지 않은 서열을 적용하여, 상기 비공지 서열이 ncRNA, 특히 miRNA 인지의 여부를 확인하는 것을 포함함을 특징으로 한다. 또한, 본 발명에 따른 방법은 miRNA 뿐만 아니라, 일반적으로 ncRNA를 모두 예측할 수 있는 방법으로서 사용될 수 있다. miRNA 전구체, miRNA, 유전자 프로그래밍, RNA 공통 구조 문법, EM 알고리즘, 공통 구조 학습, ncRNA
Int. CL G06F 19/24 (2011.01) G06N 3/08 (2011.01)
CPC G06N 3/123(2013.01) G06N 3/123(2013.01)
출원번호/일자 1020030060424 (2003.08.29)
출원인 재단법인서울대학교산학협력재단
등록번호/일자 10-0504039-0000 (2005.07.19)
공개번호/일자 10-2005-0022133 (2005.03.07) 문서열기
공고번호/일자 (20050727) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 소멸
심사진행상태 수리
심판사항
구분
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2003.08.29)
심사청구항수 6

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 재단법인서울대학교산학협력재단 대한민국 서울특별시 관악구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 장병탁 대한민국 서울 서초구
2 남진우 대한민국 경기도 안산시 본
3 정제균 대한민국 서울특별시 관악구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 임재룡 대한민국 서울특별시 강남구 논현로 ***, ***호 (역삼동, 성지하이츠*)(나래특허법률사무소)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 재단법인서울대학교산학협력재단 대한민국 서울특별시 관악구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 특허출원서
Patent Application		 2003.08.29 수리 (Accepted) 1-1-2003-0323917-80
2 출원인변경신고서
Applicant change Notification		 2004.04.17 수리 (Accepted) 1-1-2004-5060693-74
3 대리인 선임 신고서
Notification of assignment of agent		 2004.10.22 수리 (Accepted) 1-1-2004-0483750-05
4 등록결정서
Decision to grant		 2005.06.23 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2005-0291730-70
5 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2008.01.29 수리 (Accepted) 4-1-2008-5015497-73
6 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2014.08.22 수리 (Accepted) 4-1-2014-5100909-62
7 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2015.03.20 수리 (Accepted) 4-1-2015-5036045-28
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번호 청구항
1 1
ncRNA (non-coding RNA)인 것으로 공지된 포지티브 데이터 세트 및 ncRNA 가 아닌 것으로 공지된 네거티브 데이터 세트인 것으로 이루어진 데이터 세트로부터 폴스 네거티브(false-negative) 결과를 생성하지 않는 함수 트리와 이로부터 전환된 RNA 공통구조문법을 유전자 프로그래밍(genetic programming)으로 진화적으로 학습시켜 생성된 최적의 함수 트리 및 RNA 공통구조문법(RCSG)에, 공지되지 않은 서열을 적용하여, 상기 비공지 서열이 miRNA 인지의 여부를 확인하는 것을 포함함을 특징으로 하는, ncRNA 서열의 컴퓨터적 동정 방법
2 2
제 1 항에 있어서, 상기 ncRNA 가 miRNA (microRNA) 인 것을 특징으로 하는 ncRNA 서열의 컴퓨터적 동정 방법
3 3
제 2 항에 있어서, 하기 단계를 포함함을 특징으로 하는 miRNA 서열의 컴퓨터적 동정 방법: (1) 함수 트리를 포함하는 초기 집단을 랜덤하게 생성하는 단계; (2) 상기 모든 함수 트리를 구조 문법으로 전환하는 단계; (3) 공지된 포지티브 데이터 세트 및 공지된 네거티브 데이터 세트를 이용하여, 상기 모든 구조 문법을 RNA모티프 검색을 통해 평가하는 단계; (4) 모든 구조 문법에 대해 적합도, 특이도, 민감도 및 복잡도를 계산하는 단계; (5) 상기 최적도를 구조 문법을 함수 트리로 전환하는 단계; (6) 선택된 함수 트리를 돌연변이 및 교배를 통해 변형시키는 단계; (7) 상기 변형을 갖는 후세대 함수 트리를 생성하고, 최적의 개체를 선택하는 단계; 및 (8) 적합도, 특이도, 민감도 및 복잡도를 갖는 함수 트리가 생성될 때까지, 상기 단계 (2) 내지 (7)을 반복하는 단계
4 4
제 3 항에 있어서, 상기 단계 (2) 및 단계 (5) 에서, 함수 트리의 구조 문법으로의 전환 또는 구조 문법의 함수 트리로의 전환이 컴퓨터 프로그램에 의해 자동적으로 수행됨을 특징으로 하는 ncRNA 서열의 컴퓨터적 동정 방법
5 5
제 3 항에 있어서, RNA구조와 염기서열의 공통성이 유전자 프로그래밍에 의해 동시에 학습됨을 특징으로 하는 ncRNA 서열의 컴퓨터적 동정 방법
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제 1 항에 있어서, EM 알고리즘을 이용해 학습된 스코어 모델을 이용하여 2차 선별을 통해 miRNA 전구체를 예측함을 특징으로 하는 ncRNA 서열의 컴퓨터적 동정 방법
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제 1 항에 있어서, EM 알고리즘을 이용해 학습된 스코어 모델을 이용하여 2차 선별을 통해 miRNA 전구체를 예측함을 특징으로 하는 ncRNA 서열의 컴퓨터적 동정 방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
국가 R&D 정보가 없습니다.