| 1 |
1
표적 치료제의 표적이 되는 단백질의 탐색 방법으로서,섭동된 암 세포의 제1 인체 신호 전달 네트워크에 대하여 끌개 분석을 수행하는 단계, 그리고상기 제1 인체 신호 전달 네트워크에 대한 끌개 분석 결과 및 정상 세포의 제2 인체 신호 전달 네트워크에 대한 끌개 분석 결과를 바탕으로 암 세포의 제3 인체 신호 전달 네트워크에 포함된 복수의 단백질 중 적어도 하나의 단백질을 표적 단백질로 결정하는 단계를 포함하는 단백질 탐색 방법
|
| 2 |
2
제1항에서, 상기 수행하는 단계는,상기 제2 인체 신호 전달 네트워크에 암 상태에 관한 돌연변이 지도를 적용하여 상기 제3 인체 신호 전달 네트워크를 모델링하는 단계, 상기 제3 인체 신호 전달 네트워크에 포함된 복수의 단백질 중 적어도 하나의 단백질을 섭동하여 상기 제1 인체 신호 전달 네트워크를 모델링하는 단계, 그리고불리언 네트워크 모델을 이용하여 상기 제1 인체 신호 전달 네트워크의 신호 전달 과정을 시뮬레이션 하는 단계를 포함하는 단백질 탐색 방법
|
| 3 |
3
제2항에서, 상기 제1 인체 신호 전달 네트워크를 모델링하는 단계는,상기 제3 인체 신호 전달 네트워크에 포함된 복수의 단백질 중 일부 단백질의 조합을 섭동하여 상기 제1 인체 신호 전달 네트워크를 모델링하는 단계를 포함하는 단백질 탐색 방법
|
| 4 |
4
제2항에서, 상기 시뮬레이션 하는 단계는,상기 제1 인체 신호 전달 네트워크에 포함된 복수의 단백질의 상호 관계에 관한 불리언 네트워크 모델을 결정하는 단계, 그리고상기 불리언 네트워크 모델을 바탕으로 상기 제1 인체 신호 전달 네트워크에 대해 시간 동역학적 시뮬레이션을 수행하는 단계를 포함하는 단백질 탐색 방법
|
| 5 |
5
제4항에서, 상기 시뮬레이션 하는 단계는,상기 불리언 네트워크 모델을 바탕으로 상기 복수의 단백질의 상호 관계에 관한 진리표를 생성하는 단계,상기 진리표를 바탕으로 상기 복수의 단백질의 상태 변화를 나타내는 상태 천이표를 생성하는 단계, 그리고상기 상태 천이표를 바탕으로 상태 천이도를 생성하여 상기 제1 인체 신호 전달 네트워크에 포함된 단백질의 최종 상태를 나타내는 끌개를 결정하는 단계를 포함하는 단백질 탐색 방법
|
| 6 |
6
제1항에서, 상기 수행하는 단계는,상기 제1 인체 신호 전달 네트워크에 대한 시뮬레이션의 결과를 바탕으로 상기 섭동된 암 세포에 대한 끌개의 유역 크기를 계산하는 단계를 포함하는 단백질 탐색 방법
|
| 7 |
7
제6항에서, 상기 결정하는 단계는,상기 정상 세포에 대한 끌개 중 비정상 끌개의 유역 크기와 상기 섭동된 암 세포에 대한 끌개 중 비정상 끌개의 유역 크기를 비교하는 단계, 그리고상기 섭동된 암 세포에 대한 끌개 중 비정상 끌개의 유역 크기와, 상기 정상 세포에 대한 끌개 중 비정상 끌개의 유역 크기의 차이가 미리 정해진 값보다 작은 경우, 상기 제3 인체 신호 전달 네트워크에 포함된 복수의 단백질 중 섭동된 적어도 하나의 단백질을 상기 표적 단백질로 결정하는 단계를 포함하는 단백질 탐색 방법
|
| 8 |
8
제6항에서,상기 결정하는 단계는,상기 정상 세포에 대한 끌개 중 정상 끌개 및 비정상 끌개의 제1 유역 크기 비율과, 상기 섭도된 암 세포에 대한 끌개 중 정상 끌개 및 비정상 끌개의 제2 유역 크기 비율을 비교하는 단계, 그리고상기 제1 유역 크기 비율과 상기 제2 유역 크기 비율의 차이가 미리 정해진 값보다 작은 경우, 상기 제3 인체 신호 전달 네트워크에 포함된 복수의 단백질 중 섭동된 적어도 하나의 단백질을 상기 표적 단백질로 결정하는 단계를 포함하는 단백질 탐색 방법
|
| 9 |
9
제7항에서, 상기 결정하는 단계는,상기 제3 인체 신호 전달 네트워크에 포함된 복수의 단백질 중 적어도 두 개의 단백질이 상기 표적 단백질로 결정된 경우, 상기 적어도 두 개의 단백질의 조합 중 적어도 하나를 상기 표적 단백질로 결정하는 단계를 더 포함하는 단백질 탐색 방법
|
| 10 |
10
제9항에서, 상기 결정하는 단계는,상기 제3 인체 신호 전달 네트워크에 포함된 복수의 단백질 중 적어도 두 개의 단백질이 상기 표적 단백질로 결정된 경우, 상기 적어도 두 개의 단백질을 조합하고, 상기 적어도 두 개의 단백질의 조합을 섭동하여 제4 인체 신호 전달 네트워크를 생성하는 단계, 그리고상기 제4 인체 신호 전달 네트워크에 대하여 끌개 분석을 재수행하는 단계를 더 포함하는 단백질 탐색 방법
|
| 11 |
11
표적 치료제의 표적이 되는 단백질을 탐색하는 탐색 장치로서,적어도 하나의 프로세서, 메모리, 그리고송수신부를 포함하고,상기 적어도 하나의 프로세서는 상기 메모리에 저장된 적어도 하나의 프로그램을 실행하여,섭동된 암 세포의 제1 인체 신호 전달 네트워크에 대하여 끌개 분석을 수행하는 단계, 그리고상기 제1 인체 신호 전달 네트워크에 대한 끌개 분석 결과 및 정상 세포의 제2 인체 신호 전달 네트워크에 대한 끌개 분석 결과를 바탕으로 암 세포의 제3 인체 신호 전달 네트워크에 포함된 복수의 단백질 중 적어도 하나의 단백질을 표적 단백질로 결정하는 단계를 수행하는 단백질 탐색 장치
|
| 12 |
12
제11항에서, 상기 적어도 하나의 프로세서는 상기 수행하는 단계를 수행할 때,상기 제2 인체 신호 전달 네트워크에 암 상태에 관한 돌연변이 지도를 적용하여 상기 제3 인체 신호 전달 네트워크를 모델링하는 단계, 상기 제3 인체 신호 전달 네트워크에 포함된 복수의 단백질 중 적어도 하나의 단백질을 섭동하여 상기 제1 인체 신호 전달 네트워크를 모델링하는 단계, 그리고불리언 네트워크 모델을 이용하여 상기 제1 인체 신호 전달 네트워크의 신호 전달 과정을 시뮬레이션 하는 단계를 수행하는 단백질 탐색 장치
|
| 13 |
13
제12항에서, 상기 적어도 하나의 프로세서는 상기 제1 인체 신호 전달 네트워크를 모델링하는 단계를 수행할 때,상기 제3 인체 신호 전달 네트워크에 포함된 복수의 단백질 중 일부 단백질의 조합을 섭동하여 상기 제1 인체 신호 전달 네트워크를 모델링하는 단계를 수행하는 단백질 탐색 장치
|
| 14 |
14
제12항에서, 상기 적어도 하나의 프로세서는 상기 시뮬레이션 하는 단계를 수행할 때,상기 제1 인체 신호 전달 네트워크에 포함된 복수의 단백질의 상호 관계에 관한 불리언 네트워크 모델을 결정하는 단계, 그리고상기 불리언 네트워크 모델을 바탕으로 상기 제1 신호 전달 네트워크에 대해 시간 동역학적 시뮬레이션을 수행 하는 단계를 수행하는 단백질 탐색 장치
|
| 15 |
15
제14항에서, 상기 적어도 하나의 프로세서는 상기 시뮬레이션 하는 단계를 수행할 때,상기 불리언 네트워크 모델을 바탕으로 상기 복수의 단백질의 상호 관계에 관한 진리표를 생성하는 단계,상기 진리표를 바탕으로 상기 복수의 단백질의 상태 변화를 나타내는 상태 천이표를 생성하는 단계, 그리고상기 상태 천이표를 바탕으로 상태 천이도를 생성하여 상기 제1 인체 신호 전달 네트워크에 포함된 단백질의 최종 상태를 나타내는 끌개를 결정하는 단계를 수행하는 단백질 탐색 장치
|
| 16 |
16
제11항에서, 상기 적어도 하나의 프로세서는 상기 수행하는 단계를 수행할 때,상기 제1 인체 신호 전달 네트워크에 대한 시뮬레이션의 결과를 바탕으로 상기 섭동된 암 세포에 대한 끌개의 유역 크기를 계산하는 단계를 수행하는 단백질 탐색 장치
|
| 17 |
17
제16항에서, 상기 적어도 하나의 프로세서는 상기 결정하는 단계를 수행할 때,상기 정상 세포에 대한 끌개 중 비정상 끌개의 유역 크기와 상기 섭동된 암 세포에 대한 끌개 중 비정상 끌개의 유역 크기를 비교하는 단계, 그리고상기 섭동된 암 세포에 대한 끌개 중 비정상 끌개의 유역 크기와, 상기 정상 세포에 대한 끌개 중 비정상 끌개의 유역 크기의 차이가 미리 정해진 값보다 작은 경우, 상기 제3 인체 신호 전달 네트워크에 포함된 복수의 단백질 중 섭동된 적어도 하나의 단백질을 상기 표적 단백질로 결정하는 단계를 수행하는 단백질 탐색 장치
|
| 18 |
18
제16항에서,상기 적어도 하나의 프로세서는 상기 결정하는 단계를 수행할 때,상기 정상 세포에 대한 끌개 중 정상 끌개 및 비정상 끌개의 제1 유역 크기 비율과, 상기 섭도된 암 세포에 대한 끌개 중 정상 끌개 및 비정상 끌개의 제2 유역 크기 비율을 비교하는 단계, 그리고상기 제1 유역 크기 비율과 상기 제2 유역 크기 비율의 차이가 미리 정해진 값보다 작은 경우, 상기 제3 인체 신호 전달 네트워크에 포함된 복수의 단백질 중 섭동된 적어도 하나의 단백질을 상기 표적 단백질로 결정하는 단계를 수행하는 단백질 탐색 장치
|
| 19 |
19
제17항에서, 상기 적어도 하나의 프로세서는 상기 결정하는 단계를 수행할 때,상기 제3 인체 신호 전달 네트워크에 포함된 복수의 단백질 중 적어도 두 개의 단백질이 상기 표적 단백질로 결정된 경우, 상기 적어도 두 개의 단백질의 조합 중 적어도 하나를 상기 표적 단백질로 결정하는 단계를 더 수행하는 단백질 탐색 장치
|
| 20 |
20
제19항에서, 상기 적어도 하나의 프로세서는 상기 결정하는 단계를 수행할 때,상기 제3 인체 신호 전달 네트워크에 포함된 복수의 단백질 중 적어도 두 개의 단백질이 상기 표적 단백질로 결정된 경우, 상기 적어도 두 개의 단백질을 조합하고, 상기 적어도 두 개의 단백질의 조합을 섭동하여 제4 인체 신호 전달 네트워크를 생성하는 단계, 그리고상기 제4 인체 신호 전달 네트워크에 대하여 끌개 분석을 재수행하는 단계를 더 수행하는 단백질 탐색 장치
|
