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진균류 유전체 해독을 위한 시스템 및 방법

  • 기술번호 : KST2018015735
  • 담당센터 : 서울동부기술혁신센터
  • 전화번호 : 02-2155-3662
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요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 다양한 유전자 예측 프로그램을 통합하고 유전자 예측 모델을 평가하여 진균류 유전체를 해독하는 시스템 및 방법에 관한 것이다.
Int. CL G06F 19/12 (2011.01.01) G06F 19/24 (2011.01.01) C12Q 1/68 (2018.01.01)
CPC G16B 5/00(2013.01) G16B 5/00(2013.01) G16B 5/00(2013.01)
출원번호/일자 1020170063812 (2017.05.24)
출원인 고려대학교 산학협력단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2018-0128996 (2018.12.05) 문서열기
공고번호/일자 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2017.05.24)
심사청구항수 5

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 고려대학교 산학협력단 대한민국 서울특별시 성북구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 최인걸 대한민국 서울특별시 동작구
2 민병남 대한민국 서울특별시 노원구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인다나 대한민국 서울특별시 강남구 역삼로 *길 **, 신관 *층~*층, **층(역삼동, 광성빌딩)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 고려대학교 산학협력단 서울특별시 성북구
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application		 2017.05.24 수리 (Accepted) 1-1-2017-0493221-03
2 의견제출통지서
Notification of reason for refusal		 2018.09.13 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2018-0625120-89
3 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment		 2018.11.13 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2018-1127022-42
4 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)		 2018.11.13 수리 (Accepted) 1-1-2018-1127021-07
5 등록결정서
Decision to grant		 2018.11.29 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2018-0815113-15
6 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information		 2019.10.10 수리 (Accepted) 4-1-2019-5210941-09
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
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프로그램을 구비한 컴퓨터에 의해 수행되는 진균류 유전체 해독 방법에 있어서,(A) 조립된 유전체 서열 내 반복 서열을 찾아 마스킹(masking)하거나 mRNA 서열분석 리드들(reads)을 정렬 및 조립하여 콘티그(contig)를 생성하는 전처리 단계;(B) 하나 이상의 유전자 예측 프로그램을 사용하여 유전자 모델을 생성하는 단계; 및(C) 상기 유전자 모델을 평가하여 최종 유전자 모델을 선별하는 단계를 포함하고,상기 유전자 모델의 평가는 BLASTp, BUSCO 및 InterProScan 으로부터 얻은 점수를 하기 방정식에 따라 계산된 증거 점수가 높은 유전자 모델을 최종 유전자 모델로 선별하는 것인, 진균류 유전체 해독 방법:상기 식에서,coverage는 서열 길이 보정값으로, blast 결과 출력에서 query coverage를 의미하며, Pfam scores는 InterProScan 의 XML 결과에서 hmmer3-match 점수를 의미한다
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제 4항에 있어서, mRNA 서열분석 리드들을 정렬 및 조립하여 콘티그를 생성하는 것은 Hisat 및 Trinity 프로그램에 의해 수행되는 것인, 진균류 유전체 해독 방법
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제 4항에 있어서,상기 유전자 예측 프로그램은 Augustus, Braker 및 Maker인 진균류 유전체 해독 방법
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제 4항 내지 제 6항 중 어느 한 항에 있어서,상기 방법은 각 단계 또는 각 단계에서 사용되는 프로그램을 연결하는 파이프라인 프로그램이 구비된 컴퓨터를 통해 자동적으로 수행되는 것인, 진균류 유전체 해독 방법
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제 9항의 방법을 실행시키기 위한 프로그램을 기록한 컴퓨터 판독 가능 기록매체
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
순번, 연구부처, 주관기관, 연구사업, 연구과제의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 국가R&D 연구정보 정보 표입니다.
순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 농촌진흥청 고려대학교 포스트게놈 다부처유전체사업 [협동]버섯류 유전체 해독에 특화된 유전체조립 스캐폴딩 기술과 해독 파이프라인 개발