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질량분석을 이용한 당화 단백질 및 최종당화산물의 동정을 위한 새로운 생물정보처리 분석 방법

  • 기술번호 : KST2019014928
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 고분해능 질량 스펙트럼의 결과를 이용하여 당화 단백질 및 최종당화산물의 동정을 위한 새로운 생물정보처리 분석 방법에 관한 것이다. 구체적으로, 본 발명에 따른 생물정보처리 분석 방법은 다양한 종류의 시료에 포함된 종래에 공지되지 않은 당화 단백질 및 최종당화산물의 양적 변화를 효율적이고 정확하게 분석할 수 있고, 고분해능 질량 분석기를 이용함으로써, 시료로부터 암 등을 포함하는 질병의 마커를 발견하여 예측 또는 진단하는 곳에 유용하게 사용될 수 있다.
Int. CL G01N 33/68 (2006.01.01)
CPC G01N 33/6848(2013.01) G01N 33/6848(2013.01) G01N 33/6848(2013.01) G01N 33/6848(2013.01)
출원번호/일자 1020180029350 (2018.03.13)
출원인 한국기초과학지원연구원
등록번호/일자 10-1992395-0000 (2019.06.18)
공개번호/일자
공고번호/일자 (20190624) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2018.03.13)
심사청구항수 9

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 한국기초과학지원연구원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 김진영 충청북도 청주시 청원구
2 박건욱 충청북도 청주시 청원구
3 지은선 대전광역시 대덕구
4 유종신 서울특별시 강남구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 이원희 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로 ***, 성지하이츠빌딩*차 ***호 (역삼동)

최종권리자

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번호 이름 국적 주소
1 한국기초과학지원연구원 대전광역시 유성구
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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2018.03.13 수리 (Accepted) 1-1-2018-0252644-06
2 선행기술조사의뢰서
Request for Prior Art Search
2018.07.12 수리 (Accepted) 9-1-9999-9999999-89
3 선행기술조사보고서
Report of Prior Art Search
2018.10.12 수리 (Accepted) 9-1-2018-0055061-20
4 심사처리보류(연기)보고서
Report of Deferment (Postponement) of Processing of Examination
2019.04.17 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-6-2019-0040326-80
5 등록결정서
Decision to grant
2019.06.12 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2019-0417970-26
6 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2020.06.22 수리 (Accepted) 4-1-2020-5135881-88
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번호 청구항
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1) 시료 내 단백질을 가수분해하여 수득된 폴리펩타이드를 고분해능 질량분석기로 분석하여 질량 스펙트럼을 얻는 단계; 2) 상기 단계 1)에서 얻은 질량 스펙트럼 결과를 MS(mass spectrometry) 및 탄뎀 스펙트럼(MS/MS)으로 변환하는 단계; 3) 상기 단계 2)에서 변환된 탄뎀 스펙트럼 결과로부터 단백질을 동정하는 단계; 4) 상기 단계 3)에서 동정된 단백질을 펩타이드 서열에 따라 하기 a) 및 b)로 각각 그룹화하는 단계; a) 당화되지 않은 펩타이드; 및 b) 당화 펩타이드 및 최종당화산물의 펩타이드;5) 상기 단계 4)에서 그룹화된 a) 및 b)로부터 수득된 각 그룹 스펙트럼에서 당화 사이트를 제외한 b-ion, y-ion들의 강도를 평준화해서 정규패턴(Regular Pattern)을 생성하는 단계; 및6) 상기 단계 5)에서 생성된 정규 패턴과 유사한 새로운 당화 펩타이드 및 최종당화산물의 펩타이드를 선별하는 단계를 포함하는 당화 단백질 및 최종당화산물의 동정을 위한 생물정보처리 분석방법
2 2
제1항에 있어서, 상기 선별이 프룩토실화(Fructosylation), 카복실에틸(Carboxyethyl), 카복실메틸(Carboxymethyl) 및 MG-H11((Methylglyoxal-derived hydroimidazolene)로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 당화 변형 폼(form)을 이용하여 수행되는, 당화 단백질 및 최종당화산물의 동정을 위한 생물정보처리 분석방법
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제1항에 있어서, 상기 선별이 하기 수학식 1에 의해 계산되는, 당화 단백질 및 최종당화산물의 동정을 위한 생물정보처리 분석방법:[수학식 1](S: 탄뎀 질량분석 스펙트럼의 질량(x)과 상대적인 피크 강도(y),Si: (x,y) 매트릭스이며, x는 n번째의 상대적인 피크 강도, y는 n번째 피크의 질량, 및S'i: (x',y') 매트릭스이며, x'은 n번째의 상대적인 피크 강도, y'은 n번째 피크의 질량)
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제1항에 있어서, 상기 가수분해가 트립신(trypsin), 아르기닌 C(Arg-C), 아스파르트산 N(Asp-N), 글루탐산 C(Glu-C), 라이신 C(Lys-C), 키모트립신(chymotrypsin) 및 프로테나아제 K(proteinase K)로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나 이상의 효소로 수행되는, 당화 단백질 및 최종당화산물의 동정을 위한 생물정보처리 분석방법
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제1항에 있어서, 상기 질량분석기가 10,000 이상의 질량 분해능 및 50 ppm 이하의 질량 정확도를 갖는, 당화 단백질 및 최종당화산물의 동정을 위한 생물정보처리 분석방법
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제5항에 있어서, 상기 질량분석기가 오비트랩 퓨전 루모스(Orbitrap Fusion Lumos), 오비트랩 엘리트(Orbitrap Elite) 또는 Q 이그젝티브(Q Exactive)인, 당화 단백질 및 최종당화산물의 동정을 위한 생물정보처리 분석방법
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제1항에 있어서, 단계 6) 이후에 선별된 당화 펩타이드 및 최종당화산물의 펩타이드의 분자량 차이(shift)를 이용하여 평가하는 단계를 더 포함하는, 당화 단백질 및 최종당화산물의 동정을 위한 생물정보처리 분석방법
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제1항에 있어서, 단계 6) 이후에 선별된 당화 펩타이드 및 최종당화산물의 펩타이드의 정량을 분석하는 단계를 더 포함하는, 당화 단백질 및 최종당화산물의 동정을 위한 생물정보처리 분석방법
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제8항에 있어서, 상기 분석이 MS의 스펙트라에서 선택된 당화 펩타이드 및 최종당화산물의 펩타이드의 강도를 나타내는 동위원소 피크 중에 이론적으로 가장 강도가 강한 것부터 3개 피크의 강도를 합쳐서 나타내는, 당화 단백질 및 최종당화산물의 동정을 위한 생물정보처리 분석방법
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1 US20190285645 US 미국 FAMILY
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1 과학기술정보통신부 가천대학교 산학협력단 원천기술개발사업 질량분석을 이용한 허혈성질환에서 AGE-RAGE 기반 바이오마커 발굴
2 과학기술정보통신부 한국기초과학지원연구원 출연연구기관 주요사업 질량분석기술기반 모델 마우스 인간 당쇄 동질성 검증