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공통 유전자 추출에 의한 다중 암 분류 방법

  • 기술번호 : KST2020014477
  • 담당센터 : 부산기술혁신센터
  • 전화번호 : 051-606-6561
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은 공통 유전자 추출에 의한 다중 암 분류 장치 및 그 방법에 대한 것이다. 본 발명에 따르면, 환자의 암 조직으로부터 생산된 집단세포 유전자 발현 데이터와 단일세포 유전자 발현 데이터를 수집하고 분석가능 한 형태로 정규화하는 데이터 전처리 모듈, 상기 집단세포 유전자 발현 데이터를 기반으로 정상조직보다 각 암 조직에서 특이적으로 발현하는 유전자를 선택하고 13종의 암에서 가장 빈발하는 유전자들로 구성된 셋(set)을 생성하는 유전자 추출모듈, 상기 정규화된 유전자 발현데이터 중에서 정상과 13종의 암에 대해 동일한 수의 샘플을 무작위로 선택하고, 선택된 샘플에 포함된 유전자의 발현량을 나열하여 학습데이터를 생성하는 학습데이터 생성모듈, 상기 정규화된 유전자 발현데이터 중에서 단일세포 데이터를 추출하고, 추출된 단일세포 데이터의 유전자 발현 평균값을 계산하여 단일세포 데이터를 집단화 형태로 변환하는 단일세포 데이터 변환 모듈, 그리고 상기 유전자들로 구성된 셋과 학습데이터를 학습시켜 신경망 모델 기반의 다중 암 분류기를 구축하는 다중 암 분류기 구축 모듈을 포함한다.
Int. CL G16B 25/10 (2019.01.01) G06N 3/02 (2019.01.01)
CPC G16B 25/10(2013.01) G16B 25/10(2013.01)
출원번호/일자 1020190028719 (2019.03.13)
출원인 울산대학교 산학협력단, 재단법인 아산사회복지재단
등록번호/일자
공개번호/일자 10-2020-0109544 (2020.09.23) 문서열기
공고번호/일자
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보
법적상태 공개
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2019.03.13)
심사청구항수 9

출원인

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번호 이름 국적 주소
1 울산대학교 산학협력단 대한민국 울산광역시 남구
2 재단법인 아산사회복지재단 대한민국 서울특별시 송파구

발명자

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번호 이름 국적 주소
1 이창환 서울특별시 서초구
2 김봉현 서울특별시 관악구
3 유기진 경기도 성남시 분당구

대리인

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번호 이름 국적 주소
1 특허법인태백 대한민국 서울 금천구 가산디지털*로 *** 이노플렉스 *차 ***호

최종권리자

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번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2019.03.13 수리 (Accepted) 1-1-2019-0257551-54
2 보정요구서
Request for Amendment
2019.03.20 발송처리완료 (Completion of Transmission) 1-5-2019-0046993-10
3 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2019.04.22 수리 (Accepted) 1-1-2019-0411594-86
4 [지정기간연장]기간연장(단축, 경과구제)신청서
[Designated Period Extension] Application of Period Extension(Reduction, Progress relief)
2019.05.20 수리 (Accepted) 1-1-2019-0515060-23
5 [출원서 등 보정]보정서
[Amendment to Patent Application, etc.] Amendment
2019.06.20 수리 (Accepted) 1-1-2019-0635469-74
6 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2020.07.10 수리 (Accepted) 4-1-2020-5154267-54
7 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2020.07.31 수리 (Accepted) 4-1-2020-5172343-48
8 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2020.10.08 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2020-0692097-23
9 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2020.12.07 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2020-1322713-16
10 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견서·답변서·소명서
2020.12.07 수리 (Accepted) 1-1-2020-1322714-51
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
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공통 유전자 추출에 의한 다중 암 분류 장치에 있어서, 환자의 암 조직으로부터 생산된 집단세포와 단일세포에 포한된 유전자의 발현 데이터를 수집하고 분석가능 한 형태로 정규화하는 데이터 전처리 모듈, 상기 집단세포 유전자 발현 데이터를 기반으로 정상조직보다 각 암 조직에서 특이적으로 발현하는 유전자를 선택하고 13종의 암에서 가장 빈발하는 유전자들로 구성된 셋(set)을 생성하는 유전자 추출모듈, 상기 정규화된 유전자 발현데이터 중에서 정상과 13종의 암에 대해 동일한 수의 샘플을 무작위로 선택하고, 선택된 샘플에 포함된 유전자의 발현량을 나열하여 학습데이터를 생성하는 학습데이터 생성모듈,상기 정규화된 유전자 발현데이터 중에서 단일세포 데이터를 추출하고, 추출된 단일세포 데이터의 유전자 발현 평균값을 계산하여 단일세포 데이터를 집단화 형태로 변환하는 단일세포 데이터 변환 모듈, 그리고상기 유전자들로 구성된 셋과 학습데이터를 학습시켜 신경망 모델 기반의 다중 암 분류기를 구축하는 다중 암 분류기 구축 모듈을 포함하는 다중 암 분류 장치
2 2
제1항에 있어서, 상기 데이터 전처리 모듈은, 상기 집단세포 유전자 발현 데이터에 포함된 정상 조직 유전자와 암 조직 유전자들 사이의 발현량을 상대적으로 비교하여 데이터를 정규화하는 다중 암 분류 장치
3 3
제1항에 있어서, 상기 유전자 추출모듈은, 암 13종의 모든 유전자에 대해 정상조직과 발현 이질성을 가지는 유전자를 분산 분석 (analysis of variance)을 통해 추출하고, 분산 분석된 암 유전자 발현 데이터와 정상 데이터를 비교하여 암 조직에서 유의하게 발현하는 유전자를 선택한 다음, 상기 유의한 유전자의 빈발 횟수를 산출하여 13종 암의 공통 유전자들로 구성된 유전자 셋을 생성하는 다중 암 분류 장치
4 4
제3항에 있어서, 상기 유의한 유전자는, 정상 조직보다 암 조직에서 특이적으로 많거나 적게 발현하는 유전자를 의미 하는 다중 암 분류 장치
5 5
제1항에 있어서, 상기 단일세포 데이터 변환 모듈은
6 6
제1항에 있어서, 상기 다중 암 분류기 구축 모듈은, 신경망 모델의 노드와 레이어의 개수를 설정한 다음, 상기 유전자들로 구성된 셋과 학습데이터를 학습시켜 다중 암 분류기를 구축하고, 구축된 다중 암 분류기에 입력된 집단화 단일세포 데이터로부터 암을 분류하고 예측하는 다중암 분류 장치
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다중암 분류 장치를 이용하여 다중 암을 분류하는 방법에 있어서, 환자의 암 조직으로부터 생산된 집단세포 유전자 발현 데이터와 단일세포 유전자 발현 데이터를 수집하고 분석가능 한 형태로 정규화하는 단계, 상기 집단세포 유전자 발현 데이터를 기반으로 정상조직보다 각 암 조직에서 특이적으로 발현하는 유전자를 선택하고 13종의 암에서 가장 빈발하는 유전자들로 구성된 셋(set)을 생성하는 단계, 상기 정규화된 유전자 발현데이터 중에서 정상과 13종의 암에 대해 동일한 수의 샘플을 무작위로 선택하고, 선택된 샘플에 포함된 유전자의 발현 데이터로 구성된 학습데이터를 생성하는 단계, 그리고 상기 유전자들로 구성된 셋과 학습데이터를 학습시켜 신경망 모델 기반의 다중 암 분류기를 구축하는 단계를 포함하는 다중 암 분류 방법
8 8
제7항에 있어서, 상기 정규화된 유전자 발현데이터 중에서 단일세포 데이터를 추출하고, 추출된 단일세포 데이터의 유전자 발현 평균값을 계산하여 단일세포 데이터를 집단화 형태로 변환하고, 변환된 집단화 단일 세포 데이터를 다중 암 분류기에 입력하여 다중 암 분류기를 검증하는 단계를 더 포함하는 다중 암 분류 방법
9 9
제7항에 있어서, 상기 정규화하는 단계는, 상기 집단세포 유전자 발현 데이터에 포함된 정상 조직 유전자와 암 조직 유전자들 사이의 발현량을 상대적으로 비교하여 데이터를 정규화하는 다중 암 분류 방법
10 10
제7항에 있어서, 상기 유전자들로 구성된 셋(set)을 생성하는 단계는, 암 13종의 모든 유전자에 대해 정상조직과 발현 이질성을 가지는 유전자를 분산 분석 (analysis of variance)을 통해 추출하는 단계,상기 분산 분석된 암 유전자 발현 데이터와 정상 데이터를 비교하여 암 조직에서 유의하게 발현하는 유전자를 선택하는 단계, 그리고상기 유의한 유전자의 빈발 횟수를 산출하여 13종 암의 공통 유전자들로 구성된 유전자 셋을 생성하는 단계를 포함하는 다중 암 분류 방법
11 11
제10항에 있어서, 상기 유의한 유전자는, 정상 조직보다 암 조직에서 특이적으로 많거나 적게 발현하는 유전자를 의미 하는 다중 암 분류 방법
12 12
제7항에 있어서
13 13
제8항에 있어서, 상기 다중 암 분류기를 검증하는 단계는, 3개의 클래스마다 무작위로 동일한 개수의 단일 세포를 추출하는 단계, 상기 추출된 단일세포마다 포함된 유의한 유전자에 대한 발현량을 획득하는 단계, 상기 획득한 유의한 유전자에 대한 발현량의 평균값을 산출하는 단계, 상기 평균값 산출 과정을 반복하여 다중 암 분류기에 적용 가능한 집단화 단일 세포 데이터를 생성하는 단계, 그리고상기 생성된 집단화 단일세포 데이터를 다중 암 분류기에 입력하여 다중 암 분류기를 검증하는 단계를 포함하는 다중 암 분류 방법
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
순번, 연구부처, 주관기관, 연구사업, 연구과제의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 국가R&D 연구정보 정보 표입니다.
순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
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