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유전자의 CpG 부위를 포함하는, 간 섬유화 진단용 바이오마커 조성물로서,상기 유전자는 AGAP1, AGPAT9, AKR1C2, ANKRD36B, AOAH, APOA5, BAZ2B, C10orf46, CCL4L2, DKFZp686A1627, FAM189A1, FARS2, HCN3, HLA-DQA1, HLA-DQB1, HLA-DRB1, HLA-DRB5, HLA-DRB6, HOPX, IGSF21, IL17RA, IL8RBP, LMF1, LOC222699, LPHN3, LSM5, MGAT5B, MMEL1, MMP27, MYH11, NCAPH, NCF4, NDRG1, NEDD4L, NFASC, OPRD1, OR10K1, PCSK6, PPAPDC1A, PTPRN2, PVT1, RNASE4, SLC47A2, SLIT3, SMYD3, SNORD115-29, TANC1, TGFB3, TM2D2, VSX2, WDR8, XRCC2, ZFYVE28, ZNF492, 및 ZNF573로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상인 것을 특징으로 하는, 바이오마커 조성물
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유전자의 CpG 부위의 메틸화 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 간 섬유화 진단용 조성물로서,상기 유전자는 AGAP1, AGPAT9, AKR1C2, ANKRD36B, AOAH, APOA5, BAZ2B, C10orf46, CCL4L2, DKFZp686A1627, FAM189A1, FARS2, HCN3, HLA-DQA1, HLA-DQB1, HLA-DRB1, HLA-DRB5, HLA-DRB6, HOPX, IGSF21, IL17RA, IL8RBP, LMF1, LOC222699, LPHN3, LSM5, MGAT5B, MMEL1, MMP27, MYH11, NCAPH, NCF4, NDRG1, NEDD4L, NFASC, OPRD1, OR10K1, PCSK6, PPAPDC1A, PTPRN2, PVT1, RNASE4, SLC47A2, SLIT3, SMYD3, SNORD115-29, TANC1, TGFB3, TM2D2, VSX2, WDR8, XRCC2, ZFYVE28, ZNF492, 및 ZNF573로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상인 것을 특징으로 하는, 조성물
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제2항에 있어서,상기 유전자의 CpG 부위의 메틸화 수준을 측정하는 제제는, 바이설파이트(bisulfite) 또는 이의 염, 메틸화 민감성 제한효소, 상기 유전자의 CpG 부위의 메틸화된 서열에 특이적인 프라이머, 비메틸화된 서열에 특이적인 프라이머, 메틸화된 CpG 결합 도메인, 또는 메틸사이토신에 특이적으로 결합하는 항체를 포함하는 것을 특징으로 하는, 조성물
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제2항의 조성물을 포함하는, 간 섬유화 진단용 키트
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제4항에 있어서,상기 키트는 AGAP1, AGPAT9, AKR1C2, ANKRD36B, AOAH, APOA5, BAZ2B, C10orf46, CCL4L2, DKFZp686A1627, FAM189A1, FARS2, HCN3, HLA-DQA1, HLA-DQB1, HLA-DRB1, HLA-DRB5, HLA-DRB6, HOPX, IGSF21, IL17RA, IL8RBP, LMF1, LOC222699, LPHN3, LSM5, MGAT5B, MMEL1, MMP27, MYH11, NCAPH, NCF4, NDRG1, NEDD4L, NFASC, OPRD1, OR10K1, PCSK6, PPAPDC1A, PTPRN2, PVT1, RNASE4, SLC47A2, SLIT3, SMYD3, SNORD115-29, TANC1, TGFB3, TM2D2, VSX2, WDR8, XRCC2, ZFYVE28, ZNF492, 및 ZNF573로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자 각각에 특이적으로 결합하는 프라이머 세트, 및 핵산 증폭용 시약을 포함하는, 키트
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하기 단계를 포함하는 간 섬유화 진단을 위한 정보제공방법:(a) 간 섬유화가 의심되는 개체로부터 분리된 생물학적 시료에서 DNA를 분리하는 단계;(b) 상기 분리된 DNA에서 AGAP1, AGPAT9, AKR1C2, ANKRD36B, AOAH, APOA5, BAZ2B, C10orf46, CCL4L2, DKFZp686A1627, FAM189A1, FARS2, HCN3, HLA-DQA1, HLA-DQB1, HLA-DRB1, HLA-DRB5, HLA-DRB6, HOPX, IGSF21, IL17RA, IL8RBP, LMF1, LOC222699, LPHN3, LSM5, MGAT5B, MMEL1, MMP27, MYH11, NCAPH, NCF4, NDRG1, NEDD4L, NFASC, OPRD1, OR10K1, PCSK6, PPAPDC1A, PTPRN2, PVT1, RNASE4, SLC47A2, SLIT3, SMYD3, SNORD115-29, TANC1, TGFB3, TM2D2, VSX2, WDR8, XRCC2, ZFYVE28, ZNF492, 및 ZNF573로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 CpG 부위의 메틸화 수준을 측정하는 단계; 및(c) 상기 유전자의 CpG 부위의 메틸화 수준을 정상 대조군의 동일 유전체 상 영역의 CpG 부위의 메틸화 수준과 비교하는 단계
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제6항에 있어서,상기 (a) 단계는 FIB-4(fibrosis-4), NFS(NAFLD fibrosis score), BARD, 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 지표를 통해 간 섬유화가 의심되는 개체인지 여부를 결정하는 것을 특징으로 하는, 정보제공방법
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제7항에 있어서,상기 (a) 단계는 HSI(hepatic steatosis index) 또는 FLI(fatty liver index)의 지표를 통해 비알코올 지방간 질환이 의심되는 개체인지 여부를 결정한 후, 간 섬유화가 의심되는 개체인지 여부를 결정하는 것을 특징으로 하는, 정보제공방법
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제6항에 있어서,상기 생물학적 시료는 간 섬유화 의심 환자 유래의 조직, 객담, 세포, 혈액, 혈장, 혈청, 소변, 점액, 타액, 눈물, 척수액, 흉수, 유두 흡인물, 림프액, 기도액, 장액, 비뇨생식관액, 모유, 림프계 체액, 정액, 뇌척수액, 기관계내 체액, 복수, 낭성 종양 체액, 양수액 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상인 것인, 정보제공방법
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제6항에 있어서,상기 메틸화 수준의 측정은 중합효소연쇄반응(Polymerase Chain Reaction, PCR), 메틸화 특이 PCR(methylation specific PCR), 실시간 메틸화 특이 PCR(real time methylation specific PCR), 메틸화 DNA 특이적 결합 단백질을 이용한 PCR, 정량 PCR, DNA 칩, 파이로시퀀싱 및 바이설파이트시퀀싱으로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상에 의해 수행되는 것을 특징으로 하는, 정보제공방법
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제6항에 있어서,상기 (c) 단계 이후, AGAP1, AKR1C2, ANKRD36B, BAZ2B, C10orf46, CCL4L2, DKFZp686A1627, FARS2, HLA-DQA1, HLA-DQB1, HLA-DRB1, IGSF21, IL17RA, IL8RBP, LOC222699, LSM5, MGAT5B, MYH11, NCAPH, NCF4, NDRG1, NFASC, OR10K1, PCSK6, PPAPDC1A, SLC47A2, SLIT3, SMYD3, TANC1, TM2D2, VSX2, ZFYVE28, ZNF492, 및 ZNF573로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자에서 측정된 메틸화 수준이 정상 대조군에서 측정된 발현 수준에 비해 증가한 경우, 상기 개체는 간 섬유화에 걸리거나 간 섬유화에 걸릴 확률이 높은 것으로 결정하는 단계를 추가적으로 포함하는, 정보제공방법
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제6항에 있어서,상기 (c) 단계 이후, AGPAT9, AOAH, APOA5, FAM189A1, HCN3, HLA-DRB5, HLA-DRB6, HOPX, LMF1, LPHN3, MMEL1, MMP27, NEDD4L, OPRD1, PTPRN2, PVT1, RNASE4, SNORD115-29, TGFB3, WDR8, 및 XRCC2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자에서 측정된 메틸화 수준이 정상 대조군에서 측정된 발현 수준에 비해 감소한 경우, 상기 개체는 간 섬유화에 걸리거나 간 섬유화에 걸릴 확률이 높은 것으로 결정하는 단계를 추가적으로 포함하는, 정보제공방법
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하기 단계를 포함하는 간 섬유화 예방 또는 치료용 약제의 스크리닝 방법:(a) 간 섬유화가 의심되는 개체에 후보물질을 처리하고, AGAP1, AGPAT9, AKR1C2, ANKRD36B, AOAH, APOA5, BAZ2B, C10orf46, CCL4L2, DKFZp686A1627, FAM189A1, FARS2, HCN3, HLA-DQA1, HLA-DQB1, HLA-DRB1, HLA-DRB5, HLA-DRB6, HOPX, IGSF21, IL17RA, IL8RBP, LMF1, LOC222699, LPHN3, LSM5, MGAT5B, MMEL1, MMP27, MYH11, NCAPH, NCF4, NDRG1, NEDD4L, NFASC, OPRD1, OR10K1, PCSK6, PPAPDC1A, PTPRN2, PVT1, RNASE4, SLC47A2, SLIT3, SMYD3, SNORD115-29, TANC1, TGFB3, TM2D2, VSX2, WDR8, XRCC2, ZFYVE28, ZNF492, 및 ZNF573로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자의 CpG 부위의 메틸화 수준을 측정하는 단계; 및(b) 상기 유전자의 CpG 부위의 메틸화 수준의 변화를 확인하여, 상기 후보물질을 간 섬유화 예방 또는 치료용 약제로 선정하는 단계
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제13항에 있어서,상기 (b) 단계는 AGAP1, AKR1C2, ANKRD36B, BAZ2B, C10orf46, CCL4L2, DKFZp686A1627, FARS2, HLA-DQA1, HLA-DQB1, HLA-DRB1, IGSF21, IL17RA, IL8RBP, LOC222699, LSM5, MGAT5B, MYH11, NCAPH, NCF4, NDRG1, NFASC, OR10K1, PCSK6, PPAPDC1A, SLC47A2, SLIT3, SMYD3, TANC1, TM2D2, VSX2, ZFYVE28, ZNF492, 및 ZNF573로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자에서 측정된 메틸화 수준이 감소하는 경우, 상기 후보물질을 간 섬유화 예방 또는 치료용 약제로 선정하는 것을 특징으로 하는, 스크리닝 방법
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제13항에 있어서,상기 (b) 단계는 AGPAT9, AOAH, APOA5, FAM189A1, HCN3, HLA-DRB5, HLA-DRB6, HOPX, LMF1, LPHN3, MMEL1, MMP27, NEDD4L, OPRD1, PTPRN2, PVT1, RNASE4, SNORD115-29, TGFB3, WDR8, 및 XRCC2로 이루어진 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 유전자에서 측정된 메틸화 수준이 증가하는 경우, 상기 후보물질을 간 섬유화 예방 또는 치료용 약제로 선정하는 것을 특징으로 하는, 스크리닝 방법
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