| 1 |
1
CD4+ T세포 및 CD8+ T세포의 공유 클로노타입을 이용한 질병 분류 방법
|
| 2 |
2
제1항에 있어서,상기 질병은 암, SARS, MERS, 인플루엔자 감염 또는 COVID-19 인 것을 특징으로 하는, 질병 분류 방법
|
| 3 |
3
제1항에 있어서,상기 질병 분류 방법은,a) 질병을 갖는 개체들로부터 분리한 말초혈액 단핵세포(PBMC)를 대상으로 단일세포 RNA 시퀀싱(scRNA sequencing)을 수행하여 CD4+ T세포 및 CD8+ T세포의 세포 바코드를 추출하는 단계;b) 단일세포 T세포 수용체 시퀀싱(scTCR sequencing)을 수행하고, 단일세포 T세포 수용체의 바코드와 상기 단계 a) 에서의 CD4+ T세포 및 CD8+ T세포의 세포 바코드를 비교하여, 서로 일치하는 바코드를 검출한 후, T세포 수용체(TCR) 서열을 추출하는 단계;c) 추출된 CD4+ T세포 및 CD8+ T세포의 TCR 서열 중 제3 상보성 결정 부위(CDR3) 서열을 비교하고, CD4+ T세포 및 CD8+ T세포의 공유 클로노타입(clonotype)을 도출하는 단계; 및d) 도출된 공유 클로노타입을 질병에 따라 분류하여 이들 간의 빈도 분포를 측정하는 단계;를 포함하는, 질병 분류 방법
|
| 4 |
4
제3항에 있어서,상기 단계 d) 이후, 측정한 빈도 분포를 정상 대조군의 것과 비교하는 단계를 추가적으로 포함하는, 질병 분류 방법
|
| 5 |
5
제3항에 있어서,상기 단계 d) 에서의 빈도를 측정하는 단계는 세포 내 공유 클로노타입의 빈도 분포를 측정하는 것을 특징으로 하는, 질병 분류 방법
|
| 6 |
6
제3항에 있어서,상기 단계 c) 이후, 단계 c) 에서 도출된 공유 클로노타입이 만들어내는 아미노산의 분포를 분석하여 공유 클로노타입의 특성을 파악하는 과정을 시행하는 단계를 포함하는, 질병 분류 방법
|
| 7 |
7
CD4+ T세포 및 CD8+ T세포의 공유 클로노타입을 이용한 질병 의심 개체의 질병 정보 제공 방법
|
| 8 |
8
제7항에 있어서,상기 질병은 암, SARS, MERS, 인플루엔자 감염 또는 COVID-19 인 것을 특징으로 하는, 질병 의심 개체의 질병 정보 제공 방법
|
| 9 |
9
제7항에 있어서,상기 질병 의심 개체의 질병 정보 제공 방법은,A) 질병 의심 개체로부터 분리한 말초혈액 단핵세포(PBMC)를 대상으로 단일세포 RNA 시퀀싱(scRNA sequencing)을 수행하여 CD4+ T세포 및 CD8+ T세포의 세포 바코드를 추출하는 단계;B) 단일세포 T세포 수용체 시퀀싱(scTCR sequencing)을 수행하고, 단일세포 T세포 수용체의 바코드와 상기 단계 A) 에서의 CD4+ T세포 및 CD8+ T세포의 세포 바코드를 비교하여, 서로 일치하는 바코드를 검출한 후, T세포 수용체(TCR) 서열을 추출하는 단계;C) 추출된 CD4+ T세포 및 CD8+ T세포의 TCR 서열 중 제3 상보성 결정 부위(CDR3) 서열을 비교하고, CD4+ T세포 및 CD8+ T세포의 공유 클로노타입(clonotype)을 도출하는 단계;D) 질병 의심 개체의 상기 도출된 공유 클로노타입의 빈도를 측정하는 단계; 및E) 상기 측정한 빈도를 정상 대조군의 것과 비교하는 단계;를 포함하는, 질병 의심 개체의 질병 정보 제공 방법
|
