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일루미나 시퀀싱을 이용한 바이러스 탐색 및 바이롬 분석 방법으로서:시퀀싱 데이터를 획득하는 단계;상기 획득된 시퀀싱 데이터에 대해 노이즈 필터링을 수행하는 단계;상기 노이즈 필터링된 시퀀싱 데이터에 대해 분석을 수행하는 단계; 및상기 분석된 데이터에 대해 서열 유사성 검색 및 인수공통감염증 분석을 수행하는 단계;를 포함하는, 일루미나 시퀀싱을 이용한 바이러스 탐색 및 바이롬 분석 방법
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제1 항에 있어서,상기 노이즈 필터링을 수행하는 단계는:상기 획득된 시퀀싱 데이터에서, 미리 결정된 리드 품질 및 리드 길이의 서열, 어댑터 서열,및 숙주 유전체 유래 서열을 제거하는 단계를 포함하는, 일루미나 시퀀싱을 이용한 바이러스 탐색 및 바이롬 분석 방법
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제2 항에 있어서,상기 미리 결정된 리드 품질 및 리드 길이의 서열은 8 이하의 품질 점수를 갖는 서열 및 중복 염기 서열을 포함하는, 일루미나 시퀀싱을 이용한 바이러스 탐색 및 바이롬 분석 방법
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제2 항에 있어서,상기 어댑터 서열은,미리 결정된 품질 이하의 리딩(leading) 서열 및 트레일링(trailing)서열을 포함하는, 일루미나 시퀀싱을 이용한 바이러스 탐색 및 바이롬 분석 방법
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제2 항에 있어서,상기 숙주 유전체 유래 서열을 제거하는 단계는,리드를 숙주 유전체 서열에 매핑하는 단계를 더 포함하는, 일루미나 시퀀싱을 이용한 바이러스 탐색 및 바이롬 분석 방법
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제1 항에 있어서,상기 노이즈 필터링된 시퀀싱 데이터에 대해 분석을 수행하는 단계는:참조 유전체 매핑(reference genome mapping) 기반 분석, 리드 분류군 분류(read taxonomy classification) 기반 분석, 및 드노보 어셈블리 (De novo assembly)기반 분석을 수행하는 단계를 포함하는, 일루미나 시퀀싱을 이용한 바이러스 탐색 및 바이롬 분석 방법
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제6 항에 있어서,참조 유전체 매핑 기반 분석 및 리드 분류군 분류 기반 분석은, 바이러스 서열이 미리 입력된 경우 수행되는, 일루미나 시퀀싱을 이용한 바이러스 탐색 및 바이롬 분석 방법
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제6 항에 있어서,드노보 어셈블리 기반 분석을 수행하는 단계는, 파편화된 리드를 재배열하여 복원된 콘티그 (contig) 를 생성하는 단계를 포함하는, 일루미나 시퀀싱을 이용한 바이러스 탐색 및 바이롬 분석 방법
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제8 항에 있어서,상기 서열 유사성 검색 및 상기 인수공통감염증 분석은, 상기 콘티그에 대해 수행되는, 일루미나 시퀀싱을 이용한 바이러스 탐색 및 바이롬 분석 방법
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제8 항에 있어서,상기 콘티그가 인수공통감염을 유발하는 바이러스 서열인지 여부를 결정하는 단계를 더 포함하는, 일루미나 시퀀싱을 이용한 바이러스 탐색 및 바이롬 분석 방법
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일루미나 시퀀싱을 이용한 바이러스 탐색 및 바이롬 분석 장치로서:인스트럭션을 저장하는 메모리;및상기 인스트럭션을 실행하여:시퀀싱 데이터를 획득하고,상기 획득된 시퀀싱 데이터에 대해 노이즈 필터링을 수행하고,상기 노이즈 필터링된 시퀀싱 데이터에 대해 분석을 수행하고,상기 분석된 데이터에 대해 서열 유사성 검색 및 인수공통감염증 분석을 수행하도록 구성된 프로세서를 포함하는, 일루미나 시퀀싱을 이용한 바이러스 탐색 및 바이롬 분석 장치
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