| 1 |
1
실험 설계, 표준화, 추정과 검정, 군집 분석 및 분류로 구성된 상위 메뉴의 아이템 중 상기 실험 설계가 선택되면, 염료 교환, 기준설계 또는 루프설계 중 어느 하나의 실험 디자인을 선택하는 인터페이스와 상기 선택된 실험 디자인에서 사용될 어레이 개수, 어레이 간 반복 여부, 어레이 내 반복 여부 및 처리 리스트를 포함하는 설계 파라미터를 입력하는 인터페이스를 디스플레이하는 단계; 및상기 입력된 설계 파라미터를 이용하여 상기 선택된 실험 디자인에 대한 아노바 설계 매트릭스를 생성하는 단계를 포함하는 마이크로어레이 통합 분석 방법
|
| 2 |
2
제 1 항에 있어서, 상기 아이템 중 상기 표준화가 선택되면,입력된 슬라이드 정보를 이용한 단일 슬라이드 표준화, 단일 배치 표준화 및 다중 슬라이드 표준화를 순차적으로 수행하여 표준화 결과를 생성하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 통합 분석 방법
|
| 3 |
3
제 2 항에 있어서,상기 단일 슬라이드 표준화 수행시에 평균, 강도, 프린트 팁 또는 스케일 표준화 중 어느 하나의 표준화 방법을 선택하는 인터페이스를 디스플레이하고, 상기 단일 슬라이드를 상기 선택된 방법으로 표준화시키는 단계; 및상기 염료 교환 실험에 대해 동일한 조건에서 Cy3와 Cy5를 반대로 하여 실험한 결과들을 비교하여 표준화를 수행하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 통합 분석 방법
|
| 4 |
4
제 3 항에 있어서, 상기 아이템 중 상기 추정과 검정이 선택되면,상기 표준화 결과에 대해, 뉴턴 분석 또는 B-통계량 분석 중 어느 하나의 분석을 수행하여 마이크로어레이 실험에서 유의한 유전자를 추정하는 단계;상기 표준화 결과에 대해, 에스에이엠(SAM) 분석 또는 이비에엠(EBAM) 중 어느 하나의 분석을 수행하여 반복된 마이크로어레이 실험에서 유의한 유전자를 탐색하고 상기 탐색된 유전자에 따른 잘못 발견할 확률을 연산하는 단계; 및상기 표준화 결과에 대해, 에이디피(ADP) 분석을 수행하여 마이크로어레이 실험에서 유의한 유전자를 추정하며 반복된 마이크로어레이 실험에서 유의한 유전자의 조정유의확률을 연산하여 상기 조정유의확률을 디스플레이하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 통합 분석 방법
|
| 5 |
5
제 3 항에 있어서, 상기 아이템 중 상기 군집 분석이 선택되면,유전자 또는 샘플에 대한 계층적 군집분석, k-평균 군집분석, 자기조직도 분석, 주성분 분석 또는 유전자에 대한 진쉐이빙 분석 중 어느 하나의 분석 방법을 선택하는 인터페이스를 제공하는 단계;상기 계층적 군집분석이 선택된 경우, 상기 군집 분석 결과로서 덴드로 그램을 디스플레이하는 단계;상기 k-평균 군집분석 또는 자기조직도 분석 중 어느 하나의 분석이 선택된 경우, 상기 군집 분석 결과로서 각 클러스터마다 프로파일의 평균 그래프를 디스플레이하는 단계;상기 주성분 분석이 선택된 경우, 상기 군집 분석 결과로서 제1 주성분과 제2 주성분을 축으로 하여 각 유전자들을 플롯한 그래프를 디스플레이하는 단계; 및상기 진쉐이빙 분석이 선택된 경우, 상기 군집 분석 결과로서 각 클러스터에서의 실험과 유전자 발현정도를 나타내는 그래프, 실제 주어진 데이터와 순열 데이터를 나타내는 그래프 및 클러스터의 크기에 따른 갭 통계량을 나타내는 그래프를 디스플레이하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 통합 분석 방법
|
| 6 |
6
제 3 항에 있어서, 상기 아이템 중 상기 분류가 선택되면,상기 표준화 결과와 처리군 간에는 변동값이 크며 처리군 내에서는 변동값이 작은 후보 유전자를 선정하고, 상기 후보 유전자에 대해 분류를 수행하여 상기 설계 파라미터에 의한 관심 대상 그룹을 예측하며 오분류율을 출력하고,상기 분류는 선형판별분석, 이차판별분석, 선형판별분석의 크로스확인 또는 이차판별분석의 크로스 확인 중 어느 하나인 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 통합 분석 방법
|
| 7 |
7
제 6 항에 있어서,상기 설계 파라미터에 의한 관심 대상 그룹을 예측하며 오분류율을 출력하는 단계는상기 표준화 결과에 대해, 의사결정규칙을 도표화하여 예측의 대상이 되는 집단을 복수의 소집단으로 분류하고 의사결정나무를 생성하는 단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 마이크로어레이 통합 분석 방법
|
