| 1 |
1
1) 질병 샘플 및 정상 샘플의 전체 유전체 시퀀싱(whole genome sequencing) 정보를 확보하는 단계;2) 상기 전체 유전체 시퀀스 정보를 참조 유전체 서열과 비교하여 상기 질병 샘플 및 정상 샘플의 염기서열 변이 정보를 획득하는 단계;3) 상기 질병 샘플 및 정상 샘플을 바이오마커 추출 샘플 그룹과 바이오마커 테스트 샘플 그룹으로 분리하는 단계;4) 바이오마커 추출 샘플 그룹에서 하기 4-1) 내지 4-3) 단계에 따라 질병 진단 후보 바이오마커를 획득하는 단계;4-1) 바이오마커 추출 샘플 그룹을 M개의 그룹으로 나누고 M개의 그룹 중임의로 하나의 그룹을 선택하여 제1 바이오마커 추출 샘플 그룹으로 선정하고 나머지 M-1개의 그룹을 제2 내지 제M 바이오마커 검증 샘플 그룹으로 구분하는 단계;4-2) 상기 2)에서 얻은 염기서열 변이들의 유무를 기준으로 제1 바이오마커 추출 샘플 그룹에 포함된 질병 샘플 및 정상 샘플에서 대하여 질병 샘플은 질병 샘플로 정상 샘플은 정상 샘플로 구분할 수 있는 정확도를 도출하고, 특정 수준의 정확도를 만족하는 염기서열 변이들을 도출하는 단계;4-3) 상기 4-2)에서 도출한 특정 수준의 정확도를 만족하는 염기서열 변이들 전체에 대하여 각각의 염기서열 변이 유무를 기준으로 제2 내지 제M 바이오마커 검증 샘플 그룹 각각에 포함된 질병 샘플 및 정상 샘플에서 정상 샘플은 정상 샘플로 질병 샘플은 질병 샘플로 구분할 수 있는 정확도를 도출하고, 특정 수준의 정확도를 만족하는 염기서열 변이들을 바이오마커 후보 염기서열 변이 그룹으로 선정하는 단계;4-4) 상기 4-1) 내지 4-3)의 단계를 반복하고 각 반복 회차마다 선정된 바이오마커 후보 염기서열 변이 그룹에 포함된 염기서열 변이들 전체를 질병 진단 후보 바이오마커로 선정하는 단계; 및5) 상기 4)에서 선정한 질병 진단 후보 바이오마커에 포함된 염기서열 변이 유무를 기준으로 상기 3)의 바이오마커 테스트 샘플 그룹에 포함된 질병 샘플 및 정상 샘플에서 질병 샘플은 질병 샘플로 정상 샘플은 정상 샘플로 구분할 수 있는 정확도를 검증하고, 특정 수준의 정확도를 만족하는 염기서열 변이들을 최종 질병 진단 바이오마커로 선정하는 단계;를 포함하는 바이오마커 추출 방법
|
| 2 |
2
제1항에 있어서,상기 5) 단계는 질병 진단 후보 바이오마커에 포함됨 염기서열 변이들 중 일부를 선택하고, 선택한 염기서열 변이들의 변이 유무를 기준으로 최종 질병 진단 바이오마커를 선장하는 바이오마커 도출 방법
|
| 3 |
3
제2항에 있어서,상기 선택한 염기서열 변이들은 질병 진단 후보 바이오마커에 포함된 염기서열 변이들 중 질병 샘플은 질병 샘플로 정상 샘플은 정상 샘플로 구분하는 정확도가 100%를 만족하는 염기서열 변이들인 바이오마커 도출 방법
|
| 4 |
4
제1항에 있어서,상기 2) 단계에서 획득한 염기서열 변이 정보를 라이브러리화하는 과정을 더 포함하는 바이오마커 도출 방법
|
| 5 |
5
제1항에 있어서,상기 4) 단계에서 선정한 질병 질단 후보 바이오마커에 포함된 염기서열 변이들에 대한 정보를 라이브러리화하는 과정을 더 포함하는 바이오마커 도출 방법
|
| 6 |
6
제1항에 있어서,상기 염기서열 변이는 단일염기다형성(Single Nucleotide Polymorphism), 유전자 복제 수 변이(Copy Number Variation), 염기 삽입(Insertion), 염기 결실(Deletion), 염기 중복(Repetition) 및 염기 역위(Inversion)로 이루어지는 군에서 선택되는 하나 이상에 의해 발생하는 변이인 바이오마커 추출 방법
|
| 7 |
7
제1항에 있어서,상기 5) 단계에서 질병 진단 후보 바이오마커에 포함된 염기서열 변이를 이용한 바이오마커 테스트 샘플 그룹에 대한 정확도 검증은 블라인드 스크리닝(Blind screening)을 통해 수행되는 바이오마커 추출 방법
|
| 8 |
8
제7항에 있어서,상기 정확도 검증의 기준이 되는 측정값은 식별율, 민감도 및 특이도에서 선택되는 하나 이상인 바이오마커 추출 방법
|
| 9 |
9
컴퓨터를 포함하는 연산처리수단에 의해 실행되는 프로그램에 의해 제1항의 바이오마커 추출 과정이 수행되는 바이오마커 추출 방법
|
