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암 신호전달 네트워크(1)에서 섭동되는 표적노드(12)와 함께 조합되어 섭동되는 조합표적노드를 결정하는 방법으로서,상기 표적노드(12)를 섭동하지 않았을 때의 상기 암 신호전달 네트워크(1)의 후보노드(11)의 활성도인 제1활성도와, 상기 표적노드를 섭동했을 때의 상기 후보노드의 활성도인 제2활성도 간의 차이값을 기초로 상기 후보노드의 활성변화(AC)를 산출하는 단계;상기 활성변화에 비례하는 스코어를 산출하는 단계; 및상기 스코어를 기초로 상기 후보노드를 상기 표적노드와 함께 섭동하는 조합표적노드로 결정할지 여부를 결정하는 단계;를 포함하는,표적노드에 대한 조합표적노드의 결정 방법
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제1항에 있어서,상기 후보노드(11)는, 상기 후보노드(11)를 포함하는 네거티브 피드백 루프(L1)에 포함되는 노드이며,상기 후보노드(11)의 활성도가 증가하면 상기 표적노드(12)의 활성도가 증가하는 것을 특징으로 하는,표적노드에 대한 조합표적노드의 결정 방법
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제1항에 있어서,상기 표적노드에 대한 섭동에 의하여, 섭동확률(x%)로는 상기 표적노드의 활성도가 억제되고, 섭동실패확률((100-x)%)로는 상기 표적노드의 활성도가 상기 암 신호전달 네트워크의 상태를 결정하는 진리표에 따라 결정되는 (단, x는 0 내지 100의 실수),표적노드에 대한 조합표적노드의 결정 방법
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제3항에 있어서,상기 활성변화를 산출하는 단계는,상기 섭동확률로서 복수 개의 섭동확률들을 설정하는 단계; 및상기 복수 개의 섭동확률 각각에 대하여 산출한 상기 차이값들을 모두 더한 값을 기초로 상기 활성변화를 결정하는 단계를 포함하는,표적노드에 대한 조합표적노드의 결정 방법
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제3항에 있어서,상기 활성변화를 산출하는 단계는,상기 섭동확률을 100%로 설정하는 단계; 및상기 100%의 섭동확률에 대하여 산출한 상기 차이값을 기초로 상기 활성변화를 결정하는 단계를 포함하는,표적노드에 대한 조합표적노드의 결정 방법
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제1항에 있어서,상기 암 신호전달 네트워크는 확률적 부울리언 네트워크이며, x%의 확률로는 상기 표적노드의 활성도가 억제되면 상기 표적노드는 0의 값을 갖고,(100-x)%의 확률로는 상기 표적노드의 활성도가 상기 암 신호전달 네트워크의 상태를 결정하는 진리표에 따라 결정되면, 상기 표적노드는 0 또는 1의 값을 갖는,표적노드에 대한 조합표적노드의 결정 방법
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제1항에 있어서,상기 후보노드의 활성도는 상기 후보노드가 나타내는 단백질의 인산화형의 농도에 관한 값을 기초로 산출되는, 표적노드에 대한 조합표적노드의 결정 방법
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제1항에 있어서,상기 후보노드의 활성도는 상기 후보노드가 나타내는 신호전달분자의 양에 관한 값을 기초로 산출되는, 표적노드에 대한 조합표적노드의 결정 방법
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제1항에 있어서, 상기 암 신호전달 네트워크를 노미널 네트워크과 비교하여, 변이가 발생한 노드들의 인커밍 링크들을 제거하는 단계; 및상기 인커밍 링크들이 제거된 상태의 상기 암 신호전달 네트워크에서, 상기 후보노드와 상기 표적노드가 포함된 한 개 이상의 네거티브 피드백 루프들 중에서, 최단 피드백 길이를 갖는 제1 네거티브 피드백 루프의 피드백 길이(LN)를 산출하는 단계;를 더 포함하며,상기 스코어는 상기 제1 네거티브 피드백 루프의 피드백 길이에 반비례하는 것을 특징으로 하는,표적노드에 대한 조합표적노드의 결정 방법
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제1항에 있어서, 상기 후보노드로부터 상기 암 신호전달 네트워크의 세포사멸노드까지의 제1바이패스 신호전달 효과(BA)를 산출하는 단계를 더 포함하며,상기 제1바이패스 신호전달 효과가 증가할수록 상기 스코어가 증가하는 것을 특징으로 하는,표적노드에 대한 조합표적노드의 결정 방법
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제10항에 있어서, 상기 제1바이패스 신호전달 효과를 산출하는 단계는,상기 후보노드로부터 상기 암 신호전달 네트워크의 세포사멸노드까지의 신호전달경로들 중, 상기 표적노드를 포함하는 네거티브 피드백 루프들을 제외한 신호전달경로인 제1바이패스 신호전달경로들을 선정하는 단계; 및상기 제1바이패스 신호전달경로들을 따라, 상기 후보노드의 활성도가 억제됨에 따라 상기 세포사멸노드의 활성도가 증가하는 정도가 높아질수록 상기 제1바이패스 신호전달 효과를 증가시키도록 연산하는 단계;를 포함하는,표적노드에 대한 조합표적노드의 결정 방법
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제1항에 있어서, 상기 후보노드로부터 상기 암 신호전달 네트워크의 세포증식노드까지의 제2바이패스 신호전달 효과(BP)를 산출하는 단계를 더 포함하며,상기 제2바이패스 신호전달 효과가 증가할수록 상기 스코어가 증가하는 것을 특징으로 하는,표적노드에 대한 조합표적노드의 결정 방법
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제12항에 있어서, 상기 제2바이패스 신호전달 효과를 산출하는 단계는,상기 후보노드로부터 상기 암 신호전달 네트워크의 세포증식노드까지의 신호전달경로들 중, 상기 표적노드를 포함하는 네거티브 피드백 루프들을 제외한 제2바이패스 신호전달경로들을 선정하는 단계; 및상기 제2바이패스 신호전달경로들을 따라, 상기 후보노드의 활성도가 억제됨에 따라 상기 세포증식노드의 활성도가 감소하는 정도가 높아질수록 상기 제2바이패스 신호전달 효과를 증가시키도록 연산하는 단계;를 포함하는,표적노드에 대한 조합표적노드의 결정 방법
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