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적어도 하나의 프로세서에 의해 동작하는 시스템이 멀티마커 패널을 선정하는 방법으로서,질병에 연관된 기전 기반으로 질병 연관 세포기능들과 질병 마커들을 연결하는 단계,상기 질병 마커들 중 적어도 하나의 질병 마커에 유사한 유전자들을 질병 마커 후보들로 선정하는 단계,마이크로어레이 데이터를 이용하여, 상기 질병 마커들과 상기 질병 마커 후보들 각각의 발현 정도를 평가하여, 전사체 마커들을 선정하는 단계, 그리고마커 간 발현 상관 계수를 통해 획득한 발현 패턴 유사성을 기초로, 상기 전사체 마커들 중에서 발현 패턴이 유사하면서 기능 및 기전을 공유하는 중복 마커들을 제외하여 멀티마커 패널을 선정하는 단계를 포함하며,상기 질병 마커 후보들로 선정하는 단계에서 상기 질병 마커에 유사한 유전자들은 상기 질병 마커들과의 관계 유사성, 거리 및 연결 강도, 그리고 발현상관관계 중 적어도 하나를 이용하여 결정된 각 후보 유전자의 점수를 기초로 선정되는 것인, 멀티마커 패널 선정 방법
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제1항에서,상기 질병 연관 세포기능들과 질병 마커들을 연결하는 단계는질병 연관 기전 경로 내에 포함되는 질병 연관 세포기능을 탐색해서, 해당 기전 경로 내에 포함된 질병 마커를 질병 연관 세포기능에 연결하는 단계, 질병 연관 세포기능에 연결되지 않은 미연결 마커를 추출하는 단계, 그리고상기 미연결 마커에 대한 기전 경로를 탐색하고, 탐색된 기전 경로에 포함된 세포기능들에 대하여, 지정된 유의성 판별 기법을 기초로 상기 미연결 마커들이 유의하게 포함되는지 평가하여, 상기 미연결 마커를 탐색된 세포기능에 연결하는 단계를 포함하는 멀티마커 패널 선정 방법
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제1항에서,상기 질병 마커 후보들로 선정하는 단계는순서 통계(order statistics) 기반으로, 스케일이 다른 관계 유사성 점수, 거리 및 연결 강도 점수, 그리고 발현 상관관계 점수를 순위 기반으로 통합하여 각 후보 유전자의 점수를 계산하는 멀티마커 패널 선정 방법
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제1항에서,상기 전사체 마커들을 선정하는 단계는상기 마이크로어레이 데이터를 이용하여, 상기 질병 마커들과 상기 질병 마커 후보들 각각의 발현 배율 및 발현 유의 확률을 계산하고, 발현 배율이 기준 범위 이내이고 발현 유의 확률(p값)이 기준값 이하인 마커들을 상기 전사체 마커들로 선정하는 멀티마커 패널 선정 방법
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제5항에서,상기 전사체 마커들을 선정하는 단계는데이터셋별로 동일하게 정규화된 마이크로어레이 데이터를 이용하여, 상기 질병 마커들과 상기 질병 마커 후보들 각각의 판별력을 더 계산하고, 발현 배율이 기준 범위 이내이고 발현 유의 확률(p값)이 기준값 이하이며, 판별력이 기준값 이상인 마커들을 상기 전사체 마커들로 선정하는 멀티마커 패널 선정 방법
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제5항에서,상기 전사체 마커들을 선정하는 단계는상기 전사체 마커들 중에서, 검증하고자 하는 조직 혹은 세포주에서의 검증 가능성을 평가하여 질병 기능 연계된 오믹스 마커를 선정하는 멀티마커 패널 선정 방법
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제1항에서,상기 멀티마커 패널을 선정하는 단계는상기 전사체 마커들 중에서 발현 패턴이 유사하면서 기능 및 경로를 공유하는 마커들을 클러스터로 분류하는 단계, 그리고각 클러스터 내 마커를 임의로 제거하고 남은 마커를 기반으로 판별력을 예측하면서, 최적의 판별력을 보이는 마커 조합을 멀티마커 패널로 선정하는 단계를 포함하는 멀티마커 패널 선정 방법
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적어도 하나의 프로세서에 의해 동작하는 시스템이 멀티마커 패널을 선정하는 방법으로서,질병 연관 기전 경로 내에 포함되는 질병 연관 세포기능과 해당 기전 경로 내에 포함된 질병 마커를 연결하는 단계, 질병 마커 데이터베이스에 저장된 질병 마커들 중에서, 질병 연관 세포기능에 연결되지 않은 미연결 질병 마커가 있는 경우, 상기 미연결 질병 마커에 대한 기전 경로를 탐색하고, 탐색된 기전 경로에 포함된 질병 연관 세포기능들에 대하여, 지정된 유의성 판별 기법을 기초로 상기 미연결 질병 마커가 유의하게 포함되는지 평가하여, 상기 미연결 질병 마커를 탐색된 질병 연관 세포기능에 연결하는 단계,질병 연관 세포기능에 연결된 질병 마커들, 그리고 질병 연관 세포기능에 연결된 질병 마커들 중 적어도 하나의 질병 마커에 유사한 유전자들을 질병 마커 후보들로 선정하는 단계, 그리고마이크로어레이 데이터를 이용하여, 상기 질병 마커 후보들 각각을 검증하여 상기 질병 마커 후보들 중 적어도 일부 마커들로 조합된 멀티마커 패널을 선정하는 단계를 포함하며,상기 질병 마커 후보들로 선정하는 단계에서 상기 질병 마커에 유사한 유전자들은 상기 질병 마커들과의 관계 유사성, 거리 및 연결 강도, 그리고 발현상관관계 중 적어도 하나를 이용하여 결정된 각 후보 유전자의 점수를 기초로 선정되는 것인, 멀티마커 패널 선정 방법
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제9항에서,상기 멀티마커 패널을 선정하는 단계는상기 질병 마커 후보들 중에서, 발현 배율이 기준 범위 이내이고 발현 유의 확률(p값)이 기준값 이하이며, 판별력이 기준값 이상인 전사체 마커들을 상기 멀티마커 패널로 선정하는, 멀티마커 패널 선정 방법
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제10항에서,상기 멀티마커 패널을 선정하는 단계는마커 간 발현 상관 계수를 통해 획득한 발현 패턴 유사성을 기초로, 상기 전사체 마커들 중에서 발현 패턴이 유사하면서 기능 및 경로를 공유하는 중복 마커를 제외하여 상기 멀티마커 패널을 선정하는 멀티마커 패널 선정 방법
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제9항에서,상기 질병 마커 후보들로 선정하는 단계는순서 통계(order statistics) 기반으로, 스케일이 다른 관계 유사성 점수, 거리 및 연결 강도 점수, 그리고 발현 상관관계 점수를 순위 기반으로 통합하여 각 후보 유전자의 점수를 계산하는 멀티마커 패널 선정 방법
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적어도 하나의 프로세서에 의해 동작하는 시스템이 멀티마커 패널을 선정하는 방법으로서,질병 연관 세포기능에 연결된 질병 마커들을 입력받는 단계,상기 질병 마커들 중 적어도 하나의 질병 마커에 유사한 유전자들을 추출하는 단계,상기 유사한 유전자들 각각에 해당 질병 마커의 질병 연관 세포기능을 연결하는 단계,상기 질병 마커들과 상기 질병 마커들 중 적어도 하나에 유사한 유전자들을 질병 마커 후보들로 선정하는 단계, 그리고마이크로어레이 데이터를 이용하여, 상기 질병 마커 후보들 각각을 검증하여 멀티마커 패널을 선정하는 단계를 포함하며,상기 질병 마커 후보들로 선정하는 단계에서 상기 질병 마커들 중 적어도 하나에 유사한 유전자들은상기 질병 마커들과의 관계 유사성, 거리 및 연결 강도, 그리고 발현상관관계 중 적어도 하나를 이용하여 결정된 각 후보 유전자의 점수를 기초로 선정되는 것인, 멀티마커 패널 선정 방법
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제14항에서,상기 멀티마커 패널을 선정하는 단계는상기 질병 마커 후보들 중에서, 발현 배율이 기준 범위 이내이고 발현 유의 확률(p값)이 기준값 이하이며, 판별력이 기준값 이상인 전사체 마커들을 추출하는 단계, 그리고마커 간 발현 상관 계수를 통해 획득한 발현 패턴 유사성을 기초로, 상기 전사체 마커들 중에서 발현 패턴이 유사하면서 기능 및 경로를 공유하는 중복 마커를 제외하여 상기 멀티마커 패널을 선정하는 단계를 포함하는 멀티마커 패널 선정 방법
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적어도 하나의 프로세서에 의해 동작하는 멀티마커 패널 선정 시스템으로서,질병에 연관된 기전 기반으로 질병 연관 세포기능에 연결된 질병 마커들을 추출하고, 상기 질병 마커들 중 적어도 하나의 질병 마커에 유사한 유전자들을 확장된 질병 마커들로 추출하는 마커 후보 추출 장치, 그리고마이크로어레이 데이터를 이용하여, 상기 마커 후보 추출 장치에서 추출된 상기 질병 마커들 각각을 검증하여 상기 질병 마커들 중 적어도 일부 마커들로 조합된 멀티마커 패널을 선정하는 마커 선정 장치를 포함하며,상기 마커 후보 추출 장치는 상기 질병 마커에 유사한 유전자들을 상기 질병 마커들과의 관계 유사성, 거리 및 연결 강도, 그리고 발현상관관계 중 적어도 하나를 이용하여 결정된 각 후보 유전자의 점수를 기초로 선정하는 것인, 멀티마커 패널 선정 시스템
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제17항에서,상기 마커 선정 장치는입력된 상기 질병 마커들 중에서, 발현 배율이 기준 범위 이내이고 발현 유의 확률(p값)이 기준값 이하이며, 판별력이 기준값 이상인 전사체 마커들을 추출하고,마커 간 발현 상관 계수를 통해 획득한 발현 패턴 유사성을 기초로 상기 전사체 마커들 중에서 발현 패턴이 유사하면서 기능 및 경로를 공유하는 마커들을 클러스터로 분류한 후,각 클러스터 내 마커를 임의로 제거하고 남은 마커를 기반으로 판별력을 예측하면서, 최적의 판별력을 보이는 마커 조합을 멀티마커 패널로 선정하는 멀티마커 패널 선정 시스템
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