맞춤기술찾기

이전대상기술

확률 그래프 모델을 이용한 아미노산 또는 핵산 변이의 기능적 영향 및 유해성 예측 장치 및 이의 예측 방법(PREDICTION DEVICE AND METHOD FOR PREDICTING FUNCTIONAL EFFECT AND DELETERIOUSNESS OF AMINO ACID OR NUCLEIC ACID MUTATION BY USING PROBABILISTIC GRAPHICAL MODEL)

  • 기술번호 : KST2018002344
  • 담당센터 : 대전기술혁신센터
  • 전화번호 : 042-610-2279
요약, Int. CL, CPC, 출원번호/일자, 출원인, 등록번호/일자, 공개번호/일자, 공고번호/일자, 국제출원번호/일자, 국제공개번호/일자, 우선권정보, 법적상태, 심사진행상태, 심판사항, 구분, 원출원번호/일자, 관련 출원번호, 기술이전 희망, 심사청구여부/일자, 심사청구항수의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 서지정보 표입니다.
요약 본 발명은, 확률 그래프 모델을 이용한 아미노산 또는 핵산 변이의 기능적 영향 및 유해성 예측 장치에 있어서, 분석 대상인 아미노산 또는 핵산에 대한 서열 데이터와, 서열 중 일부가 치환된 변이 데이터가 수신되는 입력부; 아미노산 또는 핵산의 서열 정보와 단백질의 3차원 구조에 대한 구조 정보가 저장된 데이터베이스; 상기 데이터베이스를 이용하여 상기 변이 데이터가 분석 대상인 아미노산 또는 핵산의 서열에 미치는 기능적 영향 또는 유해성을 예측하는 제어부를 포함하고, 상기 제어부는 상기 서열 데이터와 진화적으로 관련된 서열들을 정렬하고, 정렬된 서열 정보와 상기 구조 정보를 이용하여 MRF(Markov Random Field) 모델을 생성하며, 상기 서열 데이터에서 인접한 서열을 고려하여 상기 MRF 모델로부터 상기 변이 데이터의 변이가 진화적으로 관련있는 서열에서 나타날 진화적 가능성을 측정하고, 측정된 진화적 가능성을 기초로 상기 서열 데이터의 변이가 미치는 기능적 영향 및 유해성을 예측하는 것을 특징으로 한다.
Int. CL G16B 25/00 (2019.01.01) G16B 20/00 (2019.01.01) G16B 50/00 (2019.01.01) G16B 45/00 (2019.01.01)
CPC G16B 20/00(2013.01) G16B 20/00(2013.01) G16B 20/00(2013.01) G16B 20/00(2013.01)
출원번호/일자 1020170079021 (2017.06.22)
출원인 한국과학기술원
등록번호/일자 10-1990579-0000 (2019.06.12)
공개번호/일자 10-2018-0022549 (2018.03.06) 문서열기
공고번호/일자 (20190618) 문서열기
국제출원번호/일자
국제공개번호/일자
우선권정보 대한민국  |   1020160106855   |   2016.08.23
법적상태 등록
심사진행상태 수리
심판사항
구분 신규
원출원번호/일자
관련 출원번호
심사청구여부/일자 Y (2017.06.22)
심사청구항수 12

출원인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 출원인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술원 대한민국 대전광역시 유성구

발명자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 발명자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 정찬석 대한민국 대전광역시 유성구
2 김동섭 대한민국 대전광역시 유성구
3 손정태 대한민국 대전광역시 유성구

대리인

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 대리인 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 이원희 대한민국 서울특별시 강남구 테헤란로 ***, 성지하이츠빌딩*차 ***호 (역삼동)

최종권리자

번호, 이름, 국적, 주소의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 인명정보 - 최종권리자 표입니다.
번호 이름 국적 주소
1 한국과학기술원 대전광역시 유성구
번호, 서류명, 접수/발송일자, 처리상태, 접수/발송일자의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 행정처리 표입니다.
번호 서류명 접수/발송일자 처리상태 접수/발송번호
1 [특허출원]특허출원서
[Patent Application] Patent Application
2017.06.22 수리 (Accepted) 1-1-2017-0599219-63
2 의견제출통지서
Notification of reason for refusal
2018.09.17 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2018-0634363-77
3 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2018.11.19 보정승인간주 (Regarded as an acceptance of amendment) 1-1-2018-1148670-44
4 [거절이유 등 통지에 따른 의견]의견(답변, 소명)서
[Opinion according to the Notification of Reasons for Refusal] Written Opinion(Written Reply, Written Substantiation)
2018.11.19 수리 (Accepted) 1-1-2018-1148640-85
5 최후의견제출통지서
Notification of reason for final refusal
2018.11.28 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2018-0812158-44
6 [명세서등 보정]보정서
[Amendment to Description, etc.] Amendment
2019.01.23 보정승인 (Acceptance of amendment) 1-1-2019-0082052-23
7 등록결정서
Decision to grant
2019.03.25 발송처리완료 (Completion of Transmission) 9-5-2019-0218665-48
8 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2019.04.24 수리 (Accepted) 4-1-2019-5081392-49
9 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2020.05.15 수리 (Accepted) 4-1-2020-5108396-12
10 출원인정보변경(경정)신고서
Notification of change of applicant's information
2020.06.12 수리 (Accepted) 4-1-2020-5131486-63
번호, 청구항의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 청구항 표입니다.
번호 청구항
1 1
분석 대상인 아미노산 또는 핵산에 대한 서열 데이터와, 서열 중 일부가 치환된 변이 데이터가 수신되는 입력부;아미노산 또는 핵산의 서열 정보와 단백질의 3차원 구조에 대한 구조 정보가 저장된 데이터베이스; 및상기 데이터베이스를 이용하여 상기 변이 데이터가 분석 대상인 아미노산 또는 핵산의 서열에 미치는 기능적 영향 또는 유해성을 예측하는 제어부를 포함하고,상기 제어부는,상기 서열 데이터와 기 설정된 진화적으로 관련된 서열들을 정렬하고, 정렬된 서열 정보와 상기 구조 정보를 이용하여 MRF(Markov Random Field) 모델을 생성하며, 상기 서열 데이터에서 인접한 서열을 고려하여 상기 MRF 모델로부터 상기 변이 데이터의 변이가 상기 진화적으로 관련있는 서열에서 나타날 진화적 가능성을 측정하고, 측정된 진화적 가능성을 기초로 상기 서열 데이터의 변이가 미치는 기능적 영향 및 유해성을 예측하고,상기 제어부는,상기 서열 데이터와 상기 진화적으로 관련된 서열들을 상기 데이터베이스에서 추출하고, 추출된 서열들을 정렬하여 다중서열정렬을 생성하는 다중서열정렬부;상기 서열 데이터로 생성되는 단백질의 3차원 구조 정보를 상기 데이터베이스에서 추출하고, 3차원 구조에서 서열의 위치를 노드로 구성하고, 인접한 노드를 링크한 네트워크의 MRF 모델을 생성하고, MRF 모델이 실제 단백질 구조에 근사하도록 제한하는 제한조건항을 설정하는 MRF 모델 생성부;상기 다중서열정렬, 상기 MRF 모델 및 상기 제한조건항을 기조로 MRF 모델의 파라미터를 산출하는 MRF 모델 파라미터 산출부;상기 산출된 MRF 모델 파라미터를 기초로 아미노산 또는 핵산 변이의 진화적 가능성을 측정하는 변이 분석부; 및상기 측정된 진화적 가능성을 기초로 상기 서열 데이터의 변이가 미치는 영향을 분석하는 기능적 영향 및 유해성 예측부를 포함하고,상기 MRF 모델 생성부는,상기 MRF 모델의 각 링크 파라미터에 포함되는 잡음신호의 양이 일정하도록 제한하는 조건 또는 상기 MRF 모델의 파라미터 형태가 실제 단백질 구조에 근사한 분포를 나타내도록 제한하는 조건을 제한조건항으로 설정하는 것을 특징으로 하는 확률 그래프 모델을 이용한 아미노산 또는 핵산 변이의 기능적 영향 및 유해성 예측 장치
2 2
삭제
3 3
제 1 항에 있어서,상기 다중서열정렬부는,정렬된 상기 다중서열정렬의 가중치 또는 전체 다중서열의 독립적인 크기를 기초로 서열의 중복성을 조절하는 것을 특징으로 하는 확률 그래프 모델을 이용한 아미노산 또는 핵산 변이의 기능적 영향 및 유해성 예측 장치
4 4
제 1 항에 있어서,상기 MRF 모델 생성부는,각 아미노산 잔기를 상기 노드로 구성하고, 상호 인접한 잔기 쌍을 상기 링크로 구성하여 MRF 모델을 생성하고,상기 변이 분석부는,상기 노드에서의 진화적 가능성과 상기 링크에서의 진화적 가능성을 산출함에 따라 상기 기능적 영향 및 유해성 예측부가 상기 서열 데이터에서 인접한 서열을 고려하여 변이가 미치는 영향을 분석할 수 있는 것을 특징으로 하는 확률 그래프 모델을 이용한 아미노산 또는 핵산 변이의 기능적 영향 및 유해성 예측 장치
5 5
삭제
6 6
제 1 항에 있어서,상기 MRF 모델 생성부는,상기 MRF 모델의 각 링크 파라미터에 포함되는 잡음신호의 양이 일정하도록 제한하는 제한조건항을 하기의 [수학식 3]에 의해 정의하는 것을 특징으로 하는 확률 그래프 모델을 이용한 아미노산 또는 핵산 변이의 기능적 영향 및 유해성 예측 장치
7 7
제 1 항에 있어서,상기 MRF 모델 생성부는,상기 MRF 모델의 파라미터 형태가 실제 단백질 구조에 근사한 분포를 나타내도록 제한하는 제한조건항을 하기의 [수학식 5]에 의해 정의하는 것을 특징으로 하는 확률 그래프 모델을 이용한 아미노산 또는 핵산 변이의 기능적 영향 및 유해성 예측 장치
8 8
제 1 항에 있어서,상기 MRF 모델 파라미터 산출부는,상기 다중서열정렬, 상기 MRF 모델 및 상기 제한조건항을 최적화하는 파라미터(P)를 하기의 [수학식 8]에 의해 정의하는 것을 특징으로 하는 확률 그래프 모델을 이용한 아미노산 또는 핵산 변이의 기능적 영향 및 유해성 예측 장치
9 9
제 1 항에 있어서,상기 변이 분석부는,상기 MRF 모델의 파라미터를 기초로 수신된 변이 데이터가 상기 서열 데이터와 상기 진화적으로 관련있는 서열에서 나타날 가능성을 측정하는 것을 특징으로 하는 확률 그래프 모델을 이용한 아미노산 또는 핵산 변이의 기능적 영향 및 유해성 예측 장치
10 10
제 9 항에 있어서,상기 변이 분석부는,상기 MRF 모델의 파라미터를 기초로 수신된 변이 데이터가 상기 서열 데이터와 상기 진화적으로 관련있는 서열에서 나타날 가능성을 하기의 [수학식 10]에 의해 정의하는 것을 특징으로 하는 확률 그래프 모델을 이용한 아미노산 또는 핵산 변이의 기능적 영향 및 유해성 예측 장치
11 11
제 1 항에 있어서,상기 변이 분석부는,상기 MRF 모델의 파라미터를 기초로 수신된 변이 데이터가 상기 서열 데이터와 상기 진화적으로 관련있는 서열에서 나타날 가능성을 하기의 [수학식 11]에 의해 정의하는 것을 특징으로 하는 확률 그래프 모델을 이용한 아미노산 또는 핵산 변이의 기능적 영향 및 유해성 예측 장치
12 12
제 1 항에 있어서,상기 기능적 영향 및 유해성 예측부는,상기 진화적 가능성을 기초로 변이가 단백질의 기능 및 질병 연관성 중 적어도 하나의 측면에서 미치는 영향력을 예측하는 것을 특징으로 하는 확률 그래프 모델을 이용한 아미노산 또는 핵산 변이의 기능적 영향 및 유해성 예측 장치
13 13
제 1 항에 있어서,상기 기능적 영향 및 유해성 예측부는,상기 변이 분석부에서 산출한 변이 데이터가 상기 서열 데이터와 상기 진화적으로 관련있는 서열에서 나타날 가능성을 기초로하여, 상기 변이 데이터가 미치는 기능적 영향 및 유해성을 하기의 [수학식 12]에 의해 정의하는 것을 특징으로 하는 확률 그래프 모델을 이용한 아미노산 또는 핵산 변이의 기능적 영향 및 유해성 예측 장치
14 14
분석 대상인 아미노산 또는 핵산에 대한 서열 데이터와, 서열 중 일부가 치환된 변이 데이터가 수신되는 단계;아미노산 또는 핵산의 서열 정보와 단백질의 3차원 구조에 대한 구조 정보가 저장된 데이터베이스로부터 검색한 상기 서열 데이터와 기 설정된 진화적으로 관련된 서열들을 정렬하여 다중서열정렬을 생성하는 단계;상기 서열 데이터로 생성되는 단백질의 3차원 구조 정보를 상기 데이터베이스에서 추출하고, 3차원 구조에서 서열의 위치를 노드로 구성하고, 인접한 노드를 링크한 네트워크의 MRF 모델을 생성하고, MRF 모델이 실제 단백질 구조에 근사하도록 제한하는 제한조건항을 설정하는 단계; 상기 다중서열정렬, 상기 MRF 모델 및 상기 제한조건항을 기조로 MRF 모델의 파라미터를 산출하는 단계;상기 산출된 MRF 모델 파라미터를 기초로 상기 서열 데이터에서 인접한 서열을 고려하여 아미노산 또는 핵산 변이의 진화적 가능성을 측정하는 단계; 및상기 측정된 진화적 가능성을 기초로 상기 서열 데이터의 변이가 미치는 기능적 영향 및 유해성을 예측하는 단계를 포함하고
지정국 정보가 없습니다
패밀리정보가 없습니다
순번, 연구부처, 주관기관, 연구사업, 연구과제의 정보를 제공하는 이전대상기술 뷰 페이지 상세정보 > 국가R&D 연구정보 정보 표입니다.
순번 연구부처 주관기관 연구사업 연구과제
1 보건복지부 서울대학교병원 질환극복기술개발사업 희귀질환 진단 치료를 위한 생물정보학 기술 개발(2016)