| 1 |
1
적어도 하나의 프로세서에 의해 동작하는 시스템이 암의 재발 예후 예측을 위한 바이오마커를 발굴하는 방법으로서,특정 종류의 암환자들의 대규모 유전자 발현 데이터들을 수집하는 단계,상기 대규모 유전자 발현 데이터들 사이의 유사성을 분석하여 상기 대규모 유전자 발현 데이터들을 복수의 환자군 클러스터들로 분류하는 단계,각 환자군 클러스터로 분류된 유전자 발현 데이터들을 이용하여 해당 환자군 클러스터의 암 연관 유전자셋을 결정하는 단계, 그리고각 암 연관 유전자셋의 암 재발 예후 관련 정보로 생존에 영향을 주는 정도를 나타내는 각 암 연관 유전자셋의 위험비(hazard ratio)를 계산하고, 각 암 연관 유전자셋의 위험비가 유의한지 평가하며, 각 환자군 클러스터의 암 연관 유전자셋으로 구성된 복수의 암 연관 유전자셋들 중에서 위험비가 유의한 적어도 하나의 유전자셋을 바이오마커로 선정하는 단계를 포함하며,상기 암 재발 예후 관련 정보는 환자별 재발 여부 그리고 생존 시간을 포함하고,상기 복수의 환자군 클러스터들로 분류하는 단계는상기 대규모 유전자 발현 데이터들을 바이클러스터링(Biclustering)하여 임의 유전자 발현 데이터를 적어도 하나의 클러스터로 분류하는 바이오마커 발굴 방법
|
| 2 |
2
삭제
|
| 3 |
3
제1항에서,상기 복수의 환자군 클러스터들로 분류하는 단계는각 환자군 클러스터가 피어슨 상관계수(Pearson correlation) 0
|
| 4 |
4
제1항에서,상기 해당 환자군 클러스터의 암 연관 유전자셋을 결정하는 단계는각 환자군 클러스터로 분류된 유전자 발현 데이터들로부터 발현 유전자들을 추출하고, 각 환자군 클러스터의 발현 유전자들 중에서 기준 개수 이상의 유전자 발현 데이터에서 공통발현되고, 피어슨 상관계수가 기준값 이상인 유전자들을 해당 환자군 클러스터의 암 연관 유전자셋으로 결정하는 바이오마커 발굴 방법
|
| 5 |
5
제1항에서,상기 대규모 유전자 발현 데이터들을 수집하는 단계는각 유전자 발현 데이터의 발현양을 정규화하여 저장하는, 바이오마커 발굴 방법
|
| 6 |
6
제1항에서,상기 암 재발 예후 관련 정보는 각 암 연관 유전자셋의 유전자 발현 데이터로부터 획득되는 바이오마커 발굴 방법
|
| 7 |
7
제1항에서,상기 바이오마커로 선정하는 단계는각 암 연관 유전자셋의 위험비가 유의한지 평가하고, 상기 복수의 암 연관 유전자셋 중에서 위험비가 유의한 적어도 하나의 유전자셋을 상기 바이오마커로 선정하는 바이오마커 발굴 방법
|
| 8 |
8
적어도 하나의 프로세서에 의해 동작하는 시스템이 암의 재발 예후 예측을 위한 바이오마커를 발굴하는 방법으로서,바이클러스터링(Biclustering) 기술을 이용하여, 특정 종류의 암환자들의 대규모 유전자 발현 데이터들을 복수의 환자군 클러스터들로 분류하는 단계,상기 복수의 환자군 클러스터 각각에서 공통 발현되는 유전자들을 해당 환자군 클러스터의 암 연관 유전자셋으로 결정하는 단계, 각 환자군 클러스터의 암 연관 유전자셋으로 구성된 복수의 암 연관 유전자셋들을 바이오마커 후보로 결정하는 단계, 그리고각 유전자 발현 데이터에 포함된 암 재발 예후 관련 정보를 기초로, 상기 바이오마커 후보로 결정된 각 암 연관 유전자셋의 예후 예측 유의성을 평가하고, 상기 바이오마커 후보에 포함된 복수의 암 연관 유전자셋들 중에서 예후 예측 유의성이 유의한 적어도 하나의 유전자셋을 바이오마커로 선정하는 단계를 포함하며,상기 암 재발 예후 관련 정보는 환자별 재발 여부 그리고 생존 시간을 포함하고,상기 복수의 환자군 클러스터들로 분류하는 단계는상기 대규모 유전자 발현 데이터들 중 임의 유전자 발현 데이터를 적어도 하나의 클러스터로 분류하며,상기 바이오마커로 선정하는 단계는상기 바이오마커 후보로 결정된 임의 암 연관 유전자셋의 암 재발 예후 관련 정보를 기초로, 상기 임의 암 연관 유전자셋이 생존에 영향을 주는 정도를 나타내는 위험비(hazard ratio)를 계산하고, 계산한 위험비의 유의성을 기초로 상기 임의 암 연관 유전자셋을 바이오마커로 선정할지 결정하는, 바이오마커 발굴 방법
|
| 9 |
9
삭제
|
| 10 |
10
삭제
|
| 11 |
11
삭제
|
| 12 |
12
암의 재발 예후 예측을 위한 바이오마커를 발굴하는 시스템으로서,특정 종류의 암환자들의 대규모 유전자 발현 데이터들을 기초로 상기 암환자들을 복수의 환자군들로 분류하고, 환자군별로 공통 발현되는 유전자셋을 추출하는 암 연관 유전자셋 추출 장치, 그리고환자군별 유전자셋으로 구성된 복수의 유전자셋들 중에서, 각 유전자셋의 암 재발 예후 관련 정보를 기초로 해당 유전자셋의 예후 예측 유의성을 평가하여, 상기 복수의 유전자셋들 중에서 예후 예측 유의성이 기준 이상인 적어도 하나의 유전자셋을 바이오마커로 선정하는 바이오마커 선정 장치를 포함하며,상기 암 재발 예후 관련정보는 환자별 재발 여부 그리고 생존 시간을 포함하고,상기 암 연관 유전자셋 추출 장치는상기 대규모 유전자 발현 데이터들을 바이클러스터링(Biclustering)하여 상기 대규모 유전자 발현 데이터들을 복수의 환자군들로 분류하고, 상기 바이오마커 선정 장치는각 유전자셋의 암 재발 예후 관련 정보를 기초로, 해당 유전자셋이 생존에 영향을 주는 정도를 나타내는 위험비(hazard ratio)를 계산하고, 계산한 위험비의 유의성을 기초로 해당 유전자셋을 바이오마커로 선정할지 결정하는, 시스템
|
| 13 |
13
삭제
|
| 14 |
14
삭제
|
| 15 |
15
삭제
|
