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면역억제물질 예측용 유전자 집단 (Immune suppressive gene set, ISG set)을 선별하는 방법으로서,(S1) 분리된 인간 단핵구 유래 세포주에 3종 이상의 면역억제제를 각각 단독으로 처리하는 단계;(S2) 상기 면역억제제가 처리된 인간 단핵구 유래 세포 및 대조군에 대해 유전체 분석을 수행하는 단계로서, 상기 대조군은 상기 면역억제제가 처리되지 않은 인간 단핵구 유래 세포주인, 단계; 및(S3) 상기 대조군과 비교하여 적어도 3종 이상의 면역억제제에 의해 발현이 증가한 유전자를 면역억제물질 예측용 유전자 집단으로 선별하는 단계를 포함하는, 면역억제물질 예측용 유전자 집단을 선별하는 방법
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제1항에 있어서,상기 면역억제제는 덱사메타손, 타크로리무스, 토파시티닙, 프레드니솔론, 로릴 황산 나트륨, 벤조산, 염화수은, 및 아시클로버로 이루어진 군에서 선택되는 것을 특징으로 하는, 면역억제물질 예측용 유전자 집단을 선별하는 방법
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(S1) 분리된 인간 단핵구 유래 세포주에 시험물질을 처리하는 단계; 및(S2) 상기 시험물질이 처리된 세포 및 대조군에서 제1항의 방법에 의해 선별된 면역억제물질 예측용 유전자 집단의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 시험물질의 면역억제능 예측 방법으로서,상기 면역억제물질 예측용 유전자 집단은 하기로 이루어진 군에서 선택된 2 이상인 것을 특징으로 하는, 시험물질의 면역억제능 예측 방법:PRPSAP1, LINC-ROR, APC2, TBXA2R, SLC44A2, FSIP2, CLIC6, ADM2, ADRA2C, F11R, PDGFRA, BTC, DKK2, ERAP2, KIAA0040, GPER1, LAMB1, GKAP1, ARMCX5-GPRASP2, GPRASP2, TSC22D3, XKR8, GPR162, BCL11B, PARP16, DPEP1, SLC7A5, ATF4, ASNS, GARS, TRIB3, CARS, SLC3A2, YARS, GRB10, STC2, CBS, ALDH1L2, DDIT3, DDIT4, INHBE, EIF4EBP1, VLDLR-AS1, SLC6A9, FYN, BATF3, ST6GALNAC3, FAM84B, ZBED3, METRNL, ITPRIP, JAG1, UBTD1, LRRC56, LMNTD2, CLDND2, ZNF425, HACD2, NUDT13, MORF4L2-AS1, 및 RHOV
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제3항에 있어서,상기 방법은 상기 시험물질이 처리된 세포 및 대조군의 S-score를 산출하는 단계를 더 포함하고, 상기 S-score는 하기 중 어느 하나로 표현되는 것인, 시험물질의 면역억제능 예측 방법:a) 상기 면역억제물질 예측용 유전자의 발현 수준의 중앙값; 또는b) Σβi*RNAi(여기서, βi, 면역억제물질 예측용 유전자의 회귀계수; RNAi, 면역억제물질 예측용 유전자의 RNA 발현 수준)
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제4항에 있어서,상기 방법은 대조군 대비 상기 시험물질이 처리된 세포의 S-score가 증가되어 있는 경우 상기 시험물질을 면역억제성 물질로 예측하는 단계를 더 포함하는, 시험물질의 면역억제능 예측 방법
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제3항에 있어서,상기 대조군은 면역억제제가 처리된 인간 단핵구 유래 세포주인 것을 특징으로 하는, 시험물질의 면역억제능 예측 방법
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제3항에 있어서,상기 발현 수준은 PCR, RNase 보호 분석법, 노던 블랏팅 (northern blotting), 서던 블랏팅 (southern blotting), In situ 교잡법, 전유전체 염기서열 분석법 (WGS, Whole Genome Sequencing), 마이크로어레이 (microarray), 타켓 시퀀싱 (target sequencing), 생어 시퀀싱 (Sanger sequencing), 차세대염기서열분석법 (NGS), RNA 시퀀싱 (RNA sequencing), 웨스턴 블랏, ELISA, 방사선면역분석, 방사선 면역 확산법, 오우크테로니 면역 확산법 (Ouchterlony immunodiffusion), 로케트 면역전기영동 (Rocket immunoelectrophoresis), 면역염색법, 면역침전 분석법, 보체 고정 분석법, 질량분석법 (Mass spectrometry), FACS, 및 단백질칩으로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 방법으로 측정되는 것을 특징으로 하는, 시험물질의 면역억제능 예측 방법
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제3항에 있어서,상기 면역억제능은 선천성 면역에 대한 억제능인 것을 특징으로 하는, 시험물질의 면역억제능 예측 방법
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제3항에 있어서,상기 인간 단핵구 유래 세포주는 THP-1 세포주인 것을 특징으로 하는, 시험물질의 면역억제능 예측 방법
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제1항의 방법에 의해 선별된 면역억제물질 예측용 유전자 집단의 mRNA 또는 단백질 수준을 측정하는 제제를 유효성분으로 포함하는, 시험물질의 면역억제능 예측용 키트로서,상기 면역억제물질 예측용 유전자 집단은 하기로 이루어진 군에서 선택된 2 이상인 것을 특징으로 하는, 시험물질의 면역억제능 예측용 키트:PRPSAP1, LINC-ROR, APC2, TBXA2R, SLC44A2, FSIP2, CLIC6, ADM2, ADRA2C, F11R, PDGFRA, BTC, DKK2, ERAP2, KIAA0040, GPER1, LAMB1, GKAP1, ARMCX5-GPRASP2, GPRASP2, TSC22D3, XKR8, GPR162, BCL11B, PARP16, DPEP1, SLC7A5, ATF4, ASNS, GARS, TRIB3, CARS, SLC3A2, YARS, GRB10, STC2, CBS, ALDH1L2, DDIT3, DDIT4, INHBE, EIF4EBP1, VLDLR-AS1, SLC6A9, FYN, BATF3, ST6GALNAC3, FAM84B, ZBED3, METRNL, ITPRIP, JAG1, UBTD1, LRRC56, LMNTD2, CLDND2, ZNF425, HACD2, NUDT13, MORF4L2-AS1, 및 RHOV
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제10항에 있어서,상기 키트는 하기 단계를 포함하는 시험물질의 면역억제능 예측 방법이 기재된 설명서를 더 포함하는 것을 특징으로 하는, 시험물질의 면역억제능 예측용 키트: (S1) 분리된 인간 단핵구 유래 세포주에 시험물질을 처리하는 단계; 및(S2) 상기 시험물질이 처리된 세포 및 대조군에서 면역억제물질 예측용 유전자 집단의 발현 수준을 측정하는 단계
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제10항에 있어서,상기 mRNA의 수준을 측정하는 제제는 상기 mRNA에 특이적으로 결합하는 프라이머 세트 또는 프로브인 것을 특징으로 하는, 시험물질의 면역억제능 예측용 키트
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제10항에 있어서,상기 단백질의 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질에 특이적인 항체 또는 앱타머인 것을 특징으로 하는, 시험물질의 면역억제능 예측용 키트
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제10항에 있어서,상기 키트는 마이크로어레이 키트, 유전자 증폭 키트, 및 RNA 시퀀싱 키트로 이루어진 군에서 선택된 어느 하나인 것을 특징으로 하는, 시험물질의 면역억제능 예측용 키트
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